植物真菌致病基因的研究进展

通过标记突变技术,从真菌中找到79个致病基因。这些基因在侵染结构形成、细胞壁降解、克服和避免寄主的防卫反应、毒素产生、信号传递以及对寄主体内环境应答等方面发挥重要作用。随着技术的不断完善,陆续发现了一些具有其它功能的致病基因。本文介绍了近几年这方面的研究进展。     

科学家发现白血病致病新机制

白血病又称血癌，是一种造血组织的恶性疾病。其特点是骨髓等造血组织中有人量白血病细胞无限制地增生，并进入外周血液，而正常血细胞的制造被明显抑制。尽管该病已经成为年轻人的头号恶性疾病“杀手”，但它的深层病因至今仍未完全弄清。     

致病杆菌功能基因的分子生物学研究进展

致病杆菌是与斯氏线虫共生的肠杆菌科细菌,存在于昆虫病原线虫肠道内,可随线虫的侵染进入寄主昆虫血腔,迅速繁殖并产生多种代谢产物,抑制其他杂菌的污染,保护线虫繁殖的环境。多年研究发现,该菌的代谢产物具有广泛的杀虫、抑菌、抗癌等生物活性。本文介绍了致病杆菌外膜蛋白基因、菌毛蛋白基因、共生作用相关基因、溶血素相关基因、杀虫毒素蛋白基因、抗生素相关基因以及专利申请基因的研究进展。     

美科学家发现导致细胞癌变的基因

美国科学家进行的一项新研究表明，如果消除实验鼠体内一个特殊基因的活性，以减少一种蛋白质的产生，就可以使实验鼠的癌细胞转变为无害的正常细胞。     

我国科学家发现家族性心房颤动基因

最近,同济大学医学遗传学研究所所长陈义汉博士等与国家人类基因组南方研究中心徐世杰博士等科研工作者密切合作,找到了一个引起家族性心房颤动(房颤)的致病基因。这项研究成果以论文形式被发表在2003年1月10日出版的《Science》杂志上。     

基于互信息的差异共表达致病基因挖掘方法

为了挖掘基因表达数据中的差异共表达致病基因模块,提出了基于互信息和最大团相结合的方法.互信息用于度量基因表达谱之间的相互关系,计算任意2条基因表达谱在2种不同样本中的互信息值,得到2个互信息矩阵M1和M2,选定2个阈值T1和T2(T1T2)将矩阵M1和M2二值化,并通过M1和M2中元素的逻辑"与"运算得到图的邻接矩阵,从邻接矩阵挖掘出的最大团则为差异共表达致病基因模块.将该方法应用于Colon数据,选定T1=2.2,T2=1.0,得到6个相互重叠的最大团,实验结果表明,该方法能有效挖掘出差异共表达致病基因模块.     

基于网络拓扑相似性预测潜在致病基因

相关疾病基因的发现和预测是人类基因组研究的重要目标.近些年,一些研究者通过基于网络结构的方法来解决这个难题.然而,大多数方法在推理过程中仅使用了局部的网络信息,并且仅限于推理单一基因的关联.并且这些方法很少考虑到疾病-基因关联网络的网络拓扑性.笔者提出一种改进的基于二部图网络结构推理(improved network-based inference)的计算方法.该方法基于已知的疾病-基因网络拓扑相似性来发现更多潜在致病基因.文中使用的是OMIM数据库中的203种疾病的数据,通过留一交叉验证法验证实验,并获得了88.9%的AUC值.与文中提到的另外两种方法相比,该文方法能够有效地预测潜在致病基因.     

