基于分子对接和网络药理学探寻中、蒙药抗新型冠状病毒感染的有效成分

本研究旨在探索治疗新型冠状病毒感染的有效成分及潜在作用机制。通过查阅文献，寻找蒙医治疗粘疫病、中医治疗疫病的常用药材，并借助TCMSP、Batman等数据库检索所选药材的化学成分，选取OB≥30%,DL≥0.18的化学成分，再与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接计算，选择出结合能小于洛匹那韦的化学成分。通过Swiss Target Prediction,检索出所选化学成分的作用靶点。通过TTD、Drugbank、DisGeNET,筛选出新型冠状病毒感染不同感染阶段的疾病靶点。使用Cytoscape3.7.2软件构建“成分-靶点”网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过GO富集分析和KEGG通路分析，探究有效成分治疗新型冠状病毒感染的作用机制。分子对接和网络药理学结果显示，四氢小檗碱、半甘草异黄酮等成分与ACE2有较好的结合能力，并可通过多靶点、多通路发挥抗新冠病毒作用。黄连、甘草等14味药材可能对治疗新型冠状病毒感染有效。     

ACE2在特定人群中的表达规律与COVID-19易感性和相关性研究进展

血管紧张素转换酶2(ACE2)是一种与冠状病毒刺突蛋白相互作用的感染受体,它介导了 2003年人类严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-CoV)的传播,也是产生2020年新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的受体.目前发现患有低体力活动相关的疾病、慢性疾病、感染性疾病等均与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的易感...     

新型冠状病毒感染实验动物的风险评估

摘要:目的 2019 年 12 月暴发的新型冠状病毒( SARS-CoV-2) 迅速传播,严重影响了社会生活正常运行。 由于新型冠状病毒受体血管紧张素转化酶( ACE2)在人及动物中的保守性,有必要对常见家畜及实验动物的易感性进行评估。 方法 基于 ACE2 的氨基酸序列,分析其在人、实验动物及家畜等动物中进化关系;根据冠状病毒受体结合结构域( Receptor binding domain,RBD)与 ACE2 的结合位点,比较其在物种间的变化,推测不同物种对新型冠状病毒的易感性。 结果 新型冠状病毒与 ACE2 的结合位点在不同物种间较为保守,且 ACE2 受体与新型冠状病毒RBD 的结合位点在人、猴和仓鼠的完全一致。 结论 基于位点比较和 SARS-CoV-2 感染动物特性分析,猴和仓鼠可能对新型冠状病毒较为易感,可以优先选择它们作为 SARS-CoV-2 感染动物模型。     

基于深度学习的SARS-CoV-2 RBD-ACE2结合亲和力预测方法

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的快速变异导致不断出现新的毒株.已有研究表明SARS-CoV-2的S蛋白受体结合域(Receptor Binding Domain,RBD)与宿主ACE2的结合亲和力与病毒的侵染能力相关.随着新型冠状病毒在全球的持续暴发，出现了大量RBD多点突变的新毒株.通过生物试验方式获得突变毒株RBDACE2结合亲和力费时费力，远远落后于突变株的积累，不能满足对该病毒实时监控的需求.为了快速预测具有多点突变毒株的结合亲和力，设计了一种深度神经网络模型.该模型结合卷积神经网络、循环神经网络与注意力机制，从RBD序列上学习关键特征并预测RBD-ACE2的结合亲和力,在真实数据集上对模型进行训练和评估.实验结果表明新模型可以有效地预测关切变异株的RBD-ACE2结合亲和力，也有助于对SARSCoV-2突变株的传播能力进行监控.     

分子对接技术筛选沉香中抗新型冠状病毒活性成分

从沉香中筛选潜在的抗新型冠状病毒活性成分,指导以沉香小分子作为SARS-CoV-2潜在阻断剂和抑制剂药物的研发.根据沉香已知的化学成分,采用分子对接的方法,以血管紧张素转化酶-2(ACE2)、SARS-CoV-2的3CL水解酶(3CLpro)为靶标,通过结合打分值以及与靶蛋白受体的相互作用模式,获得沉香中具有潜在抗SA...     

