家蚕重要经济性状基因分子标记定位及克隆研究

江苏大学主持的“家蚕重要经济性状基因分子标记定位及克隆研究”日前通过省科技厅组织的鉴定．该研究报道家蚕抗核型多角体病毒(NPV)、耐氟化物、多产卵、荧光茧色4类经济性状的分子标记；在家蚕上发现抗DNV相关基因BmPKCI(AY860960)、抗NPV相关基因s3a(AY705974)、感NPV相关基因BmSOP2(AY763110)，同时，建立了家蚕分子标记辅助育种技术体系，2003年-2004年经过4个省实验室鉴定及安徽省3个农村点饲养，茧质、丝质良好。     

数量性状基因座（QTL）定位的研究进展

对数量性状基因座（QTL）的几种主要定位方法的统计学大批量进行了综述，总结了每种方法的优缺点及其发展动态，特别是对新发展的多区间作图和多性状作图进行了较详细的介绍，并对目前存在的问题和今后的发展进行了讨论。     

数量性状基因座(QTL)定位的研究进展

对数量性状基因座 (QTL)的几种主要定位方法的统计学原理进行了综述 ,总结了每种方法的优缺点及其发展动态 ,特别是对新发展的多区间作图和多性状作图进行了较详细的介绍 ,并对目前存在的问题和今后的发展进行了讨论     

牦牛数量性状主基因的研究

数量性状主基因的研究和开发利用是目前动物遗传育种学研究的热点之一,本研究用偏离正态分布检测法探索了牦牛体重、体高、体长、胸围、产奶量、乳脂率等6个数量性状的主基因。结果表明：体重、体高、产奶量、乳脂率4个性状有主基因的作用;在牦育育种中应充分考虑主基因的问题,并结合主基因分析讨论了开发利用牦牛遗传资源的途径和方法。     

水稻早熟基因显性抑制基因的遗传分析和分子标记定位

将明恢63，9311，IR68，献国和BG1639等5个迟热水稻品种与早籼核不育系6442S—7杂交，对F1，F2代以及三交F1群体进行抽穗期遗传分析．结果表明，9311，IR68，献国和BG1639等4个迟熟品种含有1对等位的显性抑制基因，可部分地抑制6442S—7显性早熟基因的表达．以6442S—7∥明恢63／9311三交F1群体为定位群体，利用微卫星标记将该抑制基因定位于水稻第8染色体短臂上．该抑制基因命名为Su—Ef-cd(t)，并认为该基因对于利用6442S—7早熟基因来培育不同熟期的早熟和中早熟品种具有重要意义．     

基于均值回归理论和数量分析方法的研究

均值回归(Mean reversion)是指股票价格无论高于或低于价值中枢(或均值)都会以很高的概率向价值中枢回归的趋势。众所周知,随机漫步理论在证券投资理论中占有重要地位,但这绝不是证券投资理论研究的最终目的。对于一些投资者尤其是对一些证券投资机构和投资基金来说,随机漫步理论的指导作用极其有限。近些年来,股票价格可预测理论得到了很大发展,均值回归理论就是其中之一,这一理论在发达国家引起了很多学者的重视,它是证券投资理论的一个新的里程碑和历史性的跨跃,亦是股票收益可预测理论的一个突破性进展。也同时是对传统随机漫步理论(The Theory of Random Walk)的一个最大的挑战。     

水稻分子连锁图谱及重要性状的基因定位

对窄叶青８号京系１７的Ｆ１进行花药培养,获得了含有１３２个株系的加倍单倍体群体。     

分子标记或质量性状基因座位间连锁遗传分析的相关方法

提出对两个分子标记或质量性状基因座位的表现型赋值后求相关系数Ｃ，通过ｔ测验以检测此两个分子标记或基因座位间是否存在连锁，进而给出了重组值ｅ及其抽样误差的估计公式。     

