国外科技

生命密码破解在即 英国韦尔科姆基金会3月15日宣布,由于英、美等国科学家加快工作步伐,破译人类生命密码的工作大大加快。人类基因组工程的第一个“工作草图”有望于明年2月绘出,这将比原计划提前至少一年。 这一“工作草图”将包括人体总共约10万个基因中的90％,是最终绘出完整人类基因图谱的基础。“工作草图”绘出后,科学家将对其中测序上的不准确之处进行完善和修改,同时补上余下的待测部分。 按照去年9月的估计,“工作草图”     

知识窗

6月26日是人类生命科学史上一个值得纪念的日子。美国总统克林顿与美国两大人体基因研究组织的科学家在白宫联合宣布,人类基因组工作草图已经绘出,人体全部基因的初步测序研究工作完成。这项重大研究成果标志着人类在研究自身的过程中迈出了关键的一步。     

多国科学家携手绘制人类基因多态性图谱

为了破译人类遗传信息,美国、英国、法国、德国、日本和中国的科学家1995年正式启动了人类基因组计划。这一历时10余年的人类基因组计划,通过测序完成了人类染色体中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列的全部草图,解开了人体10万个基因密码,并绘制出了人类首张基因谱图。继人类基因组计划之     

基因生物产业向我们走来

6月26日,美、日、德、英、法、中6国科学家同时宣布人类基因组工作草图绘制完成。这一成就被认为是破译人体全部基因密码的初稿。工作草图覆盖了人体97%的基因组,并精确地测定了其中85%的基因组序列,它包含了人体约30亿对碱基对的排序。据国家"863"计划生物技术领域首席科学家强伯勤、国家医学分子生物学重点实验室研究员沈岩、北京生物技术产业促进中心负责人雷霆等专家介绍,基因是控制人类生物遗传性状的基本单位。人类基因组包含了决定一个人的生、老、病、死以及精神、行为等全部遗传信息。20世纪80年代初美     

基因专利之争没有硝烟战争

“基因淘金”热引出专利权“圈地运动”蔓延基因研究2001年6月26日，“人类基因组草图”已经绘制完毕的消息公布于世。这一由美、英、日、法、德和中国科学家参加、被誉为生命科学的“登月计划”的人类基因组草图绘制工作，立即在全世界引起了“基因淘金”的热潮。几个月来，世界大企业将基因视作网络经济之后的又一“生财良机”，纷纷抢占技术地盘，试图在有限的资源战中占据有利位置。像美国化学巨头杜邦已经花费94亿美元，收购一家种子公司，力图通过基因育种技术向生命科学靠拢。基金淘金潮中，最为激烈的莫过于对基因专利的争夺。基因…     

基因的商业价值

据2月12日6国科学家公布的人类基因组研究最新成果,人体共有约3-4万个基因。人类基因组只有一套,世界各国投入巨资寻找基因的研究实为一场“基因抢夺战”,“基因侦探们”在这3-4万个基因中逐个探索,一一破译,发现一个少一个,能抢一个是一个:谁占有较多的基因专利,谁就将在人类基因的商业开发方面(包括基因药物、基因诊断、基因治疗等)抢得先机。生物医药企业只有在获得     

新型医疗设备在抗癌中崛起

据有关研究表明,癌症病人的机体与人体基因有关。人体患有癌症有三种原因,一是人体伏有致癌基因;二是具备引起癌细胞发作的条件;三是人体缺少抑制癌细胞的基因。世界各国都在力图通过基因工程技术,作为攻克癌症的突破口。由美国发起的13国组成的联合会已投资30亿美元。拟用15年的时间将人体基组3×10~9碱基序列约10万个基因密码译出。日本一公司研制出一种自动装置,每年能“阅读”300     

