不同养殖环境下罗非鱼肠道微生物的比较分析

为了比较不同养殖环境下罗非鱼肠道菌群结构和相对丰度变化规律,选取稻田和池塘两种养殖环境下的罗非鱼为研究对象,定期测定实验期间的水质指标(溶氧、水温、pH值和氨氮),取养殖202d的罗非鱼,通过16SrRNA高通量测序检测其肠道微生物,并分析不同养殖环境下罗非鱼肠道菌群的变化规律。实验结果表明,养殖水质参数均在正常范围内,但不同养殖环境的水质参数存在差异,可能会导致罗非鱼肠道微生物的结构组成和多样性发生变化。在两种不同养殖环境下,梭杆菌门(Fusobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)3个菌群相对丰度均较高。蓝菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)物种丰富度存在显著性差异,其中蓝菌门在稻田组的罗非鱼肠道菌群中所占比例高于池塘组,而拟杆菌门和放线菌门在池塘组的罗非鱼肠道菌群中所占比例高于稻田组;在属水平下,Cetobacterium,Paeniclostrdium和Romboutsia等菌属在稻田组罗非鱼肠道菌群相对丰度较高,池塘组罗非鱼肠道菌群相对丰度较高的菌属为Cetobacterium,Enterovibrio和Plesiomonas等。不同养殖环境下,罗非鱼肠道微生物菌群分布及丰度有显著差异,该变化可为罗非鱼肠道微生物的研究提供基础数据。     

基于高通量测序的不同养殖系统下凡纳滨对虾肠道和水体中微生物的多样性

【目的】研究不同养殖系统对凡纳滨对虾肠道及水体微生物多样性的影响。【方法】以循环养殖系统和非养殖系统下凡纳滨对虾养殖水体及其肠道为研究对象,在养殖30d后采集样品,采用Illumina MiSeq高通量测序样品细菌16SrRNA基因V3+V4区,通过RDP11.3、Greengenes13.8、NCBI 16S Microbial和Customized batabase等数据库进行分析,阐述循环养殖系统的意义和微生物在其中的作用。【结果】养殖期间,不同养殖系统凡纳滨对虾均正常存活。将原始序列优化后对Clean序列进行分析,非循环系统下水体优质序列百分比约81%,肠道中约89%;循环系统下水体优质序列百分比为92%,肠道中为94%。两种养殖系统下水体和肠道细菌在纲水平占绝对优势的是变形菌纲,但各菌群丰度不同;不同的Alpha指数显示出物种间的差异性;通过系统发育树可以看出,不同养殖系统改变了凡纳滨对虾生境中的物种及发育关系,间接阐述微生物在养殖生境中的作用和意义。【结论】通过高通量测序揭示不同养殖系统中微生物菌群的差异以及多样性,对于凡纳滨对虾实际养殖具有指导作用,对阐述养殖过程中微生物和相关疾病的关系具有重要意义。     

养殖黄鳍东方鲀肠道菌群初步分析

本文以养殖黄鳍东方鲀的肠道内容物为检样,以3%NaCl营养琼脂等培养基作分离培养和计数,对典型菌株作系统生化鉴定,据此分析其微生物菌群的构成。结果表明,优势菌为溶藻弧菌、蜂房哈弗尼菌,嗜水气单孢菌也占一定比例,此外还有枯草芽孢杆菌和费氏柠檬酸菌。养殖河鲀的菌群分布特点为评价其与毒性的相关性提供了可能依据。     

养殖黄鳍东方鲍肠道菌群初步分析

本文以养殖黄鳍东方纯的肠道内容物为检样,以3％NaCl营养琼脂等培养基作分离培养和计数,对典型菌株作系统生化鉴定,据此分析其微生物菌群的构成。结果表明,优势菌为溶藻弧菌、蜂房哈弗尼菌,嗜水气单孢菌也占一定比例,此外还有枯草芽孢杆菌和费氏柠檬酸菌。养殖河纯的菌群分布特点为评价其与毒性的相关性提供了可能依据。     

新型复合功能菌群的构建及其在近海养殖水体BOD微生物传感器中的应用

从养殖水体污染严重的三亚海宝近海养殖专业合作社的养殖场水体中,分离得到3株能高效降解蛋白质、淀粉和油脂的菌株:Bacillus HXY-10,Aspergillus sp.HXY-3和Methylobacterium sp.HXY-7,通过共培养构建了能高效去除养殖水体中氨氮和亚硝酸盐氮的固定化复合功能菌群;同时采用夹膜法制作了BOD(生物需氮量)生物传感器微生物膜,传感器响应电流与水体中的BOD质量浓度2~60 mg·L-1呈线性关系,相关系数为0.992 3.对含有已知BOD含量的水样进行8次测量,RSD为3.34%,表明BOD传感器检测体系的重现性良好,这为进一步研究近海养殖水体BOD传感器奠定了基础.     

