壳菜果亚科（金缕梅科）与相关亚科的核糖体DNA ITS区序列 …

测定和分析了金缕科壳菜果亚科等各亚科代表属的核糖体ＤＮＡＩＴＳ区和５．８２Ｓ编码区序列。应用最大简约法构建的分子系统树表明;壳菜果亚科（Ｍｙｔｉｌａｒｉｌｉｄｅａｅ）植物形成１个单系类群「含壳菜果属（Ｍｙｔｉｌａｒｉａ）和山桐材属９Ｃｈｕｎｉａ）」,支持壳菜果亚科作为１个独立的亚科。本研究所得到的ＩＴＳ数据表明马蹄荷亚科（Ｅｘｂｕｃｋｌａｎｄｉｏｉｄｅａｅ）与红花荷亚科（Ｒｈｏｄｏｌｅｉｏｉｄｅａ     

金缕梅亚科ITS序列分析及其系统发育初探

对金缕梅亚科部分植物的细胞核核糖体ＤＮＡＩＴＳ区（含５８Ｓ）序列进行分析,并构建分子系统树．结果表明：金缕梅亚科是单系类群;金缕梅族为多系类群,木属是本研究中金缕梅亚科内分化最早的一支,而金缕梅属与弗特吉族关系密切;蚊母树族、狭义的弗特吉族均不形成单系分支,支持蚊母树族与弗特吉族合并;秀柱花属是牛鼻栓属的姐妹群,支持将牛鼻栓属并入秀柱花族     

中国主要红树科植物的分子系统发育

测定和分析了红树科（Ｒｈｉｚｏｐｈｏｒａｃｅａｅ）５属６种植物的ｒＤＮＡＩＴＳ区序列，所构建的ＩＴＳ区分子系统树图表明：红树科植物可形成１个单系的类群．但在部分属种ＩＴＳ序列分析的结果与红树科传统的分类系统有所不同，陆生红树科植物竹节树属（Ｃａｒａｌｉａ）的竹节树（Ｃｂｒａｃｈｉａｔａ）和旁杞木（Ｃｐｅｃｔｉｎｉｆｏｌｉａ）之间的分子差异很大，呈复系演化的特征．旁杞木与红树林主要植物秋茄属（Ｋａｎｄｅｌｉａ）的秋茄（Ｋｃａｎｄｅｌ）和红树属（Ｒｈｉｚｏｐｈｏｒａ）的红海榄（Ｒｓｔｙｌｏｓａ）的关系较近，竹节树则与另一红树林的主要种类角果木属（Ｃｅｒｉｏｐｓ）的角果木（Ｃｔａｇａｌ）呈姐妹群关系．     

金缕梅族ITS序列分析及其系统学意义

对金缕梅亚科１５属植物的细胞核核糖体ＤＮＡＩＴＳ区（含５．８Ｓ编码区）序列进行分析,并构建分子系统树,初步探讨金缕梅族的系统发育,结果表明：金缕梅族呈复系演化特征,Ｊｕ桠亚族Ｊｕ木属和四药门花属是关系密切姐妹群,与蜡瓣花系统关系较近,三者共同构成金缕梅亚科最基部的分支;马岛金缕梅亚族的Ｎｏａｈｄｅｎｄｒｏｎ和毛枝花属是秀柱花族的姐妹群;金缕梅亚族金缕梅属与弗特族亲缘关系较密切,有可能可以合并成一个     

中国金缕梅科12属植物次生木质部的比较解剖

本文采用常规的木材解剖学方法，对我国金缕梅科(Hamamelidacea)5个亚科12属14种植物，进行了木材比较解剖学研究。结果表明，本科中最原始的是金缕梅亚科(Hamamelidaceae)的榴木属；最进化的是同亚科的蚊母树属和水丝梨属。这说明金缕梅亚科内部各属之间的进化程度并不一致。其它4个亚科中的7个属，进化程度处于榴木属和蚊母树属、水丝梨属之间。壳菜果和枫香树这两个亚科内，各自的属间进化程度较为一致。马蹄荷亚科与红花荷亚科均各只有一个属，它们的进化程度相对于金缕梅亚科的3个属来说，较为居中，且彼此也很相近。总的来说，除了金缕梅亚科内部各属进化程度差异较大以外，剩下的4个亚科进化程度都较为接近。在同一亚科内，属间木材结构有一定的差异，但程度有所不同。     

