HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究

1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,P)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ·mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.     

黄柏碱血浆蛋白结合率的分析测定

药物-血浆蛋白结合率是药动学研究的重要参数,通过超滤法结合高效液相色谱法测定了黄柏碱与血浆蛋白的结合率.含药血浆经超滤法得超滤液,以C18为固定相,乙腈-0.3%冰醋酸-三乙胺(体积比为20:80:0.5,其中0.3%为体积分数)为流动相,284nm检测波长下测定超滤液中黄柏碱.黄柏碱在0.20~20.00mg·L~(-1)质量浓度范围内线性关系良好,相关系数r为0.999 8,日内、日间精密度均小于2.5%.超滤法结果表明黄柏碱在不同浓度下的血浆蛋白结合率为26.45%~34.05%,蛋白结合常数为(1.214±0.132)×10~4 L/mol.     

一种蛋白-药物结合常数的测定方法

目的建立一种蛋白-药物结合常数的测定新方法。方法以固定化牛血清白蛋白为固定相,磷酸盐缓冲溶液为流动相,获得不同进样量下药物的液相色谱保留参数,以溶质进样量与保留值的关系方程进行拟合,计算蛋白-药物结合常数(直接进样法)。结果测定了咖啡酸(CA),汉黄芩素(WO)和木犀草素(LU)3种药物与固定化牛血清白蛋白(BSA)在人体生理条件(37℃,pH7.40)下的结合常数,其数值高于竞争置换法,但与相关文献数据接近。结论直接进样法可作为一种新方法用于研究蛋白-药物的相互作用。     

果糖-1,6-二磷酸醛缩酶的研究进展

果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(FBA)是糖酵解途径中一种重要的生物酶,可催化底物果糖-1,6-二磷酸裂解为3-磷酸甘油醛和磷酸二羟丙酮或反向的醛醇缩合反应.主要介绍了FBA的分类及其功能,如参与生物体内代谢、充当纤溶酶原结合蛋白、作为宿主细胞粘附结合剂、转录调节因子等,并总结了FBA在抗真菌药物靶点、抗病原体疫苗方面的应用,旨在为后续FBA的深入研究提供基础资料.     

光谱法研究7-[(8-喹啉)偶氮]-8-羟基喹啉-5-磺酸与蛋白质相互作用

应用紫外吸收光谱法和荧光光谱法研究了7-[(8-喹啉)偶氮]-8-羟基喹啉-5-磺酸(简称主体)与蛋白质的相互作用.在p H=7.40的Tris-HCl缓冲溶液中,主体分子在400 nm处发射弱荧光,其荧光强度随白蛋白的加入明显增强.据此建立测定微量蛋白质的新方法.在相同的实验条件下,测定牛血清白蛋白和人血清白蛋白,线性范围分别为1.0×10-6~2.7×10-5mol/L和2.5×10-7~9.5×10-6mol/L,检测限分别为8.09×10-7mol/L、1.05×10-7mol/L.同时讨论7-[(8-喹啉)偶氮]-8-羟基喹啉-5-磺酸对白蛋白内源荧光的猝灭机理,测定牛血清白蛋白和人血清白蛋白结合常数分别为3.38×105和7.28×106,结合位点数分别为1.218和1.412.依据Forster非辐射能量转移理论,确定了主体-受体间的结合距离rBSA=3.98 nm,rHSA=3.04 nm及能量转移效率EBSA=0.038,EHSA=0.161,用同步荧光技术考察主体对蛋白质构象的影响.1     

聚合物NHS酯结合蛋白的研究

将自制的聚合物NHS酯[1]涂于聚苯乙烯试管或小球表面获得能与蛋白共价结合的功能材料.研究了不同功能材料与蛋白结合的各种条件:反应温度,反应时间,介质pH值以及蛋白的种类对结合的影响.实验证实,这种功能材料对蛋白的结合量大于1.5×10-6g/mm2,对蛋白的一次吸附率大于80%,能满足固相放免分析的要求.     

