MicroRNAs在皮肤生物学中的研究进展

microRNAs(miRNAs)是内源性转录后非编码小RNA分子,定向作用于靶基因,在细胞分化、组织发育等多个过程中发挥作用.皮肤是人类和动物身体最大的器官系统,miRNAs在动物皮肤形态发生和维持正常的生理生态功能等方面发挥重要作用.主要从miRNAs在皮肤形态发生、皮肤癌、皮肤伤口创伤愈合、色素形成等方面入手,对近期研究进展进行简要阐述和总结,为miRNAs在皮肤生物学研究上提供帮助.     

非编码RNA调控心脏重构与再生

近年来, 越来越多的证据表明, 大量的非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs)在基因的表达调控、细胞和机体的生理功能维持与病理环境调节方面都有重要作用, 其中主要包括微小RNA(microRNAs, miRNAs) 和长链非编码RNA(long non-coding RNAs, lncRNAs).心脏重构与再生是心血管疾病领域的关键问题, 其调控过程非常复杂, 包括表观遗传、转录、转录后及翻译水平的调控. 大量研究发现在转录后水平, miRNAs 通过负性调节靶标的表达调控心脏发育、疾病及再生进程. 近期研究揭示, lncRNAs 在心脏发育和疾病中具有潜在的作用, 可通过表观遗传、转录及转录后水平发挥作用. lncRNAs 已成为继miRNAs 之后的又一重要的调节性非编码RNA. 就非编码RNA 在心脏重构及再生进程中的调控作用进行综述.     

Wnt信号通路在哺乳动物卵泡发育中的作用

Wnt是一类癌基因。Wnt信号分子家族调控着多个组织脏器的胚胎发育,在动物发育过程中具有广泛的作用。Wnt信号通路作为一种在进化中高度保守的信号通路,在动物生长、发育、代谢和干细胞维持等多种生物学过程中发挥重要作用。     

植物中miR160/miR167/miR390家族及其靶基因研究进展

microRNA(miRNA)是真核生物中广泛存在的一类长21～23个核苷酸的非编码RNA分子,通过与靶基因mRNA的特异结合调节基因转录后表达,在调控细胞周期、生物体发育时序等方面起重要作用。miR160、miR167和miR390 3个miRNAs家族均为靶向ARF(Auxin Response Factor)基因家族,预示着它们在行使调控功能的过程中既有相似性又有特异性。笔者详细阐述了miR160/miR167/miR390在植物发育过程中的调控作用及与其靶基因之间的相互调控关系,发现miR160/miR167/miR390均在植物生长发育过程中发挥重要的作用,但miR160则侧重于调控胚胎和根的发育,miR167侧重于调控植物花和果实的发育,而miR390则对植物横向器官的发育具有调控作用,并且,miR160/miR167/miR390与其靶基因之间存在反馈调节作用。     

microRNAs家族间负关联模式挖掘

microRNAs(miRNAs)广泛地存在于动植物的细胞中,它的前体具有发夹结构,并且具有很好的保守性.miRNAs在生物体内对细胞的生长、发育、死亡和病变起着重要作用.研究miRNAs家族间在生物体内的调控关系,对miRNAs在生物组织中的表达进行关联分析和对miRNAs成熟序列、种子区域以及二级结构数据进行相似性比较,从而了解miRNAs家族对生物体的调节机制.为了识别具有高相关性的miRNAs家族负关联模式,引入相关系数来改进传统的挖掘频繁项集算法和用互信息来衡量miRNAs家族间的交互性.     

miR-125b调控动物肌肉生长发育的研究进展

miR-125b属于miR-125家族，是一种小的、高度保守的ncRNA,在多种生物学功能中发挥关键作用。miR-125b对动物肌肉组织(包括骨骼肌、心肌和平滑肌)发育的调控受到广泛关注。对miR-125b的生物起源和生物学功能以及在动物肌肉组织发育的调控进行了总结，并着重关注其对动物骨骼肌、心肌、平滑肌细胞发育过程及疾病的分子机制研究，为miR-125b在肌肉疾病的治疗和畜禽产肉性能的分子改良提供新的参考依据。     

赤霉素关键蛋白DELLA对植物雄蕊发育研究进展

在植物生长发育过程中,DELLA蛋白作为响应赤霉素（GA）信号通路负调控因子,其家族成员在植物雄蕊组织中均有表达,对植物生长发育起着重要作用.通过近几年研究发现,无论是拟南芥还是水稻,DELLA基因的突变都会导致植株的雄性不育.该文综述了DELLA蛋白基本特征、参与赤霉素信号通路的调控,以及在雄蕊发育中的作用,为今后的研究提供一定的理论基础.     

