利用朋友机制生成一类无标度网络

针对网络模型的演化问题,提出了一种新的无标度网络演化模型。该模型可以帮助人们从"朋友机制"捕捉网络形成的动态特性、了解该机制对网络最终结构的影响,对研究网络功能及网络上的动力学行为有一定的参考价值。通过理论分析与数据仿真证明,该演化模型具有无标度特征和小世界特征,比BA模型更接近于真实网络。     

一类点边同时变化的无标度复杂网络模型研究

在BA模型的基础上,提出了一个能较好描述现实复杂网络特征的无标度网络模型.该模型的节点和连边能同时发生变化,即新节点的加入和旧节点的删除,旧节点的再生连接和删除.运用连续介质理论和平均场理论建立起与之对应的演化方程,并计算出了它的严格解,导出了该模型的度分布和幂律指数的表达式.研究分析表明:该模型能自组织演化成无标度网络,其幂律指数在1~3范围内,这与现实中的许多复杂网络相吻合,因此,该模型更具有一般性.     

动态演化下的无标度网络生成算法

当无标度网络上的动力学过程导致网络结构动态演化时,随机性会破坏网络的无标度属性.为了解释动态演化下的一些网络具有无标度特征,提出一种无标度网络生成算法(SFNGA),该算法能充分考虑到现实网络随机性强的特性,结合边度优化策略,加入出生率和死亡率等参数来模拟动态演化过程,在面对节点和边的随机增加或删除时,能保证动态演化下的网络一直是无标度的.理论分析及实验结果均表明:动态演化下的无标度网络生成算法确实能在动态演化下保存网络的无标度特征,并能够抵抗随机性的干扰.     

随机-无标度统一混合演化网络模型

根据实际网络的特点,提出了一个随机-无标度统一混合演化网络模型.通过引入一个调节参数p将随机演化网络与(Barabási-Albert)无标度网络统一起来.理论计算和计算机模拟表明,当调节参数p从1变化到0时,网络结构实现了从随机演化网络到BA无标度网络的连续过渡.     

一种动态的无标度网络模型

针对BA无标度网络模型模拟现实世界的局限性,同时参考其它扩展模型的结果,提出一种新模型,该模型包含新节点的加入和旧节点的删除,旧节点之间择优的再生连接和反择优的删除连接.运用连续介质理论和平均场理论建立起与之对应的演化方程,并计算出了它的严格解,导出了该模型的度分布和幂律指数的表达式.分析结果表明该模型能自组织演化成无标度网络,其幂律指数在1-3范围内,调节参数就可与现实中的许多复杂网络的幂律指数相吻合,因此,该模型更具有一般性.     

基于节点吸引力的可调参数复杂网络模型

针对真实网络的生长演化规律,以及BA无标度网络模型和原始的节点吸引力模型在择优连接以及生成网络统计特征方面所存在的问题,综合考虑复杂网络生长演化过程中节点度和节点吸引力的择优连接特性,提出了一种基于节点吸引力的可调参数复杂网络模型. 理论研究与仿真实验分析表明,基于节点吸引力的可调参数复杂网络模型可以有效生成结构稳定并与实际网络统计特征很接近的复杂网络,通过调节模型参数可以灵活调整网络的生长演化过程. 模型生成的网络度分布仍然服从幂律分布,并且具有较高的群集系数和平均路径长度.      

基于搜索效率的复杂网络多模型并行演化分析

很多真实的复杂网络呈现无标度性．但是,这些网络为什么在增长过程中遵从优先连接规则？现有研究尚未给出有力的解释．一个合理的猜想是：这些网络如果不遵从优先连接规则,则将处于不利的地位．为证实这一猜想,采用搜索效率作为评价指标,量化评价不同演化模型的优劣．首先提出一种新的复杂网络并行演化模式,使得同一网络中不同的局部遵从不同的演化模型,从而在统一的基础上比较不同演化模型搜索效率的优劣．以BA无标度网络、WS小世界网络和随机网络为基础,构建了异质复杂网络．其次,采用随机游走搜索策略和DS最大度搜索策略,比较遵从不同演化模型的异质子网的搜索效率,力图解释复杂网络中演化模式同质化的原因．实验发现一种“信息壁垒”现象,即处于劣势的网络模型,其所属节点很难被其他模型的节点访问到．实验结果表明：对于以搜索为重要功能的复杂网络,无标度网络具有最强的适应性,从而在一定程度上解释了无标度现象在众多现实复杂网络中存在的原因．     

