中国番茄黄化曲叶病毒双向启动子的鉴定

以中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCCNV)Y10分离物感染的烟草植物总DNA为模板,扩增病毒双向启动子片段,并分别以不同方向与gus基因和nos终止子融合,构建了植物表达载体.用土壤杆菌介导的方法将质粒载体导入本氏烟叶片细胞和植株茎部进行瞬时表达结果表明,互补链和病毒链启动子均能驱动gus基因表达,并且互补链启动子的活性高于病毒链启动子的活性.TYLCCNV伴随的卫星DNAβ分子的βC1的表达载体与启动子载体进行瞬时共表达时,βC1对病毒链和互补链启动子的活性均没有调节作用.     

一种非洲番茄黄化曲叶病毒DNA的克隆

用ＰＣＲ获得了非洲塞内加尔番茄黄化曲叶病毒（ＴＹＬＣＶ－ＳＥＮ）的全长ＤＮＡＡ，并进行了克隆和部分序列分析，ＤＮＡ序列分析的序列并１３５９ｂｐ，包括外壳蛋白基因，ＡＶ１基因，基因间区（ＩＲ）及部分复制酶基因，计算机分析显示：ＴＹＬＣＶ－ＳＥＮ与其他亚组ＩＩＩ及生理病毒相比，外壳蛋白氨基酸同源性为６７％～８３．４％，ＡＶ１基物氨基酸同源性为６１％～８４％，ＩＲ最大同源性为６０％～６８％，且与非洲和中     

感染番茄抗病品种的番茄黄化曲叶病毒的基因变异分析

近几年来,生产中发现一些番茄抗病品种在不同环境条件下或应用几年后出现感病现象。为了解不同抗病品种中番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leafcurl virus,TYLCV)基因变异的情况,对5个感染TYLCV的番茄抗病品种进行了TYLCV全长基因克隆和序列测定。扩增结果显示,5个样品携带的TYLCV基因组长度均为2 781 bp,且均编码6个功能蛋白。基因组序列比较发现,这5个分离物与TYLCV-Israel株系同源性达到99%以上;通过功能蛋白比对发现,复制增强因子AC3蛋白存在变异,同世界各地报道的TYLCV-Israel株系典型分离物的AC3蛋白存在7处氨基酸差异的位点。分析结果表明,这五个病毒分离物均属于TYLCV-Israel株系,其AC3蛋白的氨基酸序列变异程度均不显著,并没有产生新的病毒株系。     

侵染番茄的中国番茄黄化曲叶病毒致病性相关分子的遗传多样性

对云南番茄中的中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)不同分离物的致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆.全序列比较分析发现滇西北和滇南各分离物DNAβ同源率较高而且进化关系较近,滇西南与之差异较大.获得的16个DNAβ分离物具有一定的地理分布差异.     

中国番茄黄化曲叶病毒在云南的发生分布及其遗传多样性

对云南普遍发生的中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)进行分子鉴定.结果发现中国番茄黄化曲叶病毒在云南的发生非常广泛,其发生、分布与地理生态、气候类型有关,主要集中在滇中南的热带、亚热带气候类型地区.共获得20个TYLCCNV分离物的病毒全基因组DNA-A,和已报道的中国番茄黄化曲叶病毒云南分离物进行同源性比较,它们之间的同源性在89.2%~97.4%之间.同源性比较发现中国番茄黄化曲叶病毒DNA-A具有明显的地理分布差异,地理和气候接近的地区同源性越接近.     

番茄黄化曲叶病毒自然种群的分子变异和进化研究

研究目的：创新要点：研究方法：重要结论：2006年我国上海首次发现番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）,随后TYLCV迅速蔓延至全国13个省份和自治区。本研究分析了2006至2010年期间TYLCV在我国首发地上海市的分子变异规律。本研究持续五年追踪田间TYLCV,分析TYLCV的全长基因组序列、分子变异及种群遗传结构,为防控TYLCV提供理论依据。2006至2010年从上海采集了26个TYLCV的分离物,利用高保真性的滚环扩增技术获得TYLCV分离物的全长基因组。应用MEGA5等生物信息学软件分析TYLCV的分子变异。TYLCV自然种群具有与RNA病毒相似的突变率,以基因间隔区的分子变异最大,平均突变率为4．81×10-3（见图2和表2）。TYLCV的大部分基因都处于负向选择,但包含在c1开放阅读框内的C4,却与c1承受着不同的选择压而处于正向选择（见图3和表6）。     

番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析

番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNA-A序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA-B和卫星DNA-β,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV-BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.1~99.9%,属于以色列TYLCV-IL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV-Mld进化成TYLCV-IL时,AC1和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CN I亚群.     