益生素对银香雏鸡生长性能及肠道微生物菌群的影响

选用1日龄银香肉仔鸡1000只,随机分成2组,每组500只,设2个重复,分别在基础日粮中添加0和0.1％的益生素,研究益生素对0～7周龄银香雏鸡生产性能和健康状况的影响.共饲养7周,每周统计耗料量、腹泻率、抽样测体重,并对49日龄雏鸡取样测定肠道微生物浓度.结果表明,试验组各周平均体重分别比对照组增加3.40％00,3...     

支气管哮喘患者肠道菌群多样性变化

 为了阐释支气管哮喘患者肠道菌群多样性及结构组成特征,探究肠道菌群与哮喘病的相互关系,以52例哮喘急性发作期患者及25例对照开展病例-对照研究.采集粪便样品,运用PCR-DGGE指纹图谱技术分析粪便菌总DNA,得到反映肠道微生物菌群结构特征的DNA指纹图谱.结果表明,哮喘个体样本的肠道菌DNA条带数量7—31条不等,平均只有17条;对照组样本个体的DNA条带数量14—36条不等,平均24条.哮喘患者肠道菌群的Shannon-Wiener多样性指数显著低于对照组(P＜0.0001).多变量统计分析表明,哮喘组肠道菌群结构组成显著区别于对照组,两组样本分类明显.两组内不同民族、性别间的差异无统计学意义.研究表明,哮喘患者的肠道菌群在分子水平上发生明显改变,多样性显著降低,肠道菌群结构改变与哮喘病有关;PCR-DGGE技术结合PCA、PLS-DA多变量统计分析手段具有预测性、先行性的优势,适用于菌群结构未知样品的研究.     

固定化微生物技术对养殖水体脱氮的研究

以聚乙烯醇（PVA）为载体,人工沸石为吸附剂,采用包埋法固定硝化细菌,通过实验发现制备固定化小球最优组合为：质量浓度海藻酸钠1.5%,硼酸溶液4%,PVA 6%,人工沸石2%,此时小球成球效果较好,有合适的机械强度及传质性能.用此工艺制备的固定化小球,在水力停留时间15h,初始pH 8.0,溶解氧浓度5.0 mg/L的...     

三疣梭子蟹养殖池塘水体中异养细菌菌群特征的研究

对三疣梭子蟹养殖池塘水体异养细菌的数量和菌群组成进行了调查分析.分离得到240株细菌,根据其菌落和菌体形态特征,分为15个类群和31个亚群.结果表明:自然水体进入养殖池塘后,其优势菌菌群和亚群都发生了显著改变,这些改变可能与池塘高有机质的分解和蟹病的发生有密切关系.     

斑节对虾虾苗活力的研究

报道鉴别斑节对虾虾的活力枯健康的虾苗有较强的趋光性和集生，用显微镜观察可了健康虾苗体表清洁，肌肉透亮，肠胃有食物，附肢弹跳有力，用毛巾包埋１５ｍｉｎ后健康虾苗仍活动正常，反应灵敏，放养在瓶子内，不投饵，不换水，健康虾苗也能存活７天。     

斑节对虾白斑综合症的防治

报道海南省临高县文科虾场、广西北海横路山虾场、北海市海水养殖综合实验场斑节对虾白斑综合症的防治实验。认为放苗前用二氧化氯消灭病毒,用漂白粉消灭病毒和细菌,用孔雀石绿杀死真菌和原生动物,用石灰中和酸性,用尿素和过磷酸钙培养浮游植物。养殖期用光合细菌净化水质,用水质稳定剂净化底质,合理投饵,科学管理,保持养殖水体生态平衡,恶化病原体繁衍条件,优化斑节对虾生存环境,可以成功地预防斑节对虾白斑综合症,对早期轻病者有一定的治疗作用。     

