烷烃小分子溶剂化自由能的快速计算

将ABEEMσπ浮动电荷模型与generalized Born(GB)模型相结合,计算分子的溶剂化自由能.GB模型是一种连续介质模型,计算快速而简单,但是这种模型的计算精度却尚待提高.由于ABEEMσπ浮动电荷模型将分子的电荷区域进行了详细划分,分为原子区域、单键和双键区域、孤对电子区域,而且双键区域又更详细地分为1个σ键和4个π键区域,充分考虑了在外界环境发生变化的情况下,分子内部各个原子电荷重新排布,因而极大地提高了GB模型的计算精度.利用该方法快速准确地计算了几个烷烃小分子的溶剂化自由能.     

溶剂化热力学的理论研究(Ⅰ)——离子溶剂化自由能的SPT计算

本文改进了 Abraham 等人的计算方法,应用定标粒子理论(SPT)计算了10种1价离子在12种溶剂中的标准溶剂化自由能ΔG_S~(?).计算结果与前人的观测值吻合得较好.     

溶剂化热力学的理论研究(Ⅲ)——含水混合溶剂中离子溶剂化自由能的理论计算

本文应用定标粒子理论计算了NaCl、NaBr、NaI、KCl、KBr及KI等6种电解质在一系列浓度的甲醇-水混合溶剂中的溶剂化自由能,并对混合溶剂条件下离子的选择性溶剂化问题进行了修正,计算结果与文献值吻合较好。     

液压缸活塞微织构化表面动压润滑性能理论研究

为研究液压缸活塞微织构化表面的动压润滑性能,在液压缸活塞表面加工开口形状为圆形、椭圆形、正方形、正六边形的微织构,利用雷诺方程对活塞表面与液压缸缸筒内圆之间的流场进行数学建模,并采用MATLAB软件进行仿真计算,研究微织构开口形状、活塞运动速度及微织构深径比对活塞表面动压润滑性能的影响。结果表明,在活塞表面加工4种不同开口形状的微织构均可改善活塞表面的动压润滑性能,其中椭圆形微织构的改善效果略差;随着活塞运动速度的提高,不同形貌微织构表面的摩擦因数均增大,活塞表面动压润滑性能变差;圆形微织构的深径比为0.009时,活塞表面的动压润滑性能较佳。     

ABEEMσπ-GB／SA方法计算6种氨基酸四肽溶剂化自由能

使用ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场，在298 K ，NVT 系综下对5种构象的A la四肽水溶液进行了动力学模拟。计算了动力学平衡态下A la四肽中非氢原子的均方根偏差。结合广义玻恩模型（GB）计算了溶剂化自由能的极性部分，使用SA 方法计算了溶剂化自由能的非极性部分。溶剂化自由能的结果表明，A la四肽αR螺旋和β折叠构象容易在水溶液中存在。使用类似方法分别对Gly ，Leu ，Val ，Asn和Asp四肽的αL螺旋构象水溶液进行了动力学研究，计算了这5种四肽的溶剂化自由能。结果表明，A sp和A sn四肽亲水性较强，Leu、Val和Ala四肽疏水性较强，Gly 四肽居中，此结论与实际相符。该类研究为ABEEMσπ浮动电荷力场用于其他生物大分子体系奠定了很好的基础。     

应用ABEEMσπ/GB-SA方法估算4个带电二肽的溶剂化自由能

采用B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平优化获得体系的稳定几何结构.在相同的理论水平下,使用SMD溶剂模型,计算这些分子在水溶剂中的溶剂化自由能,并以其作为标准值.将各分子的稳定结构作为初始结构,在298 K、NVT系综下,应用ABEEMσπ可极化分子力场,对氨基酸侧链分子的水溶液进行分子动力学模拟,模拟的时间为1ns.平衡后的结构作为训练集,以调节和确定ABEEMσπ的相关参数,最终得到与从头计算相一致的溶剂化自由能.使用相同的参数,计算带电氨基酸二肽的溶剂化自由能,ABEEMσπ的计算结果与从头计算结果具有良好的一致性,表明该参数具有可转移性,这为研究多肽和蛋白质分子的溶剂化自由能奠定了基础.     

