snoSeeker:扫描人类基因组中向导和孤儿snoRNA的计算机程序包

核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoR-NA)是真核生物细胞核内的一大类非编码RNA。按其结构和功能特点,除了MRP RNA,目前已知的sn-oRNA可分为两大类:box C/D和box H/ACA。除了少数snoRNA在rRNA前体的剪切加工和转录后修饰过程中起到重要的作用,大部分snoRNA都是通过反义互补行使功能。box C/D snoRNA指导rRNA或snRNA特定位点的2’-O-甲基化修饰,而box H/ACAsnoRNA指导rRNA或snRNA上的假尿嘧啶化修饰。根据snoRNA是否与rRNAs或snRNAs反义互补,也可将它们分为向导snoRNAs(guide snoRNA)和孤儿snoRNAs(orph…     

DNA损伤应答相关蛋白质机器维持基因组稳定性与细胞稳态的机制

基因组不稳定性和细胞稳态失衡是衰老及肿瘤、糖尿病、神经退行性疾病等老年重大疾病的重要诱因,但其中的分子机制尚不清晰,因此缺乏有效的治疗靶标和手段。DNA损伤应答(DNA damage response,DDR)是维持基因组稳定性的关键,其过程包括损伤感应、信号激活和传导、效应等不同阶段,涉及分子识别和靶向募集、信号激活和传导、损伤修复和基因转录、细胞凋亡、转化与衰老等生物学过程。DDR依赖诸多损伤修复因子的直接参与,也需要染色质重塑(chromatin remodeling)及关键蛋白质机器的可逆性翻译后修饰的精细调控作用。国家重点研发计划蛋白质机器与生命过程调控重点专项项目"参与DNA损伤应答的新型蛋白质机器维持基因组稳定性的机制研究"针对DNA损伤应答的动态过程,聚焦染色质重塑(chromatin remodeling)与蛋白质翻译后修饰(post-translational modification,PTM),筛选、鉴定新型调控染色质重塑的蛋白质机器及新型蛋白质翻译后修饰,阐明其对DNA损伤应答的时空调控机制,阐明其结构特性,揭示其结构或功能异常所致DNA损伤应答缺陷,诱发基因组不稳定性、细胞稳态失衡和肿瘤发生发展的关联机制,筛选靶向先导化合物并探讨其在肿瘤治疗中的作用机制及应用,为药物研发、临床诊治提供新的理论依据。     

膳食纤维高效制备技术研究与新产品开发

膳食纤维因其具有预防肥胖症和肠道疾病;降胆固醇、降血糖、降血压;抗氧化性和自由基清除能力;提高人体免疫能力等功能,越来越受到人们的青睐。     

胸腺起源、发生、维持和退化研究进展

发育与生殖研究国家重大科学研究计划项目"胸腺起源、发生、维持和退化"集中了国内胸腺发育研究相关的优秀基础研究团队,致力于揭示中枢免疫器官胸腺在进化中的起源、发生、维持和退化中的关键事件及隐藏的机制,这为未来免疫相关疾病的研究提供了理论基础。、本文对该项目研究中的一些核心成果做一个简要概述。     

粗纤维食物未必能改善便秘

<正>近年来,很多人从各种渠道了解到,少吃粗纤维食物易致便秘,进而得了便秘以后就希望通过多摄食粗纤维食物来改善或消除便秘症状,但是往往收效甚微,甚至事与愿违,便秘现象仍不时出现。有关专家指出,引起便秘的原因很多,比如肠道疾病所致的梗阻性便秘、吸烟酗酒所致的痉挛性便     

肠道细菌微生态研究进展

肠道菌群被认为是一个被遗忘的人体"功能器官",随着宏基因组学、代谢组学、蛋白质组学等技术和理论的发展,对肠道微生态与疾病及健康的相互关系及机制的研究已成为科技制高点。从2007年起,通过两轮的"973计划"项目资助,使得我国在肠道微生态研究得到快速发展,并取得令世界瞩目的成就。本文就近年来我国在肠道微生态方面的研究进展进行综述,包括感染性疾病的发生发展与肠道微生态及代谢的动力学变化相关性、肠道微生态与宿主免疫调控网络互作关系及肠道菌群重建等方面,力求较为详尽地介绍我国微生态研究的新成就。     