拟南芥信号传递途径

探讨拟南芥发育过程中一些调控基因表达的信号是如何传递的。广泛查阅近期有关发育生物学方面的文章,综述了拟南介信号传递的过程。发现植物体有许多与动物相同的信号传递途径,如磷酸化级联途径。在拟南芥中Raf1激酶,蛋白激酶（MEK）、蛋白激酶激酶（MAPK）都与信号转导直接有关。另外发现磷酸化过程在一定程度上依赖于卷须蛋白（CLV1）的自动磷酸化。植物信号转导途径类似于动物,通过磷酸化作用传递各种信号,来保持细胞增殖和分化的平衡。     

microRNAs 的SNPs研究进展

miRNAs是一类重要的基因调节因子,已有的研究表明它在生物体发育、细胞增殖、凋亡、脂类代谢、激素分泌以及肿瘤发生等多种生理和病理过程中发挥重要作用。本文通过对pre-miRNAs、成熟miRNAs、miRNAs的靶基因以及畜禽miRNAs的SNP的研究情况进行综述,对miRNAs的SNP在未来可能的为人类疾病治疗、提高畜禽生产性能方面的作用进行思考。     

体细胞重编程中miRNA的鉴定及功能研究

该研究针对非编码RNA研究中的核心科学问题,研究体细胞重编程微RNA功能及调控网络。研究的5年预期目标是:利用分子生物学、细胞生物学、生物化学和信息生物学手段,完成重编程和体细胞重编程和多能性细胞分化多个阶段的微RNA的表达谱,鉴定出在以上多个阶段表达变化显著的微RNA。找到影响重编程或多能干细胞分化过程的几种微RNA及鉴定其靶基因,并揭示这些基因在上述过程的作用。鉴定到在转录后加工水平和核质转运过程受调控的微RNA,阐明这些特定微RNA的作用机理,揭示其核质转运变化与重编程和多能性细胞分化之间的关联,阐明其分子机制。阐明上述相关微RNA在胚胎发育、细胞分化和重编程过程中的作用及其自身生物合成规律,并揭示其在器官发育中的作用。近3年,已建立体细胞重编程和多能性细胞分化及体细胞转分化的研究系统。采用核移植技术,建立了可用于研究体细胞重编程中mi RNA功能的新系统——来自孤雄囊胚的单倍体胚胎干细胞系。已经建立了研究mi RNA核质转运和转录后加工调控的研究体系。制作了mi RNA敲除小鼠。系统鉴定了体细胞重编程过程中差异表达的mi RNA。系统鉴定了体细胞向肝细胞转分化过程中显著差异表达的mi RNA。发现了RNA结合蛋白在转录后加工水平调控的特定miR NA的表达。发现在哺乳动物细胞核内存在一种读码机制,可能参与调控非编码RNA的核质转运。揭示了mi R-126在小鼠胚胎血管新生和血管完整性维持中的作用,探究了其发挥作用的分子机制。     

The functions of animal microRNAs

MicroRNAs (miRNAs) are small RNAs that regulate the expression of complementary messenger RNAs. Hundreds of miRNA genes have been found in diverse animals, and many of these are phylogenetically conserved. With miRNA roles identified in developmental timing, cell death, cell proliferation, haematopoiesis and patterning of the nervous system, evidence is mounting that animal miRNAs are more numerous, and their regulatory impact more pervasive, than was previously suspected.     

植物miRNAs前体的生物信息分析

miRNAs前体（pre-miRNAs）是产生成熟miRNAs的基因表达产物，能形成较为稳定的发卡环结构，具有较低的最小折叠自由能（minimal folding free cnergy，MFE）。在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上，重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值（MFEL）。结果表明MFEL是区分植物pre-miRNAs的一个很有效的参数：pre-miRNAs的MFEL值平均为-45．98kcal／mol，明显低于mRNAs（-23．08kcal／mol），tRNAs（-22．13kcal／mol）和rRNAs（-16．83kcal／mol）。使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率。     

miRNAs在不同物种进化中序列保守性的研究

miRNAs在不同物种的进化中存在保守性,不仅单独在动物或是植物中存在保守性,而且在动植物之间也同样存在．本研究在人和动物的不同组织中克隆到了同源性很高的序列,将所得结果与已发表的成熟的miRNAs比对,发现克隆到的序列与植物中miRNA319家族的相似性较高,并且保守区靠近其5’端,推测新miRNAs可能与miRNA319扮演相似的角色,而这些序列的保守性跨越不同进化阶段的物种,也为miRNAs广泛的保守性增加新的证据,显示miRNAs在物种进化过程中发挥着重要的功能．