小麦幼叶中小G蛋白的粗分离

对小麦幼苗叶片中的蛋白进行了粗提,聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测在20.1 KDa～31 KDa间呈现一条蛋白条带,经分析其分子量约为23.1 KDa,占所提取总蛋白的2.93%,推测其为小G蛋白家族中的成员.采用传统的硫酸铵盐析法对此目的蛋白进行粗分离.结果显示,30%的硫酸铵饱和度可将该蛋白分离,且所含杂蛋白量最少,其纯度和得率分别是22.96%和47.3%,是进一步细分离纯化的较好选择.     

基因工程法制备15N标记的蛋白质样品

为了用多维核磁共振方法解析蛋白质溶液构象奠定基础,在用基因工程法使天花粉蛋白在大肠杆菌中获得高效表达的基础上,用１５Ｎ标记了这种蛋白质并通过亲和层析方法进行纯化得到电泳纯的蛋白样品;测定了此蛋白对中期妊娠小鼠的止孕效应;在核磁共振波谱仪上测得了此蛋白的１Ｈ－１５Ｎ异核相关谱（ＨＳＱＣ）。结果表明,上述方法可以用于制备１５Ｎ标记的蛋白质样品。     

基于位点特异性打分矩阵的卷积神经网络预测SARS-CoV-2核衣壳蛋白的蛋白质二级结构

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)有4种关键的结构蛋白,而核衣壳蛋白就是其中的1种.本实验从公开数据库NCBI上选取的SARS-CoV-2核衣壳蛋白质序列数据,分析SARS-CoV-2核衣壳蛋白与SARS-CoV核衣壳蛋白的序列相似性,对SARS-CoV-2核衣壳蛋白的理化性质和疏水性进行分析;在此基础上提出基于位点...     

基于蛋白质互作用网络的关键蛋白质识别研究

本文提出了基于图论算法的关键蛋白质识别方法，选择合理的候选关键蛋白质集合和相关的路径参数，对大规模蛋白质互作用网络的关键蛋白质进行预测．实验表明，该算法是有效的．     

基于小波分析法的蛋白质结构研究

用小波的方法预测了一个已知结构蛋白质的二级结构，并把它同互连网蛋白质结构预测服务及其他结构预测软件得到的二级结构进行比较。结果表明：该方法可以较好地确定蛋白质的二级结构且不必进行同源蛋白质序列的联配。在预测未知结构的蛋白质序列方面，该方法与其他方法相比，预测结果并无显著差异，这说明小波分析法可以用于蛋白质结构研究，若与其他方法结合用于结构预测,将会起到更好的作用。     

基于遗传算法的蛋白质折叠模拟系统

在模拟蛋白质折叠的遗传算法基础上，采用晶格模型，设计了一个用于蛋白质折叠模拟的软件系统，并举例说明该系统的用法。该蛋白质折叠模拟系统可用于蛋白质折叠预测和蛋白质进化研究，并可为蛋白质分子设计提供重要信息。     

甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析

 基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段 (C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1-MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。     

蛋白质残基相互作用网络在线服务及可视化分析

蛋白质残基相互作用网络对理解蛋白质的结构特征，生物学功能和结合位点预测等研究有重要的作用.然而，现有的蛋白质残基相互作用分析方法易用性较差，需要下载和安装程序，较少提供友好易用的网络可视化功能，极大限制了蛋白质结构、功能和药物设计的相关研究.建立了蛋白质残基相互作用网络在线服务及可视化计算平台(http：//renault.fun)，用户不需要下载和编写程序，仅需上传蛋白质结构数据和口袋相关信息即可搭建蛋白质残基相互作用网络，并实现度中心度(degree centrality)，接近中心度(closeness centrality)和中介中心度(betweenness centrality)等网络特征的计算.该计算平台可进一步实现蛋白质残基相互作用网络的可视化，分析蛋白质表面结合口袋的网络特性，对理解蛋白质结构和药物设计的相关应用研究有较大的帮助.     

蛋白质芯片——蛋白质高表达及固定技术研究进展

就近年来国际上蛋白质芯片的高通量蛋白质生产及固定技术的研究进展进行了系统的总结和分析。蛋白质芯片是一种大规模、高通量的蛋白质组学研究技术,目前己广泛运用于基础研究(如蛋白质/蛋白质相互作用)和应用研究(如病理诊断,药物开发),而该技术的关键步骤是实现蛋白质高表达及固定。及时把握蛋白质高表达及固定技术的研究动向是开展蛋白质芯片研究的基础。     

TMV重组外壳蛋白Sc1754CP的原核表达和多克隆抗体制备

烟草花叶病毒（tobacco mosaic virus,TMV）重组外壳蛋白（coat protein,CP）Sc1754CP是一种能够激发敏感烟草产生过敏性反应（hypersensitive reaction, HR）的蛋白, 但是这种蛋白无法通过植物病毒的大量扩增获得.为了获得足够量的上述蛋白,并对这种蛋白在植物中激发的HR反应进行深入研究,作者在大肠杆菌中大量表达Sc1754CP蛋白,并且获得了Sc1754CP高度专一性的多克隆抗体.上述研究为进一步深入研究Sc1754CP及其激发的新的过敏性反应机制奠定了基础.     