基于GEO数据库和转录因子调控网络的结核病药物作用靶点筛选及其作用机制

目的 基于GEO数据库和转录因子调控网络筛选抗结核病药物及药物作用靶点。方法 通过NCBI的GEO数据库,筛选结核病患者和健康者之间差异表达的基因;通过AnimalTFDB 3.0数据库预测差异表达基因中的转录因子,并构建转录因子调控网络;通过调控网络中的关键基因筛选相关miRNA,并筛选关键节点,初步阐明结核病致病的分子机制。结果 通过GEO数据库检索,筛选出的差异表达基因为784个;通过AnimalTFDB 3.0数据库筛选出23个转录因子和对应的790个靶基因,构建了转录因子-靶基因的调控网络;通过TargetScanHuman 7.2查询到关键节点对应的miRNA,构建“转录因子-靶基因-miRNA”调控网络,筛选出4个结核病药物靶点(EP300,CREBBP,ELAVL1,HSP90AA1),阐明了其与转录因子和miRNA之间的调控机制。结论 通过构建结核“转录因子-靶基因-miRNA”网络,筛选出结核病新的潜在药物作用靶点——EP300、CREBBP、ELAVL1、HSP90AA1;同时发现,EP300、CREBBP、HSP90AA1通过激活转录因子STAT2,导致机体内炎...     

国产大蒜凝集素基因的克隆与生物信息学分析

为了获得国产大蒜新的凝集素家族基因,根据NCBI数据库中已公布的大蒜凝集素基因序列设计引物,从国产大蒜的鳞茎中提取总RNA,采用RT-PCR技术分离克隆出一个大蒜凝集素基因,命名为ASA-C。ASA-C全长546 bp,包含1个471 bp的ORF,编码156个氨基酸的多肽。利用网站和分析软件对其进行生物信息学分析。结果 表明：ASA-C与已公布的同源二聚体大蒜凝集素ASAⅡ基因具有较高同源性;推测该基因编码多肽的N端有一典型跨膜结构域的信号肽,多肽序列上有3个甘露糖特异性结合凝集素共有基序（Q-D-N-V-Y）。多重序列比对以及系统进化树的结果 表明大蒜凝集素的保守性很强,这为进一步开发利用大蒜凝集素蛋白的功能奠定了基础。     

人类基因和果蝇基因的富矿可能遗漏?

不断有研究人员指出,已经公布的人和果蝇的基因数遗漏了大量的真正的基因。“人类基因组科学”生物技术公司称,人类基因遗漏了50000个。斯坦福大学的研究人员称,塞莱拉公司的果蝇基因测序与公立人类基因组公布的果蝇基因有一半的差异。塞莱拉公司也透露,他们正在研究人类基因组变体,不久将公布变体图谱以完善人类基因组图谱。     

基因疗法——人类生命福音

今年6月26日,美、英、法、德、日、中等国科学家共同宣布,人类基因组工作草图已经绘出,人体全部基因的初步测序研究工作已经完成,科学家们将深入研究与各种疾病有关的基因、疾病基因与其他基因及环境的相互作用等。预计到2010年或2020年,基因疗法将成为一种普通的治疗方法。人类的3000多种疾病大都具有遗传性,科学家们早就认为只有从基因修复人手才能根治许多疾病,这种通过基因修复治病的方法就是基因疗法。我们可以将健康和正常的基因通过某种载体导     

水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析

从公布的水稻两个亚种（籼稻9311和粳稻Nipponbare）基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异：内含子和基因间区中微卫星的多态性较高（分别约为45%和40%）,外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低（约为25%）;两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。     

基于网络药理学与分子对接探讨“萆薢-菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制

应用网络药理学与分子对接揭示“萆薢-菟丝子”药对治疗慢性前列腺炎的分子机制,为其临床应用提供新的理论依据及研究思路.从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得“萆薢-菟丝子”药对主要活性成分,利用PubChem数据库以及SwissTargetPrediction平台数据库获取主要活性成分的药物靶点,由GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库中获得慢性前列腺炎疾病相关靶点,与先前获得的药物靶点进行交集,获得共有靶点.利用DAVID 2021在线数据库对共有靶点进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;应用STRING11.5在线数据库构建共有靶点蛋白互作网络(PPI)分析;最后通过Discovery Studio2019对靶点蛋白与关键化合物进行分子对接评价.共筛选出13个“萆薢-菟丝子”主要活性成分,包括Diosgenin薯蓣皂素、Sesamin芝麻素、NSC63551柱头甾醇、Isorhamnetin异鼠李素、beta-sitosterol β-谷甾醇等;药物靶点312个,与疾病...     

