一种适合杨树叶片的蛋白质提取方法

高质量的蛋白样品制备是进行双向电泳的前提条件.杨树叶片中因含有丰富的多酚、色素、多糖等物质,给蛋白质的提取带来了困难.为了找到一种适合杨树叶片的蛋白质提取方法,以南林895杨为实验材料,采用三氯乙酸-丙酮沉淀法对杨树叶片蛋白质进行提取.对所提取的蛋白分别用考马斯亮蓝染色法和银染法进行检测,得到了良好的双向电泳图谱.     

一种检测蛋白质相互作用的双荧光共定位系统

自发荧光蛋白以快捷灵敏、即时检测和无需破坏活细胞的特点在蛋白质相互作用的研究中得到广泛应用.从发光水母Aquoria victoria中分离的绿色荧光蛋白(GFP)和从珊瑚Discosoma sp.中分离的DsRed红色荧光蛋白是自发荧光蛋白的典型代表.本研究开发一种基于GFP和红色荧光蛋白(RFP),并可通过待检测蛋白在细胞内表达的空间位移变化产生共定位的双荧光共定位检测系统.该系统为克服两种荧光蛋白光谱渗漏带来的非特异性结果的干扰,将核仁定位信号(NoLS)和出核信号(ABL)分别连接到RFP和GFP.具有定位信号的GFP和RFP的待检测蛋白对可分别在细胞核内和(或)细胞核外表达,伴随它们的相互作用,荧光共定位的现象会产生在细胞内特定的区域.利用抗凋亡蛋白Bc1-2和Bak-BH3短肽作为蛋白对测试该系统,荧光共定位现象明显,系统灵敏可靠.     

四种淡水鱼在冻藏过程中蛋白质变性的测定

本文阐述了四种淡水鱼在- 5℃、-12℃及-18℃下冻藏近二个月,测定其冻藏期间鱼肌肉蛋白质变性程度。结果表明,四种鱼蛋白质变性大小顺序为:鳙鱼>鲢鱼>草鱼>鲤鱼。     

一种改良的蛋白质复合物识别方法

高通量的方法产生了大量蛋白质相互作用数据.然而研究表明,对于已过滤的双杂交酵母数据集,假阳性相互作用的比例达到50%左右.这些假阳性这对于进一步的PPI网络研究带来了负面影响.因此,消除假阳性或者降低假阳性带来的负面影响变得非常重要.根据蛋白质相互作用网络的拓扑特性,每一组相互作用被赋予一个存在概率,概率值表示相互作用的可靠程度,概率值为0的相互作用被标识为假阳性予以消除.提出了一种改良的蛋白质复合物识别方法,该方法基于核-附件的思想,识别的复合物具有更强的生物统计特性.改良的新方法及其他经典的识别方法在酵母数据集上得到运行,实验结果表明,改良的方法性能优于现有的经典方法.     

一种适用于卷积结构的非图像数据预处理方法

卷积神经网络凭借局部相关和权值共享等优良特性而广泛应用于图像处理领域,成为最受欢迎的神经网络架构之一.然而,对于基因组、语音和金融等非图像形式的数据,传统的卷积网络可能无法完全适用.为了摆脱这一困境,科研人员不断尝试研发诸如循环神经网络以及注意力机制网络等可用于解析非图像数据的网络结构,拓展神经网络的应用范围.新型网络架构的研发无疑是困难且耗费巨大的,从另一个角度出发,提出一种适用于卷积网络结构的数据预处理方法.通过处理源数据,将其转换为特定的一维特征向量或二维图像矩阵,接着送入自定义卷积结构中观察其算法表现.实验采用UCI和Kaggle平台上的经典数据集进行测试并使用了SVM、决策树、随机森林等传统机器学习模型来对比该方法的可行性和有效性.     

