黄嘴白鹭遗传多样性AFLP分析方法的建立

以黄嘴白鹭为研究对象,探讨并建立其遗传多样性分析的Pst I/Mse I AFLP分子标记方法.采用黄嘴白鹭13个样品作为一个种群的池DNA,通过对AFLP方法中DNA提取、酶切、连接、预扩增、选择性扩增、电泳和银染等条件进行优化,建立了一套适合黄嘴白鹭的AFLP技术优化体系,为黄嘴白鹭遗传多样性的分析奠定研究基础.     

扁桃基因组DNA的制备和AFLP技术体系的建立

AFLP技术对DNA模板的质量要求较高。桃属果树扁桃的叶片含有较高的糖分、多酚类等物质,基因组DNA的纯化比较繁琐。笔者采用3×CTAB缓冲液提取基因组DNA,并加以纯化,使DNA质量达到AFLP技术的要求。在AFLP分析中,筛选出合适的引物组合:采用E+3/M+3选择性引物组合时,扩增条带少;改用E+2/M+3引物组合后,扩增产物主要分布在600～100bp内,且扩增条带数目适中,多态性适宜,电泳图谱清晰。     

几种基于基因组DNA的真菌分类技术研究进展

基于基因组DNA的真菌分类技术发展迅速。综述了DNA分子杂交技术,真菌线粒体DNA限制性片段长度多态性(m t RFLP)分析,随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,rDNA序列分析,扩增片断长度多态性(amp lifiedfragm ent length polymorph ism,AFLP)在真菌分类和系统发育中的应用。     

AFLP技术及其在动物遗传育种中的应用

扩增片段长度多态性(AFLP)被称为“下一代分子标记”。是检测DNA多态性的一种新技术．该技术可靠性强,多态性检出率高,因而被认为是最有效的DNA指纹分析技术,AFLP已广泛应用于分类学、种群遗传学、病理学、DNA指纹分析的研究和建立数量性状基因图谱,成为最主要的遗传标记,论述了AFLP的原理、特点、影响实验成功的关键因素及在动物遗传育种中的应用。     

重楼属植物AFLP实验体系的建立

通过对影响重楼AFLP-银染技术体系的关键因素作对比研究,建立了一套优化的重楼AFLP分子标记体系.优化的关键因素为:1)DNA采用CTAB法提取更适于重楼的AFLP分析,且从幼叶中提取的DNA纯度和质量最高;2)酶切时间为9h时效果最佳;3)选择性扩增时退火温度为56℃;4)从15对引物中筛选出4对进行选择性扩增,得到扩增条带276条,其中多态性带201条(占72.83%).     

麦长管蚜AFLP银染分析体系的建立与优化

以麦长管蚜Sitobion avenae(Fabricius)为研究材料,以AFLP技术为基础,采用限制性内切酶EcoRI和MseI,对影响麦长管蚜AFLP技术体系中的关键技术,如DNA的提取质量、酶切与连接、扩增条件、引物选择、染色方法等进行了优化处理,构建了麦长管蚜AFLP银染技术体系。酶切与连接分步进行,预扩增与选择性扩增同体系完成。在此优化体系下,可以得到重复性好、稳定性和多态性高的麦长管蚜AFLP条带。该体系的构建为蚜虫种间分子遗传学研究提供了新的技术手段。     

甘蔗祖亲种特异DNA探针构建及应用研究进展

本项目研究采用 AFLP 技术分离和扩增栽培甘蔗主要祖亲种特异限制性 DNA 片段,通过 Southern 杂交检测,弃除种问同源的 DNA 序列(片段),进而构建祖亲种特异 DNA     

中药材人参鉴定技术方法的研究与评价

主要探讨现有的人参鉴定传统方法和分子生物学方法在鉴定过程中的准确性和客观性,综述了聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)、随机扩增多态性DNA标记(Randomly Amplified Polymorphic DNA,RAPD)、限制性片段长度多态性分析(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)、扩增片段长度多态性分析(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)、多位点探针DNA指纹图谱和微卫星标记技术(SSR)等在人参物种鉴定中的应用,并对每种技术进行了相应的评价.     

柴胡栽培种ZQ-T干根药材的AFLP鉴别

以干根药材为材料,采用AFLP技术进行了柴胡栽培种ZQ-T的鉴别.首先以3个柴胡栽培种干根样品混合DNA为模板进行AFLP分析,筛选出3对引物,经3次重复其DNA指纹图谱一致.然后以3对引物分别进行了7个栽培种的AFLP分析,每对引物均能从ZQ-T中扩增出特异条带,将ZQ-T鉴别出来;通过聚类分析,当遗传相似性系数分别为0.81、0.86、0.97时(引物分别为E-AAC/M-CTA、E-AGG/M-CTG和E-AGG/M-CAA)可将7个柴胡栽培种完全区分开.结果表明:AFLP可以较好地揭示柴胡种质资源的遗传差异,并可用于柴胡栽培种干根药材的鉴别.     

