基于SCAR标记的20个樱花品种的分子鉴别

以20个广泛栽培与应用的樱花品种为试材,基于特异SCAR分子标记的开发鉴别樱花品种。结果表明:4条SAPD引物和96对SRAP引物分别在20个樱花品种中的扩增得到了33条n SAPD多态片段和13条SRAP多态性片段,其中10条n SAPD和4条SRAP多态片段被成功转化为14个稳定可靠的特异SCAR标记。这14个SCAR标记在20个樱花品种中的分布不同,其中,‘普贤象’、‘松月’、‘御衣黄’、‘关山’、‘大提灯’和‘旭山樱’只有1个SCAR标记,‘郁金’、‘红丰’、‘咲耶姬’、‘朱雀’和‘菊垂樱’有2个SCAR标记,‘市原虎之尾’和‘平野妹背’有3个SCAR标记,‘八重红枝垂’和‘雨情枝垂’有4个SCAR标记,‘红笠’、‘红华’、‘一叶’、‘福禄寿’和‘杨贵妃’则没有SCAR标记。这些SCAR标记可作为品种特异性的DNA指纹,辅助用于20个樱花品种的鉴别,也可用于分子水平建立樱花品种分类鉴定系统。     

ISSR和RAPD-PCR技术对东北地区主推玉米品种的鉴别

运用现代分子生物学简单重复区间序列扩增多态性（ISSR）和随机扩增片段多态性DNA（RAPD）两种分子标记技术, 对吉林省主推6个玉米杂交种及其父本、 母本共计18份基因图谱进行鉴别. 以ISSR为主要检测方法、 RAPD为验证方法,分别从30条ISSR引物中选出4条、 从30条RAPD引物中筛选出2条扩增效果明显、 特异性高的引物. 结果表明, 运用ISSR和RAPD-PCR技术提高了玉米品种鉴定和纯度鉴定的准确性.     

兔耳风属3个近缘种ISSR分子鉴别

采用ISSR分子标记技术,对菊科兔耳风属杏香兔耳风(Ainsliaea fragrans Champ)、红背兔耳风(A. rubrifolia Franc)和铁灯兔耳风(A. macroclinidioides Hag)等3个极易混淆的近缘种进行了分子鉴别.从100条ISSR UBC系列引物中筛选出20条多态性好的引物进行检测,其中利用引物UBC807、UBC826、UBC834、UBC843、UBC853、UBC895的扩增特异性条带制成ISSR指纹图谱,完全可以用于3个近缘种的鉴别.此外,基于相似系数的UPGMA聚类分析显示,杏香兔耳风与红背兔耳风之间亲缘关系近,而与铁灯兔耳风的亲缘关系则相对较远.     

ISSR在油茶品种鉴别和遗传多样性分析中的应用

分子标记技术是准确鉴别油茶品种的重要手段之一。以湖南、湖北两省主要油茶品种为试验材料,利用ISSR分子标记技术分析了66个油茶品种的遗传多样性,揭示了各品种间的亲缘关系并对其进行了有效鉴别。结果表明:从100条引物中筛选出6条引物对66个油茶品种的基因组DNA进行扩增,获得了121条可以统计的扩增产物,其中多态性条带数(NPB)为112条,多态位点百分率为92.56%(PPB),平均等位基因观察值为1.933 9,平均有效等位基因为1.650 9,基因多样性指数即平均期望杂合度为0.369 8,Shannon信息指数为0.541 7,说明油茶品种间的遗传多样性水平较高。根据扩增图谱条带的有无、多少和不同引物提供的谱带类型组合对供试油茶品种进行了鉴别。     

St染色体组ISSR分子标记的建立和应用

以中国春(CS)、绵阳11(MY11)等小麦为对照,以拟鹅观草(Pseudoroegneria spicata)、中间偃麦草(Thinopyrum intermedium)、中国春茸毛偃麦草双二倍体(TE)为材料筛选100条ISSR引物,筛选到引物811能在拟鹅观草扩增出一条758 bp的特异DNA片段(GenBank登录号为EU368734),记为p811758.利用该引物对一系列含有St染色体组的二倍体或多倍体进行PCR扩增,结果显示含有St染色体的材料均可以扩增出p811758,小麦属的其他不含St染色体的物种不能扩增出p811758.以两套中国春-中间偃麦草二体附加系为材料进行初步染色体定位,结果表明所有材料均扩增出了这条特异带.进一步对中国春中间偃麦草后代进行扩增,结果表明p811758可以作为分子标记用来检测小麦背景中含St的染色质.     

板栗主要栽培品种的分子鉴别及遗传分析

应用RAPD分子标记手段,研究板栗品种的遗传多样性,建立了板栗品种RAPD标记的标准程序,以及板栗品种的DNA指纹数据库,为板栗育种提供理论依据,并为板栗品种鉴别提供了准确、可靠的标准方法,主要结果与结论如下:     

两个桂热甘蔗品种(系)的简单重复序列间扩增(ISSR)分子鉴别

利用筛选出的10个简单重复序列间扩增(inter-simple sequence repeat,ISSR)引物对两个甘蔗优良品系的基因组DNA进行扩增,共扩增出126条条带,多态性比率分别是81.7%和80.2%。从中筛选出3对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物,对两个桂热甘蔗品种(系)进行分子标记鉴别。结果表明,两品种间的谱带基本相同,但均存在桂热2号和桂热3号特有的谱带;这表明了两品种间在DNA水平上存在真实的遗传差异,834、844和846引物利用特殊ISSR标记的存在或缺失鉴别了两个桂热甘蔗品种(系)。此结果为后续应用分子标记方法鉴别甘蔗品种及选育新品种提供重要依据。     

