16S rDNA序列技术分析鉴定颗粒污泥中的微生物

采用16S rDNA序列分析技术对降解五氯酚的微氧颗粒污泥形成过程中真细菌和古细菌的种群多样性和动态变化进行了研究.通过对DGGE主要条带进行序列比对,发现颗粒污泥中真细菌和古细菌都与不可培养的微生物具有很高的相似性,微氧颗粒污泥中同时存在好氧菌、微氧菌和厌氧菌.通过比较不同菌的相对数量变化发现五氯酚驯化后的颗粒污泥中产生了一系列对五氯酚降解有利的优势细菌和古菌,如Proteobacteria、Sphingomonas、Methanogenic bacterium等.     

养殖鱼类链球菌病病原的分离鉴定及其16S rDNA分析

从患病的海水网箱养殖鱼中分离到5株链球菌,分别命名为HD-1、HD-2、HD-3、HD-4和HD-50。常规生化结果表明,其中4株即HD-1、HD-2、HD-3和HD-4为海豚链球菌(Streptococcus iniae);另外1株即HD-50为停乳链球菌(Streptococcus dysgalactiae)。分别对上述分离菌株的16S rDNA进行PCR扩增和测序,并与NC-BI中收录的其它链球菌的16S rDNA序列一起进行聚类分析并构建了系统发生树,确定其分类地位。分子分析结果与生化鉴定结果一致。攻毒实验表明以上4株S.iniae均能引起罗非鱼发病,呈现典型的链球菌病症状,并能从发病的罗非鱼脑、心、肝肾和血液中成功回收S.iniae。以上生化和分子生物学鉴定以及罗非鱼攻毒实验结果表明养殖鱼类链球菌病的主要病原为S.iniae,这与国外有关鱼类链球菌病病原的研究报道一致。     

以 16S-23S rDNA 间区序列为目的基因设计 PCR 引物鉴定多杀巴斯德氏菌

多杀巴斯德氏菌是养殖动物(鸡,猪,牛等)的重要致病菌.本研究以16S-23S rDNA间区序列为目的基因设计PCR引物鉴定多杀巴斯德氏菌.通过对多杀巴斯德氏菌ITS-IA(含有tDNA-Ile和tDNA-Ala的16S-23S rDNA间区序列)的测序和与GenBank中序列的BLAST,设计筛选了一对特异引物PS-F/PS-R.对引物的特异性和有效性,用PCR方法进行了验证.结果表明:所有的多杀巴斯德氏菌标准菌株和分离菌株都能被检出,而全部39株非多杀巴斯德氏菌都没有扩增出特异性条带.其检测灵敏度能达到102CFU/mL.研究结果表明,发展了的PCR鉴定方法是省时的和可靠的,整个过程只需要20 h,而传统的鉴定方法需要至少5 d的时间.     

16S rRNA测序在细菌鉴定中的应用

对分离获得的一株细菌P29,经聚合酶链式反应扩增后测定该菌株的16S rRNA基因序列,由16S rRNA基因序列比较可知,菌株P29与肠杆菌属和泛菌属亲缘关系最为接近,16S rRNA基因相似性达到99%.结合生理生化实验结果综合分析后,将其鉴定为泛菌属的成团泛菌.     

铁皮石斛试管苗的RAPD分析及其特异性鉴定引物设计

为了能方便快捷地鉴别出铁皮石斛试管苗和铁皮石斛,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对铁皮石斛试管苗及石斛属23个种进行了基因组DNA多态性分析,从中找出铁皮石斛试管苗特征性条带进行克隆和测序,并根据测序结果设计了特异性引物.采用此特异性引物对铁皮石斛试管苗及石斛属其他一些种进行扩增,结果表明,铁皮石斛试管苗与各地产野生铁皮石斛出现同一特征条带,而石斛属其他种未出现该条带.     

