CAP适合弯曲DNA的时候

由对细菌的生长,到对高等生物的发育,结合DNA的蛋白质都起到极其重要的转录调节作用。曾被认为,和这些蛋白质结合DNA的几何形状,似乎并无太大变化,只是形成或采纳了某些轻微的弯曲或纽结。但由转录激活剂所提供的证据说明,DNA是极度弯曲的。如今,由舒尔茨(Schultz)、希尔德(Shield)和施泰茨(Steitz)测定了这种复合物的结晶结构,进一步证实了DNA的弯曲是很大的.在上月发表的一篇文章里,柯波拉(Kerppola)和柯伦(Curran)表明;在拉链致癌蛋白质Fos和Jun内,它们同族DNA都是弯曲的;而且,DNA作为蛋白质的被动骨架的观点被放弃,而两者间的关系,被视为是平等协作。但DNA结构的这些变形,是如何转化为生物学功能的呢? 我们对DNA-蛋白质之间相互作用动力学的认识是逐步深入的,随着由X-射线结晶学核磁共振光谱学对DNA结合蛋白质结构的确定。抑制物蛋白质的螺旋转向螺旋的和DNA结合的基序,在同源区内出现相同效应,证实了蛋白质α-螺旋的“真实”DNA顺序,是以大沟形式出现的开始预想。现在,可把形成特异顺序的这种方式,扩伸进锌指蛋白质内。对于DNA-亮氨酸拉链间的相互作用,这也许是关键。但试图总结快速发展的这一课题,类似于为迎面奔驰而来的火车拍照;即使螺旋沟构型的观点不再普遍了。汤姆·施泰茨(Tom Steitz)和他领导的小组,占据着研究的领先地位。已从对原核生物转录激活剂和分解代谢激活剂蛋白质(CAP,也叫环状AMP受体蛋白质)的结构     

蛋白质结构基因序列不同区域的复杂性

近年来,分子生物学取得了很大的进展,随着基因克隆和测序技术的不断提高和改善,DNA序列数据库正以每年约递增50％的速度飞速增大,从而,对众多的序列进行分析成了一项非常繁重的工作。如果仅仅依靠实验手段已无法适应这一增长速度,引入计算机系统进行分析预测是必然的且是很重要的。     

DNA芯片和蛋白质芯片的制备与检测

微阵列生物芯片技术是近年来小型化技术发展的重要方面。多达2万个以上的基因——占人类表达基因总数的一半——可以被排列在一张厘米见方的基板上，成为定址的探针阵列；每个位点的直径为50～150微米。当样品溶液流经芯片时，溶液中的靶标分子与探针分子相互作用而被捕获。通过研究这样制备的芯片，能了解靶标分子在样品溶液中的浓度，或者它们的理化性质。     

揭开DNA信息制造蛋白质之谜

“2009年度诺贝尔化学奖授予了对一种关键生命过程的研究,即核糖体如何利用DNA的信息制造蛋白质,进而制造生命。这项研究扫清了目前抗生素研究中的许多障碍,研究成果可以立即被采用,这为日常生活带来许多实质性的创新,也为科学探索提供了新的工具。”     

足迹测序——一种快速精确测定被蛋白保护的DNA序列的方法

测定被调控蛋白保护的DNA顺序是阐明基因调控机制的必不可少的环节.为此,通常先将被保护的DNA片段克隆到合适的质粒上,再用化学法测定被调控蛋白保护的DNA序列.但此法操作步骤繁多,又要求多量的DNA,测定的灵敏度也较低.我们设计了“足迹测序”法,它能直接、快速测定已克隆的被蛋白保护的DNA序列.已用此法测定了和结瘤调控蛋白专一性结合的DNA序列.     

植物DNA分子标记技术的研究和应用

植物ＤＮＡ分子标记技术的研究和应用中国科学院化工冶金研究所生化工程国家重点实验室博士后唐巍研究员欧阳藩当代生物学研究的一个重要领域是基因组分析,但是它的进展在很大程度上取决于ＤＮＡ分子标记技术的进步和发展。自从Ｂｏｓｔｅｉｎ和Ｗｈｉｔｅ等于１９８０年...     

DNA改组在腺相关病毒定向进化中的发展及其应用

DNA改组(DNA shuffling)是一种高通量的突变、筛选技术, 自1994年提出以来, 经过了几十年的发展, 其在DNA、酶和药物蛋白等的改造上都有突出的表现. 腺相关病毒(adeno- associated virus, AAV)是一种细小病毒, 由于其无致病性和能有效呈递基因而成为一种非常理想的基因表达载体. 但是AAV筛除存在一些不足, 如对某些重要靶细胞感染效率不高、存在机体的免疫反应等限制了其临床研究的进展. 应用DNA 改组技术对AAV的衣壳蛋白进行定向进化, 有望解决这些问题. 本文重点综述DNA改组在AAV衣壳定向进化上的技术发展和应用, 并结合本课题组在AAV衣壳DNA改组上的研究工作展开讨论.     

