铜绿假单胞菌PAO1亚精胺脱氢酶SpdH的表达、纯化和初步晶体学研究

铜绿假单胞菌是一种具有很强环境适应性的机会致病菌,感染后通常很难治愈从而造成很严重的后果.聚胺类化学物质在很多种生物体内广泛存在,并且在细胞内发挥多种重要的功能.铜绿假单胞菌 PAO1可以利用聚胺类物质作为菌体生长所需的唯一的碳源和氮源,亚精胺脱氢酶(SpdH)在铜绿假单胞菌亚精胺代谢过程中发挥重要的作用.本研究在大肠杆菌中成功表达了可溶性SpdH蛋白,并经过多种方法纯化后筛选获得了蛋白质晶体,通过X射线衍射实验收集到分辨率达到0.185 nm的衍射数据,并使用 HKL2000软件对衍射数据进行了处理,这些数据为SpdH结构的解析奠定了基础.     

神舟八号飞船空间蛋白质结晶实验

 利用德国空间生物实验装置和自主研制的结晶室,在中国神舟八号飞船上进行了14种蛋白质的结晶实验,实验持续16.5d;同时使用相同结晶室在地面开展比对实验.结果表明：12种蛋白质在空间析出晶体,地面有11种;空间析出的6种蛋白质晶体可用于X-射线衍射实验,收得4种晶体的8套同步辐射衍射数据;地面有5种蛋白质晶体可用于X-射线衍射,收得3种晶体的5套同步辐射衍射数据,其中1套不完整.鸡蛋清溶菌酶空间晶体的初步衍射最高分辨率为1.16Å,地面晶体的为1.23Å.痢疾杆菌二磷酸四腺苷空间晶体初步衍射最高分辨率为1.75Å,地面晶体的为1.49Å,但是1颗空间晶体的晶型发生改变.衣原体蛋白酶样活化因子空间晶体的初步衍射最高分辨率为2.31Å,地面晶体未得到衍射数据.加拿大的17β-羟化类固醇脱氢酶复合物空间晶体的初步衍射最高分辨率为2.30Å,地面晶体未得到完整衍射数据.自主研制的结晶室的浸入式毛细管结构为国际上首次采用,具有无源和通用的优点,对汽相扩散结晶法具有良好的自然对流抑制效果.     

基质金属蛋白酶-1基因多态性在牙周炎中的研究进展

基质金属蛋白酶-1可以降解牙周基质的主要成分-1型胶原，在牙周炎的病理过程中起着重要作用。近年来研究表明在基质金属蛋白酶-1的启动子区存在基因多态性，其对基质金属蛋白酶-1基因表达的影响与结缔组织降解性疾病如牙周炎的易感性和严重程度存在联系。本文将就基质金属蛋白酶-1基因多态性对基因表达的影响及其调控机制和在牙周炎中的研究进展做一综述。     

一种针对不完善数据的基于全变分约束的相干衍射算法（英文）

X射线相干衍射成像(coherent diffraction imaging,CDI)技术是一种无透镜成像技术.其基本原理是使用高度相干的X射线光束照射孤立样品,在远场收集相干衍射图样的信息,使用CDI重构算法从衍射图样中还原出样品的真实结构信息.但是由于实验技术的限制,通常实验数据都是不完善的,所以相干衍射算法对于噪声和数据缺失的容忍能力是非常重要的.通过将全变分约束引入到CDI重构算法中得到了一种改进后的算法,以提升算法对噪声和数据缺失的容忍能力.并使用模拟数据与真实实验数据来进行验证,结果表明改进后算法可以加快算法的收敛速度以及提高对噪声和数据缺失的容忍能力.     

股票交易数据文件的抽取算法研究

目前市场上有很多股票交易软件,这些软件会根据股票交易的实际情况定期产生股票交易信息数据,并将这些信息数据写入二进制格式的文件中,如DAY文件等.由于这些文件不是文本文件,无法直接使用常规的文件读写进行数据的抽取,而必须设计一种数据抽取算法完成相应操作.对DAY文件进行了分析和研究,在此基础上设计了一种数据抽取算法,并利用JAVA语言实现了数据抽取算法程序,利用该程序完成了从DAY文件中抽取数据并写入数据库的实验.实验结果表明,该程序能够正确地从DAY文件中抽取数据,为后期的股票信息处理和数据挖掘提供了重要的基础.     

