纳米氧化铁对聚球藻生长及生理代谢的影响

用不同浓度纳米氧化铁(n Fe2O3)作用于聚球藻,并通过对聚球藻对数期的细胞数、叶绿素、总蛋白、总糖和中性脂含量等生理指标的测定,研究了n Fe2O3对聚球藻生理代谢的影响.结果表明,在0.3 mg/L至10 mg/L浓度范围内,n Fe2O3对聚球藻的生长未产生明显抑制或者胁迫的作用,表现为其细胞内的总蛋白、中性脂、总糖含量没有因n Fe2O3的存在而产生显著地变化.同时细胞数和叶绿素含量没有增加的趋势,说明在该浓度下铁元素的增加不会对聚球藻产生生长促进作用.     

聚球藻对镍的富集作用及影响因素

研究了环境因素与自身因素对聚球藻富集镍的影响.聚球藻对镍的富集时间在80min可以达到平衡;镍藻质量比最优值为16%～18%,此时富集量达到最大值即饱和吸附范围;pH值是影响富集的一个重要因素,同样条件下随pH值的增加富集量会不断增加,但由于过高pH会导致氢氧化镍生成,因此最佳pH值在9～10;温度和光强是调节富集量的两个因素,温度在35℃、照度在30001x左右是最佳的富集条件;同样条件下,死藻比活藻的富集量略高.     

基于LonWorks技术测控网络的流量控制方法研究

采用速率反馈方式的流量控制策略,在LonWorks总线网络节点上增加控制器和缓冲队列,是改善网络的公平性,提高网络的信息吞吐量,降低网络反馈信道的错误率的有效方法.该策略及算法不仅可优化LonWorks总线网络的通信传输质量,而且对于解决其他包含CSMA协议的工业控制网的同类问题也有参考价值.     

基于小波变换的代谢网络比较方法

针对集合论的全网络比较方法仅考虑节点本身的特性这一缺陷,提出了一种新的代谢网络比较方法,能同时考虑到节点在网络拓扑结构属性方面的差异.该方法综合了7种代谢网络拓扑中心性,应用主成分分析方法选取主成分,设计了主成分分量的序列化方法,运用小波变换来研究代谢网络结构特征曲线,建立模糊函数比较不同物种的代谢网络.该方法能定量地...     

热力学约束下代谢网络流量的蒙特卡洛采样方法

发展了一种新的基于约束的代谢网络分析方法:将代谢网络中可能的稳态类比成一个热力学系综进行蒙特卡洛采样,定义以代谢流量为变量的势能函数,既包括能使网络的生物量产出达到最优的目标量,也包含网络需要满足的一些约束条件.该方法可以对大肠杆菌稳态代谢流量空间在自动满足热力学约束和稳态约束的条件下进行采样,比已有的方法更方便有效,样本比完全随机采样具有更好的分布.优化生物量产出得到的模拟结果与真实实验结果一致.此外,使用不同势能函数,例如使乙醇产量最大化,可获得不同目标下的流量分布,对于代谢工程的遗传操作有指导作用.     

食品安全与药物代谢分析研究评述

扼要介绍现代分析化学的发展,综述作者指导研究生近20年来在分离科学研究、食品安全分析、药物代谢分析等领域的研究进展,期望进一步开展食品组学和药物代谢组学分析研究.     

基于拓扑聚类的密度聚类算法研究

聚类分析是重要的数据挖掘方法,在商务智能、地理信息系统、医学等方面有广泛的应用.随着聚类分析的蓬勃发展,涌现出了许多聚类算法,其中最重要的算法之一是基于密度的空间聚类以及其多种变种——基于密度连通链、基于加权密度、基于引力连通集合的算法.这些算法在概念上相似但没有统一的描述.本文针对基于密度的空间聚类及其变种提出了拓扑的概念.给出了聚类拓扑结构的定义,把簇定义为拓扑连通集合.此外,本文运用全新的拓扑思想改进典型的算法,提出了一种拓扑聚类的新算法.实例证明此算法有效.     

