玉米抗大斑病菌单基因系的建立及其在Exserohilum turcicum生理小种鉴定中的应用

利用美国A632,B37,B73,B68,C103,Va26等30个Ht单基因鉴别寄主, 按美国伊利诺伊大学的大田接种方案与鉴定方法, 建立了适合中国的监测玉米
大斑病菌生理小种鉴定的21个Ht单基因系. 从吉林省15个地区的不同玉米品种中采集玉米大斑病样本, 采用单孢分离获得了32个玉米大斑病菌菌株, 利用已建立的上述21个Ht单基因鉴别寄主, 通过美国的大田鉴定方案进行生理小种鉴定. 结果表明, 这32个菌株均为0号小种, 并未出现生理小种分化现象.     

玉米双孔通道(TPC1)基因片段的克隆与分析

为克隆玉米TPC1基因,根据几个物种已知的TPC1基因保守区域设计一对简并引物,以玉米RNA反转录生成的cDNA为模板进行Touchdown PCR扩增,得到1条695 bp的特异性条带,测序后与其他物种的TPC1基因进行比对,该片段与水稻OsTPC1、小麦TaTPC1、大麦HvTPC1、拟南芥AtTPC1、烟草NtTPC1A和NtTPC1B基因的同源性分别为88.1%、84.4%、84.7%、60.6%、61.1%、60.8%.基因片段推测的氨基酸序列包括5个跨膜片段(TMS)和1个孔道(P)的部分区域,第4个跨膜片段富含带正电的氨基酸残基,可能作为TPC1的电压传感器(Voltage sensor).这种结构与电压门控Na /Ca2 离子通道的第4个跨膜片段的结构和性质相似,提示含有这个片段的蛋白可能是被电压调控的.在玉米的dbEST中没有与该基因片段相似的序列,我们把它命名为ZmTPC1.     

玉米候选抗病相关基因片段的克隆

根据已经克隆的植物抗病基因和候选抗病基因的保守序列P-loop、Kinase-2及GLPLAL设计一系列简并引物，利用同源序列扩增法，对玉米的基因组DNA进行PCR扩增，并对5个扩增产物的克隆进行测序．测序结果在Gen—Bank内进行BLAST检索，发现A9克隆序列与玉米BAC库中的206C17克隆的部分序列有很高的相似性，并且距离GenBank内注册的玉米抗锈病基因rpl位点中的rpl-3基因、rpl-4基因分别约有66Kb、20Kb，且A9克隆序列在玉米基因组中是单拷贝的．这为玉米抗锈病性状的分子标记辅助选择和抗锈病基因的克隆奠定了良好的基础。     

一个新的水稻GST类似蛋白基因XIG的克隆与分析

根据编码一种玉米GST类似蛋白的mRNA In2-1序列设计引物，以水稻cDNA文库为模板，PCR扩增得到一条270bp的DNA片段，以此片段为探针分别筛选水稻根cDNA文库及水稻基因文库，获得一条全长cDNA及其相应的全长基因，并通过测序得到了两者的全序列，该基因编码的蛋白具有GST的典型特征，在水稻中尚未见报道。     

用差异显示技术分离空心莲子草抗旱相关基因

采用mRNA差异显示技术,分离空心莲子草在干旱胁迫1 d后差异表达的基因,获得139个基因片段.经过Reverse Northern检测,初步证实有两个片段受干旱诱导表达上调.对其中一个片断克隆测序并进行核甘酸序列比对,显示与其他基因同源性都很低,表明可能是新的基因.半定量PCR技术证实该基因受干旱诱导表达上调.     

