黄角苔叶绿体rbcL基因编码区的序列分析

测定了黄角苔（Ｐｈａｅｏｃｅｒｏｓｌａｅｖｉｓ（Ｌ．）Ｐｒｏｓｋ）叶绿体ｒｂｃＬ基因编码区的１３９８个核苷酸序列,并且由此推导出对应的氨基酸序列．此基因中密码子的第２和第３位上Ａ／Ｔ所占的比例较高,分别为５３６％和７７５％．黄角苔ｒｂｃＬ基因的编码区与花旗松、菠菜、玉米和雷氏衣藻间在核苷酸序列上的同源性分别为８４０％,８１５％,７９３％和７６３％;在氨基酸序列上的同源性分别为９１．０％,８９．９％,８８．５％和８９．３％．为研究角苔植物的系统发育提供了核苷酸序列方面的资料．     

红豆杉科及相关类群叶绿体rbcL基因与trnL—trnF间隔区序列的分支分析

运用对PCR产物克隆后测序和对PCR产物直接测序的方法对红豆衫科、三尖杉科和罗汉松科16种植物的叶绿体rbcL基因和tmL—trnK基因间隔区序列进行了测定。运用PAUP软件分析对rbcL基因、trnL-rtnK间隔区和rbcL基因-trnL-rtnK间隔区联合数据矩阵进行分支分析，结果显示：(1)穗花衫属以置于红豆杉科内为宜，将穗花衫属独立成科的意见未得到支持；(2)三尖衫属内篦子三尖杉的地位特殊，赞同成立篦子三尖杉组；(3)罗汉松科属单系群，竹柏类应归属罗汉松科，不同意将其从该科中分离出来成立新科——竹柏科；(4)不支持红豆杉科独立成目，其单生单轴球果可能是由复合双轴球果减化而来。     

红豆杉科及相关类群叶绿体rbcL基因与trnL-trnF间隔区序列的分支分析

运用对PCR产物克隆后测序和对PCR产物直接测序的方法对红豆杉科，三尖杉科和罗汉松科16种植物的叶绿体rbcL基因和trnL-trnF基因间隔区序列进行了测定，选用PAUP软件分别对rbcL基因，trnL-trnF间隔区和rbcL基因－trnL-trnF间隔区联合数据矩阵进行分支分析，结果：（1）穗花杉属以置于红豆杉科内为宜，将穗花杉属独立成科的意见未得到支持；（2）三尖杉属内篦子三尖杉地位特殊，赞同成立篦子三尖杉组；（3）罗汉松科属单系群，竹柏类应归属罗汉松，不同意将其从该科中分离出来成立新科竹柏科；（4）不支持红豆杉科独立成目，其单生单轴球果可能是由复合双轴球果减化而来。     

白簕(Acanthopanax trifoliatus (L.) Merr)种子的休眠机理研究

药蔬两用的白簕(Acanthopanax trifoliatus(L.)Merr)深受人们喜爱并广泛栽培,种子具有一定的休眠特性.为了探索白簕种子的休眠机理,本研究解剖种子的内部结构、测定种壳(内果皮)的透水性和透气性以及提取果实和种子各部分內源抑制物质并进行生物测定.研究结果表明:1)种胚细小,约为0.3-0.5mm,位于种子一角隅,可能存在生理后熟.2)种壳存在一定的机械束缚和透水透气障碍,相对剥皮种子和缺刻种子,可能导致完整种子萌发启动时间延后.3)白簕果实和种子各部分都可能含有抑制物质,其中果皮中存在活性较强的內源抑制物质,抑制活性为外果皮及果肉内果皮完整果实完整种子种胚和胚乳,且白簕外果皮及果肉、内果皮及完整果实随着抑制物浓度的增加,抑制作用显著增强.由此推测,白簕种子属于生理休眠类型.本研究初步阐明白簕种子的休眠机理,以期为其有性繁殖和打破休眠提供理论依据.     

