中国对虾遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA技术,对中国对虾的3个野生地理群体--朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体、黄渤海中国沿岸群体和一个人工累代养殖群体进行了遗传多样性研究.用一组随机引物,对每个群体各20尾对虾的基因组DNA进行扩增,共获得110个重复性好且谱带清晰的RAPD标记,68.2%的标记在所有个体间保持稳定的一致性,表明中国对虾的遗传多样性水平偏低.4个群体的多态位点比例在20%～33.3%之间,群体内的遗传多态度为0.0093～0.0307.群体间遗传变异高于群体内.不同群体间遗传变异水平不同,朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体相近且高于黄渤海沿岸群体,累代养殖群体遗传变异度最低.通过成对的遗传距离分析,用非加权的组平均法构建了上述4个群体中国对虾的谱系关系图,该聚类分析的结果与中国对虾在黄渤海的地理分布相吻合.     

基于RAPD技术的红花品种遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术分析了国内11个省的20个红花品种间的遗传多样性.从筛选出的20个引物中,共扩增出209个位点,其中多态性位点178个,平均多态性比率为85.17%.采用成对算术平均数的非加权成组配对法(UPMGA)对Nei’s的一致度进行的聚类分析结果表明川红花和陕红花的遗传距离最近(0.206 5),太空1号和虞城红花的遗传距离最远(0.571 6).在遗传距离为0.38处将20个红花品种分为4个类群.其中云红3号、亳州红花、延津红花、延津大红袍、南阳红花、卢氏草红花、义县红花、白沙1号、太空1号、杞县刺红花聚为一类,该类群中大多数为河南道地红花品种,说明红花不同品种之间的遗传多样性可能与地理分布存在一定相关性.     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

利用RAPD标记分析甜瓜种质资源遗传多样性

应用17条随机引物分析了41份甜瓜种质的遗传多样性,结果表明甜瓜存在较大的遗传差异,其遗传距离的变异幅度在0．06-0．48之间,平均为0．31;厚皮甜瓜种质之间的遗传距离比薄皮甜瓜的大,而且厚皮甜瓜不同种质之间也可能存在较大的遗传距离,说明厚皮甜瓜与薄皮甜瓜之间或不同厚皮甜瓜种质之间配制的杂交组合可能有较强的杂种优势．41份甜瓜种质聚为两类：一类包括18份厚皮甜瓜、17份薄皮甜瓜和2份野生甜瓜种质,另一类包括4份厚皮甜瓜种质．     

日本对虾野生和养殖群体遗传多样性的RAPD分析

为加深和丰富对我国最为重要的经济虾类之一日本对虾(Penaeusjaponicus)遗传多样性的认识,分析了日本对虾一个野生地理种群(台湾海峡北部)及其移植到北方水域进行繁育的养殖群体各23个个体的随机扩增DNA多态性.实验选取OPK组20个10bp随机引物中的17个产生效果稳定的扩增结果用于群体遗传多样性分析,在两个群体中共检测出155个位点,野生种群和养殖群体的多态比例分别为85.14%和78.62%.用经修正的Shannon表型多样性指数量化两个群体的遗传多态度,野生种群和养殖群体的遗传多态度分别为0.214和0.201;两群体的遗传相似度为94.20%,遗传距离为0.058.     

云南栽培灯盏花遗传多样性RAPD分析

对采自云南大理、泸西、玉溪等地的12份灯盏花种质资源进行遗传多样性RAPD(random amplified polymorphic DNA)分析和NTSYS2聚类分析.10个RAPD引物在12份灯盏花种质资源种共产生43条DNA片段,其中32条带具有遗传多态性,约占74.41%,12个地方种质资源被聚为2个大类,野生居群被聚为一类,栽培灯盏花聚为一类,其中栽培灯盏花有4大亚类.云南栽培灯盏花种质资源遗传多样性丰富,遗传关系与其采集地的地理分布具有密切关系,但并非严格按地理界限聚在一起.     

