基于酶序列数据库的本地化构建及应用

细胞内的代谢网络包含成千上万个化学反应,每个化学反应都有一个特定的酶催化。在整个生物系统中,存在着成千上万个的酶,这些酶支配着生物的新陈代谢、营养和能量转换等催化过程,与生命过程密切相关。为此在国内外生物信息学数据库的基础上,利用java的jsoup的软件包获取到网页中代谢网络中酶的数据,构建酶的本地化信息数据库。方便研究人员查询物种的代谢网络中酶的基础信息,重构代谢网络。     

酶的催化本质

大家熟知,在化学实验室中催化剂可以加速化学反应的进行。生物体的基本特征之一就是它不断进行新陈代谢,而新陈代谢是由为数众多的各式各样的化学反应组成,这些反应的一个特点就是它们的反应条件温和,通常是在常温、常压、近中性的溶液中进行。如果把这些反应放在实验室中进行,就会发现其中有些反应需高温、高压、强酸或强碱等剧烈条件才能进行,有些反应甚至在实验室中未能实现。生化反应在体内如此顺利迅速的进行,其主要原因就是生物体内含有一类特殊的催化剂—酶。酶是生物催化剂,它的高效和专一的催化功能使得生物体内的各种代谢活动快速地,有条不紊地进行,在生命活动中占有极其重要的地位。     

酶催化功能混杂性研究进展

酶催化生物体内化学反应,是生命代谢形成运转的动力。与传统观点认为酶具有专一性催化功能相对,近年来生物信息与实验分析都证实了酶具有多种混杂催化功能是普遍存在的现象。在过去的几十亿年里,古老酶一直不断演化以适应变化的环境,形成现代功能多样的酶蛋白家族。基于独特底物结合模式和动态蛋白结构的催化功能混杂性是酶蛋白适应性演化的基础。酶的混杂活性有望被开发应用于药物酶法合成及环境修复领域。本文就酶催化功能混杂性的普遍性、分子机理、可进化性等方面的相关研究进展进行综述。     

级联催化的新进展：大自然的灵感

自然界成千上万种的化学反应是通过酶催化在生物体内完成的。然而,人类的化学工业却主要依赖有经济效益的金属催化剂催化一些普通的化学反应。化学家经过研究发现,有机催化剂的催化效能更像自然界中的酶和金属酶催化剂。有机催化剂的支持者指出,有机催化剂具有无毒、高效的优点,并且由于其较高的立体选择     

国外科技期刊亮点

蛋白活性研究新进展 作为一个非常有效的机制,变构调节能够控制诸多生物过程中的蛋白质活动,包括信号转导、新陈代谢、催化和基因调控等。其原理是一些酶除了有活性中心外,还有所谓的变构中心,与配体（或底物）结合可使酶的构象发生改变,影响酶活性中心与底物的亲和力及酶的活性。     

大豆荚膜过氧化物酶催化硫醚反应动力学模型

用大豆荚膜过氧化物酶(Soybean Pod Peroxidase, SPP)在微乳液中催化不对称氧化反应,在酶活性为3 200 U/mL,50 ℃时反应5 h,产率为91.56%,对映体过量值为96.08%.SPP催化奥美拉唑硫醚不对称氧化反应生成S-奥美拉唑,其反应机制包括酶催化的SPP-I双电子还原反应、SPP-I单电子转移反应和非酶催化的化学反应.建立的动力学模型很好地拟合了试验数据,其平均相对偏差为5.44%.酶促反应动力学机制为带底物产物抑制的乒乓机制,而化学反应遵循幂律,过氧化氢产生底物抑制,S-奥美拉唑产生产物抑制.     

