生化反应系统的高维矩阵方程

化学主方程对生化反应系统提供了一个建模框架,但它的分析与模拟一直是计算系统生物学的一个难题,到目前为止并没有得到解决.这里,通过引进高维矩阵及其运算规则,首先把化学主方程表示为高维矩阵方程,然后给出了其分析解的形式表示,此外还介绍了一种求解高维矩阵方程的高效数值方法.研究表明:高维矩阵方法似乎解决了化学主方程的分析求解和数值求解问题.     

杜鹃花繁殖生物学研究进展

对杜鹃花孢粉学、繁育系统及传粉生物学方面的研究进展进行了分析,提出杜鹃花属植物繁殖生物学未来的研究可以主要从以下几个方面开展：（1）探讨杜鹃花属孢粉学线形结构的花粉呈现的进化意义;（2）在中国喜马拉雅地区,研究不同地点的相同物种和不同物种繁育系统,分析杜鹃花繁育系统多样性的相关因子,了解传粉系统及传粉昆虫的多样性,揭示杜鹃花属的传粉者特点;（3）选取合适的基因片段,重建杜鹃花属的系统,通过系统树找出可能是杂交起源的种类,纠正经典分类学在杜鹃花属系统位置构建方面的偏差;（4）对比不同杂交群体的繁殖生物学特性,找出传粉昆虫对不同亲本和杂交个体施加选择压力的差别,明确在物种的杂交形成过程中传粉昆虫对生殖隔离的选择作用。     

分子系统学的理论、方法及展望

随着分子生物学理论的不断完善和技术的发展,系统生物学的一个分支学科--分子系统学也在不断地发展,并已成为进化生物学、古生物学、生态学等众多学科的一个极其重要的研究手段,并在诸多研究领域中取得了许多令人瞩目的成果.然而,相对于一些传统学科而言,它毕竟还是一门年轻的学科,在许多理论和方法的运用上还存在着一些问题.本文尝试对这门学科涉及到的一些问题作一系统评述,以期有助于更好地了解它,并利用它有效地开展相关研究工作.     

癌症的系统生物学模型研究进展

系统生物学研究采用的是系统性的研究方法,即获取并整合目标系统不同层次的生物学信息,构建适用于该生物系统的数学模型,对该系统的特征性行为进行系统性研究.癌症是一种复杂的生物系统,已成为系统生物学研究的热点领域.癌症的系统生物学模型是对传统的癌症动物模型的补充,主要包括:统计推断模型、生化网络模型、以及组织水平模型等.本文综述了这些系统模型方法在癌症研究中的应用情况及其取得的重要研究成果.     

生物多样性及其进化中的模糊问题研究

生物多样性是现代生物学研究的热门内容之一.根据现代生物学和古生物学研究成就,就生物多样性概念、生物多样性诞生、生物多样性进化中的模糊问题及解决途径进行了研究.     

无脊椎动物进化中的模糊问题思考

无脊椎动物是动物界的低等类型、最庞大类群。本文根据古生物学、现代生物学和生物进化论研究成就，就无脊椎动物起源、三叶虫、头足类、昆虫进化过程中的模糊问题作了逻辑推理思考。     

The emerging conceptual framework of evolutionary developmental biology

Over the last twenty years, there has been rapid growth of a new approach to understanding the evolution of organismic form. This evolutionary developmental biology, or 'evo-devo', is focused on the developmental genetic machinery that lies behind embryological phenotypes, which were all that could be studied in the past. Are there any general concepts emerging from this new approach, and if so, how do they impact on the conceptual structure of traditional evolutionary biology? In providing answers to these questions, this review assesses whether evo-devo is merely filling in some missing details, or whether it will cause a large-scale change in our thinking about the evolutionary process.     

中韩两国高中生物教材中概念图的比较研究

本文对中、韩两国高中生物教材的概念图的内容设计、题型、相同知识点比较等进行了研究。指出了我国高中生物新教材中设计的概念图的优点及不足,提出了改进的建议。     

基础分子生物学理论课教学体会

针对基础分子生物学理论课教学中的常见问题,从启发学生重视学习基础分子生物学,让学生有效掌握知识,强化学生课后学习及给学生推荐创新的复习思路等方面多角度探讨笔者自己多年来的教学体会。     

21世纪高师生物学实验教学规范化体系研究

根据生物科学发展的动态和趋势,结合我国２１世纪生物学人才培养的模式,生物学专业和生物学课程两个层次上探讨了２１世纪高师生物学实验教学规范化体系,对面向２１世纪高师生物学专业呈现 体系改革具有重要的意义。     