影响小麦加工品质数量性状位点的研究

以M5和M16为亲本构建的重组自交系为材料,对影响小麦加工品质性状的数量性状位点（QTL）进行了研究．检测了群体中籽粒硬度、蛋白质含量、SDS沉降值、拉伸面积等品质性状,它们在群体中呈近似正态的连续分布,为多基因控制的数量性状．利用43个SSR标记和42个AFLP标记构建了相关染色体的分子连锁图．在1A、5D、6D染色体上分别检测到与籽粒硬度相关的QTL各1个,其中位于染色体5D上的Xgwn190对表型变异的贡献率最大,达62．5％,为主效基因;在1B和6A染色体上分别检测到与蛋白质含量相关的QTL各1个,它们对表型变异的贡献率分别为13．2％和15．6％;在染色体1B和3B上分别检测到与SDS沉降值相关的QTL各1个,贡献率最大（10．2％）的一个QTL位于3B染色体上靠近E37M61—286的区域;在1A、3B、5D染色体上分别检测到与拉伸面积相关的QTL各1个,其中5D染色体上的Xgwn190对表型的贡献率最大,为11．5％．     

利用分子标记分析22种水稻10个抗稻瘟病基因的基因型

为了明确已克隆的部分稻瘟病抗性基因在上海市主栽水稻品种以及新培育的水稻品系中的分布,选取22份水稻为材料,利用分子标记检测技术,对10个已被克隆的抗稻瘟病基因进行基因型鉴定及分析.结果表明,22种水稻均含Pi36、Pi37、Pi-d2、Pib抗性基因,而Pi-kh、Pi9、Pi2、Pi-ta、Pikm抗性基因在22种水稻中分布各有不同,所有被测水稻中均不携带Pi25抗性基因.     

对三点自交法构建分子标记连锁图谱的改进

对三点自交法构建分子标记连锁图谱进行了改进，使分子标记连锁图谱构建更加精确，并结合F2群体的有关数据进行了模拟计算，证实该方法的可行性，结果表明改进的方法比原有方法更加有效。     

分子区间标记定位QTL的一种改进方法——基于分子标记的极大似然法

提出了以区间分子标记定位QTL时，以分子标记各种类型的性状密度函数进行极大似然估计，进而获得LOD值的极大值，达到准确定位QTL的结果，并与原方法进行了比较。结果表明，新方法所得LOD的数字表达式更简单，并且可以看出样本客量n和分子标记的密度r对于maxELOD值的估计有很大影响。     

利用分子标记分析22种上海市重要水稻10个食味品质相关基因的基因型

稻米食味品质改良是目前水稻育种的重要研究方向之一.明确不同水稻食味品质基因型,可为优质水稻育种研究的亲本选择提供依据.本研究利用分子标记检测技术,对22个目前上海市种植的重要常规水稻和杂交稻亲本食味品质基因的基因型进行检测.结果发现,"紫香糯861"水稻含有相对较多不良食味品质基因型.3种杂交稻父本,"湘晴"、"R44"和"繁14"的食味品质基因型比这3种杂交稻母本,"寒风A"、"秋风A"和"申9A"以及其他常规稻有欠缺.从蜡质基因多态性分析显示,在本研究选用的22种水稻中,2个为糯稻、20个为粳稻,但其中有4个为软米型粳稻;在16个非软米型粳稻中,"宝农34"、"金丰"和"银香18"是具有相对最好食味品质基因型的水稻品种.     

利用DNA微卫星标记定位水稻的抗稻瘟病基因

利用回交育种中产生的回交群体结合前人的研究结果构建了Pil基因区域的局部分子标记连锁图，通过BC1F2家系的接种结果判断其基因型，将Pil定位在RFLP标记RZ536与SSR标记RM144之间，图距分别为9．7、6．8cm，从而建立了一套完整的以PCR为基础的分子标记辅助选择体系。     

