蛋白质芯片技术的新进展

基于微阵列技术基础上的蛋白质芯片技术能够在体外直接研究蛋白质的性质和作用,已经被广泛地应用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-核酸、蛋白质-小分子药物等方面的研究,并表现出了良好的前景。对蛋白质芯片技术的研究进展和未来前景展望进行了综述。     

蛋白质三维空间统一坐标系的建立

目的构建蛋白质三维结构的统一坐标系。方法利用蛋白质原子的质量作为权重,根据每个原子的位置信息求出蛋白质的质心,以此作为统一坐标系的坐标原点;再利用蛋白质位置坐标的二阶矩构造的矩阵求出蛋白质主成分的坐标向量,作为蛋白质三维坐标的基轴。结果编程实现了蛋白质统一坐标系的建立。结论该方法有效可行,为后续的蛋白质结构研究奠定基础。     

蛋白质芯片——蛋白质高表达及固定技术研究进展

就近年来国际上蛋白质芯片的高通量蛋白质生产及固定技术的研究进展进行了系统的总结和分析。蛋白质芯片是一种大规模、高通量的蛋白质组学研究技术,目前己广泛运用于基础研究(如蛋白质/蛋白质相互作用)和应用研究(如病理诊断,药物开发),而该技术的关键步骤是实现蛋白质高表达及固定。及时把握蛋白质高表达及固定技术的研究动向是开展蛋白质芯片研究的基础。     

面向同源蛋白质探测的一种新型混合深度学习模型

根据蛋白质氨基酸链探测其同源蛋白质,进而预测蛋白质的功能,是生物信息学研究领域的一个重要挑战,也是众多生物医学研究领域的基础研究内容,有着重要的科研价值和广泛的应用需求。其研究难点在于:(1)如何学习对同源蛋白质预测有效、有用的蛋白质特征信息;(2)如何更好地运用蛋白质特征信息,实现同源蛋白质的探测与识别。为了解决同源蛋白质探测与识别研究中的关键难点,本文提出一种基于混合深度学习架构的同源蛋白质探测与识别模型(HDLM-PHP)。通过采用统一的"管道式"深度学习架构,将蛋白质特征学习和探测识别统一为一个整体,提高同源蛋白质探测与识别的效能。采用多组并行的深度卷积神经网络,学习蛋白质的各种属性信息,以期获得丰富的待检测蛋白质和靶蛋白质的高级相关性特征,并通过全连接方式使用多层RBM结构融合和精炼这些相关性特征为全局相关性特征。通过统一的深度网络连接方式,以探测和识别任务为导向,学习到对于同源蛋白质预测最有效、最全面的蛋白质特征信息。在标准数据集SCOPe上,对所提模型进行性能与效率评测,结果表明:本文提出的模型能有效地学习到符合任务导向的蛋白质特征数据,提升同源蛋白质探测与识别的准确度和召回率,优于现有的模型和算法。     

热点排行(2014-06-11至2014-06-20)

正1中国全面启动人类蛋白质组计划[核心媒体报道频次:21/30]11日消息,中国人类蛋白质组计划在军事医学科学院召开第1次工作部署会,这标志着该计划全面启动实施。40多个科研单位的70余名院士、专家出席会议。中国人类蛋白质组计划由中国人类蛋白质草图项目、人类蛋白质组大数据库和知识挖掘项目、蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化项目3部分组成,主要目标是发展蛋白质组研究相关设备及关键技术,绘制人类蛋白质组生理和病理精细图谱、构建人类蛋白质组"百科全书"。     

蛋白粉与人

蛋白质的来源食物中以豆类、花生、肉类、乳类、蛋类、鱼虾类含蛋白质较高,而谷类含量较少,蔬菜水果中更少。人体对蛋白质的需要不仅取决于蛋白质的含量,而且还取决于蛋白质中所含必需氨基酸的种类及比例。由于动物蛋白质所含氨基酸的种类和比例较符合人体需要,所以动物性蛋白质比植物性蛋白质营养     

蛋白质构象与折叠行为的研究

蛋白质结构预测与蛋白质折叠是生命科学研究的核心问题之一,也是后基因时代推动生物学朝着定量化发展的重要方向之一,它是分子生物学中心法则还没有解决的一个重大生物学问题.简单介绍了蛋白质分子的结构特点,讨论了蛋白质分子构象研究的重点,即蛋白质结构预测与蛋白质折叠.重点介绍了拥挤环境对蛋白质构象的影响和蛋白质分子的力学性质,这是蛋白质分子构象研究的深入.这些介绍可以帮助我们更清楚地认识蛋白质分子.     

