蛋白质-蛋白质相互作用的实验检测方法

生物体内的蛋白质分子常常通过与其他蛋白质分子发生相互作用来发挥其生物功能.因此,研究蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)对于阐明蛋白质分子的生物功能以及分子作用机理具有重要的意义.主要介绍基于生物物理和生物化学原理的检测蛋白质-蛋白质相互作用的实验研究方法,并对发展趋...     

蛋白质与蛋白质相互作用预测模型综述

蛋白质作为生命活动的物质基础,通过彼此之间的相互作用来参与生物信号传递、能量和物质代谢及细胞周期调控等,因此,预测蛋白质与蛋白质相互作用(PPIs)有助于从系统角度理解生命过程,同时为细胞机制的研究奠定重要基础。目前,高通量测序技术的进步使研究人员获取了海量的蛋白质相互作用数据。面对大量具有潜在可用性的PPIs数据,国内外研究人员提出了多种PPIs预测模型。文章综述了现有的基于计算的PPIs预测方法,并进行分类,讨论了其各自优缺点。最后对PPIs预测方法进行总结和展望,提出了未来可以深入研究的方向。     

蛋白质运动的理论分析与蛋白质结构

从基础物理现象出发。讨论了蛋白质的运动特点，提出了动态概念，据此分析了蛋白质折迭的物理学过程，并规范出蛋白质运动的３个原则：均一化原则，最大动态自由度原则和拓扑结构原则。结合生物学研究，提出蛋白质的生物化学三原则：选择原则，最低限度原则和协合性原则，相当部分生物学现象及蛋白质知识均可在此理论系统内得到解释。     

蛋白质序列与蛋白质结构关系的研究

蛋白质结构与功能的研究一直是分子生物学研究的热点之一.基于混沌理论对蛋白质序列特性进行研究,先将蛋白质序列转为时间序列,再对其进行相空间重构,通过计算确定时间延迟t、嵌入维数m等参数,最后计算得出蛋白质序列的最大Lyapunov指数,通过对蛋白质结构分类数据库SCOP中七类蛋白质结构的蛋白质序列最大Lyapunov指数计算和比较,发现蛋白质整体序列和蛋白质结构没有明显关联.     

说说蛋白质

乔乔,多吃点鱼肉,它含有丰富的蛋白质。我不爱吃鱼肉!我也不需要蛋白质!宝贝,人体需要蛋白质,你该知道蛋白质对于我们而言是多么重要。     

飞翔的蛋白质

蝗虫,是人类的天敌。上世纪中叶,阿尔及利亚曾出现过一次蝗灾,一共200亿只蝗虫组成的蝗群犹如一片会飞的乌云,密密麻麻地覆盖住了400平方公里的田野,每天吞食的食物数以万吨计。     

蛋白质的PEG化学修饰

目的蛋白、多肽等药物分子免疫原性和毒副反应的存在及体内作用时间短等问题限制了其应用,这可以通过化学修饰部分或全部加以克服。随着蛋白质构效关系的揭示,蛋白质的化学修饰的研究飞速发展。此文对蛋白质、多肽等药物分子化学修饰的国内外研究进展和发展方向加以评述。     

基于蛋白质互作用网络的关键蛋白质识别研究

本文提出了基于图论算法的关键蛋白质识别方法，选择合理的候选关键蛋白质集合和相关的路径参数，对大规模蛋白质互作用网络的关键蛋白质进行预测．实验表明，该算法是有效的．     

稻蛋白质

1 引言 蛋白质的含量与分布 尽管世界小麦总产量大于稻米,但稻米是世界大部分人口的主粮。稻粒的结构与其它谷物结构相似,稻粒(稻谷)是由食用部分稻的颖果及其复盖结构稻壳所组成。稻壳构成稻谷重量的18—28％。颖果因其果皮呈淡褐色又叫糙米。工艺学上,糙米的最重要部分是果皮、糊粉层、胚(胚芽)和淀粉质胚乳。果皮组成颖果重量的1～2％,糊粉层为4—6％,胚为2—3％,淀粉质胚乳为89～94％。与其它谷物比较胚相对地小。糊粉层具有1～7层细胞,且背部比侧面和腹面要厚些。糊粉层细胞被小的富含蛋白质的糊粉粒所充满,这种糊粉粒包裹在有油斑物质的鞘内。淀粉质胚乳由薄壁细胞组成,通常呈放射状伸长,装载着淀粉粒与某些蛋白质体的混合物。普通稻米非粘性,胚乳透明;另一类稻米,粘性、有甜昧,或     

蛋白质空间结构的统计分析

利用数据挖掘中的数据分布拟合理论对生物科学领域中的蛋白质侧链空间结构进行统计分析.以世界上广泛使用的生物分子三维结构数据库PDB为基础,利用沈世镒教授提出的对多氨酸残基侧链碳原子间距离的统计分析方法,通过正交试验设计和信息论中的熵函数等相关知识,给出了不同位置、不同氨基酸残基种类对侧链结构的影响.     

