人类新基因电子克隆的自动化软件系统建立和实验验证与功能研究

 中国博士后科学基金资助项目《人类新基因的电子克隆、实验确认与功能研究》获得的结果与结论如下 :电子克隆到100个人类新基因 ,具有典型基因特点和一定功能结构域 ,其中23个基因被GenBank接受并被国际人类基因组组织（HUGO）基因命名委员会批准 ;首批选择10个基因用RT -PCR和cDNA测序验证 ,结果证明均是真实基因 ;这些基因的进一步确认和体内外功能鉴定正在实施中 ;采用生物信息学分析与实验确认相结合的技术路线 ,用我们克隆的基因在非冗余数据库对比发现 ,网上发布的计算机注释人类基因组编码序列存在各种类型的多处错误。     

我国科学家电子克隆百个新基因、纠正编码序列错误,首次在国际人类基因组大会上获奖

北京大学人类疾病基因研究中心博士后张德礼等人的论文《人类新基因的电子克隆与实验确认》 ,在不久前召开的第七届国际人类基因组大会上获Ｐｏｓｔｅｒ论文奖。这是我国大陆科学家首次在国际人类基因组大会上获奖。张德礼博士同时接受了国际人类基因组组织（ＨＵＧＯ）基因命名委员会授奖代表ＤｒＥｌｓｐｅｔｈＢｒｕｆｏｒｄ和ＤｒＭａｔｈｅｗＷｒｉｇｈｔ亲笔推荐他为国际人类基因组组织成员（ＨＵＧＯｍｅｍｂｅｒ）的信函。这是一种很大的荣誉 ,因为ＨＵＧＯｍｅｍｂｅｒ为数有限。这次大会共审定录用了６８０篇会议论文参加Ｐｏｓｔ…     

我国科学家电子克隆百个新基因、纠正编码序列错误,首次在国际人类基因组大会上获奖

 北京大学人类疾病基因研究中心博士后张德礼等人的论文《人类新基因的电子克隆与实验确认》 ,在不久前召开的第七届国际人类基因组大会上获Poster论文奖。这是我国大陆科学家首次在国际人类基因组大会上获奖。张德礼博士同时接受了国际人类基因组组织（HUGO）基因命名委员会授奖代表DrElspethBruford和DrMathewWright亲笔推荐他为国际人类基因组组织成员（HUGOmember）的信函。这是一种很大的荣誉 ,因为HUGOmember为数有限。这次大会共审定录用了680篇会议论文参加Poster论文竞赛 ,其中仅有5篇论文获奖 ,英、美、俄、我国大陆和台湾省各1篇。     

电子克隆新基因

随着基因定位和人类基因组测序及生物信息技术的迅猛发展,特别是人类基因组工作框架图和精细图谱及其初步分析结果的先后公布,表达序列标签(EST)已成为人类寻找未知功能的新基因以及克隆不同时空差异表达基因和疾病相关基因的重要标志物.从理论上讲,人类全套cDNA含有所有人类基因的不间断蛋白编码区,一经测出既有序列克隆又有物理克隆的人类完整cDNA,就将提供全面系统分析蛋白功能并最终认识人类生命活动本质的分子基础.     

人染色体17q12区雨330kb范围内表达顺序的筛选

用定位于人染色体17q12区带的长约330kbYAC克隆500D09（取自法国人类多态性研究中心YAC库）作为杂交探针，筛选人骨髓、胎脑、胎肾、骨骼肌和睾丸等五种组织的cDNA库（2×105～3×105pfu／库），从中获得102个初级阳性克隆．初级克隆经PCR扩增，分别与人基因组DNA、酵母基因组DNA和人rDNA探针作dotblot杂交分析，排除其中假阳性克隆后，复筛得到32个候选克隆．对其中2个候选克隆B4511和S5511分别测定143bp和147bp序列．经查新和同源性分析，这两个片段与已知基因的同源性均小于50％，提示它们可能是来自于新基因的表达顺序．     

