用分子对接搭建激酶-抑制剂复合物的三维结构

由于蛋白激酶的异常激活导致了许多疾病,激酶抑制剂成为当今医药领域的研究热点.鉴于分子对接在药物设计中取得的成功,该技术被应用于激酶抑制剂的设计.应用分子对接软件包 Autodock4 对已知三维结构的激酶一抑制剂复合物进行模拟对接,对接所得抑制剂构象与晶体结构非常一致.进一步利用对应激酶在其他体系中的结构与抑制剂进行对接.也获得了与晶体结构一致的抑制剂构象,再现了抑制剂和蛋白间重要的相互作用,从而阐明了利用 Autodock4 探索激酶一抑制剂结合模式的可行性.     

多齿配体二(2-苯并咪唑亚甲基)胺的分子结构与构象研究

利用X-射线晶体结构数据及多种计算方法,研究了多齿配体二(2-苯并咪唑亚甲基)胺的最低能量构象和配位构象.分析表明两种构象截然不同,最低能量构象中两个苯并咪唑平面互相平行,有芳环堆积效应,而配位构象则整个分子张开,有利于金属离子的进攻.     

白术多糖的溶液构象及其变化

采用刚果红实验判断白术多糖WAM在溶液中的构象特征,通过测定不同溶液体系中多糖分子的黏度、比旋度、紫外吸收光谱和圆二色谱的变化来研究多糖构象及其变化规律.实验结果表明:WAM不具有螺旋结构,温度、金属离子、变性剂均可以使WAM构象发生改变.WAM在溶液中以无规则线团形式存在.     

钙离子对S100A1蛋白聚合形式的影响

S100A1是钙结合蛋白家族S100亚家族中一个小分子量的酸性蛋白．研究S100A1蛋白分子在溶液中的构象均一性随不同钙高于浓度的变化规律，发现钙离子浓度的提高促使S100A1蛋白的寡聚化，稳定蛋白质分子的构象。     

猪胰蛋白酶及其自溶活性产物的圆二色性研究

用圆二色性谱(CD谱)研究了猪胰蛋白酶及其自溶活性产物在溶液中的构象,并观察了在十二烷基硫酸钠(SDS)溶液中酶分子构象的变化。 猪胰蛋白酶的CD谱显示有相当量的α-螺旋成份及少量β-折叠成份,它在190nm附近的[θ]值远大于牛胰蛋白酶。其自溶活性产物的CD谱显示α-螺旋的成份减少5—6％,β-折叠成份上升3—6％,而有序部分所占比例基本不变,提示自溶后α-螺旋转化为β-折叠。 在SDS溶液中,α-螺旋和β-折叠在胰蛋白酶分子中所占的比例提高,而α-螺旋成份增加更为明显,表明酶分子的有序度提高。 参照Chou与Fasman以及Chen,Yang与Martinez等人的方法,预测猪胰蛋白酶有36％的氨基酸残基可以形成α-螺旋,由实测CD谱计算,亦在37％左右,两者相符。     

卵清溶菌酶激话剂的研究Ⅱ——溶菌酶与激活剂LIA,底物相互作用的紫外差光谱

紫外差光谱是研究蛋白质在溶液中构象的有用工具,能揭示蛋白质中多种生色的氨基酸残基的存在和状态,并广泛用于多种酶类的必要基团、作用机理、过液态的存在等多方面的研究。前报I已证明,激活剂LIA能显著提高溶菌酶的活力,且是以无竞争的方式,随机地与溶菌酶结合的机理使其催化能力成倍地提高。显然,激活剂的加入使溶菌酶的结构,特别是在溶液中的空间构象发生了有利于催化作用的变化。为了弄清LIA诱导的溶菌酶构象的变化及在激活作用中所涉及的分子机理,我们进一步探索了溶菌酶与激活剂,底物相互作用的紫外差光谱。     

N’-芳基-N-烷氧羰基硫脲类化合物活性构象的理论研究

以N’-(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基)-N-甲氧羰基硫脲和N’-3-吡啶基-N-乙氧羰基硫脲的晶体结构为模板分子,运用密度泛函理论(DFT)方法,对设计的N’-芳基-N-烷氧羰基硫脲类化合物可能构象进行了系统地研究.通过对分子内氢键的形成方式和分子总能量的比较分析,得到了优势构象,并根据分子的电荷分布、前线分子轨道等信息,进一步对其活性差异给予了的评价.     