说说蛋白质

正~~     

植物蛋白质的初步研究[I] 向日葵种子蛋白质和棉子蛋白质的氨基酸组成

从本世纪初Osborne开始注意到植物蛋白貭的重要性之后,到现在这许多年来对它们的研究还是不太多的.近年来R.J.Block(1945)用酵母的酶水解的方法研究过向日葵粕中的氨基酸,他分析出十二种氨基酸并测出它的含量。A.K.Smith(1948)用鹼提取酸沉淀的方法分出向日葵种子蛋白貭,同时研究过这种蛋     

应用天然蛋白质片段构建蛋白质分子机器的初步尝试

根据对蛋白质分子结构可塑性和结构重组的理解,本文介绍了如何以来源于不同蛋白质的功能片段和人为设计的多肽片段为部件,组装出一组多结构域融合蛋白。在体外和体内实验中,这些多结构域融合蛋白表现出了我们所期待的特定功能。它们将有可能发展成为一系列新型抗菌和抗肿瘤药物。与现用药物相比,它们的效力更高,靶向性更强,更为安全。它们有可能会很快地代替现用药物,为人类创造更好的福祉。而以这些雏型为基础,则有可能构建出具有更理想功能的蛋白质分子机器。     

崭露头角的蛋白质计算机

随着生物计算机科学的诞生,以生物过程为基础,以蛋白质为材料,制造出超微、超速、低能耗的计算机已成为可能。这种蛋白质计算机不但可以植入人体,而且可以代替细胞的功能,甚至像活的细胞一样具有繁衍再生的能力。 计算机沿着微型、高速、低能耗的方向,经过好几代的发展,从使用电子管、晶体管、集成电路、大规模集成电路到超大规模集成电路;从使用硅材料、砷化镓材料到超导材料,集成度已快接近固体材料的物理极限;1平方毫米芯片上最高集成45万个元件。还能否突破这个“物理极限”?生理学研究表明:     

首次人工合成蛋白质

20世纪60年代,我国科学家在世界上第一次人工合成了牛胰岛素。这是一种大分子生命物质蛋白质,人工合成这类只有生命才有的物质,无疑具有标志性意义。为何选择合成牛胰岛素?1958年,合成牛胰岛素成为化学家们的选择,因为在世界上牛胰岛素的研究和有机合成技术已经取得了相当的成果,离生命物质蛋白质的合成似乎只有一步之遥。1955年,英国生物化学家桑格(F.Sanger,1918～)搞清     

蛋白质的环状结构

蛋白质分子中是否有环状结构存在是蛋白质化学中争论得最激烈的问题,主张环状结构的学派的最初论据就是在高温F用稀酸使蛋白质水解时得到了二酮吡嗪的衍生物.他们认为这是由条件较缓和水解不完全而得的中间产物,所以这种粘构是原来存在于蛋白质分子中的,但是有不少学者认为这种环状化合物     

细菌蛋白质的研究

随着社会进步和科学技术的发展,人们的日粮结构已经或正在从淀粉类转向蛋白质类,为了满足人们对食品的要求,世界各国畜禽饲养和水产养殖业发展很快。但是,家畜日粮中蛋白质饲料的短缺也是国际上共同存在的严重问题。因此,目前国外有些科研单位正在起劲研究以细菌蛋白质来代替谷物蛋白质,以便减少农副产品的用量。如西德的     

谷类作物蛋白质的改良

过去以稻麦为中心的谷类作物的育种,把重点放在提高丰产性上,似有忽视改善营养价值的倾向。通过品种改良获得比过去更稳定的高产而商品价值高的品种,固然是重要的。可是,忘记通过营养价值的改善,来为维持和延续人类的生命而提高必要营养的总量,也不成吧。不消说,谷类是重要的淀粉供给源,同时,作为蛋白质供给源,总希望也是高产、优质的。虽说不及大豆,稻米约含6～9%,麦约含10～13%的蛋白质,但据 Parpia(1970)估计,世界谷类蛋白生产量达11300万吨,为牛乳、肉、蛋、鱼等动物蛋白的总和3900万吨的3