用NMR数据研究多肽序列的计算机自动分析

本文描述一个自动执行软件，它是根据核磁共振ＣＯＳＹ，ＮＯＥＳＹ，ＴＯＣＳＹ和ＺＱＳＹ或ＤＱＳＹ的数据进行核磁共振谱的归属以及蛋白内残基序列自动分析，比较了一些方法的优缺点最后用来计算γＴＧＦ－α修筛１６肽的序列及归属。     

饭豆铜锌超氧物歧化酶的纯化及性质

饭豆种子粗提液中有６条Ｃｕ·Ｚｎ—ＳＯＤ活性谱带，经氯仿－乙醇混合液处理，硫酸铵盐析，ＳｅｐｈａｄｅｘＧ－１００凝胶过滤和ＤＥＡＥ－纤维素柱层析被分离，获得了两组ＳＯＤ同工酶组分（ＳＯＤ—１，ＳＯＤ—２）．它们在酶分子结构上可能存在一定差异．ＳＯＤ－１含与粗提液相对的、电泳迁移率较小的活性谱带，它在聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＰＡＧＥ）图谱上的活性染色带和蛋白染色带相互对在；在ＳＤＳ－ＰＡＧＥ和等电聚焦电泳图谱上均呈现单一区带，说明该酶已纯化到均一程度．该酶分子量为３１３００，亚基分子量为１６５００，等电点为４．２，在紫外区的吸收值为２６４．０ｎｍ．该必在０—７５℃范围内稳定．纯化的ＳＯＤ—１比活性为１７８９Ｕ／ｍｇ，ＳＯＤ—２比活性为２８４Ｕ／ｍｇ，ＳＯＤ活力回收率为３２％．     

鼠脑钠离子通道IS4片段溶液构象的NMR研究

应用２Ｄ ＾１Ｈ ＮＭＲ技术确定了合成多肽ＩＳ４的溶液构象，利用２Ｄ ＤＱＦ－ＣＯＳＹ，ＴＯＣＳＹ和ＮＯＥＳＹ实验，对ＩＳ４的＾１Ｈ谱进行了完全的指认，ＮＯＥＳＹ谱相关峰的积分被应用于结构计算，应用ＭＡＲＤＩＧＲＡＳ程序可以产生比较精确的质子－质子之间的距离约束。在应用距离几何程序ＤＩＡＮＡ计算时利用由ＭＡＲＤＩＧＲＡＳ产生的距离约束，加上二面角的约束，结果得到５个重叠得比较好的结构，最后对这５个     

丹参(Salvia miltiorrhiza)中一对具有新奇结构的立体异构体的结构测定

为了进一步弄清丹参的化学成分，应用化学和色谱分离方法从丹参中分离到一个白色粉末固体，经综合运用先进的波谱分析手段，包括１Ｈ－１ＨＣＯＳＹ、１Ｈ－１３ＣＣＯＳＹ、ＣＯＬＯＣ、ＮＯＥ等二维核磁共振谱确定了它们的化学结构为一对具有螺环缩酮内酯结构的新二萜类立体异构体化合物．     

2，4－二硝基五环［4．3．0．0~（2，5）．0~（3，8）．0~（4，7）］壬烷~1H和~（13）C NMR的完全归属

利用１Ｈ－１ＨＣＯＳＹ，１３Ｃ－１ＨＣＯＳＹ，１３Ｃ－１Ｈ远程ＣＯＳＹ以及选择性远程ＤＥＰＴ１３ＣＮＭＲ谱，对２，４－二硝基五环［４．３．０．０２，５．０３，８．０４，７］壬烷的１Ｈ和１３ＣＮＭＲ谱进行了完全的归属．     

2D-NMR对4′-去甲基表鬼臼毒素的~1H和~(13)C的完全指定

本文利用１Ｈ－１ＨＣＯＳＹ、ＨＭＱＣ、ＨＭＢＣ和ＮＯＥＳＹ二维核磁共振等技术对标题化合物的氢谱和碳谱进行了完全归属     

四-(对-辛酰氧基)苯基卟啉钴的合成与性质

合成出四－（对－辛酰氧基）苯基卟啉钴配合物［ＴＯＰＰＣｏ］,用元素分析、紫外可见光谱、红外光声光谱、摩尔电导和核磁共振氢谱等方法进行表征．用循环伏安法研究ＴＯＰＰＣｏ在ＤＭＳＯ溶液中的电化学性质     

