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相似文献
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1.
本文以大肠杆菌、地钱叶绿体和鸡线粒体基因组中tRNA结构基因的全部拷贝数为分析总体,统计出了碱基分布,在大肠杆菌中证实了Pu52-Py62半不变核苷酸对,排除了A21的共有性,确认了24个共有核苷酸,基中半数核苷酸参加三级氢键的形成作用;螺旋区碱基标准配对率平均为95%;在非标准配对中以GU为主而且集中在两个连续双螺旋的缺口处,又发现在第10、27、49位G居多现象,其意义有待阐明,大肠杆菌tRNA序列与地钱叶绿体tRNA序列极为相似,鸡线粒体tRNA由于缺乏典型的D环和TψC环而与大肠杆菌tRNA序列差别较大。本文还计算了大肠杆菌tRNA基因拷贝数与密码子利用率之间相关系数(r=0.976),并讨论了影响细胞内tRNA含量的基因剂量效应,位置效应诸问题。  相似文献   

2.
九江年降水时间序列的混沌特性   总被引:15,自引:0,他引:15  
魏一鸣  孙国栋 《江西科学》1998,16(3):141-145
针对近百年来九江年降水时间序列资料,应用分形理论,探讨了不同嵌入相空间下时间序列关联维的变化规律。计算得到了其饱和关联维数d=5.08,最低嵌入维m=9以及Kolomogorov熵k=0.452。结果表明,九江年降水时间序列是一混沌序列。从而,为进一步建立年降水预测预报模型奠定了基础。  相似文献   

3.
以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.  相似文献   

4.
SD序列矩阵表示与保守性   总被引:4,自引:1,他引:3  
提出用矩阵形式表示一组核酸序列的方法.以大肠杆菌SD序列(在起始密码子ATG前-1~-25位点的25个碱基范围内)为例给出了表示各位点单碱基、相邻双碱基、相邻三碱基出现的矩阵形式,并计算了体现序列的保守性、关联性的M(l)值,发现大肠杆菌SD序列保守性,相邻双碱基、三碱基关联性与基因表达水平成正相关关系  相似文献   

5.
水蛭素基因的递归PCR合成和在大肠杆菌中的表达与分泌   总被引:6,自引:0,他引:6  
水蛭素是凝血酶最强的特异抑制剂,可望成为预防和治疗各种血栓疾病的有效药物。根据医用水蛭头部水蛭素(HV-2)的氨基酸序列,通过递归PCR,合成水蛭素基因,并重组到本实验室改建的大肠杆菌分泌型表达载体pIN-=ompA-HI中,使水蛭素基因的编码序列直接位于大肠杆菌外膜蛋白A信号肽序列的下游。转化大肠杆菌DH5α,筛选出重组体,经PCR,限制酶切图谱和序列分析,结果表明所合成的水蛭素基因与设计完全一  相似文献   

6.
本文以大肠杆菌、地钱叶绿体和鸡线粒体基因组中:RNA结构基因的全部拷贝数为分析总体,统计出了碱基分布。在大肠杆菌中证实了Pu52-Py62半不变核苷酸对,排除了A21的共有性,确认了24个共有核苷酸,其中半数核苷酸参加三级氢键的形成作用;螺旋区碱基标准配对率平均为95%;在非标准配对中以GU为主而且集中在两个连续双螺旋的缺口处,又发现在第10、27、49位G居多现象,其意义有待阐明。大肠杆菌tRNA序列与地钱叶绿体tRNA序列极为相似,鸡线粒体tRNA由于缺乏典型的D环和TψC环而与大肠杆菌tRNA序列差别较大。本文还计算了大肠杆菌tRNA基因拷贝数与密码子利用率之间相关系数(r=0.976),并讨论了影响细胞内tRNA含量的基因剂量效应,位置效应诸问题。  相似文献   

7.
根据大肠杆菌高表达序列重新设计了人干扰素α—2b基因编码区的核苷酸序列,应用化学合成的方法合成了多个互补DNA片段,经互补片段分别退火和连接后,将完整编码区分两段分别克隆于pUC19质粒中,进行DNA序列分析,分别选取序列完全正确的两种克隆片段进行重组,获得了与设计序列完全一致的含有完整编码区的人干扰素α—2b基因。  相似文献   