非洲种族和人类线粒体DNA的进化

有关现代人种的所有线粒体DNA型,都是来自生活在约200000年前非洲群体中的一个共同祖先的主张,已引起了足够重视。为了深入研究这种观点,对从不同地区起源的189人中所取的两个mtDNA的可变片段进行了序列测定;189人当中包括了121位本地黑人。从一致mtDNA型中观察到的地理特征,为群体内所共有,不是群体间分担。与这些mtDNA顺序相互关联,而且还关系黑猩猩顺序的世系图,有着许多深的分枝,并全部导向非洲人的mtDNA。     

DNA改组在腺相关病毒定向进化中的发展及其应用

DNA改组(DNA shuffling)是一种高通量的突变、筛选技术,自1994年提出以来,经过了几十年的发展,其在DNA、酶和药物蛋白等的改造上都有突出的表现.腺相关病毒(adenoassociated virus,AAV)是一种细小病毒,由于其无致病性和能有效呈递基因而成为一种非常理想的基因表达载体.但是AAV筛除存在一些不足,如对某些重要靶细胞感染效率不高、存在机体的免疫反应等限制了其临床研究的进展.应用DNA改组技术对AAV的衣壳蛋白进行定向进化,有望解决这些问题.本文重点综述DNA改组在AAV衣壳定向进化上的技术发展和应用,并结合本课题组在AAV衣壳DNA改组上的研究工作展开讨论.     

碘杂环化合物在体外抑制癌细胞DNA、RNA和蛋白质合成能力与分子结构的关系

碘杂环化合物在辐射防护的能量转移机理方面有明显的构效关系,还有降血压和抗心律失常等作用。本文研究了新合成的10种碘杂环及其4种前体和1种类似物在体外抑制癌细胞DNA、RNA和蛋白质合成能力与分子结构的关系。     

p53蛋白两种作用之间的关系

据英国Nature，2006，443：159报道．p53蛋白是脊椎动物DNA损伤响应和肿瘤抑制的一个重要调控因子．原先的研究认为这两种作用是有因果关系的．但最新研究数据却表明了与之相反的结果。     

环状DNA的拓扑手性和拓扑非手性

环状DNA拓扑结构与其功能的关系是近代化学和生物学研究的焦点之一。基于纽     

酵母普立昂：非DNA遗传？

普立昂─—传染性蛋白质颗粒，被认为是引起“疯牛病”、人的克罗依费尔特·雅各布病（CJD）和其他神经疾病的病因。现在似乎又在酵母中不断地蔓延开来。没有理由就此不吃面包，或者不喝啤酒。因为酵母普立昂根本就没有一点表现为健康威胁的暗示。相反，它还可能有助于科学家们找出蛋白质如何能够从细胞到细胞永远保持一种特性（或者疾病）。即采取一种非正常的方式，在新的细胞中补充正常的蛋白质以达到其目的。普立昂能否实现该项绝技─—恐怕优于没有DNA或者RNA的任何可能性─—超过了是否真有普立昂，而成为这场辩论中的一个主要争…     

DNA指纹术

开栏语：纵观历史,执法者一直在寻找将罪凶绳之以法的最佳办法但道高一尺,魔高一丈。罪案常常在夜间或野外发生,因而找不到目击证人,然而,真正的证人却是罪犯留下的隐形证据。法医学家使用最新技术,将这些隐形线索转化为令罪犯难逃法网的铁证。今天,法医学正被用于从司机是否酒后驾车到某国是否在秘密研制核武器的各类判断。本刊将从本期起分类介绍各种法医学手段。1983年11月22日,15岁的英国莱斯特郡少女琳达·曼恩在离家数公里处被发现遭人谋杀现场没有明显证据能表明凶手是谁,但他留下了一丝在当时看来并不太显眼的罪证,这名强…     

用基因枪将外源DNA导入中国对虾

用基因枪的方法,以绿色荧光蛋白（green fluorescent protein.GFP)基因作为报告基因,和带有切割对虾白斑病病毒基因的核酶基因质粒pGDNA-RZ1导入中国对虾受精卵中,利用荧光显微镜分别对各个不同发育时期对虾幼体的处理组和对照组做了检测,绿色荧光蛋白在无节幼体和蚤状幼体中的瞬间表达强烈,对成体的RT－PCR和PCR检测表明,外源的GFP基因已转移到中国对虾体内并有相应的基因产物表达,初步建立了转基因虾的操作方法,为今后虾类基因工程育种在生产实践中的应用奠定了实验基础。