蛋白质组学的研究进展

蛋白质组学是近几年出现的生物学者研究的热点和新领域.人类基因组"工作框架图"的完成,标志着后基 因组时代的来临,在后基因组时代,研究的中心将从揭示生命的所有遗传信息转移到在整体水平上对功能的研究,主 要以蛋白质组为中心阐述了一些与其相关的概念、研究内容、技术及其应用方面的研究进展;在这其中,蛋白质组学 的相关概念包括结构基因组学和功能蛋白质组学;而研究技术主要有2-DE技术、生物质谱技术、蛋白质芯片技术以及 生物信息学技术等.     

蛋白质组学用于疾病特殊蛋白质的鉴定

蛋白质组学是一门新的启动技术.它将便利越过一切生物学系统或疾病的蛋白质系统分析.在疾病特殊蛋白质的鉴别过程蛋白质组学高度补充基因组方法,且第一次提供科学家使蛋白质组信息,表达mRNA,它们各自的蛋白质和亚细胞定位一体化的能力.期望会导致对疾病机制新的重大认识.     

蛋白质组学研究策略及质谱技术的应用

蛋白质组学研究的不断深入依赖于其研究技术的不断改进和完善.近年来质谱技术广泛用于生物大分子的鉴定,由于其技术的不断发展和进步,在蛋白质组学中的应用也越来越广泛和深入,为蛋白质组的分析和鉴定提供了极大的便利.     

蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用

蛋白质组学是在细胞的整体蛋白质水平上进行研究、从蛋白质整体活动的角度来认识生命活动规律的一门新学科.由于生命的表现形式最终是由蛋白质决定的,因此,从蛋白质组的角度研究肿瘤的诊断与治疗具有积极的现实意义.     

蛋白质组技术的研究进展

基因组学的研究已从结构基因组学转移到功能基因组学上来。以大规模分析蛋白质作为其主要内容的蛋白质组是功能基因组学研究的一个主要内容。综述了蛋白质组研究所使用的主要技术，包括：二维凝胶电泳技术、质谱技术、蛋白质芯片技术、蛋白质复合物纯化技术、酵母双杂交技术、嗜菌体显示技术。     

蛋白质组学及其相关技术的研究进展

对蛋白质、蛋白质组、蛋白质组学、蛋白质组学相关技术(尤其是双向凝胶电泳技术)作以简要介绍，并对孽领域近年来的发展动态进行了综述．     

蛇毒蛋白质组学研究进展

就蛇毒蛋白质组学研究的主要方法、所取得的成就及存在的问题进行了综述.利用高通量质谱技术对蛇毒组分进行全方位研究,是近年来蛋白组学研究中的一个热点.蛇毒蛋白质组学研究包括粗毒分离、质谱分析及生物信息学鉴定三个部分.粗毒分离的主要方法包括双向电泳、凝胶过滤及反相-高效液相色谱;质谱分析的方法包括基质辅助激光解离-飞行时间质谱、液相色谱质谱联用、电喷雾离子化串联质谱和电喷雾离子化傅立叶变换离子回旋共振质谱;而利用MS-Fit或Mascot搜索引擎访问相应的蛋白质专门网站对质谱所获肽序进行查询则是生物信息学鉴定的主要方法.迄今,利用蛋白质组技术已经对游蛇科、眼镜蛇科、蝰科中的58个属100多种（亚种）蛇毒的毒物进行了研究,鉴定出了十多个蛋白质家族.这些结果不仅有助于增强人们对毒素进化与分化以及中毒机理的了解,并对新药设计中的先导化合物寻找具有重要意义.未来,蛇毒蛋白质组学研究在与高通量蛇毒组的绝对定量及所鉴定蛋白的功能表征有关的方法技术方面仍有待突破.     

蛋白质组学及其研究进展

蛋白质组学作为后基因时代研究的一个重要内容,已广泛深入到生命科学和医药学的各个领域,近年来蛋白质组学技术发展迅猛。本文对蛋白质组学的概念、产生背景进行了介绍,综合论述了蛋白质组学的技术路线以及研究进展。     

蛋白质组学研究与应用

蛋白质组学是继基因组学之后20世纪末兴起的前沿学科热点．阐述了蛋白质组的概念、蛋白质组学研究的内容与特点和研究意义；综述了蛋白质纽学研究中蛋白质组样品的制备方法、所运用的蛋白质组分离技术、鉴定技术等研究技术手段及其特点，以及蛋白质组学在基础生物学、基础医学、疾病诊断与治疗、新药研究开发中的应用现状与前景；介绍了国内、外蛋白质组学研究领域的最新进展．     

基因组学与蛋白质组学

介绍了基因组与基因组学、蛋白质与蛋白质组学的概念及功能基因组学和蛋白质组学的研究方法。     

质谱技术在蛋白质组学研究中的应用

随着蛋白质组学研究的迅速发展,质谱技术已成为应用于蛋白质组学研究中的强有力工具和核心技术。质谱技术的先进性在于为蛋白质组学研究提供的通量和分子信息。笔者重点概述了基于质谱路线的蛋白质组学研究,介绍了基于质谱的定量蛋白质组学﹑翻译后修饰蛋白质组学、定向蛋白质组学、功能蛋白质组学以及基于串联质谱技术的蛋白质组学数据解析的研究进展。     