玉米候选抗病相关基因片段的克隆

根据已经克隆的植物抗病基因和候选抗病基因的保守序列P-loop、Kinase-2及GLPLAL设计一系列简并引物，利用同源序列扩增法，对玉米的基因组DNA进行PCR扩增，并对5个扩增产物的克隆进行测序，测序结果在GenBank内进行BLAST检索，发现A9克隆序列与玉米BAC库中的206C17克隆的部分序列有很高的相似性，并且距离GenBank内注册的玉米抗锈病基因rpl位点中的rpl-3基因、rpl-4基因分别约有66Kb、20Kb，且A9克隆序列在玉米基因组中是单拷贝的，这为玉米抗锈病性状的分子标记辅助选择和抗锈病基因的克隆奠定了良好的基础．     

甘蓝磷酯酶D HKD2功能区基因片段的克隆与反义表达载体的构建

以甘蓝(Brassiaca oleracea)为材料，取幼叶分离mRNA，反转录合成cDNA，以cDNA第一链为模板，通过PCR扩增，获得甘蓝磷酯酶D(Phosphorate　Lipid　Dehydrolase，PLD)HKD2功能区的基因片段．对其进行Blast分析，结果表明，分离的目的片段核苷酸序列与Genbank中报道的甘蓝PLD基因相比同源率为99．7％，只有2个碱基发生改变．将得到的PLD基因片段插入植物表达载体pAT940，构建了PLD基因反义表达载体pATC—rPLD，为下一步进行抗逆转基因作物选育打下基础．     

花椰菜(Brassica oleracea var.botrytis)黑腐病抗性基因同源序列分离及克隆的研究

通过从NBS保守序列设计简并引物PCR的方法，以花椰菜（Brassica oleracea var．botrytis）抗、感黑腐病的近等基因系为材料，分离得到NBS-LRR型抗性基因同源序列，并获得1个克隆，命名为RGA330—7．Southern杂交表明，该片段在近等基因系中存在明显的多态性，且该片段在抗黑腐病基因位点至少存在3个以上类似RGA330—7的同源拷贝．序列分析结果认为该克隆与NBS—LRR型抗性基因的部分CDSs有很高的同源性，说明该片段属于NBS—LRR型．系统进化分析该序列与甘蓝型油菜的2个抗病同源序列归为一类，很可能这3个不同来源的抗性基因同源序列同属于一种抗性基因家族．因此推测该序列与花椰菜抗黑腐病基因紧密相关，为进一步克隆花椰菜抗黑腐病基因提供了可靠的候选基因，对分子标记辅助抗性育种具有重要意义。     

mRNA差异显示法筛选和克隆东亚飞蝗抗药性相关基因

筛选和克隆东亚飞蝗抗药性相关基因.采用mRNA差异显示法(mRNA diffFerential display PCR,DD-PCR),对比了东亚飞蝗在受到氯氰菊酯杀虫剂的诱导前后,基因表达发生的变化.对差异片段进行了回收,克隆、测序,Northern点杂交验证以及序列分析和同源性比较.东亚飞蝗在受到氯氰菊酯杀虫剂的诱导前后,存在明显的基因表达差异,发现差异表达条带9条,对9条差异表达条带进行克隆、测序,经序列分析和同源性比较和RNA点杂交验证,表明确认其中1条带与东亚飞蝗的抗药性有关.东亚飞蝗的mRNA差异显示证明,该EST序列可能在抗药的发生发展中具有一定的作用.     

白粉菌诱导的小麦品种Brock的差异表达基因解析

为了解抗病小麦品种Brock对白粉菌的抗性机制,采用m RNA差异显示技术(DDRT-PCR)和反向Northern杂交技术分析小麦Brock在白粉菌诱导下的差异表达基因.对照组共获得5 072个片段,诱导组获得5 366个片段,反向Northern杂交筛选后,获得94个差异表达片段.基因测序和Blast比对后,共有71个片段得到功能注释,涉及抗病防御相关基因、能量代谢相关基因、转录因子、次级代谢相关基因以及信号转导基因等.选取与RPP13同源的片段7和与MYB44同源的片段10进行半定量表达模式分析,发现白粉菌诱导后这2个基因的表达明显上调,在染菌8 h后达到峰值,表明二者可能参与Brock白粉菌侵染的早期应答反应.     