靶向SARS-CoV-2的纳米抗体研究进展

席卷全球的新型冠状病毒病(corona virus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的,SARS-CoV-2是继严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus, SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(middle east respiratory syndrome coronavirus, MERS-CoV)后人类发现的第三种引起全球大流行的冠状病毒.刺突蛋白(spike protein, S)的受体结合域(receptor binding domain, RBD)可以与细胞表面的血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme2,ACE2)结合,进而入侵细胞内部,启动病毒的复制.为了预防和治疗新冠病毒肺炎,研究人员研发了多种疫苗、小分子药物及抗体药物.纳米抗体(nanobodies, Nbs)是可识别抗原的最小结...     

冠状病毒感染导致急性肺损伤的天然免疫机制研究进展

世界卫生组织在2020年1月31日宣布新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的肺炎为国际关注的突发公共卫生事件,目前疫情已在全世界范围蔓延.肺部是SARS-CoV-2作用的主要靶器官,该病毒通过感染肺泡细胞诱发细胞因子风暴,导致组织损伤并最终造成严重急性呼吸综合征,而天然免疫是人体抗病毒的第一道防线.该文综述肺部宿主细胞通过激活其天然免疫应答抵御冠状病毒入侵以及免疫反应过激后导致肺组织损伤的分子机制,以期为SARS-CoV-2引发的肺损伤治疗提供创新的药物靶标,并为预防和治疗方案设计提供免疫学和病理学基础.     

冠状病毒的致炎机制研究进展及疫苗研发特点

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引发的肺炎(COVID-19)疫情目前已在全球范围内大流行.该文综述了冠状病毒感染介导肺部炎症反应机制的研究进展,从病毒的复制感染和抗冠状病毒中和抗体的产生两方面阐释其可能诱发的炎症反应;进而讨论了当前SARS-CoV-2疫苗的研发特点,对减毒活疫苗、灭活疫苗、病毒载体疫苗、核酸疫苗4条不同的技术路线进行介绍,以期为COVID-19疫情的防控提供理论参考.     

《自然》：研究发现新型冠状病毒入侵人体途径

英国《自然》杂志网络版3月13日刊登报告说,荷兰研究人员找到了近来广受关注的新型冠状病毒入侵人体的途径,这将有助开发防治新型冠状病毒感染的新方法。     

基于GEO和分子对接的荔枝核黄酮类化合物治疗冠状病毒肺炎机理研究和3CLpro抑制剂虚拟筛选

挖掘冠状病毒感染肺炎的潜在靶基因,以及筛选荔枝核中抑制冠状病毒3CL蛋白酶(3CLpro)的黄酮类化合物.利用GEO数据库下载SARS-CoV感染的小鼠肺炎的基因集,利用R语言筛选差异表达基因.通过文献筛选荔枝核的黄酮类化合物,采用SWISS数据库、DRAR-CPI服务器预测化合物潜在作用靶点.使用String数据库构建成分靶点-疾病靶点互作网络,通过Cytoscape的cytoHubba插件筛选核心靶点.通过DAVID进行GO和KEGG分析,预测冠状病毒感染肺炎的发病机制及荔枝核黄酮类化合物的作用机制.借助分子对接虚拟筛选治疗冠状病毒感染肺炎的黄酮类化合物.筛选得到761个差异基因作为冠状病毒感染肺炎的潜在关键基因,其中上调757个,下调4个,它们主要富集在单纯疱疹感染、PI3K-Akt信号通路、甲型流感、炎症免疫等信号通路.荔枝核中19个黄酮类化合物可作用于380个靶点,在成分靶点-疾病靶点互作网络中挖掘得到100个核心靶点,它们参与调控PI3K-Akt、HIF-1等多条信号通路.分子对接结果显示,柚皮芸香苷、柚皮苷、原花青素A2、原花青素、芦丁5个黄酮类化合物与3CLpro抑制剂...     

