胆碱酯酶催化反应的量子化学研究——氧化对组氨酸、丝氨酸残基间氢迁移的影响

考虑到氧化对一些酶、核酸、细胞膜的生物活性丧失起着较大的作用,用量子化学半经验 CNDO/2法,从理论上探讨了胆碱酯酶中的组氨酸、丝氨酸残基间的氢键形成、氢迁移过程受氧化影响的大小,给出一些有益的信息。     

胆碱酯酶催化反应的量子化学研究——底物对组氨酸、丝氨酸残基间氢迁移的影响

本文考虑到底物的影响,对胆碱酯酶酯解部位的组氨酸、丝氨酸等残基问的氢键问题,继前文进行了深入的探讨,用量子化学理论进一步阐明乙酰胆碱酶催化水解反应的机理.指出丝氨酸残基的羟基在进攻底物的过程中逐步把氢原子转移给组氨酸残基.     

多肽链二级结构的氢键定义及氨基酸残基间的氢键分布

蛋白质的生物功能往往决定于它的三维结构,而二级结构是蛋白质的氨基酸顺序和三维构象之间的桥梁,决定了蛋白质折迭的框架,氢键是稳定二级结构的主要作用力。通过Kab—sch—Sander的二级结构的氢键定义,由氢键识别模式对二级结构及其氨基酸残基问的氢键作了统计分析,发现二级结构中的氨基酸残基的丰度与其提供氢键的能力没有统计关联,但氨基酸残基(除ser外)的CO基团形成氢键的能力越强,其NH基团形成氢键的能力越弱,反之亦然I同时给出了各种残基对在*螺旋中形成氢键能力的比较。     

天然氨基酸中氢键的量子化学研究

用从头计算法优化了20种天然氨基酸正、负、偶极离子.计算结果表明,α-NH2上的氮原子可以和羧基氧原子形成氢键,通过N1-H2…O3氢键的生成,原子N1、H3、O4、C4、C5形成了五元环.从正离子、负离子到偶极离子,氢键强度逐渐减小.侧链原子对氢键也有影响:正离子的侧链除苏氨酸和丝氨酸外,其它氨基酸不对氢键构成影响;负离子氢键受侧链的影响较大;而偶极离子中氢键基本不受侧链的影响.     

碱基与氨基酸二肽间的氢键相互作用

对于碱基-蛋白质之间的相互作用,氢键的形成及断裂起着重要的作用.选取7种氨基酸二肽和3种碱基,以它们之间形成单根氢键的体系为研究对象,在ab initioB3LYP/6-311++G(d,p)水平下进行结构优化,MP2/6-311++G(d,p)水平下进行能量的计算.同时应用ABEEMσπ/MM方法优化结构和计算能量.通过改变氢键相互作用区域的静电相互作用参数kH-bond和形成氢键的氢原子与其受体原子的孤对电子之间距离Rlp,H来拟合函数kH-bond(Rlp,H).用所得函数对选取的复合物进行结合能计算,其结果与ab initio方法所得的结果符合的很好.     

碱金属与冠醚配位反应能的量子化学研究

本文应用CNDO/2方法对几种冠醚与碱金属离子在水溶液中的配位反应能进行了计算。所得配合物稳定性次序与热力学实验结果一致;配合物的总能量计算还表明.在溶液中,碱金属水合离子与冠醚配位将形成稳定的水合物.图2,表5,参9。     

量子化学在分析化学中的应用——以量子化学半经验CNDO/2方法研究石墨炉原子化器中氢化物原子化机理

本文利用量子化学半经验 CNDO/2方法研究了石墨炉原子化器的表面状态对氢化物原子化的影响.研究结果表明:理论与实验完全相符,石墨炉原子化器中氢化物的原子化过程不是—个简单的气相热解过程,而是一个表面催化热解过程.     

联苯衍生物紫外光谱的CNDO/S量子化学计算

利用CNDO/S程序对联苯及其衍生物的紫外光谱进行了量子化学研究,算出了各分子轨道的能量及相应紫外光谱吸收峰的理论位置,并与实验值进行了比较,指出了K吸收带为π-π~°跃迁,B吸收带为π-π~°或π-π~°′跃迁。     

等离子喷涂AI_2O_3涂层内粒子间结合的研究

论述了通过对等离子喷涂Al_2O_3涂层内电镀铜,利用镀入的铜在涂层断面上的分布,定量地测定涂层内粒子间结合的方法及结果.结果表明,粒子间最大的平均结合率占所有界面的32%.这种有限的结合被认为是受熔化粒子的温度及熔滴与涂层的作用时间影响所致.     

四面体C_4H_4、C_4(GH_3)_4及其骨架的分子轨道法研究

本文用半经验的CNDO/2分子轨道法,计算了C_4H_4和C_4(CH_3)_4的电子能级、电子总能量、电荷分布和电离能。相对四面体骨架C_4(a),配位体H、CH3和tB_u的作用,四面体烷C_4H_4(b)、四甲基四面体烷C_4(CH_3)_4(c)和四特丁基四面体烷C_4(tB_u)_4(d)的相对稳定性,本文的结果给出了满意的解释,同时对于碳烷多四面体的拓扑成键规则,我们作了进一步的验证和讨论。     

氯苯胺类化合物对发光菌毒性的量子化学研究

研究氯苯胺类化合物的电子结构与发光菌毒性的关系,应用CNDO/2量子化学方法计算了20个氯苯胺类化合物的电子结构,探讨了发光菌（Photobacterium Phosphoreum)在5、15、30min时间内的半抑制浓度的负对数P（5-EC50）、P（15-EC50）、P（30-EC50）与化合物的电子结构的关系。获得了3个线性回归方程：⑴P（30-EC50）=0.177 5.056SQR;⑵P（15-EC50)=0.25 4.807SQR; ⑶P(5-EC50)=0.29 4.383SQR,其相关系数分别为0.9039,0.8836和0.8780。结果表明：SQR值越大,即化合物苯环上的正电性越强,则氯苯胺类化合物对Photobacterium Phosphoreum的毒性就越大,据此可预测化合物的毒性。     

乙二醇重排反应的量子化学研究

用ａｂｉｎｉｔｉｏ方法研究了乙二醇在酸性条件下的反应过渡态，讨论了反应机理     

邻硝基苯酚中内氢键和内锂键构成的理论研究

考虑了邻硝基苯酚中内氢键的存在，对其进行了量子化学计算，并探讨了它与锂代分子中的类氢键－内锂键之间的差异，从理论上探讨了锂键的存在与作用，对有机实验研究结果给予支持。