植物线粒体巯基亚硝基化修饰蛋白质组学研究进展

蛋白质S-亚硝基化是一氧化氮(NO)与蛋白质半胱氨酸残基(Cys)共价连接形成S-亚硝基硫醇(-SNO)的过程,被认为是植物中体现NO生物活性的最重要途径.线粒体在依赖S-亚硝基化的NO信号转导中起关键作用.综述了应用蛋白质组学技术鉴定的植物线粒体S-亚硝基化蛋白质的特征,为认识线粒体NO调控网络体系中重要的信号与代谢通路(如光呼吸、三羧酸循环、氧化磷酸化、活性氧分子(ROS)稳态,以及蛋白质加工与周转)提供了线索.     

叶绿体巯基亚硝基化修饰蛋白质组学研究进展

蛋白质S-亚硝基化是NO与蛋白质的半胱氨酸残基共价连接形成S-亚硝基硫醇的过程.叶绿体内快速变化的氧化还原环境容易导致蛋白质S-亚硝基化修饰发生.综述了植物逆境应答过程中叶绿体蛋白质S-亚硝基化参与调节的光合电子传递、卡尔文循环、抗氧化系统、蛋白质合成、蛋白质加工与周转、Ca~(2+)介导的信号转导、氮同化、硫同化,以及四吡咯化合物合成等途径,为全面理解植物逆境应答过程的NO调控网络机制提供了线索.     

玉米蛋白质组学研究进展

玉米是世界上分布较广的作物,是我国三大农作物之一。文章简要介绍了蛋白质组学的基本概念和重大意义,详细综述了有关玉米的蛋白质组学研究进展,并分析了存在的问题和发展前景。     

双向电泳技术在蛋白质组学中的应用

双向电泳技术在蛋白质组学研究领域中一直处于核心地位。此文从基本原理、方法、在蛋白质组中的应用以及方法的局限性和相关技术改进等方面做了简要综述,为进一步开发利用该技术提供参考依据。     

An in-depth analysis of proteomics expression profiling in rat glomeruli utilizing LC-MS

Glomeruli are an essential functional element of renal filtration. The majority of renal diseases caused by glomerular sclerosis or fibrosis may result in renal dysfunction. A fomulate protein profile, a comprehensive analysis of glomeruli of normal rats was conducted in this study via protein spectrum. Functional annotation and classification of these proteins were performed and it was found that 26 had the same glomerule (endothelial cells, podocytes and mesangial cells) markers with proteins.     

水稻叶片低温应答蛋白质组学研究进展

近年来,人们利用高通量蛋白质组学技术分析了水稻(Oryza sativa L.)叶片低温应答过程中蛋白质组的动态变化特征,在水稻叶片中鉴定到了504种低温响应蛋白质.系统分析了这些蛋白质的丰度变化模式,综述了水稻叶片应对不同程度低温胁迫(5~15℃处理0~8 d)过程中参与光合作用、糖类与能量代谢、胁迫与防御、转录与蛋白质代谢、信号转导,以及膜与转运等过程中的蛋白质丰度变化特征,为全面理解水稻低温应答的分子网络调控机制提供了线索.     

植物半胱氨酸可逆氧化修饰蛋白质组学技术研究进展

活性氧(ROS)介导的蛋白质半胱氨酸(Cys)可逆氧化修饰对于调控植物发育和逆境应答过程具有重要意义.近年来新发展起来的高通量氧化还原蛋白质组学技术包括:基于荧光素、生物素-巯基特异性试剂、同位素亲和标签(ICAT)、巯基特异性串联质量标签(CysTMT/iodoTMT),以及iodoTMT与同位素标记相对和绝对定量(i TRAQ)试剂联用等标记技术.这些技术的发展完善为系统研究植物蛋白质氧化还原修饰提供了重要手段.综述了植物Cys可逆氧化修饰蛋白质组学技术的研究进展.     

高丹草及其亲本种子胚差异蛋白质组学分析

 高丹草是综合高粱和苏丹草双亲优良性状的一年生禾本科饲草,其杂种优势特别明显,但杂种优势形成机理还不明确。为了揭示高丹草杂种优势形成机理,本研究以杂种高丹草及其亲本的成熟胚为试材,利用Label free结合质谱技术,采用生物信息学分析方法在蛋白质组学水平进行研究。研究结果鉴定出差异蛋白124个,其中加性积累蛋白48个,占差异蛋白总数的38.71%,加性积累蛋白中上调蛋白19个,下调蛋白29个。鉴定出非加性积累蛋白为76个,占差异蛋白总数的61.29%,非加性积累蛋白的表达模式以超高亲表达所占比例最大（29个）,其次是偏高亲表达模式（18个）,偏低亲表达模式次之（14个）,另外还有超低亲表达模式（10个）,以及不属于该四种表达模式蛋白5个,因此,加性积累蛋白在高丹草成熟胚杂种优势形成上起主导作用。加性与非加性积累蛋白涉及多个功能组,主要是胁迫响应、碳水化合物代谢、转录调控、发育调控、信号转导、蛋白质代谢等功能类别。