基于肿瘤蛋白-蛋白相互作用网络的药物靶标发现

基因组学的快速发展在我们面前呈现出了一幅肿瘤基因组的总构架,但目前最大的挑战之一是怎样将这些大量基因组信息转化成针对癌症病人基因变化的有效治疗方法.针对这一挑战,美国国家癌症研究所建立了"癌症靶标研发(CTD2)联盟".作为国家联盟的一员,埃默里大学CTD2中心着重于对癌症基因功能的研究,建立蛋白-蛋白相互作用网络,以助发现新的癌症治疗靶点.为了实现这个目标,笔者团队通过高通量筛选技术和高通量信息学方法的共同应用,快速检测癌症相关蛋白的分子互相作用,并构建了与肿瘤相关的蛋白-蛋白相互作用网络(OncoPPi).此网络将癌症基因与相应的功能蛋白相接,并可用于发现与肿瘤缺陷有关的作用机制、新药物靶标和新的治疗方法.这些数据已存入Emory CTD2中心的portal网站,供大家分享.Emory中心是CTD2联盟一个重要组成部分,联盟内提供实时的数据分享,合作紧密.通过共同努力,笔者团队以及CTD2联盟的目标是发展新的一代肿瘤信号通路干扰药物,实现基因组学基础上的精准治疗.     

一种云斑天牛气味结合蛋白的分离纯化

为揭示云斑天牛(Batocera lineolata Chevrolat)对气味分子的识别机制,通过荧光结合试验和葡聚糖凝胶G75(Sephadex G75)层析研究了云斑天牛对气味分子的识别情况,并对云斑天牛气味结合蛋白进行了分离纯化。结果表明,云斑天牛气味结合蛋白能与荧光探针N-苯基-1-萘胺(N-phenyl-1-naphthylamine, 1-NPN)产生荧光结合,云斑天牛触角部位的总蛋白提取液中存在pro. Ⅰ-Ⅻ(Protein Ⅰ-Ⅻ)12种大分子粗提蛋白,这12种大分子粗提蛋白经Sephadex G75纯化后,得到1种能与荧光探针1-NPN产生荧光结合的纯化蛋白pur-pro. I(purified protein I)。纯化蛋白pur-pro. I分子质量约为15.2 ku,对应为大分子粗提蛋白pro. Ⅻ(Protein Ⅻ)。鉴定认为,分离纯化蛋白pur-pro. I是云斑天牛的一种气味结合蛋白。     

亲和毛细管电泳法测定3种黄酮类化合物与人血清白蛋白的结合常数

采用亲和毛细管电泳技术, 对木犀草素、槲皮素和山柰酚3种黄酮类化合物与人血清白蛋白（HSA）的结合常数进行研究, 利用药物淌度变化和蛋白浓度的关系,计算得到木犀草素、槲皮素和山柰酚与HSA的结合常数分别为9.76×10⁵mol/L,1.24×10⁶mol/L和3.79×10⁵mol/L. 结果表明,此法可以作为研究药物与蛋白相互作用的一种简便可行方法.     

HIV-1 Tat与P-TEFb复合物的分子动力学模拟及结合自由能计算

P-TEFb结构中与Tat蛋白的结合位点是新型抗HIV-1药物设计和虚拟筛选的重要靶标.对含有两个锌指结构的Tat.P-TEFb复合物体系进行了14ns的分子动力学模拟,应用MM-PBSA/GBSA方法计算体系的结合自由能,以及通过基于氨基酸残基的能量分解来探究体系中蛋白质之间的相互作用.结果表明范德华作用能是复合物形成的主要驱动力,Cys261与ZN88之间的配位作用是结合自由能的最大贡献者.根据Tat.P-TEFb体系的动力学结构信息和残基能量分解结果预测了P-TEFb结构中可能的活性位点.位点Ⅰ和位点Ⅱ应可作为基于受体三维结构的抗HIV-1药物分子设计的起始位点.模拟计算的结果可以为进一步指导药物设计奠定基础.     

