Mn~(++)及二甲基亚砜(DMSO)对限制酶HindⅢ识别顺序的影响

本文以质粒pBR322及噬菌体λcI857S7DNA 为底物研究了Mn~(++)及DMSO 对限制酶Hind Ⅲ对底物DNA 识别顺序的影响.在10mMTris-HClpH8.4,10mM MgCl_2,60mMNaCl 及7mM 巯基乙醇的正常反应条件下,HindⅢ在pBR322DNA 上只有一个切点,酶切后在凝胶电泳上可看到一条带.用10mM Mn~(++)代替Mg~(++)或在反应液中加入DMSO 进行酶切,在电泳上出现许多新的带.以λcI857S7DNA 为底物也得到类似的结果.新产生的片段可以用DNA 连接酶重新连接成线状分子.Mn~(++)及DMSO还能使Hind Ⅲ切割细菌本身的DNA.这些数据表明:Mn~(++)及DMSO 确实能降低Hind Ⅲ对底物的专一性,放松对识别顺序的要求.讨论了专一性降低的机制及其在核酸研究及基因工程中的意义。     

鹅源腺病毒全基因组DNA酶切片段的克隆

利用1株鹅源腺病Y81G4株,经鹅胚增殖后收获尿囊液,用差速离心法纯化病毒子并提取病毒基因组DNA,病毒DNA经Hind Ⅲ酶切后共产生10个片段,分别回收各酶切片段,与经Hind Ⅲ单酶切的pUC18连续,获得8个不同的重组质粒。对于未克隆到的两末端片段,经碱处理去除末端蛋白后,以平端和HindⅢ粘端与经SmaⅠ和 HindⅢ双酶切的pUC18连接,获得了重组质粒pGAHC和pGAHI。克隆的各酶切片段,通过酶切电泳和Southern blotting结果鉴定,证明已分别克隆到该病毒基因组DNA HindⅢ酶切片段,且各酶切片段大小之和约为32．9kb.     

正常和细胞质雄性不育水稻线粒体DNA限制性内切酶的酶切图谱分析

从N,cms-WA,cms-BT和cms-RL四种不同细胞质源的水稻中制备线粒体DNA。用限制性内切酶Pst Ⅰ,Hind Ⅲ和Xho Ⅰ等酶切线粒体DNA经琼脂糖凝胶电泳,发现水稻N,cms-WA,cms-BT和cms-RL细胞质确有不同的线粒体DNA,不同的保持系之间也存着一定的差异。水稻线粒体DNA最小分子的大小在195～245kb之间。     

氧化亚铁硫杆菌启动子片段的克隆及酶切分析

本文利用DNA体外重组技术,将氧化亚铁硫杆菌染色体DNA的Hind Ⅲ酶切片段插入启动子探测质粒pSDSI(Ap~r,Tc~s,5.65kb)的Hind Ⅲ位点上,获得了一批具有启动子活性的染色体DNA片段.其中抗性最强的一株可在240μg/ml的四环素平板上生长,对此抗性最强的质粒pSDRF12进行了限制性酶切图谱分析,并利用其上的PstI和EcoRI位点分别酶切,得到了两个亚克隆pSDRF121和pSDRF122.新构建的两个亚克隆在其氧化亚铁硫杆菌启动子后只有一个Hind Ⅲ位点,可通过该位点插入外源目的基因,进一步观察其表达情况。     

短小芽孢杆菌质粒pCJ3的限制酶切图谱

从短小芽孢杆菌A3菌株分离的具四环素抗性质粒pCJ3,经电泳法及氯化铯密度梯度法纯化后在琼脂糖凝胶电泳上得到2条带,经电镜观察及限制酶切割证实是一种质粒的两种构型——超线团及开环DNA分子。纯化质粒用13种限制酶进行酶切试验,发现其中有BamH I、Ava I、Xba I切点1个,EcoR I、Pst I、Bgl I、Hinc Ⅱ及Xho I切点2个、Hinf I、Sal I及Bel I切点3个,Hha I切点5个,Hind Ⅲ没有切点。用BamH I、EcoR I、Ava I及Xba I进行双酶解,并根据双酶解后的琼脂糖凝胶电泳带估算出各个片段的分子量,作出质粒pCJ3的4种限制酶的酶切图谱。     

极端嗜热厌氧纤维素分解菌基因文库的构建及其内切葡聚糖酶基因片段的克隆

以从云南邦拿掌温泉中分离、纯化的高温厌氧纤维素分解菌邦2菌(Cadicellulosiruptor)为材料,制备其总DNA,经限制性核酸内切酶EcoRⅠ部分酶切后,在T4DNA连接酶的作用下与经EcoRⅠ完全酶切、去磷酸化的质粒载体pUC18连接,然后转化E.coliJM109,建立了邦2的基因文库,经筛选鉴定得到6.3×103个重组子;重组子经刚果红平板验证:约有23.5%菌落呈现透明圈;重组子经EcoRⅠ酶切验证显示:重组质粒均含有外源DNA插入片段.结果表明已克隆到邦2菌纤维素酶系中的内切葡聚糖酶基因(ED基因)片段.     