榛子种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术,对来自欧洲、美国和我国北方的共48份榛子品种或品系（包括4个种及种间杂种）的遗传多样性进行了分析．从150条随机引物中筛选出24条引物,共扩增出142条清晰可重复的带,其中多态性带130条,比例为91．5％．聚类分析将48份榛子种质分为5组：欧榛、平榛各自列为1组;杂交榛分成2个组;另外一组包括滇榛和藏榛2份种质．研究结果对榛子的种间亲缘关系进行了验证,且为同种不同品种的亲缘关系提供了更为详细的信息．     

罗氏沼虾遗传多样性的RAPD研究

采用ＲＡＰＤ技术,对２０世纪７０年代从马来西亚引进的７对罗氏沼虾后代的养殖群体和９０年代从新加坡引进的天然群体的Ｆ１与养殖群体交配繁殖的后代的遗传多样性进行了研究。     

胡卢巴种质资源RAPD遗传多样性分析

在优化随机引物扩增多态性DNA标记（RAPD）反应体系和条件的基础上,利用筛选的多态性引物分析了胡卢巴种质资源的遗传多样性．结果表明,19条RAPD引物显示了40份胡卢巴种质资源的遗传距离为0．02～0．70,来源上变幅从大到小为：宁夏和国外种质间、国外种质间、宁夏种质间、国内其他省份种质间．40份胡卢巴种质资源分为两类,即Ⅰ类包括3份国外种质;Ⅱ类包括37份种质,可大体上分为宁夏、国内其他省份和国外种质3个亚类．     

31种石斛属植物的RAPD遗传多样性分析

采用随机扩增多态性DNA技术对31种石斛属植物的遗传多样性进行分析.从100条RAPD引物中共筛选出18条引物,18条引物共扩增出1802条带,其中多态性位点有261个,多态性比为99.2％.UPGMA 聚类结果显示,基因型之间的相似系数分布于0.642～0.838之间,31种石斛属植物样品分为7类.聚类分析显示供试样...     

马氏珠母贝遗传多样性的RAPD分析

采用ＯＰＭ组２０个碱基随机引物对海南三亚（ＳＹ）,海南洋浦港（ＹＰ）,广西涠洲岛（ＷＺ）的３个天然群体和广东雷州人工养殖群体（ＬＺ）的马氏珠母贝进行了ＲＡＰＤ分析。其群体内的平均遗传相似度（ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ,Ｓ）分别是０．５８６６,０．６５１４,０．６６６６,０．７１５８,由低到高依次为ＳＹ〈ＹＰ〈ＷＺ〈ＬＺ;群体内的遗传变异度（ｖａｒｉａｂｉｌｉｔｙ,Ｖ）分别是０．４１３４,）．３４８６,０     

短枝木麻黄地理种源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记对35个短枝木麻黄（Casuarina equise fifolia）种源的遗传多样性和亲缘关系进行了分析．15个随机引物共扩增了出201条DNA带．其中148条为多态性带，占73．63％．平均每个引物扩增出9．9条多态性带．种源的Shannon’s多样性指数为0．4354，Nei’s基因多样度为0．2884，表明短枝木麻黄种源的遗传多样性水平较高．35个种源彼此的遗传距离在0．0884～0．7539之间，平均0．4045．经过UPGMA聚类分析将35个种源划分为A、B、C、D、E、F6个类群。其中A群5个种源，B群17个种源，C群4个种源．D群2个种源，E群1个种源．F群6个种源．     

苔藓植物RAPD应体系的建立及遗传多样性分析

以多枝青藓为材料优化RAPD反应条件,在此基础上对11种苔藓植物进行遗传多样性分析.结果表明:苔藓植物RAPD反应(25μl体系)的最佳条件为,Taq酶,1.0U;Mg2+浓度,2.0 mmol/L;dNTP浓度,0.2 mmol/L;模板DNA,60 ng;引物浓度,10 pmol.用40条引物进行扩增筛选,有6条引物扩增条带清晰,重复性好,共扩增出77条带.通过SPSS11.5分析软件对扩增结果进行聚类分析,结果与形态学分类基本一致,说明RAPD技术可用于苔藓植物的遗传多样性研究.     

尼罗罗非鱼RAPD标记及其遗传多样性分析

采用 4 18个引物对尼罗罗非鱼进行了RAPD分析 ,筛选出 4 6个重复性好、可用于尼罗罗非鱼RAPD标记的引物 .另用 12个引物对尼罗罗非鱼群体 (2 3尾 )进行了遗传多样性分析 :共检出 5 8个位点 ,其中 18个位点表现出多态性 ,多态位点比例达 31.0 3% ,其群体的Nei&Li氏遗传相似率为 90 .2 3% ,申农信息指数为0 .10 0 5bit.上述三项指标表明 ,该尼罗罗非鱼群体保持着较高水平的遗传变异 .     

RAPD技术在遗传多样性研究中的应用

近几年来，RAPD技术在遗传多样性研究中的应用取得很大进展，就其在收集种质资源、遗传育种物种进化及鉴定、基因组图谱构建和基因定位及分离等方面的应用进行了综合评述，并对RAPD的优点和缺点及对策进行详述。     

基于RAPD标记的罗布麻野生居群遗传多样性分析

利用RAPD技术对采自我国8个省份的9个罗布麻野生居群进行遗传多样性分析.从80条随机引物中筛选出17条引物,共扩增出157条带,其中多态性带108条.物种水平的多态位点百分率(PPB)为68.79%,Nei’s基因多样性指数H为0.2296,Shannon’s多态性信息指数I为0.3390.居群间的遗传分化系数Gst为0.8841,即11.59%的遗传变异来自于居群内,88.41%的遗传变异来自于居群间,居群间的遗传分化水平远高于居群内.居群间遗传距离与聚类结果显示各居群间的亲缘关系与地理分布不完全相关.针对现有罗布麻的遗传多样性现状,建议加强对现有自然居群的保护.     

银木和樟树遗传多样性与亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD技术分析银木和樟树的遗传多样性与亲缘关系.用筛选出的12条引物从7株银木和7株樟树中共扩增得到91条DNA带,其中多态性条带48条,多态性条带比率为52.7%.根据Nei-Li方法进行的遗传相似性分析表明,银木植株间的遗传相似性系数在0.457～0.781,平均为0.564;樟树植株间的遗传相似性系数在0.646～0.862,平均为0.777;银木与樟树间的遗传相似性系数在0.318～0.531,平均为0.422.根据RAPD结果进行的聚类分析正确地将银木与樟树各聚为一类.这些数据说明银木植株间的遗传多样性大于樟树植株间的遗传多样性,银木与樟树之间的亲缘关系小于两种植物内部个体间的亲缘关系.     

外来入侵种空心莲子草的RAPD遗传多样性分析

基于随机扩增多态DNA(RAPD)方法,对8个居群空心莲子草Agasicles hygrophila的遗传多样性及分化程度进行分析。10条随机引物扩增出99个可分析位点,多态位点百分比为36．3％。POPOGENE分析发现,空心莲子草居群平均水平的多态位点百分比为26．2％,Nei’s基因多样度为0．0906,Shannon信息指数为0．1609,具有较高的遗传多样性;居群间遗传分化比例为30．88％,居群内遗传分化占69．12％;居群间基因流为1．1189。结合居群遗传多样性及UPGMA聚类分析表明,镇江及南京地区是空心莲子草遗传变异程度最高的中心区,应该作为外来种空心莲子草防治及根除的重点地带,防治的最有效措施是加强对其无性繁殖体临近传播、蔓延和扩散途径的阻断。     

利用RAPD技术对蒙古韭不同居群的遗传多样性研究

采用RAPD方法分析了内蒙古野生分布的蒙古韭(Allium mongolicum Regel)10个不同居群的遗传多样性、遗传分化和遗传距离等.12个随机引物扩增出的多态带占总谱带的 95.65%;总的遗传多样性为0.2977;1.74%的遗传变异存在于居群间,而98.26%的遗传变异都存在于居群内部;遗传距离在0.2177～0.5965之间;地理距离与遗传距离不相关.     

唐鱼野生与养殖群体遗传多样性的随机扩增多态DNA(RAPD)分析

应用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术对唐鱼野生与养殖群体的遗传多样性进行了分析。从40个10BP引物中选取15个用于群体遗传多样性分析,共检测出93个位点,其中46个(49.46%)呈多态;两群体的多态位点比例分别为43.01%和41.94%;用香农指数量化的遗传多样性指数,野生群体(0.23)略高于养殖群体(0.20),平均遗传多样性指数为0.22,群体内和群体间的遗传变异比例分别为85%和15%;群体的遗传相似度高达0.96,彼此间的遗传距离仅为0.04。研究表明,唐鱼目前的种质资源状况令人堪忧,恢复唐鱼有效种群大小、丰富物种遗传多样性是资源保护的基础。