中国番茄黄化曲叶病毒（TYLCV—CHI）外壳蛋白基因在大肠杆菌中的表达及抗血

经PCR获得了中国番茄黄化曲叶病毒（TYLCV－CHI）外壳蛋白（CP）基因，并克隆到pGEM-7Zf( ) 载体上，序列分析表明，TYLCV－CHI感染番茄或烟草时，CP基因的核苷酸序列发生变化，并且在烟草上随感染时间的延长，突变频率增高。连接到含有编码tRNAarg4基因argU的表达载体pSBET后，TYLCV－CHI CP基因在大肠杆菌中以包含体形式得到大量表达（约33ku)。以表达的蛋白作抗原免疫家兔，制备了抗TYLCV－CHI CP的抗血清。ELISA实验表明，该血清与抗原特异反应，血清效价为TYLCV－CHI CP的抗血清。ELISA实验表明，该血清与抗原特异反应，血清效价为1：3000。Western印迹实验还表明，该血清除了与感染TYLCV－CHI的番茄、烟草有特异免疫反应外，还与感染南瓜曲叶病、烟草曲叶病的叶片有免疫反应，表明这些病毒之间有明显的 血清学关系。     

中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-CHI)外壳蛋白基因在大肠杆菌中的表达及抗血清的制备

经PCR获得了中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCV-CHI)外壳蛋白(CP)基因,并克隆到pGEM-7Zf(+)载体上.序列分析表明,TYLCV-CHI感染番茄或烟草时,CP基因的核苷酸序列发生变化,并且在烟草上随感染时间的延长,突变频率增高.连接到含有编码tRNAarg4基因argU的表达载体pSBET后,TYLCV-CHI CP基因在大肠杆菌中以包含体形式得到大量表达(约33 ku).以表达的蛋白作抗原免疫家兔,制备了抗TYLCV-CHI CP的抗血清.ELISA实验表明,该血清与抗原特异反应,血清效价为1:3000.Western印迹实验还表明,该血清除了与感染TYLCV-CHI的番茄、烟草有特异免疫反应外,还与感染南瓜曲叶病、烟草曲叶病的叶片有免疫反应,表明这些病毒之间有明显的血清学关系.     

伴随中国番茄黄化曲叶病毒的卫星DNAβ在本氏烟中的种群变异

采用根癌土壤杆菌介导接种和分子克隆技术,分析中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellowleaf curl China virus,TYLCCNV)Y10分离物(Y10)的伴随卫星DNAβ(Y10β)在本氏烟中的种群变异.结果显示表明:本氏烟中Y10β种群所有克隆均发生不同程度的变异,在接种60 d及120 d后其种群突变频率分别为2.48×10-3和2.54×10-3,表明该卫星DNAβ在同一寄主体内的侵染时间对其种群变异水平没有明显影响;Y10β种群的碱基突变位点主要分布于DNAβ的富A(A-rich)区,在卫星共同区(SCR)内碱基突变位点最少;其碱基突变类型以A→G,G→A,T→C突变及碱基G缺失等突变类型的比例较高,并且在A-rich区内出现多个克隆在同一核苷酸位点发生相同突变的现象.     

吐鲁番温室番茄病株及传毒烟粉虱的双生病毒检测与鉴定

为了明确吐鲁番地区温室番茄黄化曲叶病的病毒种类及传毒烟粉虱的生物型及携带病毒的情况,本研究利用番茄黄化曲叶病毒的特异引物通过PCR检测和DNA测序,对温室采集的43个番茄病株进行了病毒种类的分子鉴定;利用烟粉虱特异引物和番茄黄化曲叶病毒特异性引物通过PCR检测和DNA测序,对鄯善县温室采集的180头烟粉虱进行了生物型鉴定和带毒检测,并构建了双重PCR检测方法。结果显示:吐鲁番市和鄯善县温室发生的番茄黄化曲叶病的病毒种类为番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV),病株带毒率为39.5%。鄯善县温室发生的烟粉虱主要为Q型烟粉虱,带毒率为67.8%,是主要的传毒介体。本研究建立的双重PCR检测技术,能快速有效地确定Q型烟粉虱的生物型和携带TYLCV的情况。     

Identification of a bi-directional promoter from Tomato yellow leaf curl China virus

A bi-directional promoter of Tomato yellow leaf curl China virus (TYLCCNV) was obtained with the total DNA from TYLCCNV isolate Y10 infected tobacco leaves as a template. Plant expression vectors were constructed by fusing the amplified DNA fragment with the gus gene and nopaline terminator in different orientations. The vectors containing promoter fragments were transferred into leaf cells and plant stems of Nicotiana benthamiana by Agrobacterium-mediated method. Transient expression results showed that both the complementary and virion-sense promoters could drive the gus gene to express, and the GUS activity of the complementary-sense promoter was stronger than that of the virion-sense. Co-expression of the vector containing βC1 gene of TYLCCNV DNAβ with the vector containing a bi-directional promoter revealed that the βC1 protein has no impact on expression of either the virion- or the complementary-sense promoter.     

