毛细管电泳-前沿分析法在药物-蛋白结合研究中的应用

介绍了毛细管电泳-前沿分析法(CE-FA)的原理、特点以及求解药物-蛋白结合常数的方法,综述了它在药物-蛋白结合研究中的应用及研究概况.阐明了CE-FA方法的优缺点及其广阔的应用前景.     

基于肿瘤蛋白-蛋白相互作用网络的药物靶标发现

基因组学的快速发展在我们面前呈现出了一幅肿瘤基因组的总构架,但目前最大的挑战之一是怎样将这些大量基因组信息转化成针对癌症病人基因变化的有效治疗方法.针对这一挑战,美国国家癌症研究所建立了"癌症靶标研发(CTD2)联盟".作为国家联盟的一员,埃默里大学CTD2中心着重于对癌症基因功能的研究,建立蛋白-蛋白相互作用网络,以助发现新的癌症治疗靶点.为了实现这个目标,笔者团队通过高通量筛选技术和高通量信息学方法的共同应用,快速检测癌症相关蛋白的分子互相作用,并构建了与肿瘤相关的蛋白-蛋白相互作用网络(OncoPPi).此网络将癌症基因与相应的功能蛋白相接,并可用于发现与肿瘤缺陷有关的作用机制、新药物靶标和新的治疗方法.这些数据已存入Emory CTD2中心的portal网站,供大家分享.Emory中心是CTD2联盟一个重要组成部分,联盟内提供实时的数据分享,合作紧密.通过共同努力,笔者团队以及CTD2联盟的目标是发展新的一代肿瘤信号通路干扰药物,实现基因组学基础上的精准治疗.     

中药类保健食品中汞含量的3种测定方法

采用高效液相色谱-电感耦合等离子体质谱(HPLC-ICP-MS)法、微波消解-ICP-MS法和直接进样测汞法测定23批次中药类保健食品中的总汞含量.测定结果表明，3种测定方法的线性相关系数(R)均大于0.999,回收率为80.2%～100.7%,相对标准偏差(RSD)为1.6%～5.3%;HPLC-ICP-MS法能够准确、高效地测定3种汞形态化合物的含量，且测定的总汞含量与其他2种方法基本一致；总汞含量的测定应优先选择直接进样测汞法.     

毛细管电泳法测定胺类手性药物结合常数

采用毛细管区带电泳法,在20℃温度下,选择含不同浓度高磺化-β环糊精（HS-β—CD）磷酸盐缓冲溶液（磷酸盐浓度50mmol／L,pH2．50）,分别试验了HS-β-CD与伯胺、仲胺和叔胺三种胺类手性药物萘乙胺、盐酸异丙肾上腺素和扑尔敏的分离情况,采用双倒数法求解结合常数,结果表明HS-β—CD与叔胺类药物扑尔敏的结合常数最大,并对实验结果进行了讨论．     

一种面向药物-靶点相互作用预测的不平衡数据处理方法

为了解决药物-靶点相互作用(DTI)预测中数据集样本分布不平衡的问题,提出了一种新的数据处理方法。通过词向量特征提取,将原始蛋白质序列信息和药物化学结构信息转换为低维向量特征,组合药物特征和靶点特征来表征药物-靶点相互作用;采用Borderline-SMOTE技术合成少数类样本,以改善数据集的样本分布;最后将处理好的数据输入到梯度提升决策树(GBDT)分类器中进行分类预测。实验结果表明,本文方法不仅能有效提取药物-靶点相互作用的特征,加快特征提取和特征选择的过程,还能缓解数据集的不平衡性对预测结果的不利影响,提高了预测模型的性能。     

0-1整数线性规划的一种组合直接搜寻法

本文提出了一种求解0-1线性规划的组合搜寻技术，首先它把分量取0或1的所有整数向量按分量中所含1的个数进行分类；然后在每类点集中对取1的分量实施适当的组合；最后，根据约束条件搜寻最优解。     

天然气球罐置换的几种方案

根据目前的技术水平和储配站的具体情况,提出了3种天然气球罐置换方案(惰性气体置换法、水置换法、燃气直接置换法),经过方案比较,认为天然气直接置换较为方便、经济。     

金属硫蛋白结合铅离子的竞争反应和置换反应研究

从锌诱导的家兔肝脏中分离纯化得到两种亚型的金属硫蛋白(MTs)：Zn₇MT-Ⅰ和Zn₇MT-Ⅱ,在酸性条件下脱金属得脱金属硫蛋白(apoMTs)。从镉诱导的家兔肝脏中分离纯化得：Zn₂Cd₅MT-Ⅰ和Zn₂Cd₅MT-Ⅱ。采用圆二色性(CD)光谱法和紫外(UV)吸收光谱法研究金属硫蛋白结合铅离子的竞争反应和置换反应。竞争反应显示：Pb²⁺和Zn²⁺竞争结合apoMT-Ⅰ形成的是金属混配的金属硫蛋白;而apoMT-Ⅱ的金属结合位点则完全被Pb²⁺所占据,表明apoMT-Ⅱ对Pb²⁺更为敏感。置换反应显示：Pb²⁺既不能置换出Zn₇MT-Ⅰ中的Zn²⁺,也不能置换出Zn₇MT-Ⅱ中的Zn²⁺;但Pb²⁺能完全置换出Zn₂Cd₅MTs中的Zn²⁺,且其置换行为也存在着亚型上的差异。提示Zn₂Cd₅MT-Ⅱ可能有效地解铅中毒。     

《跳浓驰豫法测定反应速度常数》 实验装置的改进

常规的紫外-可见光谱仪样品室不能满足跳浓实验的快速进样和快速测量的要求,通过改进后的快速进样口,可以缩短进样所需时间,提高跳浓实验的数据记录量程,从而降低了该实验的相对误差.     