我国烟草种植区划研究进展与展望

以N’-(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基)-N-甲氧羰基硫脲和N’-3-吡啶基-N-乙氧羰基硫脲的晶体结构为模板分子,运用密度泛函理论(DFT)方法,对设计的N’-芳基-N-烷氧羰基硫脲类化合物可能构象进行了系统地研究.通过对分子内氢键的形成方式和分子总能量的比较分析,得到了优势构象,并根据分子的电荷分布、前线分子轨道等信息,进一步对其活性差异给予了的评价.     

穴醚（2,2）及其硝酸镧配合物的核磁共振研究

根据对穴醚（２，２）及其硝酸镧配合物在乙腈溶液中的＾１Ｈ ＮＭＲ谱、＾１３Ｃ ＮＭＲ谱、＾１Ｈ－＾１Ｈ相关ＮＭＲ谱及＾１Ｈ－＾１３Ｃ相关ＮＭＲ谱的分析，讨论了它们的溶液结构。穴醚（２，２）在乙腈溶液中具有几种不同的构象，它们处于快速互变的平衡中。在溶液中，穴醚（２，２）具有与晶体结构相同的对称性。在穴醚（２，２）硝酸镧配合物溶液中，Ｌａ＾３＋的配位作用把穴醚（２，２）的几种构象迅速平衡的结构固定下     

两亲分子在溶液表面吸附层中的构象和熵模型

以吸附热力学结果为依据,建立两亲分子在溶液表面上的统计学的吸附熵模型,并阐明吸附层中分子的构象。首先,从吸附自由能计算两亲分子中羟基露出表面的程度;然后应用分子内转动－振动光谱数据所理的熵求出两亲分子在吸附过程中的熵变,并与偏克分子吸附熵的实验值进行比较,以鉴定结论之合理性。     

几个包含胱氨酸类环肽的合成及结构研究

以胱氨酸二甲酯、酒石酸二酰氯、对苯二甲酰氯、草酰氯为起始物,在高度稀释的条件下进行反应,合成了24,28,30元环的3个类环肽,收率分别为40%,12%,30%.FAB-MS结果证实,在反应条件下分别得到了2 2和3 3产物.1HNMR研究证实,这些类环肽在DMSO-d6中分别具有C2或C3对称构象;而胱氨酸二甲酯与对苯二甲酰氯缩合得到的产物在CDCl3中是多种构象的混合物.     

兰索拉唑在不同溶剂中的核磁共振波谱研究

利用核磁共振技术(<'1>H NMR,<'13>C NMR,DEPT-135,<'19>F NMR,HSQC,HMBC)对兰索拉唑在两种不同极性的溶剂(DMSO-d<,6>和CDCl<,3>中的氢谱和碳谱进行了全归属.通过速率常数解释了两种不同溶剂中氢谱和碳谱位移差别的原因.     

人参皂甙－Rb_l对脂质体DPPC的作用机理

通过对人参皂甙－Ｒｂ１与脂质体ＤＰＰＣ作用的核磁共振谱和拉曼光谱的研究，表明人参皂甙－Ｒｂ１是作用于ＤＰＰＣ磷脂分子的极性头部．     

阿立哌唑的合成

目的:研究非典型抗精神病药物阿立哌唑的合成路线及工艺.方法:通过优化反应溶剂、反应温度、反应时间及加料方式,以7-羟基-3,4-二氢-2-(1H)-喹啉酮为起始原料,经N-溴丁基化和O-烃基化合成了阿立哌唑.结果:阿立哌唑的结构通过IR、1H-NMR(CDCl3)及13C-NMR(CDCl3)确认.结论:本方法反应条件温和,操作简便,且提高了反应收率.     