DNA序列数据的聚类挖掘

玻译基因图是二十一世纪最重要的任务之一．人类基因草图绘制后,接下来需要寻找各种基因的精确位置,研究各种基因的功能等．为此,必须对DNA序列片段进行分类,然后归类研究。本文分别从数学、物理、化学三个角度讨论了40个人工DNA序列和182个自然DNA序列的分类问题,提出了一些设想。     

基因专利之争:没有硝烟的战争

"基因淘金"热引出专利权"圈地运动"蔓延基因研究 2001年6月26日,"人类基因组草图"已经绘制完毕的消息公布于世.这一由美、英、日、法、德和中国科学家参加、被誉为生命科学的"登月计划"的人类基因组草图绘制工作,立即在全世界引起了"基因淘金"的热潮.     

“生物钟”基因的发现

日本东京大学医学研究所等机构宣布,他们发现了人体“生物钟”基因,从而填补了此项研究的空白。他们对人体与果蝇的“生物钟”基因进行观察发现,人体有17条染色体,老鼠有11条染色体,此外还查明了哺乳类动物“生物钟”位于丘脑下部的“视交叉上核”部位。老鼠的“视交叉上核”基因以24小时为一周期运动。美国于去年5月在老鼠体内发现     

浅析建筑草图与符号的关系

建筑草图是建筑师设计前期的重要工作。它既是构思、想像到抽象表现至具象表现的过程，也是符号表现到形象造型表现的过程。文章从建筑草图的视觉和草图符号的设计两个方面探讨了视觉符号与建筑草图的关系，强调建筑草图的重要性及符号草图到设计形象的转换，乃至互换的过程。     

复旦大学科学家发现东亚人特有“解酒基因”

复旦大学现代人类学研究中心李辉博士研究组最近公布一项最新研究成果,发现了能够分解酒中毒素的解酒基因,这一研究成果发表在最新一期的英国《人类遗传学年报》上。这种解酒基因实际上是乙醇脱氢酶基因的一种变体。乙醇脱氢酶的功能主要是将人体摄入     

三七-白及药对作用机制的网络药理学分析

通过网络药理学的方法,研究三七-白及药对在疾病治疗过程中潜在的药理作用机制.采用TCMSP数据库筛选三七-白及药对的活性成分和作用靶点,并用Uniprot数据库校正靶点信息得到靶点基因,利用CTD数据库获得靶点基因相关的疾病类型,通过STRING数据库构建靶点蛋白相互作用网络,分析得到核心蛋白,运用DAVID数据库富集分析靶点基因参与的基因本体论(GO)生物学过程及京都基因与基因百科全书(KEGG)通路.共筛选得到17个活性成分,涉及193个作用靶点.结果表明:槲皮素、β-谷甾醇和豆甾醇的作用靶点数目最多;靶点基因与35类疾病相关,主要包括癌症、神经系统疾病、心血管疾病等;蛋白相互作用网络分析得到核心蛋白AKT1,MAPK1,c-Jun,P53,TNF等;靶点基因主要涉及药物反应,RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等91条GO生物学过程,KEGG通路显著富集到癌症通路、乙型肝炎等66条通路,与前述疾病分析结果相符.     

BioStarM-140s芯片基因信息查询系统的构建及应用

应用生物信息学数据库查询的方法,对B ioS tarM-140s小鼠基因表达芯片上的14 112个基因进行相应注释信息的查询和所对应蛋白质功能的分类.首先参照人类综合型芯片上基因的功能分类,设定了14个蛋白质类别,然后采用V isual C 编程语言,构建了基因信息查询系统.应用该查询系统,进行了网络生物学数据库信息资源的自动直接查询,共搜索到有注释信息的基因12 070个;进一步按照所设定的14个蛋白质类别对12 070个基因进行分类查询,搜索到了与这14个分类相符合的、具有详细蛋白质功能注释信息的基因共1 606个.