基于ISSR西北地区珍珠猪毛菜(Salsola passerina)的遗传多样性(英文)

运片JSSR分子标记的方法,对分布于中国北方7个居群的137个珍珠猪毛菜个体筛选出了15条引物,产生了196条带,其中153条为多态性条带,总的基因多态率为78.06%,多态性在种群水平上较低,平均多态率为45.60%.平均期望杂合度和Shannon信息指数在种间水平上分别为0.1759和0.2811,在居群水平上为0.125l和0.1977,种群内个体间的遗传分化较大,为70.96%,而种群间遗传分化较小,为29.04%,种群间的遗传一致度平均为0.9320.AMOVA分析得到了相似结果.基于Nei's遗传距离的UPGMA聚类分析将7个居群分为3组:德令哈、兰州和其余5个居群(中宁,乌海,民勤,金塔和安西).Mantel检验表明遗传距离与垂直地理分布显著相关(P相似文献   

甘蔗优良新品系凉蔗90—585选育研究初报

自 CP67/412×崖86/50组合中筛选出凉蔗90—585实生单株经常规育种程序选育,区试与表证示范表明:该品系产量糖分较高、抗逆性强、农艺性状优良,适宜在攀西蔗区热量条件     

湖北省主栽板栗品种的分子鉴别

应用RAPD分子标记手段,建立板栗品种RAPD分析的稳定反应体系,用筛选出的10个随机寡核苷酸多态引物绘制12个湖北省主栽板栗品种的DNA指纹图谱,以不同的特异标记或标记组合对各品种进行了分子鉴别,并对这些品种进行了遗传多样性分析。利用此法可在板栗生长的任何时期进行品种鉴定。     

利用12S rRNA基因标记鉴定鱼翅真伪

为检测鱼翅样本真伪及鲨鱼种属,通过提取送检鱼翅、鱼翅羹样本DNA,扩增其线粒体DNA上的用于动物种属鉴定的12S rRNA基因片段,并进行DNA测序和序列分析,测序结果在GenBank上进行BLAST搜索,与数据库中相关物种序列进行同源性分析。结果表明,在送检的23份样本中,18份鱼翅羹样本、2份粉丝状鱼翅、1份翅状鱼翅中均未成功提取到DNA,未扩增出目的基因片段,而从2份鱼翅样本中成功地提取到了基因组总DNA,并成功扩增出了12S rRNA基因片段,这2份样本的12S rRNA基因片段的碱基序列分别与黑边鳍真鲨(Carcharhinus limbatus)、斜锯牙鲨(Rhizoprionodon terraenovae)的同源性达到99%。对鉴定出含有鲨鱼成分的2份样本进行高温泡发处理,高温泡发实验表明,1份样本(22号)有明胶析出。研究证实,12SrRNA基因序列测定技术能准确、快速鉴定待检样本中是否含有鲨鱼成分,结合高温泡发时是否有明胶析出可综合判定鱼翅真伪。     

不同金银花种质资源ISSR遗传多样性研究

应用ISSR标记技术,对来自国内忍冬属(Lonicera Linn.)的20个居群进行遗传多样性和遗传结构的分析. 从100条ISSR随机引物中筛选出19条引物对20个忍冬居群进行扩增,共得到308条清晰的扩增位点,其中多态性位点278个,多态位点百分率(PPB)为90.26％. 遗传分化系数(GST)为0.5659,这显示20个居群的分子变异主要存在于居群间。AMOVA分析也显示居群间的遗传分化占到55.35%. 采用UPGMA法,根据ISSR-PCR结果进行聚类分析,得出20个忍冬居群遗传关系图,其种间关系与传统的形态学分类结果基本一致,但也有个别种的归属及种间关系稍有变化. 根据聚类图分析可知,一个称为“南江”的未知种和细毡毛忍冬(Lonicera similes Hemsl.)的三个居群聚在一起,表现出很高相似性,这说明它们之间的亲缘关系较为密切. “南江”可能是细毡毛忍冬的一个变种或栽培种. 本文为保存金银花种源植物的遗传多样性和进一步培育新品种提供了基础.     

新疆不同棉花品种蕾期抗蚜性初步鉴定

对新疆棉区主栽的22个棉花品种，进行了棉花蕾期抗蚜性初步鉴定，结果表明：高抗、抗性品种共3份，占供试品种的13．64％。其中新海21抗性水平最高，蚜指减退率为27．97％。感蚜品种为中35和81-3，蚜指减退率分别为-61．85％和-74．60％。多数品种抗蚜性表现为中抗。棉花叶背茸毛密度与单株蚜量不呈一一对应关系，茸毛与品种抗性有一定关系，但不完全呈正相关。     

海南海桑遗传多样性的ISSR研究

采用简单序列重复区间扩增(ISSR)分子标记技术对分布于海南岛的海南海桑Sonneratia hainanensis 4个种群共33个个体进行了遗传变异分析.11条引物共扩增出166条带,其中142条具多态性,多态位点百分率为85.54%.在种群水平上多态位点百分率14.46%～80.12%,平均为46.24%.期望杂合度、Shannon信息指数在物种水平上分别为:0.232 9和0.361 9;在种群水平上分别为0.153 8和0.231 7.依据Gst值,海南海桑遗传变异发生在种群内的个体间占75.89%,24.11%的遗传变异发生在种群间.UPGMA聚类结果为来自文昌的2个天然种群聚为一类,东寨港引种栽培的2个人工种群聚为另一类.Mantel检验表明海南海桑种群间的遗传距离与地理距离间存在显著的正相关(P＜0.05).种群遗传多样性与环境因子间的相关性分析表明:海南海桑的遗传多样性水平与土壤总氮量、有机质含量呈显著负相关(P＜0.05).