水含量对C.cylindracea脂肪酶催化有机硅化合物生物转化的影响

研究了水含量对有机溶剂中脂肪酶催化有机硅化合物的生物转化的影响。水含量可影响酶生物转化反应的反应速度，化学反应平衡及化学反应最适温度，在正己烷有机溶剂中酶催化有机硅醇酯化反应的最适水含量为０．０６（ｗ／ｗ）％。     

纤维素酶降解机理的研究进展

纤维素酶在生物炼制过程中具有重要地位,因而十分有必要深度解析酶解作用机理.纤维素是由D-葡萄糖聚合形成的高分子聚合物,它的降解在木质纤维素解聚过程中最为关键,由于其分子结构相当稳定,需要纤维素酶各结构域及组分协同作用,才能将其高效降解为可利用的糖类.本文总结国内外学者对纤维素酶降解机理的最新进展,首先从纤维素酶分子结构与功能的相互作用出发,揭示结构与功能间的互作关系,阐述生物催化分子机制,可为优化酶结构增强酶功能提供理论依据;其次概述纤维素酶降解机理的作用特点,论述酶促协同及其外部环境对纤维素酶活力的重要影响,可为酶解体系优化设计提供借鉴;最后,结合纤维素酶降解机理总结概括了有效降低酶成本的途径.     

酶工程的应用及其未来

酶是生物体产生的具有活性的蛋白质(除个别有活性的RNA外),它可高效专一地催化特定的化学反应,且有反应条件温和、产物易纯化、反应能耗低、污染小、操作简单、是控制等特点。因此,它与传统的化学反应相比,具有较强的竞争能力。 酶工程是利用醇的催化作用进行物质转化的技术,是将酶学理论     

饲用酶制剂的应用现状与发展趋势

随着我国饲料工业的发展,积极开发新的饲料资源、提高饲料的转化效率、降低饲料成本,已成为畜牧界亟待解决的课题。饲用酶制剂的应用是现代化饲料工业的一项突破性的工作。酶是具有特殊催化能力的蛋白质,是促进生物化学反应的高效物质,能提高饲料消化率,促进动物营养物质的充分利用,节约粮食,减少疾病,降低生产成本,是一种很有前途的高效饲料添加剂。 饲用酶制剂的作用机理是直接分解废物,供给机体营养;去除抗营养因子,改善消化机能;激活内源酶分泌,补充内源酶不足;能与动物内分泌调节,影响血液中的某些成份。因此,酶制剂     

香料乙酸苄酯合成方法的改进

研究了以氯化苄和醋酸钠为原料，采用相转移催化合成乙酸苄酯。在催化剂的合成上，采用了新的加料方式；在反应过程中，加入NaHCO3使氯化苄转化完全；在产品的处理上，采用了较为经济合理的方法，使乙酸苄酯的收率达到88％。     

绿色反应技术的现状与研究进展

叙述了绿色化学技术近年来的研究进展.着重介绍超临界水、超临界二氧化碳、离子液体及无溶剂反应的研究现状与进展.认为超临界流体和离子液体对于提高反应速度和反应选择性,提高催化剂催化效率等方面具有良好效果.无溶剂参与的反应相对于经典溶剂参与的反应有产品收率高、选择性强、操作简单易行、产物的提取和纯化简单、不需要有机溶酶或用无毒可循环使用的溶酶等优点,但是有些绿色反应技术的有关规律、机理还需进一步加以研究,实现工业规模的无毒化生产还有一定难度.     

共轭亚油酸异构化技术研究进展

介绍共轭亚油酸(CLA)异构化技术的研究进展,评述异构CLA的碱性催化法、金属催化法和生物酶异构法.认为金属催化法效率高、成本低、经济环保,将成为今后工业化生产CLA的主要方法之一.构建高活性LA异构酶的基因工程菌是实现生物酶异构法产业化的重要前提.     