2D—NMR对4‘—去甲基表鬼臼毒素的^1H和^13C的完全指定

本利用１Ｈ－１Ｈ ＣＯＳＹ，ＨＭＱＣ，ＨＭＢＣ和ＮＯＥＳＹ二维核磁共振等地标题化合物的氢谱和碳谱进行了完全归属。     

2,4—二硝基五环[4.3.0.0^2.5.0^3,8.0^4,7]壬烷^1H和^13C…

利用＾１Ｈ－＾１ＨＣＯＳＹ，＾１３Ｃ－＾１ＨＣＯＳＹ，＾１３Ｃ－＾１Ｈ远程ＣＯＳＹ以及选择性远程ＤＥＰＴ＾１３ＣＮＭＲ谱，对２，４－二硝基五环［４．３．０．０＾２．５，０＾３．８．０＾４，７］壬烷的＾１Ｈ和＾１３ＮＭＲ谱进行了完全的归属。     

弓斑东方鱼屯同工酶生化表现型的初步研究

利用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳方法，对弓斑东方（ｆｕｇｕｏｃｅｌａｔｕｓ）的５种同工酶ＥＳＴ、ＬＤＨ、ＳＯＤ、ＰＯＤ、α－ＡＭＹ进行了研究，分析了其组织特异性，讨论了各同工酶的基因表达谱式，观察到ＥＳＴ同工酶谱复杂，可分成三个区域；ｓ－ＭＤＨ同工酶有二个基因座位，ｍ－ＭＤＨ同工酶不稳定；ＳＯＤ同工酶有三个基因位点，本文还对需进一步研究的问题和各同工酶的应用前景进行了讨论．     

超临界二氧化碳萃取深层稠油组分的分子动力学模拟

为了从微观层面探究超临界CO_2对稠油组分的萃取机制,采用分子动力学模拟方法分析了稠油组分在砂岩表面的密度分布和吸附特征,研究了超临界CO_2对岩石表面稠油组分的萃取特点和扩散规律。研究结果表明,稠油四组分在稠油聚集体中呈现不均衡分布状态,沥青质自缔合能力强,胶质紧密包裹在沥青质周围,构成复杂的空间网状结构;芳香烃和饱和烃分布在沥青质、胶质周围,显示出稠油分子结构的层次性。沥青质与岩石表面相互作用能较大,超临界CO_2难以在沥青质中运移,扩散系数低,萃取难度大,萃取率接近于0;而芳香烃、饱和烃与岩石表面的相互作用能较小,超临界CO_2容易在芳香烃、饱和烃中溶解、运移,扩散系数大,容易被超临界CO_2萃取,萃取率可分别达到53%和28%。运用分子动力学方法揭示的微观动力学机制对于宏观认识超临界CO_2萃取稠油轻质组分具有重要意义。     

DOSY在寡糖混合物分析中的应用

 糖链组成的高度多样化及组成单元本身的相似性,使得糖类化合物的分离纯化面临很大的困难,进而导致糖分子结构在很大程度上落后于蛋白质和核酸的结构研究。本论文将DOSY(diffusion ordered spectroscopy,扩散排序谱)应用于由D 葡萄糖和β 环糊精组成的混合物分析研究。结果表明该方法具有良好的结构分析效果,可以很好地研究混合物中单一组分的成分确定及结构表征,作为一种“NMR 色谱”技术具有良好的应用前景。     

ITQ-3分子筛中甲烷和正丁烷混合物扩散性质的模拟

采用分子动力学方法先分别模拟了单组分的CH_4和C_4H_(10)在二维分子筛ITQ-3中的自扩散系数随负载N的变化。研究表明,在z轴方向的窄孔道中,自扩散系数随负载N的增加两者均表现出先增大后减小的扩散模式,而在y轴方向的宽孔道中,则随负载N的增加单调递减。之后,又模拟了二元组分CH_4和C_4H_(10)混合物在ITQ-3分子筛中随总原子数变化的扩散行为。结果发现,在z轴方向上,当负载N较小时,CH_4的扩散系数随总原子数的增多而增大;当负载N较大时,CH_4的扩散系数随总原子数的增多而减小。在y轴方向上,当负载N较小时,CH_4的扩散同z轴方向一样表现出随总原子数的增多而增大的现象,明显不同于单组分CH_4在y轴方向上的扩散;但随着负载N的增多,在z轴方向的孔道中发生堵塞效应的总原子数在y轴方向的孔道中仍处于过渡状态。     

UHMWPE冻胶纤维萃取过程的数学分析及其萃取剂的选择

对超高相对分子质量聚乙烯(UHMWPE)冻胶纤维萃取体系中溶剂与萃取剂的双扩散过程进行了数学分析,推导出纤维溶剂扩散系数的计算公式。纤维溶剂的萃取扩散系数可用于表征萃取剂的萃取能力。通过纤维溶剂萃取扩散系数的大小,结合冻胶纤维萃取的本质和目的,选定二氯甲烷为最佳萃取剂。讨论了影响纤维溶剂扩散系数的因素,结果表明：超声萃取时纤维溶剂扩散系数要比静置萃取时大,并随萃取浴温度的升高而增加,随冻胶纤维半径的增加而减小。     