rDNA指纹图的建立及其在细菌分类鉴定中的应用

应用PCR技术,从大肠杆菌中分别扩增出16S、23S核糖体RNA基因(rDNA),以[a-32P]bATP经缺口平移法标记rDNA后作为广谱探针.选用BamhⅠ、EcoRⅠ、HndⅢ等不同限制酶,对肠杆菌科细菌及一起沙门氏菌食物中毒暴发分离株进行染色体DNA酶切,凝胶电泳分离各片段后,通过Southem杂交,获得各菌株rDNA指纹图.每个细菌都可以从rDNA的限制性片段长度多态性(RFLP)得到鉴定,rDNA指纹图显示出种特异性,明确地区分出引起食物中毒的可疑传染源.该法特异性强、重复性好,既可用于细菌的分类鉴定,也可作为分子流行病学调查的工具.     

16S rRNA基因技术在油藏微生物生态研究中的应用

分子生态学技术的发展大大促进了人们对环境中微生物群落的研究，也为研究油藏微生物群落和微生物采油技术提供了一个新的工具，尤其16S rRNA基因技术应用于油藏微生物生态研究．该技术克服了基于细胞水平研究方法的不足，能更准确、更客观地揭示油藏微生物的多样性、群落动态变化、种群结构及进化等方面的信息．文章简要综述了16S rRNA基因技术发展历程及在环境微生物生态学中的应用，详细概述了16S rRNA基因技术在油藏微生物生态研究中的地位和作用以及用于油藏微生物生态研究的16S rRNA基因技术，讨论了16S rRNA基因技术目前在油藏微生物生态研究中存在的问题，通过实例论证了该技术的现场应用效果，重点介绍了胜利油田利用T-RFLP、DGGE等分子生态学技术在河口采油厂罗801区块空气辅助微生物驱和单12区块内源微生物驱研究中的应用，阐明了分子生态学技术在微生物提高原油采收率研究中的重要的意义．     

16S rRNA序列分析在多杀巴斯德氏菌鉴定中的应用

目的应用16s rRNA序列分析方法,对多杀巴斯德氏菌进行鉴定。方法采集猝死家兔样本,进行病理组织学检查和病原菌分离培养。针对细菌16S rRNA基因保守区序列设计一对引物,以分离菌株抽提的DNA为模板,进行PCR扩增及16S rRNA序列分析。结果从死亡家兔肺脏中分离鉴定出了一株多杀巴斯德氏菌(PMr0901)。将分离菌株序列与GenBank中收录的序列进行比较,BLAST分析结果显示PMr0901与多杀巴斯德氏菌参考菌株PM70的16S rRNA核苷酸同源性大于99%。分离菌株对阿莫西林/克拉维酸、头孢曲松、左氧沙星、四环素敏感,而对青霉素G已产生耐药性。结论16s rRNA序列分析的分子生物学方法可用于病原菌的鉴定。     

6S管理模式在制造企业中的应用及其优化

6S管理模式作为一种现代管理方法,对企业的发展有着重要的理论指导和实践应用意义。卷烟制造企业引入6s管理模式,能够有效地推动企业管理进步、管理创新,实现管理水平质的飞跃。以甘肃烟草工业有限责任公司6s管理实践为例,深入分析了应用过程和效果,探讨了需要进一步改进和完善的工作。     

电子计算机在微生物分类和鉴定中的应用

微生物学领域是最早应用电子计算机进行分类、鉴定工作的领域之一。计算机的引入给微生物的分类和鉴定带来了革命性的变化。本文简要论述了电子计算机在微生物分类和鉴定中的应用概况、发展前景，以及数量分类法、提纲式检索表与计算机的关系等问题。     

rDNA ITS序列分析在中药材白花蛇舌草鉴定中的应用

通过测定茜草科Rubiaceae 4种耳草属Hedyotis植物的rDNA ITS序列并比对,为鉴定中药材白花蛇舌草提供分子依据.     

5S原理在食品微生物实验教学中的应用

将5S原理应用于食品微生物学实验教学中,说明了实施5S的措施,并分析了5S的推进层次.实验教学中引入5S后,能有效改进实验质量和效率,改善实验室卫生和安全状况,节约实验耗材,提高学生的综合素质.     