FluxExplorer： A general platform for modeling and analyses of metabolic networks based on stoichiometry

An increasing number of genomic and biochemical data make it possible to reconstruct biochemical net-works, especially metabolic networks, of an organelle or even a whole cell. Some methods for metabolism modeling and analyses in this field have been deve…     

Evolutionary analyses of the human genome

The completion of the human genome will greatly accelerate the development of a new branch of science--evolutionary genomics. We can now directly address important questions about the evolutionary history of human genes and their regulatory sequences. Computational analyses of the human genome will reveal the number of genes and repetitive elements, the extent of gene duplication and compositional heterogeneity in the human genome, and the extent of domain shuffling and domain sharing among proteins. Here we present some first glimpses of these features.     

计算变异学创立背景及其用途

为了克服生物信息学和计算生物学中字母或数字不受序列长度、氨基酸组成和位置、相邻氨基酸影响的缺陷,根据自然界普遍存在的随机性原理,创立计算变异学。计算变异学用氨基酸对可预测性、氨基酸分布概率和变异概率3种方法量化整个蛋白质及每个氨基酸,用活的、动态的测量指标量化分析蛋白质。计算变异学方法可以应用于研究蛋白质进化、遗传病定量诊断,分析蛋白质结构与功能、药物设计和病毒变异预测等领域。     

合成生物学研究和应用的生物安全问题

 合成生物学指基于系统生物学的遗传工程,人工设计与合成新的生物元件和生物系统。本文简述合成生物学的发展及其可能造成的环境、公众健康安全问题及伦理问题。借鉴欧美等国家在合成生物学发展及管理方面的经验,提出中国应加强合成生物学研究和应用的风险评估、完善监督和管理体系、强化生物安全和生物伦理教育、推动与国际社会的交流和合作等。     

Structural insights into a yeast prion illuminate nucleation and strain diversity

Self-perpetuating changes in the conformations of amyloidogenic proteins play vital roles in normal biology and disease. Despite intense research, the architecture and conformational conversion of amyloids remain poorly understood. Amyloid conformers of Sup35 are the molecular embodiment of the yeast prion known as [PSI], which produces heritable changes in phenotype through self-perpetuating changes in protein folding. Here we determine the nature of Sup35's cooperatively folded amyloid core, and use this information to investigate central questions in prion biology. Specific segments of the amyloid core form intermolecular contacts in a 'Head-to-Head', 'Tail-to-Tail' fashion, but the 'Central Core' is sequestered through intramolecular contacts. The Head acquires productive interactions first, and these nucleate assembly. Variations in the length of the amyloid core and the nature of intermolecular interfaces form the structural basis of distinct prion 'strains', which produce variant phenotypes in vivo. These findings resolve several problems in yeast prion biology and have broad implications for other amyloids.     

从理工科视角探索系统生物学

系统生物学是在系统水平上研究生物系统,即通过研究因生物系统组成单元之间的相互作用所组成的网络来揭示生命系统的复杂行为和功能。本文扼要介绍近期内笔者在系统生物学领域研究所取得的一些进展。强调从理工科的视角出发,首先在分子水平上结合数据与方法论的整合性观点构建生物网络,然后用相互作用、动态行为等整体论观点来研究该网络,达到探索在不同层面上理解和诠释复杂生命现象的目的。     

免费师范教育政策下的生物学免费师范生学习状况调查

采用问卷调查和访谈等方式,对生物学专业免费师范生目前的学习状况、学习态度、学习动机等进行了调查研究,研究发现:其学习状况良好,学习态度积极,但部分学生的学习目标尚不够明确,存在消极情绪.并根据存在的问题提出了如何加强免费师范生教育的建议.     

非亏损特征指数的灵敏度分析

将直接解析方法延伸到非亏损矩阵Ｋ的特征值的灵敏度分析，导出了周期系数系统非亏损特征指数出现重根时的灵敏度计算公式。     

等导重根特征对的泰勒展开

讨论多参数非亏损特征对的可微性,推导了具有等同一阶偏导数的重根特征的计算公式,进而得到了它们的泰勒开展开式。     

中国兰科植物研究进展概述

概述了我国兰科植物形态学、分类学、系统学、生物地理学、居群生态学与生物学、细胞学、生物化学、分子生物学、生理生态学、繁殖生物学、物种多样性保护及持续利用等方面的研究现状,并对贵州的兰花产业发展进行了展望。