生物大分子序列一级结构同源性分析的算法及其软件实现

本系统是用微机来实现生物大分子序列一级结构的同源性分析，对生物学家在一级结构同源性分析的科研工作中具有一定的实用价值。本系统是在寻找保守区的基础上进行率匹配，分别使用了顺序搜索法，优先队列法及分枝定界法，并采用了深度优先与广度优先的搜索方式以及对角线方向扩展，相邻对角线传递等技术，在实现过程中，采用了运算速度快的结构程序语言——Ｃ语言，并运用数据结构的技巧提高了系统的使用效率．     

生物大分子序列一级结构同源性分析专家系统

介绍了一个在微机上用Ｃ语言开发的专家系统的实现。该专家系统试图模拟生物大分子序列一级结构的同源性分析过程，为生物学家进行生物实验和进一步的理论研究提供依据。     

分子树在生物进化论研究中的作用

本文对分子树在生物进化论研究中的作用进行了综合性阐述     

生物序列数据挖掘技术研究

生物序列数据是生物信息数据中重要的一部分,研究生物序列解读其隐含的生物学意义是生物信息学研究的热点和难点。数据挖掘是当前分析大规模数据的有效工具之一,已广泛应用于分析生物序列数据,并取得了许多研究成果。文章综述了生物序列数据挖掘的关键技术,包括序列比对算法、DNA序列模式挖掘、关联、分类、聚类分析、RNA二级结构预测、蛋白质序列分类和聚类分析,最后展望未来研究方向。     

概率密度函数的特征相关法DNA序列分析

提出了一种客观的特征提取和相关的方法用于DNA序列的结构分析.这种方法是从DNA序列码的碱基和片段码中提取统计特征和相关特征.然后计算样本序列和已知类之间的平均相关系数.如果最大的相关系数大于对应类的平均相关系数,则该样本被分类到对应的类中去.利用一组DNA序列样本做了试验,结果表明,这种方法适合于任何DNA序列的结构分析而不需要先念的生物信息,对发掘人类基因隐藏信息的研究大有用处。     

五指山猪生长激素基因全序列克隆及序列分析

通过筛选一对引物，PCR扩增五指山小型猪GH基因全序列，并进行克隆测序分析、序列分析及氨基酸分析．结果表明，有98个位点不同，同源性为95．026％，外显子有2个碱基发生了突变，其中外显子2有1个位点的碱基突变导致了氨基酸异义取代。     

基于生物特征的随机序列发生器

利用生物特征本身内在的独特性、不可预测性和不可重复性等随机特性和外部随机噪声(光照、损伤等)给出了基于生物特征的随机序列发生器.以虹膜为例,通过Canny算子对虹膜图像进行边缘检测,得到二值化图像,提取值为“1”的坐标(i,j),利用f(i,j)=cos(i×j),得到[-1,1]之间的随机序列.使用标准随机统计测验FIPS 140-1 tests检验产生的随机序列.结果表明:和其他随机序列发生器相比,该发生器不仅具有优良的随机性,而且实现简单、方便,提供了真随机序列的一种产生方法.     

序列模式挖掘算法在生物序列的应用研究

生物序列相对于传统序列来说具有自己的特征。不同的序列模式挖掘算法应用到生物序列中有不同的特点和效率。本文分析目前比较流行的五种模式挖掘算法的运行过程，当应用到生物序列中时，分析了各个算法的性能，从而可以得出哪种算法更适应于不同类型的生物序列频繁模式挖掘。     

人类基因组与DNA序列分析

对人类基因组计划作了概述,介绍了人类基因的基本知识,并对DNA序列分析进行了报导。     

序列模式挖掘算法在生物序列的应用研究

生物序列相对于传统序列来说具有自己的特征。不同的序列模式挖掘算法应用到生物序列中有不同的特点和效率。本文分析目前比较流行的五种模式挖掘算法的运行过程,当应用到生物序列中时,分析了各个算法的性能,从而可以得出哪种算法更适应于不同类型的生物序列频繁模式挖掘。     

用NMR数据研究多肽序列的计算机自动分析

本文描述一个自动执行软件，它是根据核磁共振ＣＯＳＹ，ＮＯＥＳＹ，ＴＯＣＳＹ和ＺＱＳＹ或ＤＱＳＹ的数据进行核磁共振谱的归属以及蛋白内残基序列自动分析，比较了一些方法的优缺点最后用来计算γＴＧＦ－α修筛１６肽的序列及归属。     