外类群对构建基因树的影响

以金缕梅科枫香亚科和睡莲目的分子数据为例，初步探讨了不同的单一外类群、复合外类群和随机外类群对构建基因树的影响．基因树比较的结果表明：与内类群亲缘关系较近的单一外类群能反映较多信息，而复合外类群与其中１个或多个单一外类群的结果相同，应用随机外类群则可获得一个粗略的分支关系．     

16SrRNA基因序列变异和中国野鲮亚科鱼类单系性研究

形态和分子系统学的研究结果均表明,鲤科中的鲃系是一个单系类群,由鲃亚科、鲤亚科、裂腹鱼亚科和野鲮亚科组成,但它们各自的单系性及相互关系还没有系统发育证据.采用PCR方法获得了27种鱼类的16S rRNA基因序列,其中包括18种野鲮亚科鱼类,代表了中国野鲮亚科13个属.应用邻接法、最大简约法、最大似然法和Bayesian法分别构建其分支系统图.结果表明,野鲮亚科鱼类形成了一个单系类群,并且包括两个主要分支类群:其中一支包含鲮属、缨鱼属和墨头鱼属;另一个支系包括野鲮属、拟缨鱼属、异华鲮属、卷口鱼属、唇鲮鱼属、泉水鱼属、直口鲮属、盘鮈属、纹唇鱼属和华鲮属.分子系统学的研究表明,传统分类学中使用的一些形态特征,如口唇及其相关结构等,可能是趋同进化的结果,并不完全与其系统发育进化相一致.     

游蛇亚科(Colubrinae)二种蛇核型研究

以骨髓细胞直接制备染色体标本，首次报道了游蛇属的环纹游蛇（Ｎａｔｒｉｘａｅｑｕｉｆａｓｃｉａｔａ）和白环蛇属的黑背白环蛇（Ｌｙｃｏｄｏｎｒｕｈｓｔｒａｔｉ）的核型，其中黑背白环蛇的核型为围内白环蛇属核型首次报道。结果表明，环纹游蛇２ｎ＝４０，１６（１Ｍ＝５ＳＭ＋２ＳＴ＋８Ｔ）．２４ｍ（♀），Ｎｏ．４和ＺＺ／ＺＷ型性染色体，Ｚ染色体为Ｍ型，Ｗ染色体为ＳＭ型。黑背白环蛇２ｎ＝４２，１６（４Ｍ＋１２Ｔ）     

基于线粒体细胞色素b基因序列的蜻亚科部分种类分子系统学研究(蜻蜓目:蜻科)

通过PCR及PCR产物的直接测序技术，测定了蜻蜓目蜻科蜻亚科的灰蜻属、宽腹蜻属和蜻属共7种蜻蜓的线粒体DNA细胞色素b基因的部分核苷酸序列（长度为576bp），探讨了蜻亚科的分子系统学．在所有序列中A＋T平均含量较高，为70．2％，而氨基酸密码子第3位点的A＋T平均含量最高，为85．4％．多态住点数为180个，占总位点数的31．25％，显示出DNA序列变异丰富．基于邻接法、最大简约法和贝叶斯法的分子系统发生，分析结果支持灰蜻属是较进化的类群，宽腹蜻属次之，蜻属是相对分化较早、较古老的类群，这3个属的关系是蜻属→宽腹蜻属→灰蜻属。     

