Genomic sequence determination of Classical Swine Fever Virus persistent infection strain

Full genomic sequence of a newly isolated persistent infection strain of classical swine fever virus was firstly determined. It was demonstrated by sequence analyses that nucleotides homologies of this strain compared with virulent Shimen and vaccine HCLV were 89.7% and 87.7%, and homologies of amino acids were 94.8% and 93.3%, respectively. The sequencing results primarily suggest a tighter relationship between this persistent infection strain and virulent Shimen strain than vaccine HCLV strain. Foundation item: Supported by National Basic Research Developmental Project (G199911900). GenBank NO.: AF407339 Biography: Wu Hai-xiang (1976-), Ph.D. candidate, research direction: virus genetics.     

Complete nucleotide sequence and genomic organization of Periplaneta fuliginosa densonucleosis virus

We have cloned the replicative form of thePeriplaneta fuliginosa densonucleosis virus (PfDNV) genome and determined its complete sequence. The sequence has 5 454 nucleotides (nt), the genome consists of an internal unique sequence flanked by inverted terminal repeats (201 nt). The first 122 nt at the 5′ end and the terminal 122 nt at the 3′ end of both plus and minus strands can fold into a typical hairpin structure. The genome contains seven major open reading frames (ORFs). The plus strand has 4 ORFs occupying the 5′ half of the plus strand, whereas the others span the 5′ half of the minus strand. Two potential promoters were found at map units (m.u.) 3 and 97. Computer analysis of sequence homologies with other parvoviruses suggests that the plus strand ofPf DNV encodes very likely the nonstructural proteins and the minus strand probably encodes the structural proteins.     

Complete Nucleotide Strain Sequence of a Newly Avirulent Newcastle Disease Virus Hubei 92（HB92） Strain

A new avirulent, heat-resistance HB92 strain of newcastle Disease Virus (NDV) was acquired from Australia V4 strain. Its complete nucleotides sequence was first determined. The entire genome of NDV HB92 consists of 15 186 nucleotides (GenBank accession no. AY225110). It was demonstrated by sequence analysis that nucleotides homology of HB92 strain with virulent strain ZJ1 were 83.9%, and the homology compared with avirulent vaccine strain La Sota and B1 were 94. 0% and 93. 5%, respectively. These results might be contributive to the study of the molecular mechanism of evolution of the NDV strain HB92 and to develop the engineered recombinant vaccine.     

Genomic cloning and sequencing of betaine aldehyde dehydrogenase gene in spinach

A genomic library derived from leaves of spinach was constructed with the λGem11_BamHI Arms as the vector. The library was screened using the BADH cDNA of mountain spinach as a probe and six positive clones were obtained through three rounds of screening. One of the positive clones named D, which was hybridized with the 5′600 bp fragment of mountain spinach BADH cDNA, was selected and further analyzed. The size of the insert in clone D was about 12 kb. 8 856 nucleotides of the insert were sequenced which contained 2 459 nucleotides of 5′ noncoding region, 6 111 nucleotides of the complete sequence of the BADH gene, and 286 nucleotides of a 3′ noncoding region. The result of sequence analysis indicated that the BADH gene contained 14 introns and the junction sequences at splicing sites followed the GT_AG rule basically.     

鸡产蛋下降综合症的调查

采用微量血球凝集和血球凝集抑制试验，对石河子及附近地区部分未注射过ＥＤＳ—７６灭活疫苗的六个鸡场进行了血清学调查和流行病学调查，结果表明ＥＤＳ—７６病毒已在本地区广泛存在。     

菊花‘千手观音’LEAFY基因转录区基因组克隆和结构分析

LEAFY(LFY)基因在植物花发育过程中具有重要作用,不仅控制着花序分生组织向花分生组织的转变,而且控制着开花时间.通过基因组PCR扩增,获得了菊花‘千手观音’LFY同源基因序列.序列分析表明该基因包括2个内含子和3个外显子.其内含子1的2个序列长短不同,差异明显.2个内含子与甘菊的LFY同源基因DFL相比都表现出了丰富的变异性.其外显子推测的氨基酸序列与甘菊DFL的氨基酸序列相似性达99%.系统进化分析表明‘千手观音’的LFY同源基因与所有的菊属植物的LFY基因在树的同一枝上,且距双子叶植物的距离近于单子叶或裸子植物.Southern杂交表明,‘千手观音’基因组中LFY同源基因以两个拷贝形式存在.     

