植物miRNAs前体的生物信息分析

miRNAs前体（premiRNAs）是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能（minimal folding free energy,MFE）。在对植物premiRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值（MFEL）。结果表明MFEL是区分植物premiRNAs的一个很有效的参数：premiRNAs的MFEL值平均为45.98 kcal/mol,明显低于mRNAs（23.08 kcal/     

磁场效应对羟丙基-β-环糊精/芘体系I1/I3值的影响

利用荧光探针法，通过考察磁场作用下有无单-[2-氧-（2-羟丙基）]-β-糊精（HPCD）的水溶液中芘（Py）的荧光强度和I1／I3值的变化，研究了外加磁场效应（MFE）对HPCD／Py相互作用的影响．结果表明：MFE可使水溶液中Py的荧光强度增强，但使其I1／I3值增大．在一定的温度条件下，一方面MFE使HPCD／Py体系中Py分子取伺改变，使得暴露于水中的Py分子的表面积增加，削弱了HPCD和Py之间的疏水相互作用；另一方面MFE使Py分子激发三重态的布居增加，使Py的极性增大，疏水相互作用减弱，从而导致HPCD／Py的包络程度减小.     

从头计算理论预测:带有二级相互作用的双π-H键复合体H2O…C2H4…H2O的结构特征和氢键性质

使用从头计算方法、以较大基组（aug-cc-pVDZ）和二级微扰理论[thesecond-order Mφller—Plesset perturbation theory（MP2）level]对乙烯-（H2O）2复合体H2O…C2H4…H2O的结构特征和氢键性质进行了研究．通过几何优化计算得到了C1对称的、振动频率为实频的H2O…C2H4…H2O的优化几何，复合体H2O…C2H4…H2O的结构中存在着双π-H键和π形氢键，双π-H键和π形氢键的键长分别为RH-C-C2．427A和RO-H3．225A． 在CCSD（T）／aug-cc-pVDZ水平计算得到的H2O…C2H4…H2O的相互作用能是-3.88keal／mol.体系具有较大的电子相关效应-2．64kcal／mol、68％，较大的电子相关效应增大了体系的相互作用能．     

miRNAs基因的结构保守模式挖掘

miRNA前体（pre-miRNAs）是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能够形成较为稳定的茎—环（stem-loop）结构.为了深入研究miRNAs,对miRNAs前体的二级结构建模,并采用关联规则识别miRNAs基因在进化过程中的结构模式.通过分析产生的结构—类别关系（structure-category relationships）来探索miRNAs的功能特征和调节机制.为了获得较好的实验结果,改进传统的关联规则挖掘算法,应用支持度约束和频繁项集的聚类来优化数据挖掘结果.     

多元校正荧光法同时测定α-萘乙酸和吲哚-3-乙酸

在紫外光激发下,植物生长调节剂萘乙酸（NAA）和吲哚-3-乙酸（IAA）均能发射荧光,最大激发／发射波长分别为λex／em=291／337nm,λex／em=287／371nm。研究了酸度、光照时间、温度及共存物对荧光强度的影响。建立了多元校正不经分离同时测定NAA和IAA两组分的新方法。NAA和IAA线性范围分别是6．44×10^-8-29×10^-6mol·L^-1,1．94×10^-8-3．88×10^-7mol·L^-1;最低检测限为2．10×10^-8mol·L^-1,1．08×10^-8mol·L^-1。该法对两组分合成样及强化水样均有较好的解析能力,回收率在92％-103％之间。     

二氧化氮氧化二甲基硫醚宏观反应动力学

用NO2氧化二甲基硫醚（DMS）是合成二甲基亚砜（DMSO）的主要方法，反应过程受气液相传质影响很大．采用反应体积为120mL的连续搅拌釜式反应器，对该反应的宏观动力学进行了研究．在温度为30-60℃、NO2和DMS进料流量分别为0．01-0．10mol／min和0．005—0．05mol／min的范围内，考查了反应速率的变化，并测定了不同温度下NO2在DMSO中的饱和浓度．在热力学和动力学分析的基础上，推导出反应宏观动力学模型，由实验数据拟合出模型中的各参数．结果表明，该反应的活化能为21．64kJ／mol，液相组成变化时反应速率存在极大值，且模型计算值与实验值相吻合．     