有机蒸气-空气扩散系数的分子动力学模拟

气体扩散系数是一个重要的传质基础数据,基于分子模拟理论,利用分子模拟软件Materials Studio 7.0对部分有机蒸气-空气扩散系数,包括正戊烷、正己烷、正庚烷、正辛烷,进行分子动力学模拟,建立气体分子结构模型,构建晶胞,经弛豫、分子动力学运行后,对平衡体系进行分子动力学运行和分析,得到气体分子的均方位移曲线。输出相关数据并计算扩散系数,然后分析分子量及体系温度对模拟结果的影响情况,同时将扩散系数模拟值与实测值进行对比分析,从而验证了该方法的可行性。     

湍流和分子扩散对大气重力波翻转时间影响的模拟研究

重力波翻转意味着对流不稳定并伴随有非线性的波流相互作用,这是重力波改变背景大气结构的重要途径之一.利用自主建立的模拟重力波非线性传播过程的二维数值模式,研究了重力波的翻转时间(重力波发生对流不稳定时的持续时间)对湍流和分子扩散的依赖关系.模拟结果表明,翻转时间随着湍流扩散系数的增加而减小.通过与三维数值模式模拟的重力波翻转时间进行比较,适当调整湍流扩散系数,使得从二维模式得到的翻转时间与从三维模型得到的翻转时间具有可比性,从而得到湍流扩散系数的最优值.分子扩散从低热层开始,以指数形式增大,从而能够有效地耗散掉小尺度波动并使得重力波能够更快地恢复到稳定状态.     

Preparation and hydrogen storage properties of nanocrystalline TiFe synthesized by mechanical alloying

In this research, the mechanism of mechanical alloying(MA) synthesis of TiFe intermetallic compound(IMC)from individual components Ti and Fe has been studied. The partition coefficient of the apparent diffusion and the reaction rate constant during MA solid-state synthesis of the TiFe intermetallic compound in a planetary ball mill have been estimated. The results indicate that the apparent diffusion coefficient is close to 10~(–11)cm~2/s that is approximately one order higher than the conventional high temperature diffusion coefficient. The reaction rate constant is close to 1.75·10~(-6). The relation between the structure and the hydrogen storage properties of MA synthesized IMC TiFe have been briefly discussed.     

混氢天然气输气站场泄漏扩散数值模拟

将氢气混入天然气管网是目前世界上实现氢气大规模输送的最有效方式。氢气爆炸极限为4.0%～75.6%,上下限范围宽,且分子直径比甲烷小,极易泄漏,给输气站场带来很大隐患。针对多组分物系混氢天然气的泄漏,基于修正的二元扩散系数及热力学因子计算方法,计算了混氢天然气三物系Fick扩散系数矩阵,用来描述混氢天然气中各组分分子间相互运动的传质过程,以FLUENT为平台进行了CFD数值模拟分析,研究发现,混氢天然气泄漏后其扩散受到障碍物及风速等因素的影响;同体积混氢天然气与不含氢天然气泄漏,混氢天然气爆炸下限扩散半径更小;较低含氢量的混氢天然气泄漏后氢气组分爆炸区域仅限于泄漏点附近。研究结果可为站场内发生混氢天然气泄漏扩散提供预警和防护指导。     

分子模拟技术在乳化沥青研究中的应用

利用分子模拟技术对乳化沥青的乳化和稳定机制进行研究。选用结构不同的基质沥青,基于改进的B-L法,构建三维无定型平均结构;利用分子模拟软件构建水/乳化剂/沥青体系进行分子动力学模拟;通过界面形成能、界面层厚度、扩散系数等参数研究沥青与乳化剂相互作用对油水界面性质的影响。结果表明:分子模拟技术能够有效表征乳化沥青乳化和稳定机制;随着乳化剂用量的增加,界面形成能增大、界面层厚度增加、分子扩散系数变小,乳化剂单层膜的稳定性增加,降低油水界面张力的能力增强;对于不同的沥青体系,具有高芳碳率、高环烷碳率、高芳香环缩合度、低烷基碳率的沥青与乳化剂的相互作用越强,界面形成能绝对值越大、界面层厚度越大、扩散系数越小,乳化剂降低沥青/水界面能量的能力越强。     

铜在铍晶体中扩散系数和浓度分布的理论研究

惯性约束聚变实验中铜在铍晶体中的扩散是影响靶丸性能的重要因素. 采用分子动力学方法研究了铜在铍晶体中的扩散系数,并分析了铜在铍晶体中扩散浓度和深度的关系. 研究结果表明在低温区域铜掺杂浓度较大的体系中扩散系数明显较大. 当铜掺杂浓度为1.0 at%时其扩散系数与实验符合很好. 在靶丸热解条件下使用扩散方程得到铜原子扩散浓度和深度分别为0.06 at%和6.2 um. 10 um厚的0.5 at%铜掺杂层可以降低铜在铍晶体中扩散的深度. 这些研究能为制备性能更高的靶丸提供有用的帮助.