人类基因组计划及研究

近年来,采用ＤＮＡ序列测定、基因克隆、基因组文库的构建等方法对人类基因组进行了研究,完成了大部分人类基因组的物理图谱、转录图谱及单核苷酸多态性图谱的分析。进而发现、克隆和研究了许多新基因,如青光眼基因、肿瘤抑制基因等,这些结果使人类第一次在分子水平上认识自我,并有助于从人灰基因组中去除有害基因。最后本文探讨了人类基因组研究可能带来的问题。     

计算机辅助基因克隆的Oracle数据库系统

计算机辅助基因克隆的Oracle数据库系统利用SwissProt数据库获取已知的基因, 用 Blast程序从人类基因组序列中搜索与该基因同源的染色体DNA片段, 并将Blast返回的结果 存储于Oracle数据库. 使用者选择所感兴趣的Blast结果, 用本文所提供的算法及前端程序 合成这些DNA片段, 从而实现计算机辅助克隆新基因.     

人类新基因的研究

余龙教授课题组应用基于“蛋白质的四种方式进化”的假设而设计的“四级同源筛选法” ,分离和克隆到人类新基因 2 5 3条 ,已全部在ＧｅｎＢａｎｋ登录 ,其中 90条有潜在开发应用价值的基因 ,已申报了中国发明专利 ,从中选出 6条有直接开发应用价值的基因 ,申报了国际ＰＣＴ发明专利 .所克隆基因中 ,有 5 1个基因的组织表达谱 ,基因组结构 ,染色体定位等特征得到阐明 .相关论文已分别在Ｇｅｎｏｍｉｃｓ,ＢｉｏｃｈｅｍｉｃａｌＪｏｕｒｎａｌ,Ｇｅｎｅ等国际刊物上发表人类新基因的研究$遗传工程国家重点实验室…     

黑曲霉(Aspergillus niger)三磷酸甘油醛脱氢酶基因(GPD)的序列测定与同源性分析

ｐＡＮＧＰＤ是用构巢曲霉ＧＰＤ基因片段为探针,从黑曲霉基因组文库中筛选到的一个三磷酸甘油醛脱氢酶基因（ＧＰＤ）阳性克隆．作者对该阳性克隆进行了亚克隆和序列测定,结果表明,基因片段总长２４４１个核苷酸（ｎ．ｔ）,其中５’－端非编码区长９８１ｎ．ｔ,编码区（从起始密码子ＡＴＧ到终止密码子ＴＡＧ）长１４４６ｎ．ｔ,３’－端非编码区长２４ｎ．ｔ,基因启动子区含有ｇｐｄ－盒和ＣＴ－盒序列,但无明显的ＣＡＡＴ盒和ＴＡＴＡ盒序列．ＧＰＤ基因由７个外显子和７个内含子构成,外显子全长１００８ｎ．ｔ,编码的蛋白质长３３６个氨基酸残基．通过序列比较分析,发现该基因与构巢曲霉的ＧＰＤ基因有许多相似之处;它们的基因启动子序列都含有ｇｐｄ－盒和ＣＴ－盒,其同源性分别为９６％和６５％;推测的两个ＧＰＤ蛋白的氨基酸同源性高达９０％;两个基因所含内含子数目及位置相同．     

糖皮质激素对神经元快速作用的非基因组机制——膜受体假说

甾体激素可自由弥散通过细胞膜,进入细胞后与细胞核内（核）受体结合,从而改变基因的转录活动,改变新蛋白的合成,然后发动生物学效应,这一机制被称为基因组机制,这种作用一般缓慢而持久,但甾体激素对神经系统有快速效应,它很难用传统的基因组机制解释。根据实验结果提出：甾体激素之一的糖皮质激素（ＧＣ）可能还有另一种作用,即它通过神经元质膜上的膜受体起快速的作用,相应的机制即非基因组机制。一系列实验表明,ＧＣ可     

