非编码RNA调控心脏重构与再生

近年来, 越来越多的证据表明, 大量的非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs)在基因的表达调控、细胞和机体的生理功能维持与病理环境调节方面都有重要作用, 其中主要包括微小RNA(microRNAs, miRNAs) 和长链非编码RNA(long non-coding RNAs, lncRNAs).心脏重构与再生是心血管疾病领域的关键问题, 其调控过程非常复杂, 包括表观遗传、转录、转录后及翻译水平的调控. 大量研究发现在转录后水平, miRNAs 通过负性调节靶标的表达调控心脏发育、疾病及再生进程. 近期研究揭示, lncRNAs 在心脏发育和疾病中具有潜在的作用, 可通过表观遗传、转录及转录后水平发挥作用. lncRNAs 已成为继miRNAs 之后的又一重要的调节性非编码RNA. 就非编码RNA 在心脏重构及再生进程中的调控作用进行综述.     

非编码RNA在肌肉生长发育中的调控作用研究进展

非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)在肌肉生长发育过程中发挥着重要的作用,参与调控骨骼肌干细胞的增殖、分化和肌纤维的肥大等过程.利用30篇文献综述了3类非编码RNA(长链非编码RNA、miRNA和环状RNA)在骨骼肌生长发育中的最新研究进展,旨在为肌肉疾病的治疗和农业动物生产性能的改良提供新思路.     

非编码RNA与表达调控作用

真核生物转录产生了大量的非编码RNA（ncRNA）,种类繁多？表达及调节模式复杂多样,且对细胞的生长是必须的,并非是转录的＂垃圾＂。根据功能,ncRNA可以大致分成＂持家RNA＂与＂调控RNA＂。ncRNA在遗传信息的载体（DNA和染色质）与表达产物（蛋白质）的相关生物过程中都有着极其重要的作用。     

长链非编码RNA CASC15在胶质瘤细胞自噬过程中的调控作用

目的 探讨长链非编码RNA CASC15在胶质瘤细胞自噬过程中的调控作用.方法 应用TCGA和GTEx数据库分析CASC15在胶质瘤组织与正常组织中的表达情况,构建过表达细胞系;应用PCR法检测CASC15在不同细胞系中的表达及转染后的表达情况,CCK8检测CASC15对细胞的生长能力的影响,Western blot检测自噬相关蛋白LC3和P62的表达.结果 CASC15在胶质瘤组织及胶质瘤细胞系中高表达,并可促进U251和U87胶质瘤细胞的生长;CASC15能够增加胶质瘤细胞LC3Ⅱ/LC3Ⅰ的比率,并降低P62的表达;CASC15还能促进ATG3的表达,但ATG5和ATG7无变化.结论 CASC15可促进胶质瘤细胞生长,并激活胶质瘤细胞自噬.     

非编码RNA研究进展

多年来,人们已经清楚的认识了一系列结构RNA和调节RNA。最近,由Tuschel,Bartel和Ambro实验室发表的一系列文章里,记述了这些结构RNA和调节RNA外,还包括有许多最近发现的仅由22个核苷酸组成的微小RNA(miRNA)的研究前景。由于这些RNA不编码蛋白质,所以统称为非编码RNA(ncRNA)。最近的研究表明,ncRNA比以前所想像的要丰富和重要的多,它们在转录调节,染色体复制,RNA加工、修饰,mRNA稳定性和翻译,甚至蛋白质降解和转运过程中都起作用。本文就对ncRNA的研究进展和最近发现的miRNA作一简要综述。     

ABCG1基因表达调控在心血管疾病中的作用

胆固醇流出作为胆固醇逆向运输的第一步,是维持细胞稳态的重要机制.三磷酸腺苷结合盒转运蛋白G1 (adenosine triphophate (ATP)-binding cassette (ABC) transporter G1, ABCG1)能够促进细胞内胆固醇流出至胞外的高密度脂蛋白,参与维持细胞胆固醇动态平衡,在动脉粥样硬化、肥胖以及糖尿病等多种疾病中发挥重要作用. ABCG1的基因表达受多重因素调控,如转录因子、蛋白修饰、DNA甲基化及小分子核糖核酸的调控,进而影响多种疾病的发生发展.主要针对ABCG1及其表达调控在心血管疾病中的作用作一综述,以期为该领域的研究提供新的方向.     