科学基金与口腔医学

口腔医学是医学的一个重要分支,它涉及口腔及其相关器官疾病(包括口颌面软硬组织的损伤、疾病和口颌发育异常等)的预防、诊断和治疗。口腔医学在基础理论、研究方法与医学其他分支学科类似。但是,口腔医学由于它所研究器官的特殊性,在疾病的诊断和治疗方法上与医学其他学科也有     

夏季远离腹泻的有效方法

夏季是肠道疾病的高发季节。中医专家指出在治疗夏季腹泻时只要根据腹泻的类型不同,选择适宜的中成药,就能有效地控制病情。下面让我们具体来了解。一、寒湿泻[症状]腹泻清稀,甚如水样。腹痛肠鸣,脘闷纳呆,或伴恶寒发热,头痛鼻塞,肢体酸痛。舌苔薄白或微腻,脉浮缓。     

RNA-蛋白质机器在哺乳动物遗传信息表达中的调控功能与机制

遗传信息的表达是生物体生存发展的基础。RNA不仅是遗传信息传递过程中的信使,还在多个层面上参与遗传信息的调控。RNA与蛋白质组成复合物,参与调控配子发生、组织器官形成、个体生长发育及疾病发生发展等一系列生理病理过程。系统解析小RNA-蛋白质机器、长链非编码RNA-蛋白质机器、转录及转录后加工中的RNA-蛋白质机器等在哺乳动物遗传信息表达中的功能和机制,将促进我们对生命奥秘的了解,有助于我们开创和完善RNA-蛋白质机器组学研究体系,建立规模化RNA-蛋白质机器功能研究平台。项目的顺利执行将揭示RNA-蛋白质机器的相关生理及病理功能,全面提升我国在该领域的研究水平和国际影响力。     

控制肝脏组织发育、再生重塑与大小的关键蛋白质机器

肝脏损伤、功能衰竭及肝癌等疾病是我国重大健康问题,它们的发生发展与肝脏再生重塑及大小调控异常密切相关。针对肝脏发育、再生及大小控制机理的基础研究对于解决上述重大肝脏疾病的临床需求具有重要意义。前期研究发现Hippo信号通路在调控细胞增殖及分化、干细胞命运等方面起着关键作用,而Hippo通路的失调可导致肝脏等器官发育和大小异常,严重影响受损组织再生与重塑,或导致肿瘤迅速发生。本项目拟以肝脏为研究对象,聚焦Hippo相关信号网络如何感知器官大小并适时调控细胞生长、分化与死亡以实现器官发育、再生重塑和器官大小控制这一关键科学问题,整合基础、临床、药学领域的先进研究技术,拟通过基因编辑、内胚层干细胞肝向分化、肝细胞移植和肝脏重建、肝脏损伤修复等模型、临床病理分析、蛋白结构解析和靶向药物设计等方法,深入探讨该通路失控导致肝脏发育异常、再生重塑障碍、癌症发生的致病机理,并提出靶向干预新策略。     

何为“冠状病毒”

正冠状病毒为不分节段的单股正链RNA病毒,属于巢病毒目、冠状病毒科、正冠状病毒亚科。冠状病毒是一类主要引起呼吸道、肠道疾病的病原体,1937年首次从家禽体内分离,最早在人体内发现是在1965年。在电子显微镜下,这类病毒颗粒的表面有许多规则排列的突起,整个病毒颗粒就像一顶中世纪欧洲帝王的皇冠,因此被命名为"冠状病毒"。     

久蹲厕所或是患病表现

现代都市人的生活节奏越来越快,时间也越来越显得宝贵。不少人为了"节省时间",养成了把厕所当成"阅读室"的不良习惯,喜欢长时间躲在厕所里看报纸、看手机、上微博等等。然而如果养成这种不良习惯,就要当心自己是否患上了慢性肠道病等疾病。久蹲厕所或是患病表现很多人都知道,长时间蹲厕     

植物非编码RNA的研究进展与展望

非编码RNA是当今国际生物学研究的热点之一。包括miRNA和siRNA在内的小RNA和长非编码RNA(lncRNA)可以在转录和转录后水平调节基因表达,在植物生长、发育、生物和非生物逆境生理等方面起着重要的调控作用。我国在植物非编码RNA的机理和应用方面的研究起步较早,通过近10年的蓬勃发展,涌现了一批从事植物非编码RNA研究的优秀团队。这些团队在模式植物拟南芥及水稻等农作物非编码RNA的产生、工作机理和应用研究上取得了一系列的重要突破性进展,在某些研究方向上处于国际领先水平,为我国植物非编码RNA研究的进一步发展打下了扎实的基础。本文对近年来植物非编码RNA领域国内外的重要进展进行了简要概述,并展望了未来植物非编码RNA的研究方向和拟解决的科学问题。     