一种新的平衡化谱聚类方法

针对传统谱聚类算法在非平衡数据集上聚类效果不理想的问题，提出了一种平衡化谱聚类算法，该算法在传统谱聚类目标函数的基础上加入了对聚类隶属度矩阵的近似正交约束，从而得到新的聚类目标函数.实验结果表明，新算法可以缓解传统谱聚类产生的均匀效应，提升了在非平衡数据集上的聚类纯度.     

基于网络的教学模式创新研究

分析了当前网络教学发展的现状和困惑,从三个方面进行了教学模式改革,突破原有的教学模式,以期提高网络教学的有效性.     

对虾白斑病毒VP28基因在聚球藻中的表达与分析

通过PCR从实验室保存的pMD-VP28质粒中扩增得到对虾白斑病毒囊膜蛋白VP28基因,同时在设计的引物起始密码子前添加促进外源基因在蓝藻中表达的SD序列,引物末端添加限制性内切酶住点BamH I和EcoR I,从质粒pRL-439获得强启动子PpsbA,酶切连接构建了pDC-VP28高效表达穿梭裁体.利用三亲接合转移成功地将构建的栽体pDC-VP28转化聚球藻7002.对转基因聚球藻进行培养,其表达产物通过SDS-PAGE分析,发现表达量达3%左右.     

网络视频病毒式营销探析

通过对《旱冰宝宝》网络视频引起的病毒式营销事件,以问卷调研的形式进行实证分析,探讨网络视频病毒式营销.对病毒式营销的概念和原理进行了界定,将其与电视广告等传统营销形式进行对比,挖掘出病毒式营销的特点,结合《旱冰宝宝》案例分析了网络视频病毒式营销获得良好广告效应的传播过程.通过对消费者进行体验式问卷调研的实证方法,运用因...     

采用PhR-L20C光生物反应器培养转胸腺素α1基因蓝藻的研究

采用PhR L20C光生物反应器对转胸腺素α1基因聚球藻Synechococcussp.PCC7942进行6批次的培养,结果表明,采用本实验室优化后的培养条件,根据该型气升式光生物反应器所具备的各项性能指标和参数条件进行培养,一个培养收获周期为6d,平均生长速率为0.61OD730/d,6d后藻细胞平均终浓度达到OD730=4.27,绘制了转基因藻细胞的光密度与其干质量的标准曲线,通过曲线得出产率平均约为0.36g/(Ld),最高0.40g/(Ld);最终细胞密度平均可达2.52g/L,最高2.84g/L.     

Expanded flux variability analysis on metabolic network of Escherichia coli

Flux balance analysis, based on the mass conservation law in a cellular organism, has been extensively employed to study the interplay between structures and functions of cellular metabolic networks. Consequently, the phenotypes of the metabolism can be well elucidated. In this paper, we introduce the Expanded Flux Variability Analysis (EFVA) to characterize the intrinsic nature of metabolic reactions, such as flexibility, modularity and essentiality, by exploring the trend of the range, the maximum and the...     

暗发酵制氢代谢途径研究进展

氢能因具备高热值、燃烧产物无污染、原料来源广泛等优点成为最具潜力的新能源之一。暗发酵因不受光照限制,产氢能力强,并可以解决环境污染问题而成为研究的热点。该文主要综述了暗发酵制氢的代谢途径及其研究进展,重点阐述了产氢菌株关键酶或基因改造的最新研究成果,并对其未来的应用进行了展望。     

Relationship between topology and functions in metabolic network evolution

What is the relationship between the topological connections among enzymes and their functions during metabolic network evolution? Does this relationship show similarity among closely related organisms? Here we investigated the relationship between enzyme connectivity and functions in metabolic networks of chloroplast and its endosymbiotic ancestor, cyanobacteria (Synechococcus sp. WH8102). Also several other species, including E. coli, Arabidopsis thaliana and Cyanidioschyzon merolae, were used for the comparison. We found that the average connectivity among different functional pathways and enzyme classifications (EC) was different in all the species examined. However, the average connectivity of enzymes in the same functional classification was quite similar between chloroplast and one representative of cyanobacteria, syw. In addition, the enzymes in the highly conserved modules between chloroplast and syw, such as amino acid metabolism, were highly connected compared with other modules. We also discovered that the isozymes of chloroplast and syw often had higher connectivity, corresponded to primary metabolism and also existed in conserved module. In conclusion, despite the drastic re-organization of metabolism in chloroplast during endosymbiosis, the relationship between network topology and functions is very similar between chloroplast and its precursor cyanobacteria, which demonstrates that the relationship may be used as an indicator of the closeness in evolution.     

