Analysis of components of conserved “backbone sequences” among genomes of<Emphasis Type="Italic">Shigella</Emphasis> spp. strains

Difference in the genomic compositions of prokaryotes is the basis of the diversity in their biological characters. However, besides their flora- or strain-specific genes, those floras with closer relationship in the evolution also have conserved “backbone sequences”, which reveal the marks of their origin and evolution, and these “backbone sequences” are just the basis of their elementary living abilities and common biological properties. Shigella is very closely related to E. coli in the origin and evolution, and may turn out to belong to the same genus. In this study, a microarray containing E. coli K-12 whole genome and SG01 specific ORFs is used to investigate the genomic components of four Shigella strains. The results indicate that 16%–22% K-12 ORFs sequences are not detected in the genome of Shigella strains while the genome of Shigella contains at least 2800 conserved ORFs, which compose the common “backbone sequences”. Advanced analysis indicated that the “backbone sequences” are the essential components in maintaining the normal physiological activities of intestinal bacteria. Furthermore, only 20% SGO1-specific ORFs exist in other strains simultaneously, which demonstrate the great genome heterogeneity and the genetic diversity among the strains. the first two authours made equal contribution to this work.     

长叶车前花叶病毒上海株(RMVsh)外壳蛋白基因的克隆、序列分析及原核表达

长叶车前花叶病毒上海分离株（RMVsh)是从上海郊区的青菜（Brassica chinensis)上分离鉴定的，以提纯的病毒为材料，SDS－酚法纯化的基因组RNA作为模板，通过RT－PCR方法克服了该病毒的外壳蛋白基因（CP），DNA序列测定结果表明，外壳蛋白基因全长474个碱基，编码157个氨基酸，将CP基因插入原核表达载体pBAD/His-C中，转化E.coli Top10后，诱导表达，经聚丙烯酰胺凝胶电泳分析呈－特异性的蛋白条带，Western blot检测表明，表达产物与RMVsh抗血清呈阳性反应，RMVsh CP基因的核苷酸序列及氨基酸序列与烟草花叶病毒属中其他能侵染十字花科作物的成员相比，同源率分别为83．5％－98．9％和87．9％－99．4％，并讨论了RMVsh的分类地位为烟草花叶病毒属侵染十字花科植物2个亚组中的第一亚组的代表。     

大肠埃希菌ESBLs检测及其耐药性分析

目的探讨本地区大肠埃希菌分离株中超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）的阳性率及产酶株对β-内酰胺类抗生素的耐药性。方法采用双纸片协同法检测菌株的ESBLs,并用Kirby-Bauer法检测了415株产ESBLs的大肠埃希菌对16种β-内酰胺类抗生素的耐药性,并对其标本来源和病区分布进行了分析。结果ESBLs总检出率为50．8％,其中ESBLs检出率较高的科室为普外科、脑外科、肾内科、骨科、呼吸内科。所有大肠埃希菌分离株均对Imipenem和Meropenem敏感。产ESBLs株对其他14种β-内酰胺类抗生素的耐药性均高于非产酶株。结论本地区ESBLs检出率较高,分布科室有特殊性,产ESBLs株对抗生素的耐药性高于非产酶株。     

50例大肠埃希菌超广谱β─内酰胺酶检测结果及分析

目的：了解非临床标本中大肠埃希菌产超广谱β-内酰胺酶(ESBb)的情况及检测最佳底物，以利于ESBLs菌的监控，防止ESBLs菌的传播和区域性流行．方法：用NCCLS推荐的双纸片协同筛选试验和表型确证试验对50例大肠埃希菌进行ESBLs的检测．结果：非临床标本分离的大肠埃希菌产ESBLs阳性率为896，用于ESBLs筛选的最佳底物是CTX，其次为CRO，而CAZ敏感性较差．结论：检测ESBLs，应用双纸片协同法进行初筛，对可疑菌株再用表型确证实验确证．对底物选择应使用两种以上的头孢类抗生素．     

STEC的耐药性监测和分析

目的了解各种标本来源的产志贺样毒素大肠杆菌(STEC)对常用抗生素的敏感性.方法采用WHO推荐的K-B法,进行分鉴定菌株对18种抗生素的药物敏感试验,依照NCCLS判定结果.结果各种来源产志贺样毒素的大肠杆菌共46株,O157型23株,其余为非O157型.全部STEC对复方新诺明耐药,对链霉素耐药率为28.3%(13株),氨苄西林为30.4%(14株),红霉素为69.6%(32株),而且有5株对至少4种以上抗生素产生多重耐药,耐药谱为复方新诺明-链霉素-红霉素-氨苄西林.非O157型STEC耐药菌次为122,而O157型为63.结论非O157型STEC对抗生素可能较易形成耐药性.     

5种克罗诺杆菌鞭毛蛋白fliC基因的克隆和序列分析

根据C.sakazakii BAA 894全基因组序列中fliC基因(Gene ID:CP000783.1),设计特异性引物,通过PCR方法扩增了5种克罗诺杆菌fliC基因的全长序列,并通过生物信息学方法对fliC基因进行了序列分析.序列分析结果表明:fliC基因的全长为837bp,编码279个氨基酸.同源性分析表明:5种克罗诺杆菌fliC基因的序列相似性为92.11%~99.40%;与其它细菌的fliC序列进行比较,其核酸序列同源性为51.73%~82.57%.这表明克罗诺杆菌fliC基因具有较高的保守性,可作为制备克罗诺杆菌多克隆抗体或单克隆抗体的一种候选抗原.     

猪源产ESBLs大肠杆菌三种耐药基因检测及分析

了解福建省闽西地区猪源产ESBLs大肠杆菌耐药现状。从龙岩市10个规模猪场分离的大肠杆菌中,按CLSI推荐的纸片扩散法筛选产ESBLs菌,对其分别用CTX-M、TEM和SHV等3种引物进行PCR扩增及测序分析。结果表明,105株大肠杆菌的产ESBLs检出率为28.6%(30/105);其ESBLs基因亚型以CTX-M型和TEM型为主,检出率分别为56.7%(17/30)和36.7%(11/30),SHV型检出率13.3%(4/30)较低;5株菌同时携带CTX-M和TEM基因,2株菌同时携带CTX-M和SHV基因;测序结果表明,共检测出3种基因型:CTX-M-15、TEM-2和SHV-12。     

大肠杆菌高效表达载体pSY621的构建

基因在大肠杆菌中的表达往往受转录起始区的二级结构所影响,通过改变原有载体ｐＳＹ６００的ＴＩＲ区域的序列,来改造出一个能高效表达的载体ｐＳＹ６２１。在表达载体上接入ＡＮＧ（Ａｎｇｉｏｇｅｎｉｎ）,ＮＴ４（Ｎｅｕｒｏｔｒｏｐｈｉｎ－４）基因,由ＰＣＧＥＮＥ软件来计算二级结构和自由能,设计修改片段,产生新载体ｐＳＹ６２１。通过表达ＡＮＧ,ＮＴ４,ｐＺＰ３（ｐｉｇ ｚｏｎａ ｐｅｌｌｕｃｉｄａ）基因来检测     

新课程理念下高校公共体育课的创新性分析

高校公共体育课程教学模式是按照一定体育教学思想设计,具有相应结构和功能。为真正落实《全国普通高等学校体育课程教学指导纲要》的精神,结合本校实际,对教学指导思想、教学内容和学习评价等要素进行了实践性研究和探讨。