谈高校图书馆过刊装订新模式——自助过刊胶装——以成都信息工程学院图书馆为例

自助过刊胶装模式是一种图书馆创新过刊装订模式.阐述了其产生的过程、采用这种模式的重要意义,介绍了设备操作的具体步骤.     

影响电镀紫铜胎圈钢丝粘合力因素的工艺探索

对胎圈钢丝电镀紫铜生产过程中不同工艺参数下钢丝粘合力的变化进行研究和分析,探索了影响钢丝粘合力的工艺因素,获得了最佳生产工艺参数,达到了预期目标。     

用公开密钥加密方式保护移动节点的绑定过程

移动IP中绑定更新机制的引入带来了新的安全威胁．由于绑定更新过程相当于节点的重新接入过程，绑定信息成为了新的攻击对象．攻击节点可以通过重放节点绑定信息的形式来冒充此节点；通过修改绑定消息中的地址部分来提供虚假地址；还可以通过大量重放监听到的绑定消息进行拒绝服务攻击．为了保护绑定更新过程，引入对绑定更新消息的加密机制，提出了用公开密钥加密的方式来保护移动节点的一种地址绑定过程，并从安全性以及处理时间方面与现有的方式进行了分析和比较．     

苯环喹溴铵血浆蛋白结合率测定

为了测定苯环喹溴铵大鼠和人的血浆蛋白结合率,将大鼠和人的血浆样品加入内标后用甲醇直接沉淀法进行LC/ESI/MS分析,然后采用平衡透析法测定大鼠和人血浆中苯环喹溴铵的血浆蛋白结合率。结果表明,苯环喹溴铵大鼠血浆中药物浓度为105.2~1842ng/ml,血浆蛋白结合是线性的,苯环喹溴铵与大鼠血浆蛋白结合率约为42.0%;苯环喹溴铵人血浆中药物浓度为305.3~3813ng/ml,血浆蛋白结合是线性的,与人血浆蛋白结合率约为71.4%。苯环喹溴铵在不同种属中的血浆蛋白结合率是不同的,与人的血浆蛋白结合率较大鼠的血浆蛋白结合率高,且与人的血浆蛋白具有中等强度的结合。     

煅烧锰渣取代水泥胶结料水化机理

本文借助X射线衍射、差热分析等试验手段，分析了煅烧锰渣取代水泥胶结料（简称BMC胶结科）的水化过程和水化产物，剖析了其强度形成和稳定发展的机理．     

浅谈高校图书馆中外文过刊装订工作

根据教学科研以及图书馆工作的实际,从中外文过刊装订时间上的选择、建立装订目录以及选择装订方式等方面探讨了高校图书馆中外文过刊装订工作。     

不同溶剂中吡咯-2,5-二乙酰胺衍生物与阴离子结合的性质研究

用1H NMR滴定技术研究了CD3CN和DMSO-d6溶剂中吡咯-2,5-二乙酰胺衍生物1-4与阴离子结合的性质.在氘代乙腈溶液中,受体1-4是含氧阴离子的有效接受体,且其对阴离子的亲和性与吡咯-2,5-二甲酰胺相似.但在更具竞争性的氘代DMSO溶液中,其对阴离子的亲和性要小得多.     

基于单片机技术的试卷装订机设计

本文通过对高校使用的试卷装订机进行分析,指出了现有装订机所存在的弊端。为了提高装订机的装订性能,本文将现有装订机使用过程中的动作进行了分解,结合单片机技术,设计出了一款新颖的装订机,实践证明,该装订机能大大提高试卷装订效率。     

浅谈图书馆散页图书的修补实践

图书在借阅过程中经常会出现散页现象,影响其使用价值。结合工作实践,介绍了图书修补、装订所需要的工具和材料,说明了具体的装订方法,具有很强的实用性。