Complete Nucleotide Sequence of a Newly Avirulent Newcastle Disease Virus Hubei 92(HB92) Strain

Newcastledisease (ND )isaseriousaviandiseasewithworldwidedistributionthatcancausesevereeconomicloss esinthepoultryindustry .Thecausativeagentofthedisease ,newcastlediseasevirus(NDV)alsoknownasavianParamyxovirustype 1,isamemberoftheParamyxoviridaeandcontainsasin gle strandednegativesenseRNAgenomeencompassing 15 186nucleotides[1 3] .Theviralgenomecontainssixgenes ,whichen codetheviralnucleoprotein(NP) ,phosphoprotein(P) ,matrixprotein(M ) ,fusionprotein (F) ,hemagglutinin neuraminidase(HN…     

组织变革的方向--建立学习型组织

组织变革是组织生存与发展的永恒主题.建立学习型组织是复杂环境下组织变革的重要趋势.文章讨论了学习型组织产生的背景、组织的知识、组织学习的主要障碍和组织学习的机制,指出促进组织学习的管理规则以及学习型组织的主要特征.     

人转铁蛋白基因的克隆及序列分析

目的:克隆人转铁蛋白基因并对其编码序列进行分析.方法:以人胎肝cDNA为模板,利用PCR方法克隆人转铁蛋白基因;通过与基因组序列对比分析基因组结构;通过TargetP 1.1和SignalP 3.0预测信号肽;通过Clustal X(1.81)进行蛋白序列联配.结果:PCR扩增了一个长2 160 bp的基因片断,序列分析表明其覆盖了完整编码框,编码由698个氨基酸组成的人转铁蛋白.进一步分析发现人转铁蛋白基因有19个外显子和18个内含子,编码人转铁蛋白N端具有19个氨基酸组成的信号肽序列.人转铁蛋白与猩猩、猴子、兔子和老鼠的转铁蛋白氨基酸相似率分别为94%、91%、78%、73%.生物信息分析表明,人转铁蛋白含有高度保守的参与蛋白二硫键形成的半胱氨酸以及铁离子结合位点,有两个序列较同源的结构域.结论:成功克隆人转铁蛋白基因,人转铁蛋白与其它物种转铁蛋白同源.     

“遗传印记”现象的研究

“遗传印记”现象是由于子代体内来自父母双方的等位基因一方表达、另一方沉默造成的，对该现象的研究是分子遗传学研究的新兴领域之一。目前，通过一些研究方法，对“遗传印记”的分子机制已有一定的认识，随着对“遗传印记”研究的逐渐深入，必将深化人们对遗传和生命本质的认识。     

啤酒花潜隐病毒新疆分离物的全基因组序列分析

对新疆啤酒花上获得的HpLV分离物HpLV-XJ进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:HpLV-XJ的全基因组序列为8612个核苷酸(nt)(不包括poly A),含有6个开放阅读框(ORF),分别编码224 kDa(ORF1)、25kDa(ORF2)、11 kDa(ORF3)、7 kDa(ORF4)、34 kDa(ORF5)、和12 kDa(ORF6)蛋白。序列相似性分析结果表明,HpLV-XJ与HpLV(GenBank:AB032469)序列相似性达98.5%,6个开放阅读框的核苷酸序列相似性分别为98.3%、99.0%、97.6%、96.7%、99.5%和98.4%;由此推导的氨基酸序列相似性分别为98.6%、98.7%、97.2%、95.0%、99.4%和98.1%,各个基因的核苷酸序列和蛋白的氨基酸之间存在着一定的差异。     