胎儿心肌钙蛋白T(cTnT)基因的克隆和序列分析

人心肌钙蛋白T(cardiac troponin T,cTnT)可调节肌丝蛋白的Ca2 浓度,从而调节心脏肌肉收缩的肌钙蛋白复合体组成成分之一.在心力衰竭末期,cTnT再度表达.cTnT的mR-NA水平和其蛋白水平升高与心力衰竭密切相关.从正常流产胎儿心脏提取RNA,通过反转录获得cDNA,再利用PCR方法得到目的基因.序列分析证实,得到的基因是正确而特异的cTnT基因,不同人种的cTnT序列同源性很高,达99%以上.全序列有3个碱基与国外报道序列有差别,所编码氨基酸有2个不同.推测其区别可能是人种的差异或胎儿与成人发育期不同造成的.     

新疆汉族食管癌病人ECRG2基因遗传多态性与食管癌易感性关系的研究

为研究食管癌相关基因2（ECRG2）STR多态性与新疆汉族食管癌易感性的关系,在新疆地区进行了一个食管癌研究（食管癌84例,人群对照53例）,采用PCR-SSCP技术检测研究对象的ECRG2 STR基因型.结果显示：ECRG2 STR呈多态性,可分为3种类型：TCA3/TCA3,TCA4/TCA4,TCA3/TCA4,在有转移的食管癌中分布为67.9%、7.1%、25.0%,在无转移的食管癌中分布为14.3%、44.6%、41.1%,两者相比,有显著差异（χ^ 2=26.18,df=2,P＜0.01）.在病例对照研究中,在食管癌中所占比例分别是32.1%、32.1%、35.8%,对照组分别是15.1%、49.1%、35.8%,两组总构成比有显著差异（χ ^2=6.10,P＝0.047）.由此可知ECRG2基因TCA3/TCA3基因型与TCA4/TCA4基因型比较,增加了患食管癌和发生转移的风险.     

北京地区汉族群体D1S1612 STR基因座的遗传多态性

目的首次调查中国北京地区汉族群体D1S1612基因座的等位基因频率分布.方法采用扩增片段长度多态性(Amp-FLP)分型技术对D1S1612 STR基因座进行检测.结果D1S1612检出9个等位基因,25种基因型.其STR基因座基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.01).个人识别机率(DP)为0.901～0.927.结论D1S1612 STR基因座属高杂合度、高识别能力的遗传标记,可用于法庭科学亲子鉴定和个人识别.     

大熊猫核糖体蛋白S26亚基基因(rps26)的cDNA克隆及序列分析

为了解大熊猫核糖体蛋白亚基rps26基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基基因rps26的异同,以大熊猫的肌肉组织为材料,根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S26亚基基因(rps26)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,成功地克隆了核糖体蛋白亚基基因rps26的表达序列,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫rps26亚基基因的表达序列长为413 bp,开放阅读框(ORF)为348 bp,编码115个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为13.025 2×103,等电点为11.61.拓扑预测显示该蛋白含有3个功能位点:1个N-糖基化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ蛄姿峄?位点和1个核糖体蛋白S26e signature位点.进一步分析发现,大熊猫rps26基因与已报道的人、西藏黄牛、野猪、褐家鼠和小家鼠5个哺乳动物物种的表达序列其编码的氨基酸序列具有很高的相似性:编码序列同源性分别为90.23%、91.67%、92.82%、87.36%和86.78%;氨基酸序列同源性均为99.86%.     

一种可用于生物序列分析的轻量级索引结构

针对目前可用于重复片断查询的索引结构所需空间过大的问题,通过对序列中重复片断的分析提出一种轻量级数据结构———后继数组,它是基于基数排序方法建立的.后继数组也适用于多序列分析.理论分析表明了后继数组及多序列后继数组在存储空间上的优势.实验结果表明后继数组仅需要约原序列长度5倍的存储空间,在建立时间上后继数组也要优于后缀树等索引结构.     