拟单性木兰属近缘植物matK基因的序列分析

测定了木兰科（Ｍａｇｎｏｌｉａｃｅａｅ）拟单性木兰属（Ｐａｒａｋｍｅｒｉａ）等１０种（１１个样）植物的叶绿体ＤＮＡｍａｔＫ基因部分序列（１０３９碱基对）．最大同源性分析构建的系统树图建议：①拟单性木兰属与单性木兰属（Ｋｍｅｒｉａ）有极近的同源关系;②木兰属（Ｍａｇｎｏｌｉａ）的玉兰亚属（ＳｕｂｇｅｎｕｓＹｕｌａｎｉａ）与拟单性木兰属和单性木兰属关系亦很近,并形成１个单系分支;而木兰属的２个亚属,木兰亚属（ＳｕｂｇｅｎｕｓＭａｇｎｏｌｉａ）与玉兰亚属之间的关系却较远,木兰属内呈并系演化特征;③木兰亚属,木莲属（Ｍａｎｇｌｉｅｔｉａ）以及玉兰亚属、拟单性木兰属和单性木兰属所组成的分支形成一个单系分支．拟单性栏属、单性木兰属的系统位置,以及它们与栏属之间的关系需要重新考虑     

小豹斑鹅膏遗传多样性研究

小豹斑鹅膏子实体形态多样,不同地域所采标本有较大差异.作者应用ISSR及ITS分子标记,对采自12个不同地区的小豹斑鹅膏居群进行了遗传多样性及聚类分析.结果表明,12条ISSR引物扩增的多态性条带比例(PPB)为72.84%,居群间的基因分化系数(Gst)为0.426 1,表明小豹斑鹅膏具有丰富的基因多样性,其中57.4%存在于居群内,42.6%存在于地理隔离较远的居群间;12个地区样品的IST序列长度皆为710 bp,有30个碱基位点在ITS1区发生变异.2种方法的遗传距离分析及聚类结果基本相似,都表明小豹斑鹅膏的遗传分化与地域的相关性较大.ISSR揭示遗传分化及遗传变异的能力较ITS强.     

Cloning,Sequencing and Phylogenetic Study of rbcL Gene from Cyanobacteria Arthrospira and Spirulina

Large subunit gene of rubisco (rbcL) of cyanobacteria Arthrospiraplatensis FACHB341, A. platensis FACHB439, A. maxima OUQDSM and Spirulina sp. FACHB440 is cloned, sequenced and characterized. Results show that GC content of the gene in strain Spirulina sp. FACHB440 is higher than that in the others. The alignments based on deduced amino acid sequences indicate that Spirulina sp. FACHB440 is different from that in other three samples of Arthrospira, though they have the same conserved functional sites (95, 98, 121, 124, 221, 257). The nucleotide sequence similarity among the three strains of the genus of Arthrospira (96.5 - 99.6% ) is higher than that between Arthrospira and Spindina (78.1 - 78.5 % ). By comparison of the corresponding sequence of other cyanobacteria, a phylogenetic tree with two clusters is constructed. A. platensis FACHB341, A. maxima OUQDSM and A.platensis FACHB439 form the monophyletic linage, which is fully supported by bootstrap values (1000), while Spirulina sp. FACHB440 and Anabaena sp. PCC7120 cluster in another linage with the bootstrapvalue of 909.     

Hierarchical recognition on the taxonomy of <Emphasis Type="Italic">Nitzschia closterium</Emphasis> f. minutissima