说说蛋白质

乔乔,多吃点鱼肉,它含有丰富的蛋白质。我不爱吃鱼肉!我也不需要蛋白质!宝贝,人体需要蛋白质,你该知道蛋白质对于我们而言是多么重要。     

癌症相关促凋亡蛋白Par-4的信号转导途径预测研究

利用支持向量机(SVM)技术构建Par-4关联的蛋白质相互作用网络,预测出与Par-4有相互作用的蛋白质82个;这些蛋白质按照功能划分为8大类,主要包括:蛋白激酶、泛素化蛋白酶、死亡受体相关因子、与细胞周期或DNA复制相关蛋白质、调节蛋白质、与疾病相关蛋白质、具有特定结构域结合蛋白质和其他蛋白质等。结合文献挖掘和数据库检索信息,推断出了Par-4的2条可能新的信号转导途径。首次预测到Par-4与一大类泛素化蛋白有密切的关系。研究发现,Par-4与多种蛋白质具有复杂的相互作用,并且,在多个细胞凋亡途径中扮演了重要角色。     

一种基于最优局部信息融合的蛋白质-亚细胞定位预测方法

 基于蛋白质的合成及分选机制,提出了一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法。先采用遍历搜索技术,找出各种亚细胞蛋白质序列分选信号和成熟蛋白质之间的最佳分割位点,把蛋白质序列分为两条子序列,计算这两条子序列中的氨基酸组份并将它们融合起来作为整条蛋白质序列的特征,然后构造用于识别每类蛋白质的最佳子分类器,再根据最大化原则组建集成分类器。在NNPSL数据集上,采用5重交叉验证方法对本文方法进行测试,原核和真核两个蛋白质序列子集分别取得94.1%和87.5%的总体预测精度。同时,此方法在一些蛋白质序列中找到的分割位点与真实生物现象相吻合,能为预测蛋白质序列的剪切位点提供参考信息。     

Humanized antibodies for therapy

Protein engineering has made it possible to combine the binding sites of murine antibodies with human antibody regions. Antibodies constructed in this way have important advantages for therapy.     

植物线粒体巯基亚硝基化修饰蛋白质组学研究进展

蛋白质S-亚硝基化是一氧化氮(NO)与蛋白质半胱氨酸残基(Cys)共价连接形成S-亚硝基硫醇(-SNO)的过程,被认为是植物中体现NO生物活性的最重要途径.线粒体在依赖S-亚硝基化的NO信号转导中起关键作用.综述了应用蛋白质组学技术鉴定的植物线粒体S-亚硝基化蛋白质的特征,为认识线粒体NO调控网络体系中重要的信号与代谢通路(如光呼吸、三羧酸循环、氧化磷酸化、活性氧分子(ROS)稳态,以及蛋白质加工与周转)提供了线索.     

金标银染技术在表达文库筛选中的应用

以胶体多标记钙调素作为探针再辅以银染法（金标银染技术）,自玉米ｃＣＮＡ表达文库中筛迁钙调素结合蛋白。该探针保持钙调素的活性,特异性地与钙调素结合蛋白相结合,在胶体金标记的基础上进行银染,灵敏度获得显著提高（达ｎｇ级）。应用这一方法对玉米ＣＮＤＡ表达文库进行筛选获得了一个与探针特异结合的阳性克隆。以生物素标记的钙调素对该克隆表达的融合蛋白进行结合实验,结果表明该克隆编码的蛋白为一个钙调素结合蛋白。本     

考马斯亮兰法测定西宁市售主要四种袋装牛奶的蛋白质含量

采用考马斯亮兰法测定了西宁市售主要四种袋装牛奶中的蛋白质含量．四种样品的蛋白质含量分别为;2．2g／100mL、2．2g／100mL、2．Og／100mL和1．9g／100mL．本地牛奶的蛋白质含量明显高于其他省份的牛奶．利用考马斯亮兰法测出牛奶中蛋白质的含量明显低于商标中2．9g／100mL的标示值．     