日本脑炎病毒(JEV)内蒙古分离株M73-1 E基因的5'端克隆及部分序列分析

根据国外报道的JEV(Japanese encephalitis virus)基因组全序列,针对JEV E基因5'端设计合成一对特异引物,以日本脑炎病毒内蒙古分离株 M73-1 RNA 为模板,经RT-PCR扩增,获得366 bp的JEV E基因cDNA片段.将此片段重组于质粒pUC 19中,并转化大肠杆菌DH5α.经PCR扩增,酶切及序列分析,结果表明JEV M73-1 5'端126个核苷酸序列与JEV日本Nakayama株和JaOArS 982株的同源性分别为96.8%和96.8%,氨基酸序列同源性均为99.2%.通过对病毒基因组结构分析从分子水平上进一步证实了1973年在呼和浩特市流行的脑炎是由JEV引起的流乙脑炎.E基因编码JEV的囊膜糖蛋白,是其重要表面抗原.JEV M73-1 E基因5′端克隆和部分序列分析对JEV的分子生物学研究、建立分子生物学诊断技术以及基因工程疫苗的研制均具有重要学术意义和实际价值.     

短柄五加中的黄酮类化合物

利用抑菌活性追踪法及各种色谱技术从短柄五加Acanthopanax brachypus的根茎中分离出6个黄酮类化合物,通过理化性质和波谱数据对结构进行鉴定为藿香黄酮醇(1)、汉黄芩素(2)、山奈酚-7-O-β-D-葡萄糖苷(3)、牡荆苷(4)、金丝桃苷(5)、黄芩苷(6)。除化合物5外,其余5个化合物均为首次从该植物中获得。抑菌试验表明,短柄五加乙醇提取物中的乙酸乙酯组分,尤其是化合物1、2、4和5对供试菌种显示较强的抑菌活性。     

短柄五加中抑菌活性成分研究

利用抑菌活性追踪及各种色谱方法从短柄五加(Acanthopanax brachypus)的根茎中分离得到6个黄酮类化合物,通过理化性质和波谱数据鉴定化合物的结构分别为:藿香黄酮醇(1)、汉黄芩素(2)、山奈酚-7-O-β-D-葡萄糖苷(3)、牡荆苷(4)、金丝桃苷(5)及黄芩苷(6).除化合物5外,其余5个化合物均为首次从该植物中分离得到.采用体外抑菌活性试验法测定各提取物的抑菌活性.结果表明,短柄五加乙醇提取物中的乙酸乙酯组分,尤其是化合物1、2、4和5对供试菌种显示较强的抑菌活性.     

Cloning,Sequencing and Phylogenetic Study of rbcL Gene from Cyanobacteria Arthrospira and Spirulina

Large subunit gene of rubisco (rbcL) of cyanobacteria Arthrospiraplatensis FACHB341, A. platensis FACHB439, A. maxima OUQDSM and Spirulina sp. FACHB440 is cloned, sequenced and characterized. Results show that GC content of the gene in strain Spirulina sp. FACHB440 is higher than that in the others. The alignments based on deduced amino acid sequences indicate that Spirulina sp. FACHB440 is different from that in other three samples of Arthrospira, though they have the same conserved functional sites (95, 98, 121, 124, 221, 257). The nucleotide sequence similarity among the three strains of the genus of Arthrospira (96.5 - 99.6% ) is higher than that between Arthrospira and Spindina (78.1 - 78.5 % ). By comparison of the corresponding sequence of other cyanobacteria, a phylogenetic tree with two clusters is constructed. A. platensis FACHB341, A. maxima OUQDSM and A.platensis FACHB439 form the monophyletic linage, which is fully supported by bootstrap values (1000), while Spirulina sp. FACHB440 and Anabaena sp. PCC7120 cluster in another linage with the bootstrapvalue of 909.     

