核酸序列的非均匀性分析

核酸序列的非均匀性分析李炜疆（内蒙古大学物理学系，０１００２１，呼和浩特）关键词非均匀性，核酸序列，编码区，非编码区中图资料分类号Ｑ７１ＯＺ１３．９ＨｅｔｅｒｏｇｅｎｅｉｔｙＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＮｕｃｌｅｏｔｉｄｅＳｅｑｕｅｎｃｅｓ￥ＬｉＷｅｉｊｉａ...     

连续小波变换法分析核酸序列的长程相关性

提出了基于连续小波变换的检测核酸序列长程相关性的新方法。利用小波变换来观察序列，再用分数布朗运动建立数学模型，计算Hurst指数，并以此来衡量序列的长程相关性。最后发现在同一个基因内，外显子序列的Hurst指数明显小于内含子序列，此特征是这两种序列的显区别。     

事件空间中ЧaΠЛЫГИН非完整力学系统的约化

讨论事件空间中ЧａΠЛЫИН非完整力学系统的约化问题，证明了位形空间中的广义Ｗｈｉｔｔａｋｅｒ约化方法归于事件空间中的广义Ｒｏｕｔｈ方法。     

事件空间中Чаплыгин非完整力学系统的约化

讨论事件空间中非完整力学系统的约化问题，证明了位形空间中的广义Ｗｈｉｔｔａｋｅｒ约化方法归于事件空间中的广义Ｒｏｕｔｈ方法．     

SO(N)SO(N-1)约化因子及其Mathematica计算软件

SO(N)群在研究量子多体问题中起着重要的作用。为了构造物理系统的波函数和计算相互作用矩阵元等 ,需要知道 SO(N)的不可约表示和 SO(N) SO(N- 1)约化因子。利用不可约张量基方法 ,得到了正交李代数 SO(N)的不可约表示和 SO(N) SO(N- 1)张量型基础约化因子的解析表达式 ,并在此基础上编制了相应的 Mathematica计算软件。该软件有较好的通用性 ,调用函数有较小的时间复杂度 ,不仅可以进行数值计算 ,而且可以进行符号计算。这些结果对研究原子核、原子分子物理中的代数模型富有意义。     

SO(N)(∩)SO(N-1)约化因子及其Mathematica计算软件

SO(N)群在研究量子多体问题中起着重要的作用.为了构造物理系统的波函数和计算相互作用矩阵元等,需要知道SO(N)的不可约表示和SO(N)(∩)SO(N-1)约化因子.利用不可约张量基方法,得到了正交李代数SO(N)的不可约表示和SO(N)(∩)SO(N-1)张量型基础约化因子的解析表达式,并在此基础上编制了相应的Mathematica计算软件.该软件有较好的通用性,调用函数有较小的时间复杂度,不仅可以进行数值计算,而且可以进行符号计算.这些结果对研究原子核、原子分子物理中的代数模型富有意义.     

线虫基因组外显子与内含子序列特征研究

根据外显子在密码子三个位点上的分布不均匀性 ,引入非均匀指标 H I,来研究线虫基因外显子与内含子的序列特征 .通过推广 H I参数 ,定义干涉指标 R,对外显子和内含子的多个片段的特征进行研究 ,得到了 R值分布以及与外显子和内含子片段的关系 .     

DCF的二进制指数退避算法的非均匀性研究

在对IEEE 802.11 DCF的二进制指数退避算法的非均匀性进行严密分析的基础上,提出了一个详尽的使用马尔可夫链的分析模型来描述由BEBA控制的信道活动.为了降低计算复杂性,对该模型作了进一步的近似处理.模型的分析结果与仿真结果表明该分析模型能在更广泛的系统配置范围内更精确地刻画BEBA的特性.     

