南昌链霉菌与放线菌噬菌体ΦC31相互关系的研究

经点滴法和平板法检测,放线菌噬菌体ΦC31及大部分衍生噬菌体能感染南昌链霉菌,但这些噬菌体的DNA却不能南昌链霉菌。通过比较来自不同宿主的KC515噬菌体悬液对为铅青链霉菌和南昌链霉菌的侵染效率,发现南昌链霉菌对ΦC31及衍生噬菌体具有很强的限制性。Southern杂交实验表明,ΦC31衍生噬菌体KC301（C^ attP^ ）可以整合到南昌链霉菌NS－32－26的染色体上形成溶源,其溶源菌自发释放KC301,但热激诱导后并没有提高释放频率。通过脉冲电泳技术和Southern杂交的方法定位了KC301在南昌链霉菌NS－32－26染色体上形成溶源的附着位点（attB)。这些结果均有利于利用以ΦC31为基础的载体对南昌链霉菌进行分子生物学的研究。     

温度对苏云金杆菌溶源化效率的影响

实验表明，在寄主菌苏云金杆菌生长良好的２５～３７℃的温度范围内，温和噬菌体ＴＰ的存活率及吸附效率与温度变化关系不大，但使寄主溶源化的效率则随温度的上升有明显提高．这一结果为解决发酵工业中噬菌体污染问题提供了新思路     

细菌菌蜕的研究进展

细菌菌蜕是革兰阴性细菌被噬菌体PhiX174的裂解基因E裂解后形成的完整细菌空壳.这种基因灭活过程其内外膜结构保持良好,不会引起细菌表面结构的任何物理化学变化,可作为递送系统和疫苗使用,在疾病的预防和治疗方面具有广阔的应用前景.     

“善良的”病毒：噬菌体与致病细菌之战

噬菌体是一种病毒,但是这种病毒却是“善良”的,因为它可以治疗细菌引起的感染,有效地杀死细菌。然而,使用噬菌体杀灭细菌的疗法和技术并非十分成熟,许多国家,诸如美国,当局依然限制使用噬菌体治疗。     

一株尿路致病性大肠杆菌噬菌体的分离鉴定及生物学特性分析

本研究从尿路感染患者尿液样本中分离、鉴定大肠杆菌裂解性噬菌体,对其裂菌活性等生物学特性进行分析,为探索应用噬菌体治疗耐药性尿路致病性大肠杆菌导致的尿路感染奠定基础.利用双层琼脂平板法,从尿液样品中分离、纯化,得到一株能裂解大肠杆菌的噬菌体.通过电镜观察噬菌体形态,测定其裂菌谱、最佳感染复数、一步生长曲线、以及热稳定性、...     

噬菌体,我们做朋友吧

正噬菌体是什么?它会偷偷钻进细菌里,利用细菌的生化系统克隆出很多自己。在克隆完成后,它们会使宿主破裂,从而杀死宿主。总而言之,这是一种会攻击细菌的病毒。噬菌体非常小,有蝌蚪形、细杆形等形状,以蝌蚪形多见,由核酸和蛋白质构成。其中,蛋白质起着保护核酸的作用,并决定噬菌体的外形。根据繁殖特点,噬菌体分为毒性噬菌体和温和噬菌体两类,前者繁殖能力极强,后者繁殖能力稍弱。     

抑制铜绿假单胞菌生长的噬菌体K4基因的筛选

噬菌体基因组携带多种影响宿主菌生长的基因,是筛选新型抗菌素的可能靶位.本研究分别克隆铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)噬菌体K4携带的全部75个基因,在阿拉伯糖启动子控制下进行表达.实验结果表明,6个噬菌体基因的表达产物能够显著抑制宿主菌的生长.生物信息学分析显示,基因gp72编码的末端酶大亚基与噬菌体基因组包装过程相关,基因gp49编码假定的5′-3′核酸外切酶,其余4个基因编码产物未发现特定的蛋白结构域.利用脉冲场凝胶电泳分析宿主菌染色体DNA的完整性,在阿拉伯糖诱导5,h时,蛋白Gp17、Gp41、Gp72、Gp29和Gp49能够导致宿主菌染色体DNA的显著降解,这是抑制宿主菌生长的可能原因.蛋白Gp67对宿主菌染色体DNA没有影响,其抑制细胞生长的机制不同于其他蛋白.实验还发现,筛选基因的产物还能影响噬菌体的感染效率.本研究发现的抑制细菌生长的基因,能够为筛选新型抗菌素提供新的靶位.     