There is the second virus that causes tobacco leaf curl disease (not TbLCV-CHI) in the field

Sequence analysis of virus isolation DNA of tobacco leaf curl disease shows that there is the second geminivirus (not Chinese Tobacco Leaf Curl Virus, TbLCV-CHI) that causes tobacco leaf curl disease in the field in the Guangxi Zhuang Autonomous Region, China. This virus DNA-A contains 2 734 nt. Large intergenic region (LIR) contains 269 nt, the virus sense strand contains 2 open reading frames (ORFs): AV1 (115 aa) and AV2 (coat protein gene, CP, 256 aa), and the complementary sense strand contains 4 ORFs: AC1 (replicase gene, 361 aa), AC2 (transactivator, 134 aa), AC3 (134 aa) and AC4 (97 aa). The virus belongs to one kind of subgroup III geminiviruses from old world, and could be the Chinese tomato yellow leaf curl virus (TYLCV-CHI).     

Molecular characterization of<Emphasis Type="Italic">Tomato yellow leaf curl China</Emphasis> virus and its satellite DNA isolated from tobacco

Virus isolates, Y8, Y36 and Y38, were obtained from tobacco plants showing leaf curl symptoms in Honghe,Yunnan Province. In reactions with 14 monoclonal antibodies raised against Begomoviras particles, Y8, Y36 and Y38 had similar antigenic reaction in TAS-ELISA as Tomato yellow leaf carl China virus (TYLCCNV). The complete DNA-A nueleotide sequences of Y8, Y36 and Y38 were determined and they contain 2727, 2730 and 2730 nueleotides, respectively. Each of the DNA-A sequences has a typical Begomovirus genome organization encoding 60RFs with 20RFs[AVI(CP) and AV2] in virion-sense DNA and 40RFs (AC1 to AC4) in complementary-sense DNA. Comparisons with total DNA-A, intergenie region and deduced amino acid sequences of individual ORFs show that Y8, Y36 and Y38 are isolates of TYLCCNV. Satellite DNA molecules (DNAβ) were found to be associated with Y8, Y36 and Y38, which consist of 1338, 1339 and 1338 nucleotides, respectively. Comparisons show that these DNAβ molecules share 98%--99% sequence identities on nucleotide level and have a common ORF (designated C1) encoding 126 amino acids on the complementary strand.     

新疆加工番茄品种抗早疫病测定及防治药剂筛选

对15个加工番茄品种进行了田间抗早疫病鉴定,结果表明,供试品种中无抗病品种,耐病品种6个,占40%;感病品种9个,占60%。对加工番茄早疫病菌进行了室内毒力测定和小区药效试验,室内毒力测定结果表明:72%锰锌·霜脲氰WP对菌丝生长抑制效果最好,EC50值为8.1μg/mL,70%代森锰锌WP、58%甲霜·锰锌WP、10%苯醚甲环唑WP次之,其它的药剂抑菌效果较差。小区药效试验结果表明:72%锰锌·霜脲氰的防治防效最好,可达81.2%,其次是10%苯醚甲环唑WP、70%代森锰锌WP、58%甲霜·锰锌WP,防效分别为73.1%、71.0%和61.0%。     

小麦叶枯病内生生防细菌的筛选及鉴定

本研究采用表面消毒后涂布平板的方法,从开封郊区不同品种的45份健康小麦根系内分离获得105株小麦内生细菌.采用种子包衣法,在小麦活体上测定了内生细菌对小麦黄斑叶枯病的生防效果.其中,菌株T-7生防效果最好,防治效果为53.41%.综合利用形态学、生理生化分析等方法对T-7进行鉴定,结果表明,T-7属于枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis).定殖能力测试表明,T-7在小麦根部可以长期定殖.处理30天后,该菌株在小麦根部的菌落形成单位仍达到3.4×104 CFU/g roots.     

丙型肝炎病毒E2基因在转基因番茄植株中的表达

以T-E1E2为模板扩增得到丙型肝炎病毒包膜蛋白基因E2,构建该基因的植物表达载体p35s-E2．通过农杆菌介导的叶盘法转化番茄子叶．转基因番茄植株叶片总DNA的PCR、Southern blot检测结果表明,E2基因已整合进了转基因番茄植株基因组中;RT-PCR,Western blot分析证实E2基因在转基因番茄植株叶片中表达．