一种快速有效检测SSR标记的非变性聚丙烯酰胺凝胶的银染方法

聚丙烯酰胺凝胶银染法是一种具有高分辨率检测SSR标记的有效方法,然而传统的银染方法存在操作步骤较多、所需时间较长及试剂种类与用量较多等不足.本研究利用菜心和烟草SSR标记为研究对象,建立一种能快速有效检测其PCR扩增产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶的银染方法.该方法包括染色和显影2个主要操作步骤,整个银染流程耗时6~7 min,只需要AgNO_3、NaOH和甲醛3种试剂,所检测SSR标记的DNA条带清晰、易辨.与其他银染法相比,本研究建立的银染法具有易于操作、耗时少、所需试剂种类和用量少及检测效果好的优势.     

RDSPH:一种适用于一维非连续条件的新SPH方法

基于恢复粒子一致性的光滑粒子流体动力学(RSPH)方法,同时借鉴DCSMP方法,在非连续区间上对未知函数分段泰勒展开,并保留零阶项和一阶项,构建了一套适合于模拟一维非连续物理现象的新SPH方法(RDSPH).比较不同SPH方程近似二次函数的结果,新方法不仅改进了传统SPH方法存在的边界缺陷问题,同时在非连续区域内也能更有效地修复由非连续引起的核近似截断积分和消除粒子不一致性所造成的误差.     

一种适用于地衣总DNA提取的改进方法

目的:针对地衣初生、次生代谢产物丰富的特点,提出了一种适于地衣总DNA的提取方法。方法:应用改良的CTAB法,对3种常见地衣进行了总DNA提取,经过琼脂糖电泳、紫外吸收分析DNA质量。结果:3个样本DNA的A260/A280值均在1.8～2.0之间,琼脂糖电泳图像清晰。结论:改良的CTAB法简便、省时、价廉,适合于地衣总DNA的提取,获得的DNA含量高,纯度好。     

一种适用于盐生植物的RNA提取方法

介绍了一种红树ＲＮＡ提取方法，此法无需特殊试剂和贵重仪器设备，可有效地排除红树细胞中大量存在的胶质和多糖类物质的干扰，所得ＲＮＡ样品经紫外分光光度计检测和１％琼脂糖凝胶电泳分析证明具有较高的纯度和完整性，可满足多数分子生物学实验的需要，尤其适用于提取多糖含量较高的植物细胞的ＲＮＡ．     

一种融合多组学数据的关键蛋白质预测算法

关键蛋白质在维持生物体的生理活动中发挥着重要的作用,预测关键蛋白质有助于设计药物分子靶标.随着高通量技术的发展,基于蛋白质相互作用关系数据采用计算方法识别关键蛋白质成为当前的热门研究.研究表明,将蛋白质相互作用网络与其他生物学信息结合起来能够更有效地识别关键蛋白质.因此,本研究提出一种整合蛋白质相互作用数据、基因本体注释信息、蛋白质亚细胞定位信息及蛋白质结构域信息的识别关键蛋白质的新方法TGSD.为了评估新算法的有效性,选取4组常用的酵母测试数据集进行仿真实验,详细比较TGSD方法与其他7种经典方法的识别效果.数值结果显示,TGSD在预测正确关键蛋白质数目和准确率等统计指标上明显优于其他算法.     

额济纳旗胡杨幼叶糖类物质变化

以额济纳国家级胡杨林自然保护区中两种不同样地中的胡杨幼叶为材料,进行可溶性糖和淀粉含量的变化研究,并对胡杨叶的形态结构的生长发育状况进行观测。实验结果表明:胡杨叶形态结构表现为随时间变化,叶的长、宽逐日增大,胡杨叶中可溶性糖的含量随时间变化而明显增大;淀粉含量则随时间变化呈略微增大趋势.在土壤含水量较低的样地,胡杨叶中可溶性糖含量较大,这是对干旱胁迫的一种适应.     

