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1.
福建建瓯锥栗、茅栗遗传多样性分析 总被引:4,自引:0,他引:4
利用RAPD的DNA标记技术.分析了福建建瓯锥栗和茅栗以及我国板栗栽培品种的遗传多样性.结果表明,锥栗、茅栗和板栗多态位点百分率分别为44.9%.53.7%和52.7%。遗传多样性分析表明,锥栗的有效等位基因数目(Ne)、基因多样度(h)和Shannon多样性信息指数(I)略小于茅栗和板栗.但差别不大,它们的值分别为1.6088~1.6916,0.3480~O.3529和0.5179~0.5357,显示出较高的遗传多样性。 相似文献
2.
在两组40个随机引物中,筛选出16个重复性好的多态引物,对山羊与岩羊闻RAPD片段分析表明,16个引物扩增出67条带,其中54条带表现多态,多态率80.60%,山羊各群体共有条带为23条,山羊和岩羊共有条带为13条,岩羊有4条特异带,不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同.岩羊特异RAPD片段,OPA-10724的序列与人类全基因组比较,同源的短序列较多,最太长度为86bp,唯有30bp的长度与绵羊ZFZ基因和牛ZFY基因内含子同源。 相似文献
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葡萄抗霜霉病基因RAPD标记的序列分析 总被引:3,自引:0,他引:3
用WizardDNAClean upSystem纯化葡萄抗霜霉病基因RAPD遗传标记OPO 0 6 - 150 0片段 ,用T easyVector克隆RAPD标记 ,采用自动荧光DNA测序仪 (型号ABI 377DNASe quencer)测定了该DNA片段的核苷酸组成及其排列顺序 .来自中国野葡萄的RAPD标记OPO 0 6- 150 0从左右两端各测了 586bp和 4 52bp .对两端序列的酶切位点进行了分析 .根据两端序列可以设计专一PCR扩增引物作为合成抗霜霉病检测探针的基础 ,用于检测葡萄抗病育种和抗病品种的霜霉病抗性 . 相似文献
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不同球孢白僵菌菌株DNA的RAPD分析 总被引:3,自引:1,他引:3
采用RAPD技术分析了16个球孢白僵菌菌株的遗传分化。由160个随机引物中筛选出27个引物对各菌株进行了PCR扩增。结果表明从16个 孢白僵菌菌株中共获301个RAPD标记,其中多态性标记288个,占95.7%,表明菌株间具有较丰富的遗传多态性,聚类分析把16个球孢白僵菌菌株分为三大类型(1)Blh,,Bgd和Bpy;(3)By7,F-263,RECBb01,B12和B13;(3)B7,B11,Bxs,B6,By2,Bpc和Bzs。菌株DNA多态性与采集地之间有一定的相关性,但与寄主来源,孢子形态和对松墨天牛幼虫的毒力间未表现出明显的相关性。 相似文献
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RAPD标记对甘薯及其近缘野生种的遗传多样性分析 总被引:5,自引:0,他引:5
用随机扩增多态性DNA(RAPD)分析技术对甘薯近其近缘野生种进行了遗传多样性分析,使用15种10个碱基的随机引物,对17个甘薯品种及其近缘野生种的基因组DNA进行了扩增,共产生了105条DNA带,其中91条为多态性带,通过聚类分析将17个甘薯品种及其近缘野生种聚类成3个类群:A类群由三裂叶野牵牛(Ipomoeatriloba)单个野生种组成,C类群由海滨野牵牛(I.littoralis)和二倍体三浅裂野牵牛(I.frifida2x)组成,B类群则由四倍体和六倍体三浅裂野牵牛以及12个甘薯品种组成。 相似文献
6.
外显子捕获联合高通量测序技术在检测新的致病基因,特别是罕见的基因变异时,表现出很高的检测效率.但在具体使用过程中,探针易出现非特异性杂交,设计探针时需考虑Tm值均一性、所需初始样品量较大等问题.RecA是原核生物同源重组的中心分子,参与DNA损伤的重组修复.通过在体外模拟RecA蛋白在原核生物体内重组寻找同源序列的途径,用以捕获目标DNA分子,以期提高外显子捕获过程中的探针杂交效率和特异性.根据RecA在体内同源重组中的作用模式,先将基因组染色质片段化,再纯化DNA,设计生物素标记的特异性探针,在RecA蛋白的介导下以捕获基因组中的目的同源片段.结果显示:设计的和目标片段互补的探针高效而特异地捕获了目标DNA片段,ATP和水能够破坏RecA介导形成的三链复合体的稳定性,可以作为很好的杂交后洗脱试剂,而且水直接作为洗脱试剂可以提高洗脱目的 DNA片段的效率和纯度. 相似文献
7.