STIM1蛋白SOAR结构域与小分子的共结晶及X射线衍射的初步研究

钙库操纵的钙内流(Store-operated Ca2+entry)是钙离子进入细胞的一种经典方式,对于多种细胞生理活动具有重要的意义.它是由位于内质网膜上的钙离子感受器STIM1分子与细胞膜上的通道蛋白ORAI1相互作用而被激活的.其中,STIM1位于细胞质内的C端含有一段SOAR(STIM-ORAI association region)结构域,可以和ORAI1直接作用从而激活ORAI1组成的CRAC通道.考虑到STIM1在钙库操纵的钙内流过程中的重要调节作用,通过药物分子来调节STIM1的活性从而影响细胞、甚至机体的生理活动势必成为关注的方向.本实验将人类STIM1分子的SOAR结构域在大肠杆菌中异源表达,经过多种层析方法获得了纯度较高的SOAR蛋白,并通过与一种小分子——间苯二酚的共结晶,获得了复合物的晶体.X光衍射数据收集到0.21nm,并用HKL2000软件进行处理.这些数据为SOAR与间苯二酚复合物结构的解析奠定了基础.     

基于量子理论方法的分子C60单缝衍射研究

已有大量实验对各种粒子的衍射现象进行了研究,并在理论上用许多模型解释了这些衍射现象.笔者应用量子理论方法研究了C60的单缝衍射问题,所得的结果与实验符合较好.     

基于XPath比较的Web数据抽取方法

研究了从包含多个数据块的页面中抽取数据的方法.通过对比各个数据块的XPath,发现这些数据块具有相似的XPath,提出一种基于XPath比较的数据块抽取规则生成算法XERG.得到各个数据块抽取规则之后,块内的信息可以使用相对XPath或者正则表达式的方法来进行抽取.实验结果表明,该方法能够准确地获得各个数据块,正确抽取块内信息.     

宽谱双向反射分布函数的测量

介绍了用于测量光散射数据的宽谱全向反射计,并提出一种宽谱双向反射分布函数(BRDF)的测量方法.该仪器使用一个宽谱白光光源、一个包含衍射光栅及二极管线阵的宽谱探测器,通过相对测量的方法获得了400~700 nm的BRDF数据.完成的宽谱全向反射计能够同时实现测量角度范围覆盖入射半球和发射半球的大部分,可对可见光谱段的高密度光谱取样和高效率的测量操作.对两个试样进行了BRDF测量,并给出数据,实验结果证明了系统的可用性.     

基于量子理论的电子双缝衍射实验

用薛定谔方程求解电子在缝中的衍射波函数,用路径积分方法求解电子在缝外的衍射波函数,最终推导出衍射强度的关系式.理论计算结果和实验测得数据符合相当好,验证了量子理论方法能够精确解释电子的衍射现象.     

滤波与系统识别一种最小二乘方方法

通过观察构建模型在科学的许多分支中起着重要的作用。尽管通过我们感觉作出观察很重要，但科学观察经常借助于测量仪器或者传感器来完成。这些传感器获得的测量数据经常需要进行处理以便判断或者确认实验，或者从正在进行的实验上获得更多的信息。     

基于智能的网页信息提取系统的研究与设计

随着Internet的迅速发展,为人们提供了大量的信息,但这些信息都包含在网页中,为了使用这些信息数据,需要将数据从网页中提取出来.本文介绍了一种新的基于智能的网页信息提取系统EIES,通过对RoadRunner的改进和利用,在提取过程中不需人工干预,实现了信息提取的智能化.实验表明,该系统能够更准确、更有效地分类相似网页和提取网页信息.     

一种利用引擎节点实现高效微博营销的方法

微博营销是一种成本低、效率高的营销手段.其问题的关键是准确寻找网络中有影响力的节点作为触发品牌知名度的少数用户,保证在较少投入情况下获得较大收益.本文以真实微博数据为研究对象,提出了一种利用微博信息传播引擎节点实现高效网络营销的方法.首先,在兴趣领域相近的网络信息级联树上挖掘扩散系数高的引擎节点;其次,以这些引擎节点作为初始传播节点进行信息传播演化.实验结果表明,利用引擎节点作为初始节点能够使信息传播速度更快、范围更大.     