Nitzschia closterium f. minutissima, a marine eukaryotic unicellular diatom, originally classified as Bacillariophyta/Bacillariophyceae/Bacillariales/Bacillariaceae/Nitzschia, is one of the most important feed sources in mariculture. In this study, its morphological features were examined under DIC Microscopy （differential interference contrast microscope）; its pigments and fatty acids composition were analyzed by using High Performance Liquid Chromatography （HPLC） and gas chromatography （GC）; the complete Actin cDNA, part 18S rDNA, complete ITS1 and ITS2 sequences, part 28S rDNA sequences, and a putatively encoding A5 fatty acid desaturase gene were cloned respectively and further functioned in transgenic yeast. The sequence alignments were separately conducted using the related sequences from Nitzschia closterium f. minutissima, Cylindrotheca closterium （Bacillariophyta/Baci- Ilariales/Bacillariaceae/Cylindrotheca） and Phaeodactylum tricornutum （Naviculales） with ClustalX 1.83. No distinct difference was discovered between N. closterium f. minutissima and P. tricornutum in both biochemical and molecular level. Their identity was more than 99.6% among 18S rDNA, 5.8S rDNA and actin-gene sequences, and is up to 98.6% even among ITS1 and ITS2 sequences. Their △5 desaturase similarity was 99.4%. However, the lower similarity was disclosured between N. closterium f. minutissima and Cylindrotheca closterium, which shared less than 40% identity in the ITS1 and ITS2 sequences. So, N. closterium f. minutissima should not be placed in Bacillariales, Bacillariaceae, Nitzschia, but in Naviculales, Phaeodactylaceae, Phaeodactylum, and it was actually a strain of P. tricornutum.     

基于rDNA ITS序列的何首乌PCR-RFLP分子鉴别

为建立何首乌(Fallopia multiflora)DNA分子鉴别技术,对何首乌及其常见混淆品的rDNA ITS（核糖体DNA内转录间隔区）序列进行了扩增和测序,运用CLUSTAL X、MEGA软件对该区进行序列分析.结果表明：何首乌与毛脉蓼（F. multiflora var.cilliinervis）、翼蓼（Pteroxygonum giraldii）及耳叶牛皮消（Cynanchum auriculatum）在ITS1区的差异率分别为6.9%、18.1%、42.0%,在ITS2 区的差异率分别为10.0%、19.4%、43.9%,而何首乌种内各居群间ITS1 和ITS2 区的差异分别为0%～2.13% 和0%～1.03%．进一步利用premer premier 5 找出了一个位于ITS2间区的何首乌特征性NsbI酶切位点,将何首乌rDNA ITS 序列PCR扩增产物用NsbI酶切后可得到得一个含约531 bp和109bp的二片段PCR－RFLP图谱, 而其混淆品rDNA ITS 序列PCR扩增产物不能被NsbI酶切,图谱呈单一条带.建立的PCR－RFLP方法简单易行,可用于何首乌原植物的鉴别．     

“活化石”植物银杏形态与分子进化（Ⅰ）

测定了银杏雌株核糖体ｒＲＮＡ基因转录间隔区ｒＤＮＡＩＴＳ区全序列共１１７２碱基对,其中ＩＴＳ１长７８８碱基对,ＩＴＳ２２２６碱基对,５８ＳｒＲＮＡ基因１５８碱基对．采用计算机分析软件对所获得序列进行比较分析．结果表明：形态上仅有很少变化的银杏,其个体之间有明显的分子差异,不同产地栽培株ｒＤＮＡＩＴＳ区序列的核苷酸差异值高达２５％,这一差异远远大于一般意义上种间的距离,表明了该类植物形态上的变化与分子进化的不一致．造成形态与分子进化不一致的原因有待进一步探讨．     

光柄筒冠花核糖体DNA ITS区序列

测定中国特有植物光西风筒化的ＩＴＳ区序列,分析了其结构特征,Ｇ＋Ｃ百分含质量及序列变异性,并比较了光西风筒冠花与其他被子植物的ＩＴＳ区序列特征。光柄筒冠花的ＩＴＳ区和５．８Ｓ ＤＮＡ的总长度为６０９个核苷酸。其中ＩＴＳ－１为２０７ｂｐ,ＩＴＳ－２为２３６ｂｐ,５．８ＳｒＤＮＡ为１６６ｂｐ;总的ω（Ｇ＋Ｃ）为５９．１１％,其中ＩＴＳ－１为６４．２５％,ＩＴＳ－２为５７．６３％和５．８ＳｒＤＮＡ为５３