与m6A修饰和免疫基因相关的长链非编码RNA在前列腺癌中的作用

前列腺癌是男性癌症死亡的第二大原因,前列腺癌患者五年生存率仅为30%。m6A修饰和长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在前列腺癌的预后中起着非常重要的作用。因此,研究m6A与lncRNA之间的关系对改善前列腺癌患者的预后生存将有所帮助。本文研究了与m6A相关的lncRNA和与免疫基因相关的lncRNA,通过LASSO分析构建了基于六个lncRNA基因的预后模型,将前列腺癌样本分为高、低风险组,KM生存分析显示高风险组患者预后较差。通过单因素和多因素分析发现该模型可能是预测前列腺癌患者的独立因素。通过突变数据分析发现肿瘤突变负荷与该模型存在密切联系;免疫浸润分析得出高、低风险组中免疫细胞浸润存在差异;GO和KEGG分析结果发现m6A修饰主要富集在肌肉收缩、离子通道活性上。这些研究结论有望提高前列腺癌患者的预后生存率。     

长链非编码RNA HULC在肿瘤中作用的研究进展

近年来随着分子生物学研究的迅猛发展,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)越来越受到高度重视,它在肿瘤发生、发展、治疗和预后等方面所发挥的作用也逐渐被深入认知.肝癌高表达转录本(highly up-reglated in liver cancer, HULC)是lncRNA的一种,最先在肝癌中被发现,近年研究揭示它与其他许多癌症,例如胃癌、结肠直肠癌、骨肉瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤等,也密切相关.本文主要对HULC在几种不同肿瘤组织中的表达情况及其作用机制的研究进展做一综述.     

长链非编码RNA:与植物发育和胁迫响应相关的新型调控因子

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是指在基因组序列中长度大于200 nt,没有明显的开放阅读框,并且不具备蛋白编码能力的转录本.早期阶段,lncRNA一度被认为是遗传物质中的“转录噪声”.然而,随着越来越多的研究在不同物种中被报道,以及对lncRNA的功能研究逐渐深入,lncRNA已经逐渐成为基因组学领域的研究热点.该文系统地介绍了lncRNA的分类方法,总结了lncRNA参与调控植物发育与逆境胁迫响应的特征和机制,分析了lncRNA的主要研究技术和策略,并讨论了当前存在的主要问题以及未来的研究方向,旨在为后续的植物lncRNA研究及其在育种领域中的实际运用提供一定的指导依据.     

长非编码RNA与SAFB1相互作用中RNA二级结构的作用

为探究RNA与SAFB1蛋白相互作用过程中RNA二级结构的作用.采用足迹法确定SAFB1与LINC-PINT-1特定的结合区域,在此基础上根据RNA结构分析研究SAFB1结合区域所具有特定的二级结构.最后通过凝胶迁移率实验论证该二级结构在RNA与SAFB1蛋白结合中的作用.结果显示:在针对LINC-PINT-1的亚克隆发现只有包含30～55 nt区域的亚克隆才能维持RNA结合区域的二级结构,并且证实了LINC-PINT-1与SAFB1蛋白相互作用依赖于特定的RNA二级结构.结果表明:长非编码RNA与SAFB1蛋白相互作用或依赖于特定的RNA二级结构,本研究为RNA与蛋白质相互作用的分子机制研究提供了有力的理论实验支撑.     

非编码RNA与染色体变化

与特异染色体类型在新核型演化中作用相同重要的是物种间染色体数目和结构的变化、多态性以及物种内变中和病变等这些事件。曾经非编码RNA(ncRNAs)被认为是转录噪声,而现在却发现其是后期调控和染色体稳定性方面的重要媒介。我们发现短和长ncRNAs在染色体某些区域(着丝粒、端粒、衍生断点和脆性位点等)的功能和稳定性方面发挥作用。通过总结最近的研究本文得出ncRNAs能够促进染色体改变并且对ncRNAs造成DNA断裂的机制进行了描述。     

非编码RNA与心肌重构

非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNAs) 是一类不编码蛋白质的RNA 分子. 相关研究表明, ncRNAs 不仅参与细胞的增殖、凋亡、分化、代谢等生理过程, 还参与疾病的病理过程. 心肌重构(myocardial remodeling)是多种心血管疾病最主要的病理基础. 已有多项研究表明, 心肌重构的发生发展与ncRNAs 的调控息息相关, 近年来针对ncRNAs 在心脏疾病方面的研究也得到了迅猛发展. 对ncRNAs 包括微小RNA(microRNAs, miRNAs)、长链非编码RNA(long non-coding RNAs, lncRNAs)和环形RNA(circular RNAs, circRNAs) 与心肌重构的最新研究进展以及作用机制进行介绍, 旨在寻找新的心脏疾病治疗靶点.     