耐热碱性磷酸酯酶基因的DNA序列分析

从栖热菌中克隆到产耐热碱性磷酸酯酶（FD－TAP）基因并进行了DNA序列分析,结果表明此2．0kb的片段含有一个1056bp的开放阅读框,编码501个氨基酸的蛋白质,其N端有一26个氨基酸的信号肽．在起始密码子的上游5bp处有一个5＇－GGAGGT－3＇的SD序列．基因编码区的（G＋C）％为68．7％,第3位密码子（G＋C）％为92．7％．FD－TAP的氨基酸序列与大肠杆菌等生物的碱性磷酸酯酶氨基酸序列比较,相同性为27％,相似性为38％．中央β－折叠区及与活性中心相关的氨基酸残基高度保守．表明FD－TAP具有与大肠杆菌碱性磷酸酯酶相似的结构和作用机制．在相当于大肠杆菌碱性磷酸酯酶的His370至His412两个金属离子结合部位之间,FD－TAP有一72个氨基酸的插入片段,提示该插入片段与FD－TAP的高耐热性相关．     

马铃薯天冬氨酸蛋白酶抑制剂基因5′上游调控区的分离和序列分析

利用单一特异引物聚合酶链反应技术，将马铃薯ＤＮＡ中天冬氨酸蛋白酶抑制剂家族一成员的５′上游区分离，并克隆进ｐＵＣ１８质粒ＳｍａＩ位点中．用３２Ｐ中标记的单一特异引物──ＰｒｉｍｅｒＡ为探针，经斑点杂交得一阳性克隆．ＤＮＡ测序获得含有马铃薯天冬氨酸蛋白酶抑制剂基因５′上游区的插入物的核苷酸序列．从这序列结构中见到ＴＡ富含区，并发现典型的调控序列ＴＡＴＡ和ＣＡＡＴ．此上游序列与国外所得到的天冬氨酸蛋白酶抑制剂的上游区相比较在序列和ＴＡＴＡ及ＣＡＡＴ盒的位置上有着很大的不同．     

苦瓜(Momordica Charantia L.) MADS-box基因BAG启动子的克隆分析及表达载体的构建

作者提取苦瓜基因组总DNA，构建了DNA步移文库，并根据已克隆并公布的苦瓜MADS-box基因BAG的基因序列设计引物，通过染色体步移技术克隆出BAG基因起始密码子上游调控序列BAGP．对BAGP的鉴定和分析表明其具备大多数高等植物启动子的保守元件，预测它对BAG基因的表达具有一定的作用．为鉴定BAG基因的基本启动子元件。将基因5′侧翼序列做缺失片段分析，利用PCR方法从BAGP中得到3个大小不等两端带有HindⅢ,BamHⅠ酶切位点的片段BAGPl，BAGP2和BAGP3，定向插入载体pMGFP4(pBI221改建，报告基因为GFP)中，取代原有的CaMV35S启动子，构建了由驱动报告基因GFP的植物表达裁体BAGPVl，BAGPV2和BAGPV3．     

DNA甲基化对杆状病毒极早期和滞早期启动子转录活性的影响

利用体外DNA甲基化酶和荧光素酶报告系统分析了DNA甲基化对杆状病毒苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(Autographa californica multicapsid nucleopolyhedrovirus,AcMNPV)的8个极早期和滞早期基因启动子表达活性的影响.研究结果表明,病毒极早期基因ie1和ie0启动子的活性受到甲基化修饰的强烈抑制,pe38启动子活性受到部分抑制;同时滞早期启动子p35、DNApol、lef1、lef3和lef8的启动子则在甲基化处理后得到一定程度的激活.转染的同时用AcMNPV感染细胞,在多数启动子中并没有改变甲基化处理对它们表达活性的影响,但使其影响程度有所减弱.在另一些启动子(pe38,p35,lef1)中,AcMNPV的感染使甲基化的作用基本消失.这些结果表明DNA甲基化对一些杆状病毒启动子的转录活性有一定的调控作用.