微乳介质中相转移催化制备乙酸苄酯的研究

在Oil／Water(简称O／W)型微乳介质中实施苄氯与乙酸钠的相转移催化反应，在室温下成功地制得了乙酸苄酯，并且研究了几种因素对产品得率的影响，使产品得率可达80％．表明在微乳介质中可大大提高相转移催化效率，从而大大加快反应速率．     

新型有效的PEG1000-DAIL[BF4]/Fe2(SO4)3均相催化氯化苄水解反应

在离子液体PEG₁₀₀₀-DAIL[BF₄]、甲苯和Fe₂(SO₄)₃组成的温控两相催化体系作用下,氯化苄的均相催化水解反应能够高效地进行,在110 ℃搅拌反应40 min,产物苯甲醇收率高达96%.该新方法收率高,操作简单,催化体系可以较好地回收循环使用而且催化活性基本保持不变.同时,对水解反应的机理和温控两相催化的过程也进行了阐述.     

SnCl4对酯化反应的催化作用

SnCl4是一种强的路易士酸，对氧具有很强的配位能力。为探索SnCl4对酯化反应的催化作用，现以SnCl4为催化剂来合成常见的几种酯，并与其它几种常见的催化剂的催化活性进行了比较，还从SnCl4的用量、反应温度和反应时间、催化机理等几个方面进行了探讨，实验表明，SnCl4对酯化反应有很高的催化活性，尤其对于高沸点的伯醇和叔醇，比其它几种催化剂的催化效果更好，可代替其它几种催化剂来合成某些酯。     

低温等离子体-催化协同空气净化技术研究进展

低温等离子体协同催化剂净化技术是一种先进的空气污染控制技术,它结合了低温等离子体技术和催化氧化技术的优点,具有能耗低、能源利用率高、副产物少等优势,在环境治理领域有着广阔的应用前景.结合国内外关于低温等离子体与催化剂物化性质的相互影响,以及等离子体驱动光催化方面的研究成果,分析了低温等离子体协同催化技术净化空气的原理,概述了国内外利用该技术处理挥发性有机污染物和氮氧化物的情况,并提出了研究展望,指出国内工作应在深入开展理论研究的基础上,尽早实现该项技术的实际工业应用.     

氨基修饰MIL-101金属-有机骨架化合物的制备、表征及其对Knoevenagel反应的催化性能

采用后处理法将氨基接枝到具有开放金属位的金属-有机骨架化合物MIL-101上,利用XRD、N2吸附—脱附、元素分析等手段对材料进行了表征,并考察了其对Knoevenagel反应的催化活性.结果表明,在不破坏母体骨架结构的同时,氨基被成功地引入MIL-101骨架结构中;氨基修饰的MIL-101对Knoevenagel反应具有很高的催化活性:当催化剂量为0.05 g、反应时间为1 h时,苯甲醛的转化率可以达到97%,并且材料在循环使用过程中不存在氨基流失的情况.     

微波诱导催化轻质烃芳构化

研究了在常规加热和微波辐射两种不同加热方式下ZnN/HZSM-5早混合碳四烃及正己烷芳构化反应的性能。考察了高／径比、反应温度及反应时间对反应性能的影响。探讨了微波辐射诱导催化反应的作用机理。     

介质阻挡放电-催化降解甲苯的研究

〖JP2〗采用线板式介质阻挡放电结合催化剂去除甲苯，系统研究背景气体、催化剂负载位置、湿度等因素对甲苯去除与出口O3质量浓度的影响. 结果表明，负载催化剂能提高反应器的能量密度. 催化剂置于等离子体区，主要作用是催化含氧物种，实现甲苯的高效去除，〖JP〗同时可降低出口O3质量浓度. 发泡镍后端负载催化剂，比前端负载催化剂的甲苯去除效率高，出口O3质量浓度低. 湿度对等离子体去除甲苯具有双重效应，甲苯的去除效率随着湿度的增加先增大后减少.催化剂置于等离子体区后，可实现甲苯和O3的同时高效去除. 在等离子体催化体系中，甲苯的降解由高能电子和自由基引发，反应的主要产物是CO、CO2和H2O，气相副产物主要有烷烃、酸、醛和含苯环有机物.