发现一类新型环状非编码RNA

<正>非编码RNA(核糖核酸),被称为生命体中暗物质。之前我们看到的RNA都是线状的,日前,中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA,并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机制。研究成果发表在Nature Structural and Molecular Biology上。     

小分子非编码RNA 数据聚焦分析

1996～2005年,小分子非编码RNA领域的SCI论文共计8979篇。从论文的年代分布来看, 1996年仅有98篇论文,到2005年激增到3786篇(见图1)。在10年的论文总量中,有94%的论文是2001年以后发表的,说明小分子非编码RNA是一个近年来发展异常迅速的研究领域。10年中有69个国家和地区开展了此方面的研究。在最近的5年中科技五强发表的论文数量占世界总量的81%。     

家蚕新的非编码RNA功能初探

构建了家蚕50～500 nt非编码RNA的cDNA文库,发现了189个新的ncRNA,其中一个小RNA-Bm-86在家蚕幼虫和蛹中的表达量显著高于卵和成虫.利用生物信息学软件对该ncRNA的特性及其与上下游基因的关系进行了深入分析,并利用Northern杂交和半定量RT-PCR技术对该ncRNA与其宿主基因在家蚕不同组织的表达情况进行了研究.结果发现,该ncRNA属于H/ACA box snoRNA家族,是由家蚕eIF5A基因的第二个内含子转录产生的,且在家蚕中没有明显的靶标位点.分析其上下游基因结构发现,在其上游263 bp处存在着一个可能的启动子位点,表明其有独立转录的倾向.进一步分析Bm-86与其宿主基因eIF5A在家蚕不同组织部位的表达情况发现,二者在表达上存在着负相关的关系,且该现象在丝腺中尤其明显.推测Bm-86可能通过影响eIF5A基因的表达参与到家蚕丝腺发育调控过程中.     

细菌非编码小RNA的生物学特征及作用机制研究进展

细菌非编码小RNA(sRNA)是一类长度为50～500 nt、一般不编码蛋白质的具有调控功能的小RNA,主要通过与靶mRNA碱基配对或与靶蛋白质结合,在转录后水平发挥调控作用.sRNA参与细菌氨基酸代谢和转运、环境胁迫响应以及毒力作用等众多重要生理过程的调控,与传统的转录因子等构成多层级的调控网络,协同作用使细菌对环境变化做出快速且精细的响应.由于sRNA在细菌调控网络中的重要作用,发现新的sRNA并阐明它们的调控功能成为原核生物基因表达调控研究的一个热点.本综述对细菌sRNA的筛选、鉴定、作用机制以及生物学功能等方面取得的进展进行总结,希望给相关领域的研究者提供一个较为全面的视角.     

小分子非编码RNAs在乳腺肿瘤中的作用机制

小分子非编码RNAs由siKNA,miRNA,piRNA@snoRNA组成。研究证实rnjRNAs在乳腺肿瘤的发生过程中具有重要调控作用．其它三种非编码RNAs的功能尚未研究清楚。本文旨在探讨mjRNA通过调节细胞生长周期的方式参与乳腺癌的发生发展过程及其对乳腺癌干细胞的调控功能,并对乳腺肿瘤中有piRNA@snoRNA实验证据进行了总结。     

长链非编码 RNA H19 在多发性骨髓瘤硼替佐米耐药中的作用研究

摘要:目的 探讨长链非编码 RNA H19( lncRNA H19)在多发性骨髓瘤( multiple myeloma, MM)硼替佐米耐药中的作用。 方法 选取我院 2017 年 2 月― 2018 年 12 月治疗的初诊 MM 患者 26 例、硼替佐米化疗缓解 MM 患者 25 例及硼替佐米化疗后耐 药 复 发 MM 患 者 22 例。 siRNA-H19 和 慢 病 毒 转 染 人 多 发 性 骨 髓 瘤 OPM2 细 胞。 荧 光 定 量Real-time PCR 检测 lncRNA H19 表达。 CCK-8 细胞活力检测 OPM2 细胞对硼替佐米敏感性。 结果 对照组、初诊MM 组、缓解 MM 组和耐药 MM 组 lncRNA H19 的 2^{-△ △ Ct} 值分别为(0.107±0. 032) 、(0. 324±0. 067) 、(0. 218±0. 042)和(0. 486± 0. 095 ) , 各 组 间 具 有 显 著 性 差 异 ( P < 0. 01 ) 。 其 中, 初 诊 MM 组 显 著 高 于 对 照 组 和 缓 解 MM 组( P<0. 01) ,耐药 MM 组又显著高于初诊 MM 组( P< 0. 01) 。 对照组、OPM2 / si-H19 组、OPM2 / NC 组、OPM2 / H19 组和 OPM2 / Blank 组 细 胞 的 IC₅₀ 值 分 别 为 ( 17. 86 ± 1. 64 ) nmol / L、 ( 6. 83 ± 1. 05 ) nmol / L、 ( 18. 04 ± 1. 72 ) nmol / L、(31. 14±3. 57) nmol / L 和 ( 17. 75 ± 1. 68) nmol / L。 其 中, 对 照 组、 OPM2 / NC 组 和 OPM2 / Blank 组 无 显 著 性 差 异( P>0. 05) ,OPM2 / si-H19 组硼替佐米 IC50 值显著低于对照组( P<0. 01) ,OPM2 / H19 组硼替佐米 IC₅₀ 值显著高于对照组( P<0. 01) 。 结论 MM 患者 lncRNA H19 显著升高,高表达 lncRNA H19 可能参与了硼替佐米耐药过程。