辣椒矮化性状的遗传分析、初步定位及SSR标记筛选

目的 明确辣椒矮化性状的分离规律,筛选与之紧密连锁的分子标记,为开展辣椒矮化性状的MAS育种奠定基础。方法 以辣椒矮化种质SSI9024a和无限生长型种质杭椒为试材,分别比较了2个种质7个农艺、品质性状,并构建了4世代分离群体,通过BSA混池测序对该性状进行初步定位,并筛选了与之紧密连锁的SSR分子标记。结果 在株高、果长、果宽、单果重4个农艺性状指标中,杭椒都显著优于SSI9024a亲本,而后者在V_C含量上是前者的6倍多。遗传分析表明,矮化性状受单个隐形基因控制,BSA测序将该基因定位在第6号染色体上,通过对回交后代单株进行验证,引物HpmsE002与矮化性状紧密连锁。结论 成功解析了辣椒矮化性状的遗传规律,并获得了与之紧密连锁的分子标记,这对其后续的MAS育种提供了参考依据。     

BoxCox变换对数量性状基因座位检测效率的影响

数量基因位点(quantitative trait loci, QTL)分析是利用图位法克隆控制数量性状主效基因的前提和基础 。采用BoxCox公式进行数据正态转换对提高QTL分析效率有显著作用。笔者以杨树为实例显示了BoxCox公式在数据正 态转变中的应用及数量性状表型分布对QTL分析的影响。结果发现,数据是否符合正态分布对发现控制数量性状的基 因位点有显著影响。如果不对性状的表型值进行分布检测并进行正态转变,可能无法发现某些有显著效应的遗传位 点。通过比对转化前后QTL分析的LOD值变化曲线得知,曲线变化的趋势在转化前后是一致的,曲线上各个小峰的位 置也是稳定的,但转化后LOD峰值显著提高。如第4染色体上,转化前后LOD值变化曲线上在40~60、80~100及130~150 cm区间均有3个独立峰值出现,数据转化后对应峰值升高,其中第1个峰的峰值约增加3倍,数据转化后该峰值LOD支 持度达到了极显著水平,显示该位置存在一个控制该性状的较强的遗传位点。第8染色体上也出现相似的情况。     

分子标记与QTL间连锁的检测与估计：Ⅱ.利用双单倍体（D…

将数量性状基因定位的“相关方法”应用到双单倍体群体，给出了适用于ＤＨ群体之标记座位与数量性状座间连锁测验的统计方法，并进而给出了生组值及其抽样误差估计的理论公式。     

水稻白叶枯抗性基因Xα-min（t）的抗谱鉴定及其分子标记的筛选

利用来自11个国家的34个水稻白叶枯病菌菌株，以高感品种IR24、含有已克隆的抗白叶枯病基因Xα2的品系C64(IRBB21)、中花11和日本晴4个水稻品种作为参照，对一个含有来自小粒野生稻(0ryza minuta)的抗白叶枯病基因Xα—min(t)的渐渗品系(introgression line)78-15进行了抗谱鉴定。结果表明，Xα—min(t)是一个广谱、高抗的白叶枯病抗性基因。同时，以IR24和78—15为亲本进行杂交，并采用分离群体分组分析法(BSA)、随机引物扩增多态性DNA(RAPD)和序列特异性扩增区(SCAR)筛选与Xα—min(t)连锁的分子标记。共筛选了800个购自Operon公司的随机引物，其中有2个引物，BE05和BE06，可扩增出与Xα—min(t)连锁的RAPD标记BE05 300和BE06 1400。对这两个DNA片段克隆并测序，根据两端序列设计了两对长度为21～24bp的特异引物扩增供试材料，其中一个RAPD标记可转化成稳定、重复性好的SCAR标记ScBE05 300。用ScBE05 300和BE06 1400标记分别对IR24和78—15的杂交F2代948和719个单株进行的连锁分析表明，这两个标记与Xα—min(t)的连锁距离分别为2．2和3．7cM，并位于Xα—min(t)的同一侧。这些结果为Xα—min(t)的精细物理图谱的构建奠定了基础。     

植物数量性状基因座（QTL）的作图与克隆

从QTL定位方法以及QTL精细定位和克隆等方面对植物数量性状遗传进行了综述。