平衡态与非平衡态分子溶剂化自由能的计算效率比较

着眼于13个中性氨基酸侧链类似物在水中的溶剂化自由能的计算,来比较两种计算自由能的平衡态动力学模拟和非平衡态动力学模拟方法在高性能计算机上的表现.研究发现,利用非平衡态动力学模拟来计算自由能除了在准确度上和平衡态动力学模拟的计算一致之外,在计算效率和实际所需时间上,非平衡方法计算效率更高,实际所需时间更少.     

盐在混合溶剂中活度系数和溶剂化的研究

李芝芬等人测定了盐在甲醇混合溶剂中的溶解度,得到经验公式: logs_0/s_s=kx_Ne (1)式中s_0和s_s分别为盐在甲醇和混合溶剂中的溶解度,x_Ne为第二组分溶剂的摩尔分数,k为第二介质常数。他们还提出了单纯溶剂化模型,导出了计算溶剂化数的公式: n_++n_-=-(2logs_0/s_s)/(logΦ_P) (2) 本文测定了KClO_3,KClO_4,KIO_3和KIO_4,在水-甲醇,水-乙醇,在水-丙醇,水-丙酮和水—二氧六环五种混合溶剂中的溶解度。近似符合经验公式(1),而公式(2)对本实验研     

体积、粘度和核磁共振方法研究离子在PC+THF混合溶剂中的溶剂化行为

锂电池电解质溶液的性质是溶液中离子-溶剂和离子-离子等复杂相互作用的宏观体现,这些微观相互作用是决定电液乃至电池性能的根本原因[1].     

LiBF4在基于碳酸脂类混合溶剂中的溶剂化行为研究

具有较好化学稳定性和热稳定性的四氟硼酸锂(LiBF4),与有机溶剂所形成的电解质溶液较广泛地应用于锂电池、高能核材料、有机合成等领域.电解质溶液的性质是溶液中离子—溶剂和离子—离子等复杂相互作用的宏观体现,这些相互作用是决定电解质乃至电池性能的根本原因.电解质在溶液中的体积性质研究对于了解电解质的电离、溶剂化、离子缔合都具有重要意义.本文在前期工作的基础上[1],报道298.15K时LiBF4在基于碳酸丙烯脂(PC)的混合溶剂(PC DMF,PC THF,PC AN和PC DME)和在基于碳酸乙烯脂(EC)的混合溶剂(EC THF,EC AN,EC DME和E…     

Genome-scale approaches to resolving incongruence in molecular phylogenies

One of the most pervasive challenges in molecular phylogenetics is the incongruence between phylogenies obtained using different data sets, such as individual genes. To systematically investigate the degree of incongruence, and potential methods for resolving it, we screened the genome sequences of eight yeast species and selected 106 widely distributed orthologous genes for phylogenetic analyses, singly and by concatenation. Our results suggest that data sets consisting of single or a small number of concatenated genes have a significant probability of supporting conflicting topologies. By contrast, analyses of the entire data set of concatenated genes yielded a single, fully resolved species tree with maximum support. Comparable results were obtained with a concatenation of a minimum of 20 genes; substantially more genes than commonly used but a small fraction of any genome. These results have important implications for resolving branches of the tree of life.     

分子高激发振动态的经典非线性性质

该文阐述如何运用经典非线性力学的概念,来理解分子高激发振动态的谱学性质.内容包括:莫尔斯振子,单摆的动力学和共振的关系,力学体系的构成单元是单摆,一个共振对应于一个守恒量,混沌,共振的重叠导致混沌的产生等.我们的出发点是运用二次量子化算子构成的代数哈密顿量,经由海森伯对应而得到的陪集空间上的动力学体系.从此哈密顿量,可以得到动力学势.而动力学势和经典的不动点关系密切,并且量子态就处在由动力学势所包围,分成的几个量子环境中.从动力学势,可以依据它的对称性,方便推得局域模式的存在,最后我们利用这些非线性力学的概念,来分析DCO分子高激发振动态的解离问题.     

酒店建筑用能特性及节能措施分析

为探讨酒店建筑的用能特性,首先在对三峡库区城市14家典型三星级以上酒店年用电量及空调系统运行调研的基础上,分析了三峡库区城市酒店类建筑的能耗特点;其次,在已有的调研数据的基础上,分析了节能技术在三峡库区城市公共建筑空调系统中的应用状况;最后,提出了降低酒店建筑能耗可行的节能措施,通过实测分析了变水量系统的节能潜力.     