血尿酸水平与慢性心力衰竭患者预后的临床观察

目的观察慢性心衰患者血尿酸浓度，为临床判断慢性心衰疗效及预后提供帮助。方法（1）检测70例心功能Ⅰ～Ⅱ级，50例心功能Ⅲ级，73例心功能Ⅳ级患者血尿酸浓度，对其比较；（2）对193例心功能Ⅰ-Ⅳ级病因分别为冠心病、扩张性心肌病、高血压心脏病、风心病组患者观测其预后；（3）对例慢性心力衰竭患者治疗前后血尿酸浓度比较。结果（1）心功能Ⅰ～Ⅱ级组血尿酸浓度（209±29）μmol／L,HI级组血尿酸浓度（448．05±54）μmol／L，Ⅳ级组血尿酸浓度（526．11±102．8）μmol／l，心功能Ⅰ-Ⅱ级组分别与Ⅲ级组、Ⅳ级组间比较差异有统计学意义（P〈O．05），Ⅲ级组与Ⅳ级组间差异有统计学意义（P〈0．05）；（2）心功能Ⅰ-Ⅱ级组治疗前（209±29）μmol／L，治疗后（178±36）μmol／L，差异无统计学意义（P〉0．05），Ⅲ级组治疗前后分别为（448．05±54）μmol／L、（276±98）μmol／L，Ⅳ级组治疗前后分别为（526．11±102．8）μmol／L、（324±106）μmol／L，Ⅲ级组与Ⅳ级组治疗前后差异有统计学意义（P〈0．05）。结论心衰越严重血尿酸浓度越高，预后越差。心功能改善后血清尿酸浓度明显下降，动态检测血清尿酸浓度是判断心衰的预后的一个有意义的生化指标。     

降低梨外植体组培褐变途径的初步研究

以苍溪梨为试材进行降低组培褐变实验。结果表明：（I）在不同培养基上相比较，苍溪梨在MS＋1．0mg／LBA＋0．02mg／LNAA上生长分化，将芽在0．002mol／L的8-羟基奎啉溶液作不同时间的处理，20min处理更有利于防止褐变同时不阻抑梨芽生长，成活率高达90％，2hr处理时间成活率低至0；（2）从3月到5月用相同的培养基进行培养，5月下旬采集的材料的褐变率最低；（3）通过不同的预处理实验表明，在田间将采集的梨外植体进行低温处理，接种前作20min8-羟基奎啉和苯甲酸钠（浓度分别为0．002mol／L和0．2mol／L）均有较为理想的效果。     

microRNAs 的SNPs研究进展

miRNAs是一类重要的基因调节因子,已有的研究表明它在生物体发育、细胞增殖、凋亡、脂类代谢、激素分泌以及肿瘤发生等多种生理和病理过程中发挥重要作用。本文通过对pre-miRNAs、成熟miRNAs、miRNAs的靶基因以及畜禽miRNAs的SNP的研究情况进行综述,对miRNAs的SNP在未来可能的为人类疾病治疗、提高畜禽生产性能方面的作用进行思考。     

C60与IIB族金属卟啉的超分子相互作用

富勒烯和卟啉或金属卟啉通过非键相互作用形成超分子复合物。应用PBE密度泛函方法,对C60与卟啉或金属（锌,镉,汞）卟啉复合物进行几何结构优化。计算出结合能△Eint在-12．0～-16．0kcal／mol之间,对相互作用能进行了能量分解,结果表明静电相互作用能占主导;并探讨了相对论效应对其相互作用的影响;分析了富勒烯和卟啉或金属卟啉之间的电荷转移问题。进一步对其相互作用的本质进行了解释。     

非编码RNA调控心脏重构与再生

近年来, 越来越多的证据表明, 大量的非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs)在基因的表达调控、细胞和机体的生理功能维持与病理环境调节方面都有重要作用, 其中主要包括微小RNA(microRNAs, miRNAs) 和长链非编码RNA(long non-coding RNAs, lncRNAs).心脏重构与再生是心血管疾病领域的关键问题, 其调控过程非常复杂, 包括表观遗传、转录、转录后及翻译水平的调控. 大量研究发现在转录后水平, miRNAs 通过负性调节靶标的表达调控心脏发育、疾病及再生进程. 近期研究揭示, lncRNAs 在心脏发育和疾病中具有潜在的作用, 可通过表观遗传、转录及转录后水平发挥作用. lncRNAs 已成为继miRNAs 之后的又一重要的调节性非编码RNA. 就非编码RNA 在心脏重构及再生进程中的调控作用进行综述.     

