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中国特有植物大血藤的RAPD分析:植物地带性分化的分子差 … 总被引:4,自引:1,他引:3
采用随机扩增多态性DNA技术对中国特有科特有属植物大血藤(Sargentodoxa cuneata)进行分析,探讨植物地带性分化的分子差异。从100个随机引物中筛选出11个有效的10碱基对寡聚核糖核苷酸作引物,用于对取自5省区的大血藤植物基因组DNA进行PCR扩增;用UPGMA法对各居群间的Jacfcard相似性系业和遗传距离进行聚类分析。 相似文献
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中国鹅5个品种随机扩增多态DNA(RAPD)分析 总被引:3,自引:1,他引:2
目的 用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分析中国鹅的5个品种一皖西白鹅、太湖鹅、浙江白鹅、四川白鹅和狮头鹅的随机扩增多态DNA(RAPD)。方法 从34个10-寡核苷酸随机引物中筛选出的14个引物对每一品种的总基因组DNA进行了单引物PCR扩增,结果 5个品种共扩增出174个DNA片段,其中48个(占27.6%)在5个品种间表现多态性,根据扩增DNA片段的异同计算了各品种间的遗传距离指皖西白鹅和 相似文献
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DNA Extraction and RAPD Analysis of Podocarpus 总被引:20,自引:5,他引:15
以鸡毛松(P.imbricatus.)、竹柏(P.nagi)、长叶竹柏(P.fleuryi)、百日青(P.nerifolius)和罗汉松(P.macrophylus)为材料,通过对CTAB法进行改进提取了罗汉松属植物的DNA.DNA的产率和质量均较理想,能满足PCR扩增的需要.对4组80个引物进行筛选,发现9个引物的带型清晰并呈多态性,每个引物扩增的DNA片段数为1~11个.该9个引物在每个样本中扩增的片段总数平均为31个.采用UPGMA法对由RAPD数据求出的遗传距离进行聚类分析,得到的结果显示:本研究中的植物明显地分为3个亚类群,支持在罗汉松属内建立罗汉松组、竹柏组和鸡毛松组的处理方式;不同意把竹柏类从罗汉松属中分离出去成立新科的观点. 相似文献
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含笑亚族植物的RAPD分析及其系统学意义 总被引:7,自引:0,他引:7
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了14种含笑亚族植物。对Operon公司60个引物进行筛选,发现13个引物的带型清晰并呈多态性。该13个引物在每个样本中扩增的片段总数在60 ̄80个之间。采用UPGMA法对由RAPD数据求出的遗传距离进行聚类分析,得到的结果显示,植物明显地分为2个亚类群,支持将合果木独立成属与含笑属并列的处理方式;不同意把观光木从含笑属中独立出来独成属的观点。 相似文献
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疣蝗5个种群间遗传分化的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,在DNA分子水平上对疣蝗5个种群间的遗传差异进行了研究。在23个引物中有6个引物出现稳定的扩增带,扩增总带数为66条,其中53条具多态性,占80.3%,平均每个引物8.9条。利用Nei & Li相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现用该法检测到的遗传差异从南向北是连续性梯度差异,因而建议所研究地区疣蝗是一个单型种。 相似文献
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半套式PCR技术在植物基因克隆中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
杨明挚 《云南大学学报(自然科学版)》1998,20(5):377-379
常规PCR方法在分离克隆已知序列的基因中发挥着重要的作用,但要求目的基因片段与引物间的同源性几乎是100%,一旦引物序列与目的基因间存在有差异,便往往会导致扩增的特异性不强,扩增效率不高,给克隆带来很大的困难.在常规PCR基础上,若所分离的基因在不同植物间存在保守序列,依据这一序列再合成一对引物,进行半套式PCR则能大大提高扩增的特异性及扩增效率.对于较长的基因片段而言还能同时完成亚克隆.本文依据南瓜GPAT(甘油-3-磷酸酰基转移酶)基因cDNA序列及比较拟南芥菜、豌豆间在该基因内的保守区段序列合成相应引物来分离克隆黑子南瓜及西瓜GPAT基因的cDNA片段为例来说明半套式PCR技术在植物基因克隆中的应用 相似文献
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杉木杂种群体分子框架遗传连锁图初报 总被引:19,自引:1,他引:18
利用随机扩增DNA多态性分子遗传标记-RAPD,以杉木J0和F11两个亲本杂交形成的F1群体为作图群体,从1040个随机引物中筛选出78个引物,对78个F1群体及双亲样本进行了RAPD扩增,共获得129个RAPD标记,首次构建了杉木分子遗传连锁框架图,其中J0亲本包含8个连锁群,标记覆盖的基因组总长度约为595.2cM,F11亲本包含4个连锁群,标记覆盖的基因组总长度约为315.3cM。129个RAPD标记中偏分离标记占14.7%。本图谱为构建饱和的杉木分子遗传图谱提供了框架结构,为进一步开展杉木分子遗传方面的研究奠定了基础。 相似文献