一种新的水离子积常数的测定方法

本文提出一种新的用电化学的方法测定水的离子积常数实验方案，实验表明，用该方法此较简便、其结果与其它测定方法所得的结果吻合，因此，该实验方法是测定水的离子积常数的一种新方法。     

考虑多因素交互作用影响的权重确定

引入岩石工程系统（RES）理论的交互作用矩阵构造和编码原理,提出了一种新的考虑多因素交互作刷影响的权重确定方法。基于改进BP网络推导了新的权重确定方法的算法流程,其网络输入层与隐层间以及各隐层间变换函数采用双曲正切函数S型函数tansig;f（x）=2／（1＋exp（-2x））-1,隐层与输出层间采用logsig函数：f（x）=1／（1＋exp（-x）,并采用动量法和自适应学习率相结合训练网络。通过VCR法采场岩爆实例分析,得出了交互作用下岩爆倾向性8个影响因素的作用权重大小,展示了该法的实际应用。     

确定隐函数中参数的最小二乘法

将最小二乘法推广到了隐函数情形，简化了一些实际问题的处理。文中给出了插值和非线性回归两种情况下的最小二乘法原理，并讨论了具体的算例。     

Vertex-searching method for linear interaction programming

In order to solve linear interaction programming, the vertex-searching method is proposed in this paper. First, the existence of equilibrium is analyzed for the model of linear interaction programming. Then the conclusion is obtained in which the equilibrium is in the boundary of the restriction region of linear inter-action programming. Also, a searching equilibrium solution is deduced from the conclusion.     

一种时空采样矩阵的确定方法

在分析数字视频系统时空采样矩阵基本特性的基础上,依据时空采样矩阵的定义,结合实际视频系统扫描和采样结构,采用多点标定,得到了一种确立数字视频流时空采样矩阵的方法.并通过一个应用实例,在时频域上给出了完整的数字视频流结构分布和相应参数,以及两种视频流之间转换的方法,证明了多点标定方法的实用性和有效性.     

液化场地桩-土相互作用大变形无网格法分析

将无网格法应用于地震液化过程中的桩-土相互作用分析.以Biot固结理论的u-p列式作为饱和砂土的控制方程,土的本构关系采用能够描述饱和土体振动液化特征的有效循环弹塑性模型.利用移动最小二乘近似推求形函数,再采用伽辽金法对控制方程离散,获得无网格伽辽金法的基本计算方程.最后,通过优势验证,说明了该方法能有效地避免液化有限元分析时由于大变形所引起的体积自锁而使计算中断等问题.     

分析复合受载裂纹群相互干涉效应的有效方法

对任意二维型裂纹群,受复合载荷作用时的相互干涉效应,本文提出了改进型体积力法。改进之一是采用以每个裂纹中心为基点的相对坐标变换法;其二是采用间接法有效地处理了积分奇异性。计算结果同文献数据相比较,表明了本法更为高效和精确。     

一种有效的分布式构件交互性质验证方法

目的在基于构件的分布式系统开发过程中,更大程度地消除对构件交互风格和交互协议描述与验证产生的所谓的状态爆炸现象。方法提出一种有效的基于π-演算的构件交互协议验证方法——状态约减验证算法,在模型组合之前,将与性质定义无关的状态剥离,然后再进行模型组合。结果用标记转移系统证明了该验证算法的有效性,采用π-演算描述的同步请求/响应交互模型作为例证,证明上述算法比传统算法更有效。结论该算法缩小了组合模型的状态空间,提高了验证效率。     

利用定积分处理实际问题的一种直观方法

对定积分的概念赋予了一个直观化的结果，该结果有利于非数学专业人员利用定积分处理实际问题．     

框架面板式构型卫星冲击响应特性分析方法

框架面板式构型卫星火工品作动时产生的高量级、高频响冲击载荷会导致星上单机设备的损伤,然而板杆耦合的力学特性导致冲击载荷的传递及衰减特性差异很大,分析评估关键部件的响应准确性差.本文通过直接积分法和模态叠加法对框架面板式构型卫星进行瞬态响应分析,比对两种求解方法优缺点并分析影响计算结果精度和时长的可能因素.仿真数据表明,对于爆炸冲击这类作用时间极短、高频成分占激起响应较大比重的载荷,模态叠加法虽然可以通过截断模态选取范围,调整时间步长解决直接积分法计算量大、运算次数多、计算时间长的问题,但易忽略高阶模态、影响计算结果的准确性.通过与地面试验验证结果比对,直接积分法更适应于框架面板式构型卫星的冲击响应分析.     

基于能力谱法的PSSI体系Pushover分析

为了寻求桩-土-结构非线性动力相互作用的简化分析方法,提出了桩-土-结相互作用(PSSI)体系基于能力谱法的pushover分析方法.该方法将PSSI体系经两次等效为等价SDOF体系,并修正了PSSI体系的等价修正阻尼比和能力谱,然后将pushover分析得到的结构能力曲线与需求曲线相结合,得到结构在大震下的峰值反应.能过对一4层3跨的桩-土-结相互作用体系进行实例分析,验证了该方法的可行性,对带桩筏基的剪切型钢筋混凝土结构在大震作用下的非线性反应,能够进行较好的估计.