防治森林病虫害的油烟剂研制

<正>防治森林病虫害的油烟剂,以溴氰菊酯、氯氰菊酯和百菌清为主剂,０￣＃、１００￣＃、１２１０￣＃为主要载体,并加入适量助剂研制的杀虫、杀菌油烟剂,其理化性能符合技术质量要求。白鼠急性毒性表明;溴氰菊酯油烟剂是微毒农药制剂,百菌清油烟剂是低毒农药制剂,符合使用要求。     

二棕榈酰磷脂酰胆碱LB膜诱导下草酸钙晶体生长的SEM研究

目的：利用二棕榈酰磷脂酰胆碱（DPPC）的Langmiur-Blodgett膜（简称LB膜）作为模板诱导草酸钙晶体的生长,进而模拟生物体内尿结石的形成和抑制。方法：采用扫描电子显微镜（SEM）,对磷脂DPPC的L膜诱导过饱和溶液中生长的草酸钙晶体的密度增加、尺寸增大。但很小（π=1mN/m)时,几科没有草酸钙晶体,随着膜压增大,草酸钙晶体的密度增加、尺寸增大。但当膜压增加到35mN/m时,晶体却特别稀少。结论：作为模板的DPPC的LB膜的膜压不同时,可以诱导生成具有不同形状、不同密度和尺寸的CaC2O4晶体。LB膜中DPPC分了间的距离与CaC2O4晶体的结构相匹配是CaC2O4晶体定向生长的主要原因。     

三种杀虫剂对大眼隐翅虫(Stenus sp.)捕食功能的影响

实验运用功能法评价了高效杀虫剂、氧乐果乳油、杀虫双水剂等三种杀虫剂对大眼隐翅虫捕食功能的影响．结果表明，由于大眼隐翅虫对各种农药的敏感性不同，杀虫剂造成的大眼隐翅虫的死亡率和残存大眼隐翅虫的捕食功能减退率均不同．高效杀虫剂对大眼隐翅虫的作用最明显，杀虫双水剂作用较小．     

溴氰菊酯对蚯蚓体重及体内纤维素酶乙酰胆碱酶活力的影响

通过急性和亚急性暴露实验研究发现,不同浓度的溴氰菊酯可使蚯蚓体重降低,形态发生伤害性改变.进一步分析蚯蚓体内纤维素酶活力和乙酰胆碱酶的活力,结果显示:溴氰菊酯不同浓度、不同作用时间对蚯蚓体内的纤维素酶活力、乙酰胆碱酶活力有不同程度的抑制作用.     

溴代苝四羧酸二酐的合成及表征

目的合成1,6,7,12-四溴-3,4,9,10-苝四羧酸二酐。方法以3,4,9,10-四酸二酐为原料,经过溴代反应,合成1,6,7,12-四溴-3,4,9,10-苝四羧酸二酐,并利用硅胶柱色谱进行纯化,用TLC薄层色谱检测反应进程及纯化后产物的纯度,利用~1H NMR进行表征检测。结果 1,6,7,12-四溴-3,4,9,10-苝四羧酸二酐的产率为52.2%。~1H-NMR(400MHz,CDCl_3):8.88(s,4H)。结论以3,4,9,10-四酸二酐为原料,合成了1,6,7,12-四溴-3,4,9,10-苝四羧酸二酐,计算了其产率,并用~1HNMR、元素分析进行了结构表征。     

溴氰菊酯降解菌Pseudomonas sp.P1-1-B3产酶条件的优化

农药降解酶对去除农药残留污染具有良好的应用前景.从海洋沉积物中筛选到一株高产溴氰菊酯降解酶的菌株Pseudomonas sp.P1-1-B3,研究了碳源、氮源、pH值、培养温度、培养时间、接种量及溴氰菊酯对菌株产酶的影响.结果表明,降解菌产酶的最适条件为:以可溶性淀粉作为碳源,m(蛋白胨):m(酵母浸膏)=2:1为氮源,pH 7.5,温度30℃,培养时间2 d,接种量3%,溴氰菊酯含量15μmol/L.在此条件下,菌株产酶的比活力最大为113.3 U/mg.该降解酶对溴氰菊酯的降解,在12 h内降解率达54.6%.