瑞德西韦对冠状病毒抑制作用的研究进展

冠状病毒(CoV)作为人畜共患病毒,轻可致人出现轻度呼吸道感染症状,重可致高传播性和严重肺部感染等,例如严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)与中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV).2019年底新出现的严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)标志着高致病性冠状病毒在全球的再次流行,目前这种新冠状病毒肺炎被WHO命名为COVID-19.而新型核苷酸类似物抗病毒药瑞德西韦(Remdesivir;GS-5734)作为一种广谱抗病毒药物,对SARS-CoV与MERS-CoV表现出一定的抗病毒活性.本文综述冠状病毒的起源与发展、种类、结构及对人类健康的影响,并针对瑞德西韦的分子结构特点、抗病毒的特点及其治疗人冠状病毒感染的国内外新进展做一系统总结,以期为抗冠状病毒的药物选择提供参考.     

新型冠状病毒肺炎的临床诊断、治疗与流行病学研究

新型冠状病毒肺炎疫情是由一种之前从未发现的冠状病毒引发的传染病,具有许多新的临床和流行病学特点。对新型冠状病毒肺炎的病毒特点、发病机制、传播途径、临床诊断与治疗、科学防控等领域亟需开展应急研究。对目前国内外关于新型冠状病毒肺炎的文献进行梳理,综述了新型冠状病毒肺炎的流行病学特点、防治方法等。     

新型冠状病毒肺炎疫情期间某三甲医院呼吸内科病房管理实践

目的:探讨在新型冠状病毒肺炎疫情期间呼吸与危重症学科(以下简称呼吸科)病房最优管理方案,减少院内感染,为最大程度降低呼吸科住院患者与工作人员感染新型冠状病毒肺炎的风险提供保障.确保医护人员工作顺利开展,增加住院患者的满意度.方法:根据国家卫生健康委员会颁布关于印发新型冠状病毒肺炎诊疗方案第二至第六版以及其他关于医疗物资及不同人群等的管理方法官方文件,结合呼吸科专科病房的工作特点,制定最优的病房管理方案.结果:通过疫情特殊情况下呼吸科病房最优管理方案,我院呼吸科患者满意度平均为91.3分,住院患者无1人疑似或者确诊感染新型冠状病毒肺炎.我院呼吸科工作人员,包括医生、护士、科室工勤人员无1人疑似或者确诊感染新型冠状病毒,病房工作开展顺利.结论:我院呼吸科在疫情期间,病房管理方案有效可行,值得推广借鉴.     

SARS-CoV-2感染诱导宿主炎性损伤的毒理学机制研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已成为国际关注的突发公共卫生事件.SARS-CoV-2的传播、致病机制、疫苗研发等成为当前研究焦点,其感染可诱导宿主靶细胞中病原体相关分子模式(PAMPs)和损伤相关分子模式(DAMPs)激活、介导细胞器损伤和细胞毒性作用,并...     

泛素样蛋白ISG15抗冠状病毒感染作用的研究进展（英文）

干扰素刺激基因15(ISG15,interferon-stimulated gene 15)是一种泛素样蛋白，在调节机体天然免疫和抗病毒感染过程中发挥重要作用。ISG15在针对流感病毒、乙型肝炎病毒、HIV病毒、埃博拉病毒、SARS病毒、中东呼吸综合征冠状病毒、巨细胞病毒等病毒的抗病毒研究已有文献报道。除此以外，最新的研究表明ISG15分子会在新型冠状病毒的木瓜蛋白酶样蛋白酶的作用下失活，从而抑制其抗病毒功能。因此抑制新型冠状病毒木瓜蛋白酶样蛋白酶，除能直接阻断病毒的生命周期、抑制病毒在体内的复制以外，同时也会提升ISG15分子水平，继而间接提升机体免疫能力，降低感染风险。该文介绍ISG15抗新冠病毒的过程，重点介绍ISG15抗冠状病毒作用的特异性，此外，总结新冠病毒通过木瓜蛋白酶样蛋白酶阻断ISG15介导的天然免疫实现免疫逃避的机制，并罗列了潜在的木瓜蛋白酶样蛋白酶的抑制剂。本文从ISG15抗病毒天然免疫的分子机制角度，总结抗SARS-CoV-2药物的最新进展，并对相关药物的研发前景进行展望。     