8.
为了解耶尔森菌强毒力岛(HPI)在鸭致病性大肠杆菌中的流行情况,根据HPI结构基因irp2和fyuA参考序列设计了引物,用PCR方法对从成都等地分离的64株鸭致病性大肠杆菌和28株健康雏鸭泄殖腔拭子分离的大肠杆菌基因进行了扩增和检测,并对5个菌株相关基因进行了克隆和序列分析.结果表明,irp2和fyuA携带率在鸭大肠杆菌病分离株分别为40.6%(26/64)和39.1%(25/64),在健康鸭泄殖腔大肠杆菌分离株分别25.0%(7/28)和21.4%(6/28).鸭大肠杆菌病分离株携带fyuA和irp2的阳性率显著高于健康鸭大肠杆菌分离株(P<0.05),HPI毒力岛的携带率与菌株的致病性呈明显的正相关.分析表明相关基因与GenBank中参考序列的同源性高达98%以上.  相似文献   

9.
谷氨酸脱氢酶是生物体内最主要的氧化脱氨基酶类,为了进一步研究其功能,我们以大肠杆菌DH5α菌株基因组DNA为模板和相应的寡聚脱氧核苷酸为引物,进行PCR扩增大肠杆菌NADP特异性谷氨酸脱氢酶基因(NADP-specific glutamate dehydrogenase,gdhA gene),将所得DNA片断连接到质粒pUC18上,转化大肠杆菌DH5α,进行蓝白筛选和酶切鉴定,经测序证明序列正确无误后将gdhA基因连接到表达载体pTrcHisC上,在大肠杆菌BL21(DE3)中表达,经SDS-PAGE和双波长扫描分析,确定大肠杆菌谷氨酸脱氢酶在大肠杆菌中表达时以包涵体的形式存在,未能检测到可溶性蛋白的表达,表达量可达菌体总蛋白的15%以上.  相似文献   

10.
维持某种生物细胞生长所必需的基因被称为是这个物种的必需基因.这些基因组成了该物种生存所需要的最小基因集合.本文构建了必需基因数据库(DEG)以及探索必需基因数据库的可能应用,应用Z曲线方法分析了枯草杆菌(Bacillus subtilis)中必需基因和非必需基因的核苷酸分布,并且通过蛋白质序列比对的方法对大肠杆菌(E.coli K12)的必需基因进行理论预测,同时分析了大肠杆菌基因组当中必需基因的功能分类,探讨了通过序列比对的方法确定微生物必需基因的可行性.  相似文献   

11.
空间数据集成研究--以空间数据仓库的构建为例   总被引:2,自引:0,他引:2  
随着空间数据复杂性的增加,现有的空间数据库和空间分析工具已经不能提供足够的决策支持,迫切需要建立大量具有历史数据,以及不同尺度的空间数据仓库.在建设空间数据仓库的过程中,数据集成是一个重要的环节,专门针对空问数据的集成更是一项艰巨的工作,本文在研究了现有的空间数据库,空间数据仓库以及空间数据集成的基础上,首先探讨了空间数据仓库模型的建立过程,然后系统提出了面向空间数据仓库数据模型的数据集成的两个主要的方面:不同数据源的空间数据的集成;不同尺度维上的空间数据的集成.  相似文献   

12.
动态数据距离与动态数据几何辨识-恢复   总被引:1,自引:0,他引:1  
应用P-集合,提出动态数据偏离度概念与动态数据距离的概念。动态数据偏离度包括内-动态数据偏离度、外-动态数据偏离度与内-外动态数据偏离度;动态数据距离包括内-动态数据距离、外-动态数据距离与内-外动态数据距离。应用动态数据偏离度与动态数据距离,得到动态数据的辨识与恢复定理,给出信息系统动态稳定数据的几何辨识准则,并给出应用。动态数据距离使得信息系统动态数据辨识与恢复直观化,是研究信息系统数据变化的一个几何工具。  相似文献   

13.
基于XML的异构数据源间数据交换的实现   总被引:1,自引:0,他引:1  
基于Web Service,XML设计开发了可配置的灵活数据交换集成中间件,阐述了数据集成中间件的关键难点部分的设计,如确定数据源、数据源数据和XML数据之间的映射、Select和Insert等命令的语法检查、转换规则的建立等.所开发的中间件在档案和办公系统的数据集成中得到了应用,很好地完成了对异构数据源数据的数据检索、交换、迁移以及数据更新的任务.  相似文献   