欧鳗“狂游病”病毒的分离及观察

患“狂游病”欧鳗的主要脏器经电镜切片观察表明：该病毒主要存在于病鳗的脑、心脏和肌肉组织中,存在有一大小约为80－100nm的圆形病毒,成熟的病毒颗粒具有清晰可见的包膜结构,病鳗组织匀浆后,经蔗糖分步超速离心法,RNA酶及DNA酶消化去除组织内DNA、RNA后,获得纯化的病毒颗粒。又经蛋白酶K消化后得到病毒的核酸,以DNAaseI或RNAaseA分别消化,经1％的琼脂糖凝胶电泳证实该病毒为DNA病毒。     

硅藻DNA片段在表达质粒pMZR中再克隆的研究

用部分酶切法切开表达质粒 pMZR 中一个 HindⅢ位点后,插入了一个带 HindⅢ粘性末端的1kb 硅藻 DNA 片段重组 DNA 分子转化 E.coli LE392,对转化子中的重组 DNA 分子用酶切分析后,鉴定了1kb DNA 片段插入 pMZR 的位置。     

中国棉铃虫核多角体病毒(Heliothis armigera NPV)VHA273毒株DNA的酶切分析与比较研究

VHA273毒株原为MNPV型,经纯系中国棉铃虫扩增而得出约10％的SNPV.高度纯化两型多用体,温和碱解后,酚法抽提SNPVDNA和MNPVDNA.限制性内切酶BglⅡ,BamHI,EcoRI和HindⅢ分别平行酶切两种DNA,依次均得出11,8,14和13条电泳带．比较分析DNA的酶切电泳图谱发现,经同一种限制性内切酶酶切,SNPVDNA与MNPVDNA不仅电泳片段数相同,电泳带位也-一对应．讨论提出：该SNPVDNA与MNPVDNA在分子、亚分子水平上是一致的．     

用α—珠蛋白基因探针对两例Hb—Bart''''s胎儿双亲的α—基因的探测

采用限制性内切酶印迹杂交放射性自显影技术和α—珠蛋白基因探针分析了二例Hb—Bart's胎儿水肿综合征及其双亲的α—珠蛋白基因,其分析结果表明:Hb—Bart's胎儿水肿综合征没有α—基因;其双亲则以内切酶HindⅢ消化其DNA得到17、4.5、3.8kb α—基因特异片段,用内切酶Bgl Ⅱ消化则得12.3、7.2kb二个α—基因特异片段。其基因图谱与正常人相似,为正常人的一半。     

柳毒蛾核型多角体病毒内蒙株(LsNPV-IM)DNA的限制性内切酶谱分析

将柳毒蛾核型多角体悬液降解 ,降解产物经 Tris-饱和酚和氯仿抽提 ,乙醇沉淀分离出Ls NPV-DNA.用限制性内切酶 Pst ,Hind ,Pst /Hind ,Hind /Eco R 和 Pst /Bam H 单酶切或双酶切 .经琼脂糖凝胶电泳并对其结果进行分析 ,建立了酶切图谱     

乙型脑炎病毒E蛋白Ⅲ区基因的克隆表达及亲合层析纯化

克隆表达JEVE蛋白Ⅲ区基因,序列测定正确后进行融合表达、纯化。采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）从JEVcDNA中扩增Ⅲ区基因,用限制性内切酶消化后插入到PMD-18T载体,序列测定正确后,再亚克隆到融合表达载体pET32a中。转化大肠杆菌BL21（DE3）,目的基因经IPTG诱导,由T7启动子调控表达了氨基端带6个连续组氨酸残基的JEVEⅢ区蛋白。在变性条件下对目的蛋白进行纯化,获得了融合6个组氨酸残基的JEVEⅢ区蛋白,蛋白纯度大于80%。证实构建了JEVEⅢ基因的重组表达载体,并获得了高纯度的融合表达蛋白,为以后的深入研究奠定了基础。     