Molecular ecology studies of marine Synechococcus

Cyanobacteria of the genus Synechococcus is a dominant component of microbial community in the world's oceans, and is a major contributor to marine primary productivity and thus plays an important role in carbon cycling in the oceans. Besides the ecological importance, the cultivability also made Synechococcus a very special group of marine microorganisms, which has attracted great attention from oceanographers and biologists. Great progress in the physiology, biochemistry and phylogeny of Synechococcus has been made since its discovery. We here review the current status of molecular ecology of marine Synechococcus and give a perspective into the future based on our understanding of the literature and our own work.     

基于移动协助方式的网络连通性恢复技术研究

无人值守的无线传感器网络在严酷环境中易大规模损坏,节点数据无法传输给 Sink节点,造成网络不可用。为解决该问题,借助移动数据收集器,设计了一种基于移动协助方式的网络连通性恢复方案。该方案将剩余可用节点通过 FCM聚类算法大致分为K个集群,在确保集群内部正常通信的情况下,运用 Dijkstra 算法最小化移动数据收集器的移动长度,从而实现移动路径最优条件下的网络连通性恢复。在含有100个节点的无线传感器网络上进行仿真验证,结果表明所设计的方案是有效的。     

二苯甲酮类化合物对发光菌毒性的神经网络法研究

二苯甲酮类化合物在众多领域得到广泛应用,是非常重要的一种日用化工原料.为了研究二苯甲酮类化合物对发光菌毒性与其结构之间的定量结构-毒性相关关系,基于拓扑理论,计算了14个二苯甲酮类化合物分子的连接性指数(~mX),选取连接性指数(~mX)中的2种结构参数(~2X和~5X_c)作为理论结构描述符,引入与二苯甲酮类化合物对发光菌毒性相关的回归分析中,构建了稳定性较好的QSTR模型,并将这2种连接性指数(~2X和~5X_c)作为人工神经网络法(ANN)的输入层节点,采用2-2-1的神经网络结构,构建了相关性良好的神经网络预测模型,该毒性预测模型的总相关系数r_t达到0.998 3,预测的毒性值与其相应文献值的相对平均误差只有1.60%,两者吻合度较好.结果表明,二苯甲酮类化合物对发光菌毒性与2种分子连接性指数具有良好的非线性关系,利用该模型可为设计毒性低的新二苯甲酮类化合物分子提供指导.     

基于Content-Addressable Network的对等网络研究

CAN(Content-Addressable Network)是基于分布式哈希表(Distributed Hash Table,DHT)的结构化对等网络.CAN系统通过分布式哈希表(DHT)在d维虚拟空间中搜索、共享资源,具有良好的可扩展性,容错性和完全自适应性.本文从网络架构,系统性能等方面综合介绍了CAN系统并对2种基于子空间策略CAN资源搜索算法进行了介绍和分析.     

The genome of a motile marine Synechococcus

Marine unicellular cyanobacteria are responsible for an estimated 20-40% of chlorophyll biomass and carbon fixation in the oceans. Here we have sequenced and analysed the 2.4-megabase genome of Synechococcus sp. strain WH8102, revealing some of the ways that these organisms have adapted to their largely oligotrophic environment. WH8102 uses organic nitrogen and phosphorus sources and more sodium-dependent transporters than a model freshwater cyanobacterium. Furthermore, it seems to have adopted strategies for conserving limited iron stores by using nickel and cobalt in some enzymes, has reduced its regulatory machinery (consistent with the fact that the open ocean constitutes a far more constant and buffered environment than fresh water), and has evolved a unique type of swimming motility. The genome of WH8102 seems to have been greatly influenced by horizontal gene transfer, partially through phages. The genetic material contributed by horizontal gene transfer includes genes involved in the modification of the cell surface and in swimming motility. On the basis of its genome, WH8102 is more of a generalist than two related marine cyanobacteria.