面向同源蛋白质探测的一种新型混合深度学习模型

根据蛋白质氨基酸链探测其同源蛋白质,进而预测蛋白质的功能,是生物信息学研究领域的一个重要挑战,也是众多生物医学研究领域的基础研究内容,有着重要的科研价值和广泛的应用需求。其研究难点在于:(1)如何学习对同源蛋白质预测有效、有用的蛋白质特征信息;(2)如何更好地运用蛋白质特征信息,实现同源蛋白质的探测与识别。为了解决同源蛋白质探测与识别研究中的关键难点,本文提出一种基于混合深度学习架构的同源蛋白质探测与识别模型(HDLM-PHP)。通过采用统一的"管道式"深度学习架构,将蛋白质特征学习和探测识别统一为一个整体,提高同源蛋白质探测与识别的效能。采用多组并行的深度卷积神经网络,学习蛋白质的各种属性信息,以期获得丰富的待检测蛋白质和靶蛋白质的高级相关性特征,并通过全连接方式使用多层RBM结构融合和精炼这些相关性特征为全局相关性特征。通过统一的深度网络连接方式,以探测和识别任务为导向,学习到对于同源蛋白质预测最有效、最全面的蛋白质特征信息。在标准数据集SCOPe上,对所提模型进行性能与效率评测,结果表明:本文提出的模型能有效地学习到符合任务导向的蛋白质特征数据,提升同源蛋白质探测与识别的准确度和召回率,优于现有的模型和算法。     

Catalysis of guanine nucleotide exchange on Ran by the mitotic regulator RCC1

The product of the gene RCC1 (regulator of chromosome condensation) in a BHK cell line is involved in the control of mitotic events. Homologous genes have been found in Xenopus, Drosophila and yeast. A human genomic DNA fragment and complementary DNA that complement a temperature-sensitive mutation of RCC1 in BHK21 cells encode a protein of relative molecular mass 45,000 (Mr 45K) which is located in the nucleus and binds to chromatin. We have recently isolated a protein from HeLa cells that strongly binds an anti-RCC1 antibody and has the same molecular mass, DNA-binding properties, and amino-acid sequence as the 205 residues already identified. HeLa cell RCC1 is complexed to a protein of Mr 25K. We have shown that this 25K protein has a sequence homologous to the translated reading frame of TC4, a cDNA found by screening a human teratocarcinoma cDNA library with oligonucleotides coding for a ras consensus sequence, and that the protein binds GDP and GTP. We have referred to this protein as the Ran protein (ras-related nuclear protein). In addition to the fraction of Ran protein complexed to RCC1, a 25-fold molar excess of the protein over RCC1 was found in the nucleoplasm of HeLa cells. Here we show that RCC1 specifically catalyses the exchange of guanine nucleotides on the Ran protein but not on the protein c-Ha-ras p21 (p21ras).     

一种测定大豆蛋白质水解度的简易方法

介绍了一种新的测定大豆蛋白质水解度的方法,G-25色谱层析法。该方法利用快速蛋白纯化系统将大豆蛋白水解多肽溶液进行G-25色谱层析,根据蛋白峰和肽峰面积计算蛋白质的水解度,并与甲醛滴定法进行了比较。结果表明,G-25色谱层析法测定的大豆蛋白水解度略低于甲醛滴定法。该方法快速、简便,可以普遍适用于各种蛋白质水解度的测定。     

Low pH-induced conformational changes in 33 kD protein of photosystem Ⅱ

33 kD protein, located on the lumen side ofthylakoid membranes, is one of three extrinsic proteins ofphotosystem Ⅱ (PS Ⅱ ). Previous study showed that NBSmodification of W241, the only tryptophan in 33 kD protein,is helpful for understanding the function of W241 in main-taining functional conformation of 33 kD protein. In thispaper, studies of both circular dichroism and fluorescencespectra showed that upon decreasing pH from 6.2 to 2.5, theconformation of soluble 33 kD protein changed significantly,with an increase or a decrease in percentage of random coilor (z-helix and turns. The changes in secondary structures ofthis protein are pH reversible. After NBS modification at pH2.5, the conformational change of 33 kD protein was keptfixed. The CD ellipticity at 200 nm for NBS-modified 33 kDprotein is much lower than that for control, indicating that the unfolding degree of 33 kD protein was enhanced after the NBS modification. Moreover, the conformational flexibility islost in NBS-modified 33 kD protein, and the conformationalchange becomes pH irreversible, indicating that NBS modi-fication blocked the reversibility of conformational change of33 kD protein. The specific binding capability of NBS-modi-fled 33 kD protein is much lower than that of low pH-treatedcontrol. Furthermore, the rebinding of modified protein on PS Ⅱ membranes cannot restore the activity of oxygen evo-lution. We suggest that it is low pH but not NBS modificationof W241 that leads to the conformational change of 33 kDprotein from one functional to another non-functional state.The significant capability of proton transport of 33 kD pro-tein is discussed.     

丝蛋白与化妆品

本文叙述了丝蛋白的组成、构造与性能,介绍了丝蛋白与美容美发的相依关系,分析讨论了丝蛋白作为化妆品添加剂的优良作用及效果.     

拟南芥中一个镍离子转运蛋白的亚细胞定位

离子的跨膜转运是细胞获取养分的重要环节,亦是植物在组织和器官水平上进行养分吸收运移的基础．在植物中镍（Ni）元素主要以Ni^2＋的形式存在,并通过Ni^2＋转运蛋白将其跨膜转运至相应的组织器官,参与氢酶和脲酶的合成．生物信息学分析表明,拟南芥中一个Ni^2＋转运蛋白AT2G16800含有叶绿体定位信息．克隆该基因5’端编码转运肽的272bp片段,与绿色荧光蛋白（GFP）基因融合后,在拟南芥中高效表达,对其进行了亚细胞定位的研究．转基因植株通过共聚焦扫描显微镜的观察,发现GFP荧光信号只存在于叶绿体中,该结果表明A他G16800为叶绿体蛋白．