基于双层生物模块网络的致病基因预测

为提高致病基因预测的准确性,提出了一种结合多种生物组合数据的生物分子网络构建方法。利用蛋白质相互作用网络、蛋白质复合物和代谢通路构建双层生物模块网络,并设计一种新型异构图神经网络。实验结果表明,与基于蛋白质相互作用组学数据构建生物分子网络的经典方法相比,本方法的AUC和F1分数提高了约1.5%和3.7%。     

比利时 能辨别致病基因的电脑程序

比利时科研人员编写出一种新型电脑程序，它可以汇总，加工多个数据库的基因数据，辨别出与疾病成因有关的基因，为专家寻找更好的诊断和治疗方法提供了有效手段。     

基于双层生物分子网络的致病基因预测

基于“致病基因邻居倾向于引起相似疾病”和“必需基因和致病基因关联较少”的假设,融合蛋白质相互作用和代谢通路,构建双层生物分子网络,提出一种基于双层生物分子网络双流量网络传播的致病基因排序方法。为致病基因和必需基因分配正流量和负流量,挖掘与已知致病基因相似的潜在致病基因。实验结果表明,本方法与基于经典假设的单层网络方法相比,在富集分数1和富集分数2分别提高11.66和13.66。     

丹麦科学家研制出具有“扫雷”功能的基因植物

需要连续几个小时使用振动工具的工人可能会遭受永久性身体损伤，两名美国研究人员认为，他们找到了出现这种情况的原因。     

多国科学家绘出鸭嘴兽基因草图

一个由多国科学家组成的研究小组7日报告，他们成功绘出了鸭嘴兽这一奇特的哺乳动物的基因组草图。这对研究人类和其他哺乳动物进化起源“极为重要”。     

科学家发现“长寿基因”

美国科学家日前通过对芽殖酵母和线虫的基因分析．鉴别出两种生物共有的25个负责调控寿命长短的基因。在这25个“长寿基因”中．至少15个在人的基因组内存在相似版本。这意味着．科学家有可能借此锁定人体内的基因目标．研究如何减缓人的衰老过程．治疗衰老引发的相关疾病     

科学家发现防癌防衰老基因

研究人员在蠕虫体内发现了一些既能防癌又能减缓衰老的基因,他们正在研究这些基因在人体内是否也有同样的作用。人们已知人体内有许多与蠕虫体内相类似的基因,旧金山加州大学研究人员说,她们希望更多地了解引发衰老和癌症的过程。     

水稻白叶枯病菌致病相关基因筛选系统的建立

水稻白叶枯病菌Xanthomonas oryzae pv.oryzae是水稻生产中最严重的细菌性病害之一。本研究采用Tn5转座子随机插入突变的方法构建水稻白叶枯病菌广西菌株K74的突变体库,Southern杂交显示Tn5随机单拷贝插入基因组。通过水稻致病性检测试验,目前获得15个致病力降低50%以上的突变体,为定位Tn5插入突变基因,经质粒拯救、测序、序列分析后发现:4个突变基因为gum基因簇基因,5个为LPS基因簇基因,2个为metB基因,1个为hrpB1基因,2个是与糖合成转移酶相关基因,1个为编码假定蛋白的基因。其中14个突变基因是已知的与致病相关的基因。实验结果表明本研究成功建立了一个筛选水稻白叶枯病菌致病相关基因的系统,为进一步研究水稻白叶枯病致病相关基因,阐明该病的致病机理奠定基础。     

加拿大科学家破解黑死病基因密码

加拿大麦克马斯特大学“古代DNA中心”主管波拿亚和德国图宾根大学克劳斯领导的研究小组成功破解了黑死病基因密码。     

以色列科学家发现与慢性疼痛有关的基因

由神经损伤引发的慢性疼痛,如持续性头疼、背疼、关节疼等,是一种常见症状,全球大约有20％的成年人受其困扰。我们知道,有些人比其他人更容易患慢性疼痛,而且对不同的人来说,即使经历同样的损伤,疼痛感也会不一样,但是究竟是什么原因导致这种现象却无人知晓。     

基因外显子测序方法同样可以准确找出致病基因

外显子是人类基因的一部分,包含着合成蛋白质所需要的信息。全部外显子,称为“外显子组”（exome）,只占人类基因组的1％。测定外显子序列只需针对外显子区域的DNA即可,因此远比进行全基因组序列测序更简便、经济,已成为现阶段基因测序工作的重心。