荔枝龙眼炭疽病和霜疫霉病的识别与防治

总结了荔枝龙眼重要病害炭疽病和霜疫霉病的症状、病原、发生规律及综合防治措施;指出荔枝龙眼炭疽病和霜疫霉病主要为害叶片、花穗和果实,叶片早落,花穗干枯死亡,果实腐烂并产生异味;两种病害为害造成的损失很大,防治必须及时,且防治措施以农业防治和化学防治为主。     

中胚花筒螅辐射幼体附着和变态及其温盐效应

研究了中胚花筒螅辐射幼体的附着和变态过程以及不同温、盐度对辐射幼体附着和变态的影响．结果表明幼体的附着分为暂时性附着及永久性附着两个阶段；幼体附着变态的适宜盐度范围为23～41；适宜温度范围为13～21℃；在较低温度下（9～17℃），幼体可逆性ATT附着时间延长，有利于幼体对附着基底的选择及幼体的扩散．     

中胚花筒螅辐射幼体附着和变态及其温盐效应

研究了中胚花筒螅辐射幼体的附着和变态过程以及不同温、盐度对辐射幼体附着和变态的影响.结果表明幼体的附着分为暂时性附着及永久性附着两个阶段;幼体附着变态的适宜盐度范围为23～41;适宜温度范围为13～21℃;在较低温度下(9～17℃),幼体可逆性ATT附着时间延长,有利于幼体对附着基底的选择及幼体的扩散.     

镁合金板带生产应用现状与发展前景

通过对目前镁合金板带的生产技术、工艺设备和产品应用现状等方面的描述,分析了其生产与应用的特点.同时,通过介绍镁合金板带生产工艺的开发现状,探讨了其发展趋势与前景,尤其是以热轧开坯进行卷式法生产的可能.     

桩土摩擦粘着特性及分析方法

同一土层的桩侧摩阻力在不同条件下取值会有很大区别,因此有必要对桩侧摩阻力的影响因素进行分析。分析了桩土的摩擦粘着机理,指出影响侧摩阻力的因素主要为桩土界面强度及土层强度,其中桩土界面强度包括界面摩擦力和界面粘着力两部分。根据机理分析提出使用有限元法配合试验结果进行分析应包括两方面的(1)根据试验实测结果通过试算确定侧摩阻力极值由桩土界面强度决定还是由土层强度决定;(2)若侧摩阻力由界面强度决定则根据土层特性进行摩擦系数假定,进而确定界面摩擦力及粘着力。介绍了ADINA建模及计算过程。通过应用一组混凝土短桩的静载试验结果进行计算分析来说明分析过程。     

科技出版与科技学术道德

本文从科技出版的角度探究和思考了当前关注的学术腐败问题，对学术腐败产生的原因、学术腐败在科技出版中的表现以及科技出版如何抵制学术腐败进行了分析，提出了解决问题的意见。     

海洋科技发展演变的影响因素及规律探析

海洋科技在漫长的发展演变过程中,由于多种因素的交织作用而形成了特有的发展规律。基于分析影响海洋科技发展的诸如政治、经济、军事等各种因素,探讨海洋科技发展演变规律,有利于深层次理解海洋科技的发展历程、正确把握其发展脉络,并对未来的走势作出科学预测。     

毕业设计(论文)质量监督体系的设计与实践

毕业设计(论)是一项重要的教学环节。本从毕业设计(论)选题、过程监控、答辩、质量评价等方面，提出了提高本科生毕业设计(论)质量的一些方法措施。     

模具开放性和综合性实验教学的改革与实践

为了既培养塑性成形与模具专业方向本科学生的动手能力,又充分利用实验室的教学资源,在实践教学中引入了模具开放性和综合性实验环节.这不仅推进了实验教学改革,也调动了学生的学习积极性和主动性,增强了学生的模具设计能力,同时,学生的综合素质和动手能力也得到了提高.     

CAI系统的设计原则,方法与课件的开发,管理

本文提出了计算机辅助教学系统教学软件设计的三大原则及其相应的方法。并通过开发一个PASCAL课程软件,说明课件开发过程及其系统结构。最后给出了教学软件的评价标准。