有限图的约化及其连通性

通过复杂图的邻接矩阵的变换,给出了有限图的约化图的邻接矩阵的概念,并在此基础上证明了有限图与其约化图的连通性是一致的,同时给出了任意有限图连通性判定的约化算法。      

B(m,n)方程的对称性约化

利用对称性约化的直接法，给出了Ｂ（ｍ，ｎ）模型ｕ１＋（ｕ＾ｍ）ｘ＋（ｕ＾ｎ）ｘｘ＝０的所有对称性约化，第一种是非行波约化，第二种行波约化的一般解可用积分表达式表示，第三种约化在特殊条件下可表示为有理函数解。     

基于隐马尔可夫模型的DNA序列识别

利用隐马尔可夫模型训练中不同结构的DNA序列的L值分布范围不同的特点,对传统多类投票模型进行改进,提出一种优于传统算法的快速训练算法,该算法只需训练出一类隐马尔可夫模型参数.对DNA内含子和外显子序列进行识别,平均识别率达到了90.8%.与支持向量机相比,隐马尔可夫模型在解决多分类问题方面具有优势,不但计算时间少,而且识别率高.     

内含子序列“三碱基组”的信息分析

在对编码序列的碱基分布作大量统计分析的基础上，对内含子序列中Ｇ、Ｃ的分布作了统计分析．发现内含子在“三碱基组”的意义下，第一位上（Ｇ＋Ｃ）含量占优势．如果将同一基因的外显子三联密码和内含子“三碱基组”做比较，发现在内含子中出现而外显子中没有的那些三碱基组，它们大多属于Ｌｉó所列出的“非偏爱”密码     

核酸序列的矩阵表示

提出了用矩阵形式一对一地表示核酸序列的方法．发现通过矩阵运算很容易得到描述核酸序列中单碱基出现概率和碱基相关出现概率的矩阵和值,并且很易推广到多个碱基关联的情况．对于核酸序列的编码区,用这种矩阵方法计算出密码子的使用频率．而且发现用矩阵方法比较核酸序列的同源性非常直观．     

核酸序列进化的早期突涨模型

总结了序列编码区的统计特征。1.信息参致(?)X对进化的依赖;2.关联长度的分布;3.子序列参数的特异性;4.编码区长度与进化水平无关;5.重复区长度的冻结现象;6.重复片段具有大的D_f和偏置的GC含量。为了解释这些特征,本文提出假设:生命形成伊始,有一个序列长度的突涨阶段一一序列(编码区)在较短的时间内,通过重复,拼接而迅速变长。当序列达到了一定长度以后,才开始以碱基突变和选择为主的阶段,以及真核以后的内含子插入机制阶段。     

核酸重复序列的统计分析

本文研究了252个核酸序列(编码区)的长度大于5的重复片段,发现重复区长度约占序列长的一半,重复片段的出现次数和总长与进化没有相关性,但与信息剩余量 D_1有一定的相关性,并且重复片段的结构(D’1)与序列的进化也有一定的统计相关性.     

核酸序列碱基关联的进一步研究

本文对核酸序列中碱基关联性质作了进一步研究,对2341个编码区进行分析的结果表明,2/3以上的序列关联长度≤2,(其中6.7％关联长度为0),10％的序列具有3倍周期的关联(其中包括少量9倍周期),其余具有长程的非周期关联。     

德化县景观格局及空间差异性分析

景观格局是景观生态学的基本研究内容,数量化分析景观组分的空间分布特征,是进一步研究景观功能和动态的基础,它可为景观的合理管理提供有价值的资料.本课题以福建省德化县作为研究区域,使用G1S技术和景观格局分析软件FRAGSTATS,分析了德化地区的景观格局和空间差异性,并从物种多样性保护角度出发,对当前地类分布的优势和不足进行了分析,并提出了改进措施.     

核酸分子杂交检测黄瓜花叶病毒

为检测黄瓜花叶病毒的存在,应用Northernblot,将提取的黄瓜花叶病毒RNA样品,经甲醛变性凝胶电泳分离,使RNA解离成单链,然后用上行毛细管转移法,将凝胶上的单链RNA片段转移到尼龙膜上.经适当洗涤、干燥后,在烤箱中80℃保温2h,用于杂交.以带有黄瓜花叶病毒目的片段的细菌质粒制备DNA探针,用放射性同位素32P标记探针DNA,100℃变性处理用于杂交的探针,然后进行杂交.结果表明,在杂交膜上显示与特异性探针结合的阳性RNA条带,检测到了黄瓜花叶病毒的存在.