HIV-1 蛋白酶异位抑制剂体系的长时间分子动力学模拟

采用新开发的ff12SB力场在NVIDIA CUDA GPU上对HIV-1蛋白酶的活性位抑制剂体系和异位抑制剂体系分别进行了100 ns的长时间分子动力学模拟,并用MM-PB/GBSA方法计算了活性位点抑制剂TL-3与HIV-1蛋白酶的结合自由能。异位抑制剂体系中分子片段2-甲基环己醇结合在Exo位,有利于抑制剂被束缚在活性位点附近。异位抑制剂体系中抑制剂TL-3与蛋白酶的结合自由能为-85.78 kcal/mol,活性位抑制剂体系中为-79.45 kcal/mol。这些结果有助于深入了解HIV-1 PR的动力学过程,为设计新型强效抑制剂提供了新见解。     

从头算和RRKM理论研究O（1D）+trans-CH2FCH2F反应

运用MP2/6-311G(d,p)方法优化得到了O(1D)+trans-CH2FCH2F反应势能面上稳定点的优化几何构型和振动频率。精算的能量是在QCISD(T)/6-311++G(d,p)水平上得到的。RRKM(Rice-Ramsperger-Kassel-Marcus)理论用来计算碰撞能在0-350 kcal/mol范围内通过中间体的微正则速率常数。计算得出,当碰撞能低于140 kcal/mol时标题反应的主要产物是HF和CH2F;碰撞能在140-350 kcal/mol时反应的主要产物是HF,CH2F和OH.在整个碰撞能范围内,HF和CH2F是主要产物。     

动物MicroRNAs的研究进展

MicroRNAs（miRNAs）是一类小的、内源的、非编码的RNA家族,其在转录后水平上对基因表达进行调控。nfiRNAs是在研究秀丽新小杆线虫（Caenorhabditis elegans）发育转变过程中发现的,最初称为stRNAs（small temporal RNA,小时序RNA）,但stRNAs只是miRNAs家族的一部分,随后在线虫、植物和哺乳动物中发现了miRNAs家族的数百个成员。动物miRNAs不仅在发育调控中起重要作用,还参与许多重要的生理过程。本文综述了动物中miRNAs的发现历程、生物学起源、作用机制、生物学功能、研究方法,并对动植物miRNAs的特点进行了比较。     

艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系的分子动力学研究

对艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系和活性位抑制剂体系进行8 ns的分子动力学模拟,用MM-PBSA方法分别计算了抑制剂与蛋白酶的结合自由能。异位抑制剂体系中抑制剂与蛋白酶的结合自由能为-90.30 kcal/mol,活性位抑制剂体系中为-59.58 kcal/mol。在异位抑制剂体系中分子片段4DX卡在蛋白酶的exo位,使蛋白酶活性位点附近残基的活动范围减小,有利于抑制剂被束缚在活性位点附近。异位抑制剂使体系刚性更强,更稳定,抑制剂与蛋白酶的结合更为牢固。     

非编码RNA与心肌重构

非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs) 是一类不编码蛋白质的RNA 分子. 相关研究表明, ncRNAs 不仅参与细胞的增殖、凋亡、分化、代谢等生理过程, 还参与疾病的病理过程. 心肌重构(myocardial remodeling)是多种心血管疾病最主要的病理基础. 已有多项研究表明, 心肌重构的发生发展与ncRNAs 的调控息息相关, 近年来针对ncRNAs 在心脏疾病方面的研究也得到了迅猛发展. 对ncRNAs 包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNAs, lncRNAs)和环形RNA(circular RNAs, circRNAs) 与心肌重构的最新研究进展以及作用机制进行介绍, 旨在寻找新的心脏疾病治疗靶点.