65个菊花栽培品种遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP技术, 对65个菊花品种进行了遗传多样性分析.选用6对多态性高、分辨力强的引物组合分别对供试材料的基因组DNA进行扩增, 共获得244条清晰可辨的谱带, 其中多态性带178条, 多态位点百分率达72.95%,揭示了菊花栽培种质丰富的遗传多样性.对AFLP扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析,多数瓣型相同的菊花种质表现出较为密切的亲缘关系,地域来源与聚类结果也有一定程度的相关性,而花色与聚类结果无明显的相关性.     

扩增片段长度多态性技术在动物遗传多样性研究中的应用

扩增片段长度多态性(AFLP)是一种有效的分子遗传标记方法,具有快速、经济、简便、模板需要量少、重复性高、结果可靠等优点。目前AFLP在动物方面的应用还不是很多,处于初级阶段,主要用于鉴定分类关系、种群遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建等方面。     

AFLP的一种改进方法

扩增片段长度多态性技术是一种兼具稳定性及多态检出率高的ＤＮＡ指纹分析技术,具有广泛应用前景,但该技术费用高,操作较复杂,本文对ＡＦＬＰ技术从限制性内切酶水解,扩增条件,检测方法三方面作了一些改进,建立了一磋稳定的和简便易行的实验条件,同时对这种改进的方法对家蚕基因组ＤＮＡ的多态性进行了初步研究,得到了良好的ＤＮＡ的多态性检测效果,不仅分辨力较高,而且带型稳定。     

松属树种种苗鉴定中AFLP指纹技术的研究

AFLP(扩增片段长度多态性)标记技术是高效而可靠的标记技术之一，特别对于那些基因组序列信息很少的物种更为有效。笔对基因组较大的松属树种的AFLP实验程序进行了优化，提供了松树树种AFLP分析中DNA酶切、引物连接、预扩增及选择性扩增的优化实验程序。结果显示．预扩增反应中利用选择碱基数不同的预扩增引物(E/M 1，E／M-2)制备的模板对后续的选择性扩增结果没有显影响；在选择性扩增反应中，对碱基数目选择进行了细致的优化．分别测试了15个E-3M-3引物组合，6个E 4/M 3引物组合及15个E 3/M 4引物组合。对于有相同选择碱基数的引物．扩增结果随选择碱基的组合不同而有较大差异。据总的扩增结果发现，选择碱基增加时．扩增谱带数明显减少，谱带清晰度增加，即当选择碱基增加到E引物末端时(M十4／E 3)，大多数引物组合的扩增谱带数要比选择碱基增加到M引物末端(E 3/M 4)的引物组合扩出的谱带数少且带型清晰。总体来看，E 4/M 3的引物组合比较适合于松属树种的AFLP分析。笔还利用单株树种子的胚乳组织对AFLP标记的遗传方式进行了研究，在所用的两个引物组合获得的标记中，约有30％左右的分离标记．分离标记中偏分离比例约为6％。另外．选用3个松属树种对选出的14个AFLP引物组合进行的验证显示，这些组合在不同种间均获得了较好的扩增结果．说明在不同松属树种中筛选出的引物组合可以为其它松属树种AFLP分析引物组合的选择提供借鉴。     

AFLP的研究

AFLP(扩增酶切片段多态性)是由Zabeau等近年发明的一项新的研究生物遗传多样性的方法,具有技术可靠性和技术高效性.一次可获得50～100条谱带.本文详细介绍了AFLP的银染检测程序及其可能出现的问题,AFLP技术为不同来源和不同复杂度基因组的分析提供了一个有力的工具.     

AFLP标记在植物研究上应用

论述了AFLP分子标记技术原理及其特点,详述了AFLP－DNA指纹技术在植物研究中应用进展,并指出了存在的问题及其相应对策。     

动物育种中AFLP分子标记技术的应用

简述了AFLP分子标记的原理、流程、技术关键及其优化措施．对AFLP技术的特点进行了评价．综述其在动物育种中的研究．最后对AFLP的应用前景进行展望．     

SSR标记技术及其在植物遗传学中的应用

SSR是建立在PCR技术上的新型分子标记 ,与RFLP、RAPD、AFLP相比 ,SSR具有多态性高 ,结果稳定可靠 ,重复性好 ,操作简便等特点 .阐述了SSR的原理和方法 ,概括介绍了其在遗传学和遗传育种研究领域中的应用     

AFLP分子标记技术及其应用研究进展

AFLP是新近发展起来的一种DNA指纹技术，该方法重复性好、特异性高、能反映生物基因组的细微变化，在生物遗传多样性研究、品系分析、高密度遗传图谱的构建、微生物分型与鉴定、生态位变化、抗性育种、动物近交系选 育、疾病诊断等方面应用广泛。本简述了AFLP分子标记的基本大批量、方法与特点以及在动植物、微生物、生态群落等方面研究中的应用和发展前景。     

Study on the sex-related AFLP marker of the Yangtze finless porpoise

The sex-related molecular marker of the Yangtze finless porpoise was screened using Amplified Fragment Length Polymorphism （AFLP） technique combined with the bulked segregant analysis. Totally 36 AFLP primer combinations were used to detect the genome DNA bulks of the female and male porpoises, and one sex-related AFLP marker was finally obtained. The marker can be applied to sex identification, and provides a base for further cloning of sex-related genes and analyzing of Y chromosome haplotypes of the Yangtze finless porpoise.