λ噬菌体切除酶基因Xis在大肠杆菌中的可溶性融合表达

λ噬菌体切除酶Xis(excisionase)是调控λ噬菌体溶源裂解转换过程中的一种重要蛋白质.通过密码子优化及两步法将来自λ噬菌体切除酶基因Xis在体外合成,然后克隆到带有类泛素蛋白SUMO标签的定向原核表达载体SUMO-p ETG上,测序正确后,然后转化至E.coli BL21(DE3)细胞可溶性表达.经SDS-PAGE及质谱检测证实表达蛋白确实为目的蛋白.该研究通过融合表达λ噬菌体切除酶Xis不仅解除了Xis对E.coli宿主细胞的毒害作用,而且实现在E.coli中的高水平可溶性表达.因此,Xis的大量制备,将会促进Gateway克隆技术的广泛应用.     

在细菌上寄生的细菌——介绍一种弧菌(Bdellovibrio)

前言弧菌(Bdellovibrio)是寄生于植物病原细菌或一般土壤细菌体内引起溶菌的细菌。1962年首先在德国发现,被称为吞食细菌的细菌。此后许多国家都进行了分离和研究。明确了这种细菌不仅能在别的细菌上寄生,而且也能在人工培养基上繁殖。在生理、生态、寄主——寄生者间的相互关系等方面进行了广泛的研究。最近还对这种细菌的遗传物质 DNA 作了分析,对它的均一性等作了详细的研究,确定了其分类学位置。     

谷氨酸产生菌筛选方法的改进

自福建各地采来的土壤共24样,进行了谷氨酸产生菌棒状杆菌类的分离筛选,发现在富含有机质的陈积土壤中,特别是垃圾土和污泥,易于分离到产谷氨酸的棒状菌。为了证实这些土壤是该菌属棲息的环境,我们进行了各种土壤中的棒状杆菌的噬菌体的分离,印证了只有在上述的类似环境才有棒状菌杆的噬菌体,而其他土壤皆未分离到。因此我们根据了棒状杆菌的生长环境的特点和该菌菌体在灼烧时具有特殊的响声,可以迅速地分离到产谷氨酸细菌,大大地提高了筛选的效率。     

污水处理系统中噬菌体的浓缩分离和宏合格基因组DNA的提取

以城市污水活性污泥为材料,经分级粗滤、超滤、等密度梯度离心等方法获得高纯度噬菌体悬液,常规SDS方法提取噬菌体DNA.荧光显微镜观察和计数表明浓缩液中噬菌体的纯度和丰度都显著提高;利用透射电镜对浓缩液进行观察,噬菌体的形态呈杆状、线状等多样;基因组提取结果显示,得到的DNA样品纯度高,大小介于20~25kb之间,电泳条带清晰,整个泳道没有弥散现象;利用细菌通用引物对提取的噬菌体DNA进行16SrDNA扩增阴性,说明所得到的噬菌体纯度较高,没有细菌污染.通过实验获得一种高效快捷的从污水处理系统中纯化浓缩噬菌体并进一步获得噬菌体宏基因组DNA的方法,同时为研究环境噬菌体生态分布、多样性组成奠定基础.     

稀有放线菌的选择性分离方法

 为了设计稀有放线菌的分离方法,对噬菌体S7,S3,重铬酸钾、萘啶酮酸、利富平、硫酸庆大霉素、柱晶白霉素、放线酮、制霉菌素等抑制剂及几种碳源进行了试验,设计或改良了几种培养基,研究它们分离稀有放线菌的效果.发现噬菌体能有效降低常见链霉菌的出菌率,重铬酸钾抑制真菌、细菌的效果好,MOPS、海藻糖、丙烯酰胺和乙二胺四乙酸能提高稀有放线菌的出菌率.推荐海藻糖-脯氨酸培养基、改良高氏2号、改良脯氨酸培养基作为稀有放线菌分离培养基.还提供了一些分离稀有放线菌的经验.     

科普中国

正人工培养噬菌体首度阻止"超级细菌"生长噬菌体可以作为抗生素的替代品。近日,一个由德国、奥地利和瑞士的研究人员组成的团队首次证明,专门培养的噬菌体比已知的野生噬菌体对多重耐药性细菌有更好的疗效。而此前即使在最好的情况下,     

钝齿棒状杆菌转导噬菌体T-1的理化和生物学特性

虽然对谷氨酸产生菌(Corynebacterium crenatum)噬菌体已有许多较深入的研究,但对于噬菌体在遗传学上的应用的研究却很少。为寻找适合于谷氨酸产生菌的遗传载体,本实验室从分离出的48株噬菌体中,筛选后得到两株具有转导能力的噬菌体。下文报道其中一株的理化、生物学特性,为已发表的谷氨酸产生菌噬菌体进行比较,提供选择转导噬菌体的参考。     