肠道“隐形器官”与大脑炎症关联密切

正英国《自然》杂志近日在线发表了一项神经科学研究:美国科学家团队通过小鼠实验发现,肠道微生物组的变化,改变了多发性硬化症(MS)实验小鼠的脑内免疫细胞的活性。这项研究扩大了我们对肠道和脑之间相互作用的理解,有助于开发针对多发性硬化症和其他神经疾病的新疗法。数以万亿计的细菌生活在生物体的肠道中,它们被称为一个"隐形器官",已被证明与多种疾病有     

跨细胞蛋白质内稳态调控机制

蛋白质内稳态平衡是受到多级调控的,并不仅限于细胞水平。细胞特定的分区如线粒体(Mito)、内质网(ER),有其独特的调控蛋白质稳态平衡的信号通路。当Mito、ER稳态失衡导致未折叠蛋白在其中累积,会诱导一种适应性的反应,叫做"非折叠蛋白反应"(unfolded protein response, UPR),重建细胞器内部蛋白质稳态平衡。虽然关于Mito和ER蛋白质稳态调控机制已被广泛研究,但对于不同细胞/组织之间是否可以相互影响、协调其Mito、ER UPR来适应环境变化、系统调控物种整体的应激状态这一领域内的重大问题,却一直缺乏研究。基于前期工作基础,本研究将利用线虫和哺乳动物细胞培养两大手段,详细考察跨细胞内稳态调控的分子机制,为治疗衰老、神经退行性疾病、癌症等疾病提供新思路和新靶点。     

夏季细菌肆虐 当心6种肠胃病

夏季天气炎热,气候潮湿,是各种肠道病原菌繁殖的最佳时间。夏季,我们该如何预防肠道传染病呢?1、细菌性痢疾细菌性痢疾在上世纪60年代是造成死亡的常见病,虽然现在有下降的趋势,但急诊中仍然很多见。这种病症状表现为发烧、腹泻等,有的时候有脓血便,病人会有排便排不干净的感觉,身体太好或者太差的人可能不会发烧。     

肌凝蛋白-X调控了Netrin介导的轴突生长和导向

高等生物的任何一种行为(包括感知觉、学习与记忆以及睡眠等行为)都是以相关的神经环路作为基础和所引起的。神经系统发育过程中,神经环路的形成包括神经元的产生与迁移以及神经元树突和轴突的发育。在神经系统发育过程中,新生神经元的轴突有时要经历漫长的历程才能到达预定的脑区,然后与靶区神经元建立突触联系进而形成精密复杂的神经系统网络。因此,在发育过程中,神经元轴突的生长和导向是形成正常神经系统功能的前提和保证。相反,轴突发育的异常会导致多种神经系统疾病,包括智力障碍和癫痫发作等。在发育过程中,轴突的生长和导向是受外界…     

神经元发育与退行性病变的分子细胞遗传机制

神经精神疾病的防治是全球所面临的重大科学问题。而多数神经精神疾病都与神经细胞的发生发育异常和退变有关。深入研究神经细胞发育及退变的分子机制,将有助于我们理解神经精神疾病的发病病理过程,并为这些疾病的防治以及新药的开发奠定重要基础。     

器官衰老与退行性病变研究

衰老是伴随增龄而出现的机体功能衰退的过程,涉及器官、组织、细胞和分子等多个层面,呈现基因组不稳定、干细胞耗竭、细胞间通信改变等特征.全身系统性组织器官的再生能力下降易诱发机体衰老及衰老相关疾病的发生.本文揭示器官退行性变化的机制,解析衰老对器官稳态的影响,构建衡量器官健康状态的指标体系,研究干预器官衰老,以推动人类衰老...     

结肠癌发生与肠道菌群相关

正近日,以色列耶路撒冷希伯来大学的研究人员发现,某些种类的癌症与肠道微生物群内代谢物高水平相关。与此同时,肠道菌群与人们摄入某些细菌有关,这些细菌存在于富含抗氧化剂的食物如红茶和热可可中。因此他们建议,对于肠道癌症易感者,应注意饮食选择。