Theoretical study of the potential energy surface and the highly excited rovibrational spectroscopy of H2S molecule

This note reports the potential energy surface of H2S that has been refined by using SCF-CI approach and the high-resolution experimental data. The calculated splitting values of the local mode vibration states pair close to observed values. This vibration state calculation has shown that there are no obvious non-Born Oppenheimer effects occurring in the lower vibration states of the system.     

对两种大学生心肺功能评价方法的比较研究

台阶试验的演变过程说明不同测试对象与测试结果之间有很大的相关性。根据多年的测试经验,用台阶试验和1 000m(800m)作对比得出:作为评价大学生心肺功能好坏的测试项目,后者优于前者。结合实际测试的情况,提出对心肺功能评价的一些建议,以期更加科学合理地做好《国家学生体质健康标准》测试评价工作,促进大学生的身心健康。     

The v-v energy transfer of highly vibrationally excited states (I)

The relaxation of the highly vibrationally excited CO (v = 1–8) by CO₂ is studied by timeresolved Fourier transform infrared emission spectroscopy (TR FTIR). 193 nm laser photolysis of the mixture of CHBr₃ with O₂ generates the highly vibrationally excited CO(v) molecules. TR FTIR records the intense infrared emission of CO(v→v-1). The vibrational populations of each level of CO(v) have been determined by the method of spectral simulation. Based on the evolution of the time resolved populations and the differential method, 8 energy transfer rate constants of CO(v = 1–8) to CO₂ molecules areobtained: (5.7±0.1), (5.9±0.1), (5.2±0.2), (3.4±0.2), (2.4±0.3), (2.2±0.4), (2.0±0.4) and (1.8±0.6) (10¹⁴ cm³ · molecule⁻¹ · s⁻¹), respectively. A two-channel energy transfer model can explain the feature of the quenching of CO(v) by CO². For the lower vibrational states of CO, the vibrational energy transfers preferentially to the u³ mode of CO² For the higher levels, the major quenching channel changes to the vibrational energy exchange between CO(v→v-1) and the u¹ mode of CO².     

The v-v energy transfer of highly vibrationally excited states (II)

The vibrational energy transfer from highly vibrationally excited CO to H₂O molecules is studied by time-resolved Fourier transform infrared emission spectroscopy (TR FTIR). Following the 193 nm laser photolysis of CHBr₃ and O₂ the secondary reactions generate CO(v). The infrared emission of CO(v → v−1) is detected by TR FTIR. The excitation of H₂O molecules is not observed. By the method of the spectral simulation and the differential technique, 8 rate constants for CO(v)/H₂O system are obtained: (1.7 ±0.1), (3.4 ±0.2), (6.2 ±0.4), (8.0 ±1.0), (9.0 ±2.0), (12 ±3), (16 ±4) and (18 ±7) (10¹³cm³ · molecule^-1· s^-1). At least two reasons lead to the efficient energy transfer. One is the contributions of the rotational energy to the vibational energy defect and the other is the result of the complex collision. With the SSH andab initio calculations, the quenching mechanism of CO(v) by H₂O is suggested.     

Vibrational properties of uracil

1 Introduction Spectroscopic behavior of biological macromole- cules, such as the nucleic acid (NA) bases, contained in non-interacting environments or their solvation, may help us clarify the role of these molecules in biological systems. There are many …     

高振动激发态的C_6H_6与N_2、O_2碰撞传能的QCT计算

准经典轨线法 (QCT)是目前理论上研究高振动激发态大分子碰撞传能的常用方法之一 ,本文用QCT方法计算了高振动激发态的C6H6 与N2 、O2 的碰撞传能 通过计算发现 ,与N2 、O2碰撞时 ,C6H6 的每次碰撞平均振动失能值与实验结果符合较好 计算结果表明 ,高振动激发态的C6H6 失去的振动能传到了N2 、O2 的振动自由度上 ,即V V传能 通过分析每一条轨线 ,发现了直接碰撞、络合碰撞及颤动碰撞三种碰撞类型 ,这与文献计算是完全一致的