Fine mapping of the <Emphasis Type="Italic">Ht2 (Helminthosporium turcicum</Emphasis> resistance 2) gene in maize

Fine mapping of Helminthosporium turcicum resistance gene Ht2 is extremely valuable for map-based cloning of the Ht2 gene,gaining a better knowledge of the distribution of resistance genes in maize genome and marker-assisted selection in maize breeding.An F2 mapping population was developed from a cross between a resistant inbred line 77Ht2 and a susceptible inbred line Huobai.With the aid of RFLP marker analyses,the Ht2 gene was mapped between the RFLP markers UMC89 and BNL2.369on chromosome 8,with a genetic distance of 0.9cM to BNL2.369.There was a linkage between SSR markers UMC1202,BNLG1152,UMC1149 and the Ht2 gene by SSR assay,Among the SSR markers,the genetic distance between UMC1149 and the Ht2 gene was 7.2cM,By bulked segregant analysis 7 RAPD-amplified products which were probably linked to the Ht2 gene were selected after screening 450 RAPD primers and converted the single-copy ones into SCAR markers.Linkage analysis showed that the genetic distance between the SCAR marker SD-06633 and the Ht2 gene was 0.4cM.From these results,a part of linkage map around the Ht2 gene was constructed.     

声波刺激对拟南芥基因表达的影响

运用银染mRNA逆转录差异显示(DDRT-PCR)技术,初步研究了声波刺激对拟南芥差异基因表达的影响.研究分离得到SA3、SG2-1、SG2-2、SG7-1、SG7-2、CA2共6个差异表达基因片段,进一步运用Northern点杂交确定SA3、CA2、SG7-1为阳性片段,其中SA3片段属于声波刺激特异表达基因, SG7-1片段属于声波刺激增强表达基因,CA2片段属于声波刺激抑制表达基因.研究结果表明植物在基因水平对声波刺激具有响应,为下一步探索植物响应声波应力的分子生物学调控机理奠定了基础.     

HFJ和MIJ近交系大鼠RAPD特征与比较研究

目的 利用人工合成的PCR随机引物,对本单位培育的HFJ和MIJ近交系大鼠基因组DNA进行扩增,建立 HFJ和MIJ大鼠RAPD扩增特征图谱;选择常用近交系大鼠Lewis和F344作为对照品系,观察HFJ和MIJ大鼠与 对照品系大鼠的RAPD多态性。方法 用酚-氯仿法分别提取4个不同品系大鼠的基因组DNA,从60条随机引 物中筛选能够得到清晰扩增条带的30条引物,对HFJ和MIJ大鼠DNA进行扩增。再从30条引物中随机选择12 条,对4个品系大鼠基因组DNA扩增,并对扩增条带多态性比较分析。结果 30条引物对HFJ和MIJ大鼠DNA 进行扩增,均能获得1～7个较清晰条带,除引物0～08外,条带的分子大小均在200～1 100 bp之间,两品系的引 物0-08扩增结果,均在2 000 bp以上的近原点处扩增出1条清晰的条带。HFJ和MU大鼠品系内个体间和两个品 系之间,扩增的结果均完全一致;用12条随机引物对4个品系大鼠同时扩增,HFJ和MIJ大鼠扩增结果一致,与 Lewis和F344比较,有5个引物出现差异条带。结论 用30条随机引物建立了HFJ和MIJ大鼠RAPD扩增特征性 图谱。由于两品系来源于同一对Wistar封闭群大鼠,虽然遗传特性有显著差异,但是在所选30条引物扩增时,未 发现多态性。两品系与Lewis和F344之间存在多态性条带     

应用cDNA微阵列芯片筛选胃癌转移相关基因的初步研究

采用cDNA微阵列技术建立胃癌原发灶和淋巴结转移灶基因表达谱,识别和克隆胃癌转移相关基因。用含10000个已知基因和7000个EST的cDNA微阵列分析胃癌原发灶和淋巴结转移灶表达谱的变化,利用生物信息学分析差异表达基因, RT-PCR和反向Northern点杂交验证cDNA微阵列结果。发现2倍以上的差异表达基因601个,其中淋巴结转移灶中表达上调527个,表达下调74个;2倍以上的差异EST 71个,其中淋巴转移灶中表达上调62个,表达下调9个。在胃癌原发灶中,与细胞免疫、发育、信号转导功能相关基因存在高表达;而在淋巴结转移灶中,与细胞生长、细胞周期、细胞运动和粘附功能相关基因存在高表达。RT-PCR和反向Northern点杂交结果进一步证实carbonic anhydraseⅡ、IGFBP-4基因高表达与胃癌转移相关。通过分析胃癌原发灶和淋巴结转移灶表达谱的变化,发现一些与胃癌转移相关的基因和EST,为进一步寻找和克隆胃癌转移相关基因提供研究线索。     