新疆艾比湖地区胡杨林生长监测方法研究

文章主要依据德国柏林工业大学生态学院景观与林业研究中心长期的实践经验监测形成的一套成熟的研究方法,对新疆艾比湖地区9个标准样地的胡杨林的生长情况进行准样地数据和树木数据监测,并提出其保护措施和方案。     

燕麦中蛋白质的提取、纯化及氨基酸成分分析

利用不同浓度的NaCl溶液和复合酶对燕麦蛋白质进行提取试验,结果表明:最佳的工艺条件为,温度40℃,盐浓度8%,复合酶用量3.5 g(U/g),反应时间4 h;燕麦蛋白质提取率为67.5%,蛋白质纯度达到91.4%,蛋白质含量为15.2%.燕麦蛋白质氨基酸分析表明:氨基酸含量丰富,尤其是人体所必需的氨基酸齐全,比例适当.     

一种眼睛特征抽取的新方法

眼睛特征对诸如人脸识别、表情识别及三维人脸重建等应用领域而言都是非常有效的信息．本文综合利用彩色信息、Gabor小波特征信息以及各特征之间的相互位置关系抽取眼睛特征．首先,在HSV彩色空间的H通道中检测瞳孔的中心位置并对眼球的半径加以估计;然后,在Gabor特征空间中构造了眼角滤波器用以检测眼角位置;最后,在前面两步检测的基础上,用样条函数拟合眼睛的轮廓．在SJTU库上的大量仿真实验验证了该方法的准确性与稳健性．     

一种新方法合成吡嗪甲酸根合铜(Ⅱ)配合物

文章介绍了一种合成二水吡嗪甲酸合铜配合物[Cu(CPY)_2(H_2O)_2](CPY=吡嗪-2-甲酸根)的新方法,用吡嗪二甲酸为起始原料与二水乙酸合铜反应得到二水吡嗪甲酸合铜配合物,合成了以吡嗪-2-甲酸根为配体的单核铜(II)配合物[Cu(CPY)_2(H_2O)_2].对该配合物进行了元素分析表征,并对其进行了X-射线单晶结构测定.该单晶属于单斜晶系,空间群为P 2(1)/c,其晶胞参数为α=5.4447(11)(A)、alpha=90 deg;b=10.894(2)(A)、beta=98.23(3)deg、c=10.386(2)(A);gamma=90 deg,Volume=609.7(2)(A)3.     

测定蛋白质与胆酸盐结合量的方法

介绍一种应用高效液相色谱仪连接示差折射率检测仪测定牛血清白蛋白与脱氧胆酸钠的结合量的简便方法．该法通过凝胶过滤实现脱氧胆酸与蛋白质的结合平衡和脱氧胆酸的分离，根据示差折射率检测仪的读数定量脱氧胆酸钠．应用该法精确测定脱氧胆酸钠与牛血清蛋白结合等温线与已报道的采用其他方法测定的结合等温线相似     

水葫芦叶蛋白提取工艺初步研究

为高效利用水葫芦和缓解我国蛋白资源的紧缺,初步研究了加热法、氯化钙和葡萄糖酸内酯絮凝及直接发酵法提取水葫芦叶蛋白。研究结果表明加热法的最适温度范围70～80℃、氯化钙和葡萄糖酸内酯絮凝最适添加量分别为0.2%和0.1%、直接发酵法最适发酵时间为24～48 h,提取效果优劣先后排序依次为加热法、氯化钙絮凝、葡萄糖酸内酯絮凝和直接发酵法。     

从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的方法

目的:寻求从福尔马林固定的癌组织中提取RNA的合理方法.方法:运用Trizol法从福尔马林固定的胃癌组织中提取RNA,用分光光度计测定RNA的产量和纯度;通过RT-PCR对不同长度的管家基因-actin进行扩增.结果:100 bp和300 bp的-actin均能顺利扩增出特异性条带,500 bp的-actin未能扩增.结论:用Trizol法从福尔马林固定的癌组织中提取RNA是可行的;进行RT-PCR时应尽量设计小片段引物(100~300 bp)以获得更好的扩增效果.