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长江鳙遗传多样性的研究 总被引:17,自引:2,他引:15
运用40个10碱基随机引物对长江中游鳙的遗传多样性进行了随机扩增多态DNA(RAPD)分析,所用引物中,有10个能对鳙不同个体扩增出多态DNA带,占总引物数的25%,据所取长江中游自然繁殖的18条鳙样品的RAPD谱带的分析结果表明,鳙任意两个体间的遗传相似度在0.9386 ̄0.9857之间,平均值为0.9661;遗传变异度则在0.0143 ̄0.0614之间,平均值为0.0439;所分析样本的Sha 相似文献
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几种番茄品种基因组DNA的相似指数初步分析 总被引:2,自引:1,他引:1
用4种随机引物(10bp),对普通番茄5个品种的基因组DNA进行了PCR扩增,并对其RAPD带谱进行了统计处理,发现不同随机引物扩增出来的RAPD标记所表现的相似指数有所不同,综合考虑,普通番茄种内不同品种同DNA多态性保持了较高的稳定性。 相似文献
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中国香菇野生菌株的DNA多态性研究 总被引:2,自引:0,他引:2
采用20个不同来源的野生香菇菌株,用RAPD方法对这些香菇菌株的多态性进行了研究.结果发现,有11个引物表现清晰的RAPD谱带并呈显著多态性,同时发现香菇菌株的亲缘关系与生态地理有一定的关系,但没有必然的联系. 相似文献
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利用RAPD技术对采自我国8个省份的9个罗布麻野生居群进行遗传多样性分析.从80条随机引物中筛选出17条引物,共扩增出157条带,其中多态性带108条.物种水平的多态位点百分率(PPB)为68.79%,Nei’s基因多样性指数H为0.2296,Shannon’s多态性信息指数I为0.3390.居群间的遗传分化系数Gst为0.8841,即11.59%的遗传变异来自于居群内,88.41%的遗传变异来自于居群间,居群间的遗传分化水平远高于居群内.居群间遗传距离与聚类结果显示各居群间的亲缘关系与地理分布不完全相关.针对现有罗布麻的遗传多样性现状,建议加强对现有自然居群的保护. 相似文献
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浙江省及其临近地区益母草的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
运用8个有效的10mer-寡核苷酸引物对浙江省及其邻近地区益母草(Leonurus japonicus)7个居群的基因组DNA进行了RAPD(random amplified polymorphic DNA)扩增,共检测到65个位点,其中多态位点45个,占69.23%。应用Jaccard公式计算了7个居群在65个位点上的相似性,并以此为基础,应用主坐标排序法作出了7个居群遗传分化的三维排序图,结果表明,浙江省及其邻近地区益母草的遗传性状总体较为接近,7个居群的遗传分化与其地理分布有一定的联系。 相似文献
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油蒿种群遗传分化的RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对油蒿(Artemlsia ordosica Krasch.)的5个种群进行了研究.用15个随机引物扩增出297条清晰谱带,其中285条为多态性谱带.利用POPGENE 32软件对数据进行处理,结果如下:(1)油蒿有着丰富的遗传多态性,多态位点百分率达96%,各种群多态位点百分比在84.6%~90.9%之间.(2)油蒿的种群间分化较小Gat=0.1364,86.36%的遗传变异存在于种群内,各种群的遗传一致度都在96%以上(3)聚类分析显示,地理分布近的种群被聚到了一起,反映了油蒿种群的遗传分化和地理距离有着一定的相关性. 相似文献
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Wolf spiders are predators in large quantities in the fields. How wolf spiders keep their dominant species status under long-period pesticide force? To answer this question, eight geographical populations of Pardosa pseudoannulata were used as materials to test the influence of geographical habitats on their genomic DNA polymorphism. The RAPD pattern showed polymorphic variations among and within different populations. Total 84 bands amplified by 10 random primers, of which 62 (73.81%) are polymorphic, were generated from 55 individuals of