针对倾向错误的PCR技术中不同目的、不同长度基因的诱变种类一直缺乏准确参考的问题,以酵母spt15基因为研究对象,在标准的PCR反应体系中加入不同Mn2+摩尔浓度(0.125,0.250 和0.500 mmol·L-1)进行倾向错误的PCR,扩增spt15不同长度(分别约为200, 500和700 bp)的DNA片段,研究其突变频率,突变碱基数目及突变类型,以分析不同种类的突变所需的最佳条件.研究结果表明:长片段DNA的PCR突变率对Mn2+摩尔浓度更敏感;模板的长度对DNA PCR突变碱基个数也有较为明显的影响,低Mn2+摩尔浓度有利于单突变;Mn2+驱动的突变有明显的倾向性,其中A→G和T→C的突变居多. 相似文献
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利用原核微生物GroE基因特定区域高保守性设计了简并引物,以Rhodopseudomonas palustris Y6的染色体为模板进行PCR扩增,得到片段594bp的产物,将该DNA片段连接到pUC-T载体多克隆位点上,转化大肠杆菌DH5α菌株,得到阳性重组子。经Southem 杂交验证,已克隆的594bpDNA片段来自Rhodopseudomonas palustris测序结果分析表明该片段是细菌groE基因高保守区。 相似文献
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中国水仙种质资源的遗传多样性分析 总被引:11,自引:1,他引:11
用随机扩增多态DNA(RAPD)标记方法对中国水仙主要栽培品种及不同的生态类型进行了遗传多样性检测。从98个随机引物中筛选出16个有效引物,共扩增出120条DNA带,其中多态位点39个,占32.5%。相对其他作物,中国水仙遗传多样性水平偏低。中国水仙遗传多样性贫乏可能是现有中国水仙品种稀少的重要原因。用UPGMA法对各样品间的Nei氏相似性系数进行聚类分析。结果显示,崇明水仙与漳州水仙亲缘关系十分密切,平潭水仙与漳州水仙亲缘关系相对较远。平潭水仙和崇明水仙各居群内的遗传分化很小,而漳州水仙居群内遗传多样性较为丰富。以栽培品种看,单瓣水仙与重瓣水仙亲缘关系密切,“金三角”与单瓣水仙、重瓣水仙两者的亲缘关系较远。基于研究结果,提出采用新技术引进新种质选育水仙新品种的思路和保护中国水仙资源的重要性。 相似文献
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以杂交狼尾草叶片为材料,用0.05 mol NaOH溶液在沸水浴中加热处理10 min,进而用pH3.0的TE溶液进行中和获得DNA提取液,并用该DNA提取液为模板进行RAPD-PCR和SSR-PCR扩增.结果显示:用该方法提取的DNA与常规CTAB法提取的DNA质量相当,可用于以PCR技术为基础的DNA分子标记分析与96孔板技术相结合,可以实现DNA高通量提取. 相似文献
11.
DNA分子标记在花卉上的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
本文综述了DNA分子标记的常见类型 ,以及各类型的特点。着重指出了DNA分子标记在花卉分类、育种、组织培养、基因定位等方面的应用 相似文献
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31种石斛属植物的RAPD遗传多样性分析 总被引:4,自引:0,他引:4
采用随机扩增多态性DNA技术对31种石斛属植物的遗传多样性进行分析.从100条RAPD引物中共筛选出18条引物,18条引物共扩增出1802条带,其中多态性位点有261个,多态性比为99.2%.UPGMA 聚类结果显示,基因型之间的相似系数分布于0.642~0.838之间,31种石斛属植物样品分为7类.聚类分析显示供试样... 相似文献
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用20种随机引物对多小核草履虫、旋毛草履虫、双小核草履虫和绿草履虫四种纤毛虫基因组多态性分析显示,多小核草履虫与双小核草履虫有共有片段27条,共享度达45.8%;旋毛草履虫和绿草履虫有共有片段27条,共享度为42.8%。多小核草履虫与旋毛草履和绿草履虫的共有片段分别为10条和11条,共享度分别为17.1%和16.8%。双小核草履虫与旋毛草履虫和绿草履虫的共有片段分别为12条和19条,共享度分别为21.2%和29.9%。所得结果与Woodruff和Wichterman对草履虫属的两类群的假设相一致。据此作者推测,同属于一个类群的草履虫,即多小核草履虫和双小核草履虫、旋毛草履虫和绿草履虫的亲缘关系较近。表明RAPD技术对纤毛类原生动物的系统分类是有价值的。 相似文献
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葫芦科作物属种间RAPD多态性分析 总被引:4,自引:0,他引:4
选用了14 个随机引物,对葫芦科3 个属的12 种材料作 R A P D 多态性分析,并对各材料的指纹图谱进行了聚类和相似性分析。结果表明,12 种材料基因组的分析结果与传统分类学的结果基本相符,同时3 属内各种间都具有其特殊的扩增带,这些带可作为分子标记应用于植物的分类和鉴定。 相似文献
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几种动物RAPD指纹图谱反应条件的分析 总被引:1,自引:0,他引:1
用随机排列碱基顺序的寡核苷酸引物,对蚕、鱼、蛇、家猪等动物的基因组DNA扩增,获得了这些动物的随机扩增多态DNA指纹图谱,对影响扩增结果的几个因素进行了分析,对动物随机扩增多态DNA反应的适宜条件进行了讨论。 相似文献
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适于RAPD分析的三种基因组DNA提取方法比较 总被引:7,自引:0,他引:7
通过对 3种基因组DNA提取方法的实验比较 ,找到了一种既能够满足RAPD实验要求 ,又简便快捷、经济的基因组DNA提取方法 ,经RAPD试验检测与电泳结果分析表明 :DNA扩增效果良好 相似文献