一种蛙病毒的纯化和酶切分析

从患病虎纹蛙（Rana tigrina rugulosa)蝌蚪中分离得到一种蛙病毒,感染鱼的FHM、CO、EPC细胞,获得大量的病毒原料,分离纯化得到高纯度的病毒粒子,电镜下可见病毒粒子为二十面体,具囊膜,直径平均为125nm。抽提病毒核酸,对其基因组DNA进行酶切分析,病毒基因组为双链DNA分子,表现脊椎动物虹彩病毒基因组的特点即其胞嘧啶5′端高度甲基化。以限制性内切酶XbaⅠ、BanHⅠ、HindⅢ、KpnⅠ和PstⅠ酶切病毒基因组DNA,经电泳分离后,分别得到13、25、6、14、22条清晰的酶切片段,并根据酶切片段算得基因组的大小超过100kb。用PCR方法,得到这个病毒的主衣壳蛋白（MCP）基因保守序列,与FV3相比,同源性达98％。     

早期肺癌病人血液中P53的克隆及其pEGFP-N1-p53的构建

首先用RT-PCR方法从早期肺癌病人的外周血中克隆出人抗癌基因p53,经测序确认为野生型后,通过酶切、连接、转化构建出扩增质粒pMD18-T-p53,然后构建出含增强型绿色荧光蛋白(EGFP)基因的真核表达质粒pEGFP-N1-p53.pEGFP-N1-P53经限制性内切酶Hind Ⅲ和BamH Ⅰ酶切,酶切产物电泳结...     

无HindⅢ位点新霉素磷酸转移酶标记基因的建立

用体内自发突变，卡那霉素抗性筛选和体外限制酶切富集方法消除载体ｐＮＧ３５中新霉素磷酸转移酶基因内的限制酶位点ＨｉｎｄⅢ，除去ＨｉｎｄⅢ位点后的载体ｐＮＧ３５△Ｈ赋予宿主细胞的卡那霉素抗性水平远远高于原载体ｐＮＧ３５。     

玉米半胱氨酸蛋白酶的原核表达及酶学性质表征

以玉米基因组DNA为模板扩增获得玉米半胱氨酸蛋白酶基因(zmCP1),先将其克隆至pET-28a(+)原核表达载体中,再转化至大肠杆菌BL21(DE3)中.对重组酶进行诱导表达后经聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白免疫印迹(Western blotting)鉴定,经Ni柱纯化后其质量分数大于95%.利用二肽荧光底物(R-AMC)和四肽荧光底物(LAFR-AMC)进行酶反应动力学实验,证明该酶对小底物R-AMC具有更好的亲和力和催化活性.重组酶的酶学性质研究表明,该酶最适温度为55℃,最适pH值为6.0,在90℃下的半衰期为39.82min.     

坛紫菜(Porphyra haitanensis)叶绿体DNA 的快速提取

以阴干的坛紫菜叶状体为材料，通过酶解等方法获取完整的叶绿体．再裂解叶绿体并酚仿抽提获得叶绿体DNA．限制性内切酶Hind Ⅲ和EcoR Ⅰ双酶切及RAPD检测结果显示：叶绿体DNA与基因组DNA的酶切图谱及RAPD图谱均有比较明显的差异．多次重复实验证明，按此法提取的叶绿体DNA．其得率稳定，并可用作PCR扩增的模板及酶切图谱的构建等．该方法操作简便．过程快捷．可作为大型海藻叶绿体DNA提取的参考方法．     

限制性酶切DNA片段的计算机辅助测量

文中对几种测量限制性内切酶解DNA片段大小方法的测量精度进行了比较。在所讨论的方法中有手工半对数作图法、线性回归、组合线性回归、拉格朗日插值法、Southern法及改进的分段函数法和其计算机计算程序。用以上方法检验了λDNA/HindⅢ+EcoRⅠ酶切片段的测量精度,并测量了pSaA基因限制性内切片段大小。结果表明改进的分段函数法给出最小标准方差(Sd)及最优测量一致性。     

重要海水养殖鱼斜带髭鲷和花尾胡椒鲷16S rRNA遗传变异研究

应用PCR技术扩增了我国南方重要养殖石鲈科鱼类斜带髭鲷(Hapalogenys nitens)和花尾胡椒鲷(Plectorhinchus cinctus)线粒体DNA(mtDNA)的16S rRNA基因片段,纯化后分别进行EcoRⅠ、MseⅠ、PstⅠ、SacⅠ和HindⅢ等5种限制性内切酶酶切和测序分析.酶切结果为:斜带髭鲷16S rRNA扩增片段被MseⅠ和SacⅠ两种内切酶酶切,花尾胡椒鲷16S rRNA扩增片段只被MseⅠ酶切.两者在MseⅠ和SacⅠ酶切图谱的差异可作为区分两者的遗传标记.16S rRNA序列分析结果表明,斜带髭鲷和花尾胡椒鲷的遗传相似度为86.94 %,遗传差异为13.06 %.进化上,两者分化年代大约为1.98×106年前.