eight geographical populations. Meanwhile, Shannon’s index (Ho= 0.5177) showed a rich genetic diversity of P. pseudoannulata, and most of the genetic variation (64.24%) was found within populations. Multiple regression analysis suggested that it is the climatic variation (such as annual average temperature etc.) that results in adaptive eco-geographic differentiation, and it is the long-period pesticide force that speeds up the genetic differentiation of P. pseudoannulata which changed the genetic diversity of the population. 相似文献
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中国水仙种质资源的遗传多样性分析 总被引:11,自引:1,他引:11
用随机扩增多态DNA(RAPD)标记方法对中国水仙主要栽培品种及不同的生态类型进行了遗传多样性检测。从98个随机引物中筛选出16个有效引物,共扩增出120条DNA带,其中多态位点39个,占32.5%。相对其他作物,中国水仙遗传多样性水平偏低。中国水仙遗传多样性贫乏可能是现有中国水仙品种稀少的重要原因。用UPGMA法对各样品间的Nei氏相似性系数进行聚类分析。结果显示,崇明水仙与漳州水仙亲缘关系十分密切,平潭水仙与漳州水仙亲缘关系相对较远。平潭水仙和崇明水仙各居群内的遗传分化很小,而漳州水仙居群内遗传多样性较为丰富。以栽培品种看,单瓣水仙与重瓣水仙亲缘关系密切,“金三角”与单瓣水仙、重瓣水仙两者的亲缘关系较远。基于研究结果,提出采用新技术引进新种质选育水仙新品种的思路和保护中国水仙资源的重要性。 相似文献
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利用RAPD研究星天牛地理种群间亲缘关系 总被引:7,自引:0,他引:7
利用随机扩增的多态性DNA(RAPD)方法对分布在我国甘肃、宁夏、内蒙、河北、西安、青岛、福建、江苏等16个地区,美国纽约、芝加哥、新泽西3个地区和韩国2个地区的光肩星天牛及其近缘种星天牛共23个地理种群进行了研究.实验筛选出17个多态性引物产生了219个多态性位点,RAPD聚类分析表明,美国和中国的光肩星天牛种群之间存在显著差异,遗传关系较远. 相似文献
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不同地区桐花树种群的分子遗传变异分析 总被引:9,自引:0,他引:9
利用RAPD和ISSR两种分子标记,对4个不同纬度桐花树种群的遗传多样性和遗传分化进行探讨,根据RAPD和ISSR数据计算遗传距离并进行聚类分析.结果表明,4个种群桐花树遗传变异性低,4个纬度桐花树种群分为南北两个类群,海南和广西为1个类群,广东和福建为1个类群.利用Shannon's指数计算4个种群的遗传多样性,广西种群多样性指数最高,福建种群最低.大部分的遗传变异存在于种群内(64%),小部分的遗传变异存在种群间(36%).本文同时探讨了种群遗传保护和引种策略. 相似文献
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中药溪黄草及其药用近缘种的RAPD分析 总被引:6,自引:0,他引:6
运用14个有效的10mer寡核苷酸引物对中药溪黄草原植物线纹香茶菜Isodonlophanthoides及其药作近缘种基因组DNA进行PCR扩增,共检出194个位点.其中单态位点14个,占72%;多态位点180个,占928%;分类群特有位点108个,占557%.用UPGMA法对分类群间的Jacard相似性系数和遗传距离进行聚类分析.结果表明,狭基线纹香茶菜和细花线纹香茶菜与溪黄草的亲缘关系较近,而溪黄草与线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、细花线纹香茶菜之间的亲缘关系远.可用RAPD技术对中药的正本清源、真伪品及质量进行研究. 相似文献
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Genetic diversity and geographic pattern of wild lotus (Nelumbo nucifera) in Heilongjiang Province 总被引:6,自引:0,他引:6
XUE Jianhua ZHUO Lihuan ZHOU Shiliang 《科学通报(英文版)》2006,51(4):421-432
1MATERIALS AND METHODS1.1PLANT MATERIALS FROM AUGUST TO SEPTEMBER IN2004,WE TRAVELED EX-TENSIVELY IN HEILONGJIANG PROVINCE LOOKING FOR THE WILD LOTUS.THE WILD LOTUS WAS FOUND AT40LOCALITIES AND49ACCESSIONS OF SAMPLES WERE COLLECTED AT THESE LOCALITIES(FIG… 相似文献