基于Fibonacci采样的数据预处理方法研究

提高神经网络(NN)的收敛速率和预测精度一直是人工智能领域的一个挑战性问题,尽管许多研究人员已在研究中使用小批量数据训练神经网络获得了较好的效果,但是这些方法并不够灵活.针对这个问题,该文提出了一种新的数据预处理算法即Fibonacci采样算法.根据Fibonacci数列规则绘制一个新的训练数据序列,这不仅可以恢复小批...     

嗜热菌Lon蛋白酶的功能分析

Lon蛋白酶是一种在各种生物体内广泛分布并且具有多种生物功能的蛋白质.以嗜热栖热菌（Thermus thermophilus HB8）的Lon蛋白酶（TTLon）为研究对象,将TTLon蛋白酶的编码基因克隆至pTrc His载体,并在大肠杆菌中进行了成功表达,采用Ni-NTA亲和层析对其进行分离纯化,并通过一系列实验证明Lon蛋白酶能够与ATP结合,具有依赖ATP的蛋白酶活性和依赖ATP的分子伴侣活性.     

人鼻病毒3C蛋白酶在大肠杆菌中的表达、纯化及活性分析

人鼻病毒3C蛋白酶具有高特异性,且在低温条件下具有较高酶活,目前已被商品化.在大肠杆菌中利用麦芽糖结合蛋白(MBP)作为融合标签可促进人鼻病毒3C蛋白酶的可溶性表达.将人鼻病毒3C蛋白酶的DNA编码序列克隆到pRK792载体上,然后导入到大肠杆菌BL21(DE3),进行诱导表达,获得MBP-LEVLFQGP-6x His-人鼻病毒3C蛋白酶融合蛋白,随后通过Ni柱亲和纯化获得目的蛋白.用该产物切割纯化的MBP-LEVLFQGP-6x His-木聚糖酶融合蛋白,可获得木聚糖酶并用底物平板检测其活性.实验结果表明人鼻病毒3C蛋白酶能够在大肠杆菌中表达,并且能特异性地在其底物识别序列进行切割,从而移除MBP标签,获得仅带有6x His的人鼻病毒3C蛋白酶.该酶可以特异性地去除木聚糖酶融合蛋白中的MBP标签,获得有活性的木聚糖酶.利用MBP标签能够促进人鼻病毒3C蛋白酶可溶性表达,且人鼻病毒3C蛋白酶的活性不受影响,有利于一些不稳定的蛋白在低温下的标签去除和纯化.     

1株传统曲霉型豆豉中高活力蛋白酶产生菌的分离及其鉴定

豆豉是一种以大豆作为原料经过微生物发酵而形成的传统发酵食品.在发酵过程中,蛋白酶产生菌是其优势菌株并发挥着重要作用.通过对传统曲霉型豆豉发酵过程中的微生物进行分离、初筛和复筛,筛选获得1株高产蛋白酶的菌株,经测定其酶活力为2231 U·L-1.通过生理生化及16S DNA分子鉴定该菌株为解淀粉芽孢杆菌.获得的高活力蛋白酶产生菌将为后续制作风味良好的豆豉提供基础,同时也为工业化生产蛋白酶提供菌种资源.     

一种大容量数据文件抽取算法的优化研究

数据挖掘过程中,对数据文件进行数据抽取是构建数据仓库的重要过程.目前在抽取大容量数据文件时会出现很多局限性问题,如抽取操作出错、数据量无法自动匹配获取及数据库写入速度较低等.为了解决这些局限性问题,对大容量数据文件抽取算法进行了优化研究,提出并设计了一种大容量数据文件抽取算法.实验结果表明,该算法能够优化常规算法的效率,并具有数据容量自适应抽取及数据库快速写入等特点.     

基于智能的网页信息提取系统的研究与设计

随着Internet的迅速发展，为人们提供了大量的信息，但这些信息都包含在网页中，为了使用这些信息数据，需要将数据从网页中提取出来.该文介绍了一种新的基于智能的网页信息提取系统EIES，通过对RoadRunner的改进和利用，在提取过程中不需人工干预，实现了信息提取的智能化.实验表明，该系统能够更准确、更有效的分类相似网页和提取网页信息.     

水波演示的改进

利用水波投影可以非常形象地演示波动的许多重要性质,如平面波,球面波的传播;波的反射和折射;波的衍射、惠更斯原理;波的干涉;都普勒效应等。它在教学上的作用是很大的。为了能够推广这些演示实验,我们对教具进行了多次改进,取得了较好的效果,现将水波演示器的结构、自制要点及演示方法简介如下: