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用cDNA表达阵谱比较鼻咽癌与正常鼻咽组织的基因表达谱差异 总被引:10,自引:1,他引:9
Atlas~(TM)cDNA Expression array Ⅰ是Clontech公司1997年4月推出的第1张商品化大规模核酸阵谱,包括588个严格选择的处于严密转录调控、在不同生物过程中起关键作用的人类基因cDNA序列,分6个功能区(A,B,C,D,E,F)点阵于1张尼龙膜上。我们用其做了人胚鼻咽、成人鼻咽和鼻咽癌组织的基因表达谱,比较其差异。材料包括胚胎鼻咽2例,成人慢性鼻咽炎活检组织11例及鼻咽癌活检组织17例。提取总RNA,纯化Poly A RNA,合成放射性标记cDNA探针,与阵谱杂交及放射自显影。结果见图1与表1。 相似文献
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蛋白质结构中某些氨基酸的氧化和还原是生物体内对蛋白功能的一种调控方式.甲硫氨酸(Met)被氧化则变为甲硫氨酸亚砜(Met(O)),它可导致所在蛋白质的生物学活性降低或丧失,但肽-甲硫氨酸亚砚还原酶(Peptide methionine sulfoxide reductase, msrA)则可使甲硫氨酸亚砜还原为甲硫氨酸,使其所在蛋白质重新恢复活性.为了研究人体中Met氧化还原的机制,以牛msrA cDNA序列为信息探针,筛选人EST数据库,依据若干同源EST的信息从人cDNA分子库中克隆到一个长1255hp的人MSRA cDNA.该CDNA包含一个长705 bp的可读框,它编码了 235个氨基酸残基.同源性比较表明,该基因与牛和大肠杆菌的msrA基因的氨基酸一致性分别为88%和61%.表达谱分析发现,该基因在人体大多数组织中均有一条长约1.6kb的转录本,并在肾中呈高表达.应用辐射杂种细胞株定位系统(radiation hybrid mapping panel, RH mapping)将该基因精确定位在人染色体8p22~23区带的DSS518和D85550位标之间,由于此前已有Keratolyticwintereryth 相似文献
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耐旱植物厚叶旋蒴苣苔BDN1脱水素基因的克隆及表达特性分析 总被引:8,自引:0,他引:8
根据已知植物脱水素基因保守区域设计引物,采用RT-PCR方法从耐旱植物厚叶旋蒴苣苔的总cDNA中扩增出一个500bp的与植物脱水素基因同源的序列。结合5’RACE获得了植物脱水素基因家族一个新成员BDN1的全长cDNA(1148bp)。Southern杂交分析表明,BDN1基因在厚叶旋蒴苣苔基因组中以单拷贝形式存在,Northern杂交结果表明,该基因的表达受干旱,寒冷及ABA的诱导。推测该基因与 相似文献
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白芷细胞外ECBP21全长cDNA克隆 总被引:4,自引:0,他引:4
ECBP21是从白芷悬浮培养细胞外检测并纯化的一种依赖钙的钙调素结合蛋白。利用RT-PCR和5‘-RACE方法,获得其cDNA全长。ECBP21 cDNA全长947bp,编码216个氨基酸,其中N端1-25氨基酸为信号肽,26-216氨基酸为成熟蛋白肽段,而且26-45氨基酸序列与纯化ECBP21N末端测序结果完全一致。将此cDNA成熟蛋白编码区核苷酸片段导入pET-28b( )表达载体中,并在大肠杆菌表达系统中诱导表达,经CaM-Gel overlay检测证实表达蛋白具有Ca^2 依赖的钙调素结合特征,从而进一步证实了cDNA克隆的正确性。这为进一步用分子生物学方法研究植物细胞外多肽ECBP21的生物学功能奠定了基础。 相似文献
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一个黄瓜花叶病毒强株系的外壳蛋白基因的合成、克隆、序列分析和表达 总被引:2,自引:0,他引:2
黄瓜花叶病毒(CMV)能引起属于365属、85科的775种植物产生病害,是我国、亚洲和世界各地危害最严重的病毒病害之一。由于在大多数作物中未找到抗CMV的基因,加之其传染又属非持久性的蚜虫介体,难于进行治蚜防病,故无有效防治方法。 抗黄瓜花叶病毒的基因工程早已受到人们的注意。我们实验室于1988—1990年已获得 相似文献
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近年来光合作用基因工程的研究进展十分迅速,许多重要的编码光合作用反应中心的蛋白质及酶的基因,已在多种植物叶绿体基因组及核基因组上定位并测定了其碱基序列,杉浦昌弘等先后完成了烟草、水稻等高等植物叶绿体基因组全序列分析,但是C_4植物除玉米外,叶绿体基因的研究较少,高粱是主要的C_4植物,其叶绿体光系统基因的研究国内外均 相似文献
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一个与人鼻咽癌相关新基因的克隆 总被引:16,自引:0,他引:16
利用高密度cDNA微阵列表达检测技术,筛选出在成人正常鼻咽组织高表达而在成人咎咽低分化鳞状细胞癌组织中低表达的ESTN27741,用RT-PCR技术证实之,进而由该EST克隆出长度为1096bp的新基因,利用生物信息学分析发现,该序列有含有完整的阅读横架,编码256个氨基酸,在5'端起始密友子上游有终止密友子TAA,3'端有加尾信号AATAAA和poly A尾,该新序列在非宙余的核酸序列数据 比 相似文献
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人肝癌组织IGF-Ⅱ cDNA变异体的克隆和顺序分析 总被引:3,自引:0,他引:3
人原发性肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,研究其发生、发展的分子机理对于肝癌的诊断和治疗有着重要的意义,已有研究认为:癌的发生是多因素和多阶段的发展过程,其中癌基因的活动在癌变过程中起着关键的作用.在1988年,顾健人等已报道了有关肝癌的7种癌基因谱,IGF-II基因是其中之一.以后,顾健人等又报道了IGF-II及其受体(IGF-II R)在肝癌和癌旁组织同时过量表达,从而提示IGF-II及IGF-IIR可能有旁泌和自泌作用,它和肝癌 相似文献
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豌豆乙酰羟酸还原异构酶基因的cDNA克隆及其表达 总被引:2,自引:0,他引:2
用cDNA差示分析法从G2豌豆总RNA中筛选到一个GA3特异诱导表达的基因片段,用该片段作探针进一步筛选G2豌豆cDNA文库,得到一个全长2036bp的cDNA序列。经分析,该cDNA含有一个1746bp的可读框,编码的蛋白质含有581个氨基酸,理论分子量为64ku,cDNA及推导的氨基酸序列分别与不同来源的乙酰羟酸还原异构酶相应序列有较高的同源性。将该基因转入表达载体中并在大肠杆菌中表达,获得了具有显著酶活性的外源蛋白。 相似文献
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锌指蛋白是一类参与基因表达调控的重要调节蛋白,这些蛋白可与DNA/RNA相互作用,从而参与基因的表达调控.迄今已克隆的人类锌指蛋白基因近200个.根据保守结构域的差异,锌指蛋白可分为数种类型,其中C2H2型锌指蛋白占绝大多数,这种蛋白质的锌指基序由28个氨基酸组成,常为YECX2CX3FX5LX2HX3HTGEKP,其序列是非常保守的,特别是各个锌指之间的毗邻区(TGEKP)极其保守[1].近期研究表明,锌指蛋白基因结构的变异与肿瘤发生、胚胎发育和分化等密切相关,如人体锌指基因WT1和LAZ3的易位可分别导致Wilm’s瘤[2]和… 相似文献
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在MS培养基中加入高浓度的蔗糖,可使胡萝卜体细胞胚的发育静止于子叶胚阶段,而当蔗糖浓度恢复到正常水平时,静止的体细胞胚便转入胚后发育。采用RT-PCR的方法,从调控状态的胡萝卜体细胞胚中获得lea基因Dc3家族一个新成员的cDNA片段。Northern杂交结果表明,该基因在调控状态的胡萝卜体细胞胚中具有强表达活性;在解调控12h的胡萝卜体细胞胚中,表达活性明显降低;解调控24h之后,其表达活性则基 相似文献
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抑制素(inhibin)和激活素(activin)是2种主要由性腺分泌的肽类激素,因分别能抑制和促进体外培养的垂体促性腺细胞释放促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)而得名.抑制素和激活素亦存在于人胎盘中,并对胎盘的激素分泌具有调节作用.但有关妊娠早期人胎盘抑制素的表达调控尚未见报道.本文利用液相杂交/核酸酶保护测定 相似文献
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动蛋白(kinesin)种类很多, 在真核细胞中行使多种功能. 利用3′-RACE 技术从拟南芥中克隆了动蛋白-14B 亚家族中的一个成员, 命名为AtKP1 (拟南芥动蛋白1). 其最大可读框为3.3 kb, 编码1087个氨基酸. 结构域分析表明,AtKP1多肽链中部有一个马达结构域, 氨基端有一个CH结构域, 羧基端一个含有202个氨基酸残基的序列表现出很强的特异性. Northern印迹表明, AtKP1基因在各种器官中广泛表达, 但在幼苗中表达量最大. 将克隆的长度为2808 bp的AtKP1启动子区域与GUS 基因进行了融合, 转基因分析显示, AtKP1主要在幼嫩器官维管束和幼叶表皮毛中表达, 表明AtKP1可能参与了维管束和叶表皮毛的分化或发育. 对AtKP1的马达结构域进行了原核表达和亲和纯化, 生物化学特性研究表明这个马达结构域可以核苷酸依赖的方式与微管结合, 且具有微管激活的ATP酶活性. 相似文献