14.
给出数据分离与它的属性状态特征生成的基本理论。利用逆P-集合的结构与动态特征,给出数据外分离,数据内分离与数据外-内分离概念,给出数据分离特征,给出数据分离生成的属性状态特征。给出数据补充定理,数据删除定理与数据补充-删除定理。给出数据外分离的属性基数定理,数据内分离的属性基数定理与数据外-内分离的属性基数定理。论文给出的理论结果是数据分离生成的特征。  相似文献   

15.
地质灾害多源数据一体化集成   总被引:1,自引:0,他引:1  
针对地质灾害多源性特点,从空间特征表现和属性表征两方面分析了地质灾害多源数据的差异性,提出地质灾害多源数据的一体化集成.并从空间数据与非空间数据、图形数据与属性数据、多尺度数据和多格式数据等方面探讨了地质灾害多源数据一体化的集成模式.  相似文献   

16.
随着人类社会逐步迈入以情感计算、自然语言处理等智能技术为核心支撑的人工智能时代,数据的战略资源地位日益凸显,数据治理已成为推进高校教育治理现代化的关键工具。人工智能赋能高校数据治理的基本逻辑主要体现在数据管理、数据质量、数据决策与数据服务4个层面。高校数据管理忽视“多方协同管理”、缺乏相对统一的数据质量标准、数据决策在权责限定与顶层设计方面存在缺失、数据服务潜能激发不力制约数据价值高效释放等可被视为人工智能赋能高校数据治理的现实挑战。对此,应创设落位智能共管的高校数据管理职能优化机制、完善校本化高校数据挖掘与共享质量标准、构建基于责权厘定的智能化数据决策体系、优化指向数据价值释放的智能数据服务体系。  相似文献   

17.
针对传统方法对数据库中的数据进行检索的过程中,在海量冗余数据干扰时存在无法区分检索数据类别,降低数据检索的效率和精度的问题,提出一种基于特征模糊接近的海量冗余数据干扰下数据库中数据优化检索方法.利用数据模糊集间的接近度表述海量冗余数据干扰下数据库中数据的一致度,结合数据融合技术,对类间数据实现分类处理.利用模糊集算法准确查询分类数据,对分类数据实现二次聚类计算,细分其类边缘,通过加载辨别函数实现数据定位,完成数据检索.实验结果表明:该方法进行数据检索时具有较高的检索效率和精度,且抗干扰能力较强.  相似文献   

18.
以整合银行数据为例,提出了数据处理的二级架构形式。指出数据处理的概念模型设计、数据源分析和数据抽取转换的方法策略。以目标数据为依据,针对数据源中存在的冗余数据和语义冲突数据、不完整数据和错误数据以及格式或定义不一致的数据分别给出清洗的业务规则,使用SQL Server的DTS工具予以实现并上线使用。  相似文献   

19.
文章分析了国外对地观测数据处理中心的发展趋势,指出了我国对地观测数据管理中存在的问题与差距,提出了我国对地观测数据中心的建设方案:建立数据处理中心并提供深层次服务;建立数据共享机制,促进数据共享与服务;资源优化与整合。为了促进陆地观测数据共享与应用,必须建立国家陆地观测数据中心,建立的数据中心包括数据处理、归档、分发与服务。国家对地观测数据中心必将改善对地观测数据共享与应用,满足对地观测数据的需求。  相似文献   

20.
具有数据清理功能的交互式数据迁移及应用   总被引:7,自引:0,他引:7  
针对众多论文对数据迁移的研究多是泛泛地介绍数据迁移的方法,而没有考虑数据迁移过程中的数据清理问题,提出了一种具有数据清理功能的交互式数据迁移技术.该技术把数据迁移和数据清理紧密地结合在一起,具有开放的规则库和算法库.通过在规则库中定义规则以及从算法库中选择合适的清理算法,不仅能灵活、准确地完成数据的迁移,还能保证数据迁移后新系统的数据质量.该技术被应用于医疗保险信息系统再工程项目,取得很好的效果,从而说明这种数据迁移技术在实践中是可行的.  相似文献   

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