酸性环境对斑节对虾的危害及酸化控制

报道演海虾场和文科虾场池水返酸过程，池养斑节对虾对酸性环境反应，池水慢性返酸使斑节对虾发生软壳，维生素Ｃ缺乏症，蜕壳不完全等症状，急性返酸到ｐＨ值６．１１以下时引起对虾突然蜕壳而大量死亡通过对比实验，认为施用石灰提高ｐＨ值，施肥繁殖浮游藻类，利用藻类光合作用消耗二氧化碳，降低酸性，大潮时加大换水量，小潮时抽水提高水位，能有效地防止池水返酸，控制斑节对虾酸性环境综合症。     

红树蚬与歪红树蚬形态差异分析

【目的】从形态上区分红树蚬(Polymesoda erosa)和歪红树蚬(Polymesoda expansa)。【方法】运用多变量形态度量学分析方法,采用14项生物学形态性状指标比较广西廉州湾草头村红树林的红树蚬与歪红树蚬的差异。【结果】方差分析结果显示,1个比例性状达到差异显著水平(P0.05),12个比例性状达到差异极显著水平(P0.01)。主成分分析构建了4个主成分,第1主成分贡献率为30.70%,第2主成分贡献率为17.76%,第3主成分贡献率为10.11%,第4主成分贡献率为7.80%,累计贡献率为66.37%。逐步判别分析建立判别函数,其判别准确率p1为81.7%~89.0%,p2为81.7%~87.5%,综合判别率为86.0%。【结论】壳高、壳宽、韧带长、韧带宽等性状决定红树蚬和歪红树蚬两个种间的形态差异,判别方程可以有效将上述种群区分开来。     

不同菌肥对华重楼根际土壤微生物多样性及理化性质的影响

为更好地筛选适合华重楼(Paris polyphylla var.chinensis)人工栽培的微生物菌肥种类,为华重楼的产业化生产提供理论参考,本研究以华重楼为材料,采用高通量测序技术分析不同菌肥处理对华重楼根际土壤微生物多样性的影响.结果表明:经不同施肥处理的华重楼根际土壤中共检测出细菌类群23门57纲125目18...     

不同栽培基质对两种石斛生长及生理的影响

以金钗石斛和蜂腰石斛为试验材料,采用菌渣、松树皮、草炭、木屑、椰糠和水苔为栽培基质,研究不同配比的栽培基质对两种石斛生长和生理的影响.筛选出更适宜两种石斛幼苗生长的最佳基质配方,为两种石斛的规模化生产奠定基础.结果表明:添加有菌渣、水苔、草炭和椰糠等材料的基质都较常规栽培基质(松树皮+水苔)能不同程度地增加两种石斛的成活率,有效提高生物量,促进植株生长.通过隶属函数综合评价可知,m(菌渣)∶m(松树皮)∶m(水苔)=1∶2∶1的基质配方最有利于金钗石斛幼苗的生长,而m(草炭)∶m(松树皮)∶m(椰糠)=1∶2∶1的基质最有利于蜂腰石斛幼苗的生长.且这两种混合栽培基质能有效增加金钗石斛和蜂腰石斛幼苗的叶绿素、可溶性糖和可溶性蛋白含量;增强POD和SOD活性,提高植株抗逆性.     

不同规格魁蚶在不同温度下潜沙率差异分析

【目的】通过对不同规格的魁蚶在不同温度下潜沙率差异的分析,探究魁蚶的潜沙行为与温度的关系,为魁蚶的底播增殖提供数据支撑。【方法】实验设置12℃、15℃、18℃和21℃4个不同的温度梯度,水温变化均控制在±0.2℃以内。在水箱中铺沙进行观察实验,记录不同规格魁蚶在各温度组的下潜情况,计算各潜沙率。【结果】水温在12℃和15℃时,不同规格魁蚶的初潜率均低于18℃和21℃的初潜率。水温在18℃和21℃时,不同规格魁蚶的初潜率及最终潜沙率均在90%以上,并且小规格魁蚶组的潜沙率略高于大规格魁蚶组。魁蚶规格为1.5cm和2cm组在不同温度下的初潜率高于1cm组和2.5cm组。1.5cm组在12℃的潜沙率略高于2cm组,在15℃、18℃和21℃时较为接近,均在93%以上。【结论】应选取潜沙速度快、适应能力强的规格作为埋栖型贝类的底播规格,建议选择2cm作为魁蚶底播规格;底播温度根据实验结果建议选择(20±2)℃。     