犬源Hepcidin的克隆与序列分析

根据Genbank中已发表的犬属Hepcidin序列(AY772532),设计一对特异性引物,采用RT-PCR技术,从犬的肝脏中扩增出长258bp的基因。经测序表明该基因序列为犬属Hepcidin序列,对其序列分析表明,该基因序列与Genbank中已发表的犬属Hepcidin基因序列(AY772532)比较,第243位核苷酸发生突变。     

两种抗α毒素单链抗体基因的序列分析

应用RT－PCR技术,从两株分泌具有中和活性的抗A型产气荚膜酸菌α毒素单克隆抗体（McAb)的杂交瘤细胞株2E3和1A8中,分别扩增出抗体VH和VL基因,用Linker(Gly4Ser）3基因,将VH和VL基因连接成ScFv基因2E3－ScFv和1A8－ScFv,并将其克隆至pGEM-T载体中,经核苷酸序列分析证实,VH和VL基因以及Linker基因拼接正确,2E3－ScFv基因全长为729bp,经计算机分析,VH和VL基因均为新发现的基因序列,符合功能性重排的鼠抗体可燮区基因特征,2E3－ScFv的VH和VL基因分别属于鼠免疫球蛋白重链Ⅱ（B）和轻链kⅢ家簇;而1A8－ScFv的VH和VL基因分别属于鼠免疫球蛋白重链Ⅱ（A）和轻链кⅥ家簇。     

伪随机码及计算机的产生

扩频通信系统的频谱扩展是借助于扩频函数而实现的，典型的扩频函数就是伪随机序列码，实用的伪随机码必须是具有随机性，有尖锐的自相关特性，有较小的互相关值，要有较多的序列数，同时，还要求系列平衡，易于实现等特点。m序列和gold序列伪随机码满足以上条件，是应用广泛的扩频函数。文中介绍了这两个随机码的原理、性能和构造方法。并介绍了由本原多项式和递推公式用计算机产生、计算和组成序列集的方法。方法简练，适合工程技术人员参考。     

对硝基酚磷酸酶pNPPase的基因克隆和序列分析

对硝基酚磷酸酶（p-nitrophenylphosphatase pNPPase)是一种对硝基酚磷酸盐（p-intophenylphosphate)为底物的酶，被广泛地应用于核酸标记，通过菌落原位显色法成功地从脂肪芽孢杆菌（Bacillus stearothermophilus)中克隆到了编码耐热pNPPase的基因，序列分析表明它是一个编码255个氨基酸的酶。     

基于序列分析的制造车间平面布局设计

给定一个制造车间,把生产每一产品所需要的所有零部件的工序合并构成了一个有序图，即物流网络，称为加工装配图(OPC)，其对应的图结构可以抽象为有向树.以这样的有向树为基础，提出通过树的旋转处理算法和序列聚类分析，得到车间的平面布局，并通过一个实际使用范例证实这一方法的有效性.     

单词记忆软件中的次序算法

主要论述了如何在变化的范围内按“字母顺序”、“随机选择”和“先易后难”3种不同的次序抽取单词的算法,并介绍了这些算法在Delphi环境下的实现。     

基于动态算法的序列分析

为了获得2009年新型甲型H1N1流感病毒与2008流感病毒的基因序列及氨基酸序列的一致性,以便对一个基因家族的生物学特征有一个简明扼要的了解,针对目前流行的新型甲型H1N1流感病毒的基因序列及其所编码的氨基酸序列,采用动态规划算法对其一级序列进行序列相似度分析,获得了2009年新型甲型H1N1流感病毒的NA和M基因片段以及2008年猪源性甲型H1N1流感病毒的相应基因片段同源性高、在有些位点发生了基因突变增添和突变缺失等重要基因信息。为此次新型甲型H1N1流感病毒的研究提供了依据。     

siRNA序列特征的RNA干扰效率预测的新方法

为了快速、准确预测siRNA(Small interfering Ribonucleic Acid)的干扰效率,通过对2431条siRNA的统计学分析找到了一个可靠的预测新方法.通过统计学方法从众多特征中筛选出了19个与siRNA抑制效率相关的序列特征,并用这些特征给出了siRNA抑制效率水平的聚类方法,准确率达到81...     

四川资阳及邻区震旦系灯影组储层段沉积及层序地层学特征

资阳地区灯影组储层段为一套受波浪作用为主的浅水台坪白云岩沉积,由17种岩石微相和5种相序组成的地层中米级—亚米级沉积旋回明显。其储层段由三个不完整的层序构成,高水位体系域沉积构成了层序的主体,层序界面为I型和Ⅱ型。沉积和层序特征受到海平面变化、构造沉降和碳酸盐沉积速度的共同控制。