各种药物对溶源性细菌释放噬菌体的诱导效应

应用浓度梯度培养皿的方法,在Escherichia coli K12 W1177和K12 W1485 his~-系统中测定了93种药物对于溶源性细菌释放噬菌体的诱导能力.这些药物包括已知的基因诱变剂、抗肿瘤药物、致癌药物、辐射防护剂以及代谢抑制剂等.诱导量达到5%(约25倍于自发释放量)的药物共15种,诱导量在45%以上的有3种.在具有诱导作用的药物中至少有60%的药物对于基因有诱变作用.有6种药物对于自发释放有抑制作用,其中尿嘧啶的结构类似物占4种.实验表明许多同时具有致癌和抗肿瘤作用及诱变作用的药物都具有诱导作用.文中简单地讨论了药物的杀菌作用和诱导作用之间的关系,以及5-溴脱氧尿核苷和重氮尿嘧啶及2-硫尿嘧啶等天然碱基结构类似物的可能作用机制.     

一株新铜绿假单胞菌噬菌体SRT6的分离以及全基因组序列分析

分离一株新铜绿假单胞菌噬菌体,进行生物学特征分析,全基因组测序和比较基因组学分析.了解该噬菌体与其他假单胞菌噬菌体之间的亲缘关系以及它的潜在应用价值.利用双层平板法分离纯化噬菌体,利用酚氯仿抽提基因组,利用Illumina Hiseq测序平台对基因组测序,利用生物信息学进行基因组和比较基因组学分析.分离到一株新的烈性铜绿假单胞菌噬菌体SRT6,其基因组全长91 364bp,G+C含量49.3%,存在182个蛋白质编码基因,其中的96个与已知功能的蛋白质具有相似性,无tRNA和tmRNA.比较基因组分析发现,噬菌体SRT6属于一个新物种.分离鉴定出一株烈性铜绿假单胞菌噬菌体SRT6,并发现它属于一个新种噬菌体,为未来利用噬菌体治疗耐药铜绿假单胞菌感染打下坚实的基础.     

铜绿假单胞菌耐药机理

铜绿假单胞菌是耐药性十分突出的一类院内感染条件致病革兰氏阴性细菌．本文从生物被膜、细胞密度依赖式毒力因子、外排系统、基因盒一整合子系统及铜绿假单胞菌噬菌体几方面对其耐药性机理进行了概述，并提出了未来对微生物耐药性研究和应用的一些策略。     

汉江水体和沉积物中噬菌体特征研究

基于2014年3月和10月汉江中下游6个断面的水体和沉积物监测样品,获得384个高质量vOTUs(viralOperationalTaxonomicUnits)。研究表明,vOTUs中95%以上隶属Caudovirales (有尾噬菌体目),丰度居前3位的科分别为Myoviridae (肌尾噬菌体科)、Siphoviridae (长尾噬菌体科)和Podoviridae(短尾噬菌体科)。主坐标分析和相似性分析结果表明,沉积物中病毒群落结构相对稳定,而水体中群落易随季节发生变化,同流域的水体和沉积物中群落可能具有连通性。宿主来自2域(界) 19门,丰度最高的宿主是Proteobacteria门(变形菌门)。88%的vOTUs具有单一的门水平的宿主,有3个vOTUs跨越5个门。跨域(界)感染的vOTUs在感染古菌界Thermoproteota门的同时,最常见的是感染细菌界的Bacteroidota门(拟杆菌门)。与水体相比,沉积物中宿主的群落组成更加多样。Pearson相关分析表明,噬菌体与其宿主的组成在门水平上一致。     

谷氨酸产生菌噬菌体φCC-1-9-80对发酵影响的动态观察

自谷氨酸发酵不正常的罐中,分离一株与松井等的三种溶菌类型不同的噬菌体。这噬菌体在营养肉汤中不能传代,它的增殖需Mg~(++)或Mn~(++)离子;模拟发酵实验,在发酵初期,以低感染量,影响发酵产酸不显著,高感染量,使发酵延迟12小时左右,以后又可恢复到近乎正常;发酵中溶菌强度与Mg~(++)离子浓度有关。 实验证明,受噬茵体感染的寄主菌,可形成较高频率的抗性菌。推测是噬菌体在细胞内形成暂时性的整合或成自主性的质粒。这些抗性菌在传代中又可恢复为敏感菌。     

噬菌体在肠杆菌科细菌分类鉴定中的敏感试验研究

目的通过加入蓝四氮唑指示剂提高噬菌体在肠杆菌科细菌分类鉴定中的敏感性.方法加蓝四氮唑法.结果加入蓝四氮唑后提高了噬菌体在肠杆菌科鉴定中的敏感性和清晰度.结论建议在应用噬菌体鉴定肠杆科细菌时,加入蓝四氮唑指示剂.