新型Protein A免疫吸附膜材料制备及其特性

以纤维素复合膜为基质合成了Protein A免疫吸附材料，研究了微环境对固定化的Protein A吸附性能的影响，优化了合成方法并对Protein A免疫吸附膜材料的性能进行了评价。实验表明，当每g复合膜上的环氧基团为0．74mmol，间隔臂长度为18个原子，溶液pH为7－8时，Protein A免疫吸附膜能够达到良好的吸附性能和再生性能，每g膜对IgG的最大吸附能力为12．84mg，在连续使用100次时，仍能达到10．08mg。制备的Protein A免疫吸附膜柱具备良好的流动特性和抗压能力，同时非特异吸附小，能够满足免疫吸附治疗的要求。     

玉米杂交后胚胎中蛋白质和细胞分裂素类物质变化的研究

玉米七个杂交组合及与其亲本自交授粉后1d,3d,7d、10d四个时期胚胎中蛋白质含量增长速度不同。授粉后1d胚胎中蛋白质电泳谱带分离清楚,分子量为94,000～67,000的蛋白带较少,而在67,000～43,000和40,000～20,000范围内的蛋白带分布集中。在分子量大于43,000的蛋白带中,杂交胚的某些蛋白分子量大于或介于自交亲本,在43,000以下的,杂交胚中某些蛋白分子量介于或小于自交亲本。授粉后10d大分子蛋白带有所增加,杂交胚胎中总的细胞分裂素类物质和玉米素含量均显著高于自交双亲。     

蛋白质光谱探针研究进展

蛋白质分析是生命科学研究中的重要课题。蛋白质内源紫外吸收光谱和荧光光谱可以用于蛋白质分析，但其灵敏度不能满足微量分析的要求。蛋白质光谱探针（包括金属离子、有机试剂和金属络合物）能够与蛋白质相互作用生成超分子复合物并引起体系光谱信号的变化，由此可以提供蛋白质含量或结构方面的信息。根据光分析方法的不同，蛋白质光谱探针可以分为吸光探针、荧光探针和光散射探针3类。本文中，笔者综述了蛋白质光谱探针的研究进展，讨论了发展趋势。     

再生丝素蛋白-壳聚糖包药微囊的质量研究

以模型药物消炎痛(吲哚美辛)作为芯料，在W／O型乳化体系中分别以复凝聚法制备再生丝素蛋白-壳聚糖包药微囊和以单凝聚法制备壳聚糖包药微囊，测试并分析了两种微囊的形貌、粒径、成囊率、包囊率和释药率等质量指标。结果表明，丝素-壳聚糖包药微囊的成囊率、包囊率比壳聚糖包药微囊高，药物缓释效果更好。     

家蚕卵蛋白的 SDS-PAGE 分析(动物科学)

本研究探讨了蛋白质提取方法、十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)条件对家蚕卵蛋白分离效果的影响。分别用裂解液提取法、TCA沉淀法、冷丙酮沉淀法和TCA-丙酮沉淀法制备蛋白质样品,然后进行6%～12%、6%～15%两种梯度胶的SDS-PAGE,获得了不同提取方法和电泳条件下的电泳图谱用以比较家蚕卵蛋白分离效果。结果表明用TCA-丙酮沉淀法除盐,再用含9 mol.L-1尿素、4%CHAPS、1%DTT的裂解液重悬,最适合家蚕卵蛋白提取;6%～12%梯度胶对家蚕卵蛋白的分离较为适宜。利用这一优化方法对家蚕感染微孢子虫的蚕卵和正常蚕卵进行了比较研究,在分子量66 kD和85 kD处找到了与感染微孢子虫相关的蛋白,为进一步进行正常蚕卵和感染微孢子虫蚕卵的蛋白质组学研究奠定了基础。     

GFP-TNF融合蛋白的制备及在亲和力研究中的运用

目的:在TNF的研究中寻找一种取代同位素标记的检测亲和力的方法。方法:表达及纯化GFP-TNF融合蛋白;鉴定GFP-TNF融合蛋白;用GFP-TNF与TNF做TNF受体的竞争结合分析。结果:GFP-TNF与TNF可竞争结合U937细胞表面的TNFR。结论:GFP-TNF有望取代125I-TNF在TNF的研究中作为检测亲和力的工具。