基于分子对接技术从虾夷扇贝中筛选抗SARS-CoV-2活性肽研究

为从食品原料中筛选具有抗2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)能力的生物活性肽段,选用虾夷扇贝肌球蛋白为目标序列,利用计算机对虾夷扇贝肌球蛋白进行模拟酶解,对酶解所得的肽段进行毒性和生物活性预测。选取活性评分超过0.5且无毒性的肽段,以SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白和COVID-19 Mpro水解酶为靶标进行分子对接,鉴定其病毒抗性。结果表明:肽段CSNAIPEL可以与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的GLN42和GLU329两个关键氨基酸结合,LibDock Score为136.03;肽段LPIY不仅能与SARS-CoV-S/ACE2复合蛋白上的ASP38和TYR491氨基酸结合,还能够与COVID-19 Mpro上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score 分别为142.85和168.04;肽段QRPR与COVID-19 Mpro 水解酶晶体上的THR24、THR25和THR26氨基酸结合,LibDock Score为154.93。研究表明,肽段CSNAIPEL、LPIY和QRPR三者表现出较好的抗SARS-CoV-2能力。本研究旨在为抗新型冠状病毒功能食品的研发提供新的思路。     

皮肤病患者预防新型冠状病毒肺炎个人防护专家共识(第一版)

2019年12月以来,湖北省武汉市陆续出现新型冠状病毒感染引起的以肺部病变为主的新发呼吸道传染病,即新型冠状病毒肺炎(COVID-19),之后呈现快速蔓延.该病具有发病迅速、传染性强、病程变化快等特点,因此采取甲类传染病的预防、控制措施.当前全国正处于新型冠状病毒肺炎防控工作的紧张阶段,皮肤病患者多存在皮肤屏障功能受损情况,会增加易感性.因此,皮肤病患者的个人防护工作亦极为迫切.针对上述问题,我们组织美国、英国、澳大利亚,中国香港、中国澳门、中国台湾及中国多省市著名专家、教授联合编写了皮肤病患者个人防护专家共识,内容较为翔实,以满足当前抗击新型冠状病毒肺炎疫情工作的需要,帮助皮肤病患者更好地做好个人防护.     

中西医结合治疗一例新型冠状病毒肺炎出院患者的疗效观察

进行中西医结合治疗新型冠状病毒感染肺炎的疗效观察;结合国家卫健委发布的新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案,对甘肃省首批,我院首例新型冠状病毒肺炎病人进行中西医结合治疗,在治疗过程中根据病情变化随时调整治疗方案,确保患者病情得到及时救治;经过中西医结合治疗,患者于入院后第8天经专家组评估符合国家新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案解除隔离和出院标准,病愈出院;经中西医结合治疗,患者病愈出院,中西医结合治疗能有效缓解症状,改善预后,最大程度降低病死率。     

COVID-19粪便传播可能性的研究

2019年12月由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引发的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)爆发,并在短时间内迅速蔓延至全世界,对全球公共卫生造成了严重威胁.SARS-CoV-2主要通过飞沫和近距离接触进行传播,具有较高的感染率.病毒进入人体后,主要在肺泡中复制,引起肺中炎症反应加剧,损害肺组织,严重患者出现急...     

全国23个省市区新型冠状病毒肺炎中医药防治方案用药规律探讨与分析

2019新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是一种急性感染性肺炎,属于中医"湿毒疫"范畴.随着疫情形势的发展,从国家卫生健康委员会(以下简称"国家卫健委")、国家中医药管理局(以下简称"国家中管局")到全国各省市,均结合各地气候特点、人群体质和患者临床表现,相继发布中医药防治方案.近期,全国疫情逐渐得到有效控制,中医药在新型冠状病毒感染的肺炎防治中已显示出明确疗效.笔者通过对全国23个省市区对外发布的新型冠状病毒肺炎中医药防治方案进行系统整理归纳总结,分析其用药规律,探寻中医药防治疫病的疗效优势和特色作用,以期为疫情的诊治和指导临床合理用药提供一定的参考.