微卫星标记引物的开发及其在棉花中的应用

本文综述了微卫星标记引物开发的三类主要方法:构建基因组文库筛选的方法、直接PCR扩增为基础的方法、数据库筛选为基础的方法。概述了每种方法的实验步骤,总结了其优缺点,提出了新的发展思路,并简述了微卫星标记在棉花中的最新应用情况。     

C-V方法及其在体表损伤图像分割中的应用

法医体表损伤种类的多样性及损伤图像灰度图多峰值、边界模糊等特点决定了精确判定损伤部位的边界十分困难。C-V方法是一种变分水平集分割方法,它结合区域信息使得分割结果全局最优,同时采用水平集函数的表达方式,可以非常自然地处理轮廓线拓扑结构的变化。本文改进了C-V方法中符号距离函数的快速生成算法,并把它用于体表损伤图像分割,实验证明,C-V方法在体表损伤图像的分割中取得了较理想的效果,它可以较清晰地把损伤部位的边缘分割出来。特别是对边缘比较复杂的图像,C-V方法相比传统的分割方法,优势更加明显。     

物种特异性PCR在中药材白花蛇舌草鉴定中的应用

提供中药材白花蛇舌草物种特异性鉴定引物以及建立简便、高效的特异性鉴定方法和研制鉴定试剂盒．为此收集目前市场上出现的所有白花蛇舌草正伪品样品共9种,并测定所有样品的核糖体基因ITS区核苷酸序列,在此基础上设计一对物种特异性引物B174和B53,特异性地鉴定白花蛇舌草．表明用这对引物扩增白花蛇舌草,获得207bp的特异性产物,而其它伪混品样品没有阳性产物．可以认为用白花蛇舌草特异性鉴定引物B174和B53的所配制的鉴定试剂盒具有很好的应用前景．     

小型电子计算机XDJ-16的设计及其在电台自动化中的应用

小型电子计算机XDJ-16是一台多功能的集成电路数字计算机,可以用于生产自动控制、数据检测,数据处理以及简单的数值计算等各个方面,是由西北大学和陕西国际电台共同设计和研制生产的。样机已于76年7月1日联调成功。根据一年来的现场工作情况来看,这台机器性能良好,稳定可靠,得到了有关方面的好评。目前与电台现场联接的外国设备和控制线路已基本装好和连通,正在作电台自动化控制的试验和编制有关控制的工作程序,预计很快即可实现发信台的自动化控制。关于这台电子计算机的详细情况,可参阅“小型电子计算机XDJ-16说明书”。现仅就这台机器的主要技术指标和设计特点以及用于自动化电台的系统的情况作一简要的介绍。     

SAS软件在微生物培养条件优化中的应用

多种实验优化方法已被成功地运用于微生物培养基和培养条件的优化工作中。根据Plackett-Burman设计法和响应面分析法的基本原理,对SAS软件在实验安排和数据分析中的应用进行较为详细的分析。     

臭氧杀菌及其在微生物实验室中的应用

介绍臭氧杀菌机理、特性、影响因素及其在微生物实验室中的应用 .     

固定化微生物技术及其在废水处理中的应用

通过对比介绍了固定化微生物技术的分类方法及常用的固定化载体。同时结合国内外的研究成果 ,归纳综述了该技术在各种废水处理领域中的应用。并分析了该技术的发展前景和亟待解决的问题     

微卫星标记及其在微生物研究中的应用

微卫星标记技术应用于微生物学研究始于20世纪90年代,近几年来发展相当迅速.为了把握这个研究方向和促进该研究领域的发展,作者从微卫星的种类、微卫星在基因组中的分布及其功能、微卫星标记的应用前景等方面进行了概括和总结.介绍了基于杂交的SSR指纹、微卫星引动的PCR、锚定SSR、微卫星位点的PCR扩增、RAMPs标记、SAMPL标记等几种主要方法及其应用情况,并从简单重复序列在基因组中的分布及其功能、遗传标记、遗传作图、遗传多样性分析等方面总结了已有的研究成果.