BRC2基元的合成及与靶肽p53(171-192)的相互作用

乳腺癌易感基因2(Breast Cancer Susceptibility Gene 2,BRCA2)是能抑制细胞发生恶变的关键基因.p53蛋白是参与细胞过程的主调控蛋白,p53蛋白要想行使其功能,则需要BRCA2及其产物对p53进行调控.选择BRCA2中的BRC2重复基元,用Fmoc固相合成法合成了BRC2及其3个片段.通过反相高效液相色谱(RPHPLC)和质谱对其进行表征,得到纯度大于90%的目标肽链.利用圆二色谱法初步探究了BRC2及其3个片段与靶肽p53(171-192)的相互作用.结果表明,BRC2的3个肽片段中,片段NEVGFRGFYSAHG在BRC2肽行使其功能中起着主要的作用.     

野油菜黄单胞菌8004胞外酶及多糖合成正负调控基因在X.c.NK01菌中功能初探

利用野油菜黄单胞菌（Xanthomonascompestris）8004正、负调控胞外酶及多糖合成的基因片断分别经三亲本接合方法导入黄单胞菌NK01抗性突变株中，测定接合于四种胞外酶活力和多糖合成能力，确定该正、负调控基因对NK01的作用．结果表明，负调控基因作用明显，使NK01胞外多糖及胞外酶产量显著降低，正调控基因未见明显的胞外酶及多糖合成的增强作用．本文并对正、负调控基因的作用方式作了初步探讨．     

Amplification of immunoglobulin lambda constant genes in populations of wild mice

The lambda immunoglobulin light chain (Ig lambda) locus of BALB/c inbred mice consists of two variable region gene segments (V lambda)1-3, and four constant region gene segments (C lambda)1,2,4,5. Each C lambda gene segment is associated with a unique joining segment (J lambda)2,4-7, and they are organized in two paired units, J3C3-J1C1 and J2C2-J4C4 (refs 4, 8). Using cDNA probes specific for C lambda 1 and C lambda 2 (ref. 9) we have analysed the genomic organization of the C lambda gene segments in wild-derived and inbred strains of mice. Although Southern blots of the genomic DNA of inbred mice show a constant pattern of hybridization, wild-derived mice show a high degree of variation in the number, size and intensity of hybridizing fragments. We have now found that, per haploid genome, mice of a Mus musculus musculus stock isolated from Sladeckovce, Czechoslovakia (CzII) have at least 12 C lambda segments, and mice of a Mus musculus domesticus stock 'Centreville Lights' from Centreville, Maryland (CL) have at least 8 C lambda segments. There appears to have been relatively recent amplifications of the C lambda gene segments in wild mice.     

银染mRNA差异显示法的建立及其应用

以银染mRNA差异显示方法对原发及转移灶胃癌标本总RNA为研究对象进行银染差示分析和回收差异条带,从中获得系列差异表达片段。随机选取5个从原发性胃癌样品回收的表达条带,以取自体外培养胃癌细胞株的RNA进行点杂交验证,均被证实为真实带。对2个差异表达片段进行分析、测序和GenBank同源比较结果表明：MGD1片段与肿瘤转移相关基因MTA1完全同源,属胃癌转移相关基因;PGD2与胃癌转移抑制相关,并与细胞周期抑制蛋白p27／Kip1具99％的同源性。结果表明,银染差异显示法具有快速、直观、假阳性率低等优点,同时也为进一步研究胃癌转移的相关基因提供了新线索。