昆虫全基因组DNA的保存及提取

以蚂蚁、天牛、蝗虫等昆虫为实验材料,建立了75%酒精常温浸泡密封保存和福尔马林常温浸泡密封保存昆虫样品2~4周后进行全基因组DNA提取的方法。基因组DNA经紫外分光光度法(260 nm、280 nm)、琼脂糖凝胶电泳、PCR检测,结果表明:从两种方法保存的样品中均能提取到纯净完整的基因组DNA,适用于分子生物学实验。     

犯罪组织结构的社会网络分析

为弥补由于实际数据缺乏而导致的犯罪组织研究所具有的局限性,采用网络建模的方法研究了不同类型犯罪组织的结构特性。基于复杂网络建模的方法建立了具有无标度特征、小世界特征和层次特征的犯罪组织网络,采用社会网络分析中的中心度方法识别组织中的关键成员,并利用网络成员间的连接性和移除一定数量成员后的网络密度变化值分别考察了不同犯罪组织结构的运行效率和安全性。结果表明:在无标度网络和层次结构网络的犯罪组织中,核心成员均可以在较短的时间内将信息传遍至整个组织,因此这2种组织结构相对于小世界网络具有较高的运行效率。在安全性方面,由于小世界网络的犯罪组织中的内部成员间具有较大的平均距离,因而成员间不易被孤立,组织的安全性较高,而无标度网络和层次结构网络的组织安全性则较差。因此,在打击犯罪组织的活动中应针对不同类型的犯罪组织结构制定合理的策略方能取得较好的效果。     

建筑结构用钢2Cr13和1Cr18Ni9焊接接头的组织与力学性能分析

分析对比了建筑用钢2Cr13马氏体钢和1Cr18Ni9奥氏体钢在不同焊接方法下的焊接接头组织,得到了不同焊接接头显微硬度的拉伸强度。比较结果表明异体钢焊接接头的组织和力学性能比同种材料有所降低,采用适当的焊接方法可以提高焊接接头的组织和力学性能,这一研究有助于实际生产中选择适当的焊接材料和焊接方法。     

事件根本原因分析过程的组织管理探讨

随着建筑行业的飞速发展,工程建设阶段由于过程管理环节执行偏差而造成不同等级的安全质量事件,对于有效组织事件的根本原因分析并制定纠正预防措施越来越迫在眉睫,能否准确定性事件的根本原因直接影响后续措施的针对性和有效性,根本原因的调查分析除需一定的专业技能之外,还需要强有力的组织管理,该文通过作者以往根本原因分析组织管理经验,阐述事件调查分析过程中组织管理方面的关注点,有助于调查分析工作快速准确定位并高效完成.     

适于RAPD分析的三种基因组DNA提取方法比较

通过对 3种基因组DNA提取方法的实验比较 ,找到了一种既能够满足RAPD实验要求 ,又简便快捷、经济的基因组DNA提取方法 ,经RAPD试验检测与电泳结果分析表明 :DNA扩增效果良好     

艾美耳属球虫卵囊基因组DNA不同提取方法的比较

为了获得高质量的艾美耳属（Eimeria）球虫卵囊基因组DNA,采用了4种不同方法提取3种艾美耳属球虫卵囊的基因组DNA．对比结果表明,采用机械法破裂球虫卵囊壁,用裂解液裂解孢子囊和子孢子,释放出DNA,在保持碱性的环境下（pH=8．0）,以苯酚-氯仿异戊醇抽提,乙醇沉淀,可获得高质量的DNA分子,经PCR检验为艾美耳属球虫卵囊基因组DNA．     

利用改良CTAB法提取雪莲果基因组DNA

阐述了利用改良CTAB法提取雪莲果（Smallanthus sonchifolius）基因组DNA的的过程,对提取的DNA经0.8%琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测,表明此法提取的DNA的一级结构完整,浓度较高,其DNA可进一步用于其他分子生物学试验。     

组织社会学视野下贵港农民合作组织之发展

农民专业合作组织的发展适应了农村改革与发展的要求,正成为新农村建设中最具活力的组织形式。本文以广西贵港市农民专业合作组织的实践为例,对农民专业合作组织的组建冲动、发展的有利及阻碍因素进行分析,认为农民专业合作组织的专业化、规范化程度将逐步提高,并将向综合服务性组织和经济实体型组织发展。