横断山区鞍型藻属硅藻植物中国新记录

报道了采自横断山区双壳缝目舟形藻科鞍型藻属硅藻12个中国新记录种,分别为奥德雷基鞍型藻（Sellaphora auldreekie Mann & McDonald）、椭圆披针鞍型藻（Sellaphora ellipticolanceolata Metzeltin, Lange-Bertalot & Nergui）、冥河鞍型藻（Sellaphora styxii Novis, Braidwood & Kilroy）、日本鞍型藻（Sellaphora japonica （Kobayasi） Kobayasi）、辐节型鞍型藻（Sellaphora stauroneioides （Lange-Bertalot） Vesela & Johansen）、古言鞍型藻（Sellaphora guyanensis Metzeltin & Lange-Bertalot）、十字形鞍型藻（Sellaphora crassulexigua （Reichardt） Wetzel & Ector）、娜娜鞍型藻（Sellaphora nana （Hustedt） Lange-Bertalot）、分离鞍型藻（Sellaphora disjuncta （Hustedt） Mann）、类瞳孔鞍型藻（Sellaphora paenepupula Metzeltin & Lange-Bertalot）、凸腹鞍型藻（Sellaphora ventraloides （Hustedt） Falasco & Ector）和黑色鞍型藻（Sellaphora nigri （Notaris） Wetzel & Ector）. 对新记录种的形态特征进行详细描述,给出每个种的地理分布、生境信息和理化指标,并对新记录种及其相似种的形态差异进行讨论.     

具有反秀丽隐杆线虫捕食能力的根际细菌的筛选及其反捕食机理的研究

虽然生物菌肥具有多效、环保、可持续等多种优点,但经常被生活在土壤中的其他生物捕食而减少其实际应用效果.细菌为应对捕食演化出多种机制,排斥或杀死线虫.对具有反捕食能力的菌株进行筛选,能够得到具有高竞争力的菌株.以秀丽线虫为样本,对细菌进行对峙试验,得到两株具有较高反捕食能力的植物促生细菌:橘黄假单胞菌(Pseudomonas aurantiaca)JD37、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)P13.以大肠杆菌(Escherichia coli)OP50为对照,线虫对3株细菌的偏好性由强至弱依次为P13、OP50、JD37.缓慢杀线试验中,JD37、P13对秀丽线虫的致死率分别达26.12%和18.66%.在单培养下,JD37能使线虫活力下降,产卵数量减少.化学和分子生物学研究显示:JD37不能产生任何已知的杀线次级代谢产物,而P13能够产生氰化氢(HCN).以上结果表明JD37能够抵御秀丽线虫捕食,在捕食压力下有较强竞争力,作为生物菌肥具有广泛的应用前景.     

苦荞CCT基因家族生物信息学及表达分析

CCT转录因子在调控植物花期、生长发育及抗非生物胁迫等方面发挥着重要的功能。本研究以拟南芥AtCCT基因家族为参考序列,利用本地BLAST并结合保守结构域等生物信息学工具,筛选出苦荞FtCCT基因家族成员,并对其理化性质、染色体分布、基因结构、系统进化及表达水平进行分析。结果显示:从苦荞中共鉴定出35个FtCCT基因,含1-8个内含子;编码蛋白有117-753个氨基酸残基,等电点为4.96-9.51,均为亲水性蛋白。染色体定位分析表明,这些基因在8条染色体上均有分布。苦荞FtCCT基因家族含有10个保守基序和5个保守结构域,且都含有CCT保守结构域。系统进化分析表明,苦荞的FtCCT基因家族与拟南芥一样可分为3个亚家族,其中CMF亚家族的成员最多。35个FtCCT基因在苦荞根、茎、叶和花中的表达水平具有差异性,在叶和花中具有高表达量的成员较多,只有少数的成员在根和茎中高表达。本研究为进一步解析CCT基因调控苦荞花期及生长发育奠定基础。