复杂动态网络的一种和谐统一的混合择优模型及其普适特性

为了描述真实世界是确定性与随机性的和谐统一的世界, 提出了复杂动态网络的一种和谐统一的混合择优模型, 该模型引进一个关键的总混合比作为调控参数, 实现所需的混合生长的演化复杂网络, 并把该思想方法应用于无权的和含权的3个典型模型. 数值模拟和理论分析揭示了混合复杂动态网络随混合比变化的若干普适特性, 兼备小世界效应和无标度性质, 具有应用潜力.     

一种基于社团和分层思想的无标度演化模型

针对复杂网络节点度分布服从幂律分布问题, 给出一种基于社团和分层思想的无标度演化模型. 该模型利用转轮思想和限制节点度改进了无标度模型的优先连接策略; 加入分层结构优化了无标度网络的搜索; 将局域世界模型中的局域世界思想引入到模型中, 并利用社团结构改进了局域世界模型中局域世界的不确定性问题.  理论分析证明了模型的度分布服从幂律分布, 且幂律指数可调.  模拟实验结果表明, 模型有较小的平均路径长度和较大的聚类系数,  且两层网络搜索效率优于单层网络搜索.     

节点数固定的ER网络演化模型拓扑性质的研究

复杂网络模型的研究主要集中在ER网络模型、小世界网络模型和无标度网络模型,其中ER网络模型是最经典的复杂网络模型之一。文章研究了节点数固定情况下的ER网络模型,根据网络内部边的动态演化特点,将节点数固定的网络模型进行了细分,给出了模型的生成算法,并模拟了算法生成的随机网络的平均路径长度和聚类系数。仿真结果表明,节点数固定的ER网络具有小世界特性,出现这种小世界特性的主要原因是由于网络内部边的异质性,而与网络的节点数变化没有必然联系。     

关于BCl-代数的一种结构

本文在BCI-代数中定义一种二元运算“+”:x+y=x*(x*y),讨论了与这种运算有关的代数结构中的一种.     

一个层状铅膦酸盐化合物的合成及晶体结构研究

通过水热法合成了一个新化合物,Pb3(HL)2·2H2O1,(H4L=C6H11N(CH2PO3H2)2).通过x射线单晶衍射仪测定其晶体结构.并对其进行了元素分析,红外光谱以及热重等性质测定.晶体结构研究结果表明,这个化合物属单斜晶系,空间群为C2/c,a=38.4018(8),b=7.4197(3),c=10.1180(4)(A),β=100.610(2)°,Z=4,V=2833.63(17)(A)3,最终偏差因子R1=0.0779,wR2=0.1452(对I＞2σ(I)的衍射点)和R1=0.1308,wR2=0.1752(对所有衍射点).化合物中,铅通过桥连二膦酸配体形成一个《200》有机无机杂化层,层与层之间通过范德华力相连形成超分子结构.     

一个层状铅膦酸盐化合物的合成及晶体结构研究

通过水热法合成了一个新化合物,Pb3(HL)2.2H2O1,(H4L=C6H11N(CH2PO3H2)2)。通过X射线单晶衍射仪测定其晶体结构。并对其进行了元素分析,红外光谱以及热重等性质测定。晶体结构研究结果表明,这个化合物属单斜晶系,空间群为C2/c,a=38.4018(8),b=7.4197(3),c=10.1180(4),β=100.610(2)°,Z=4,V=2833.63(17)3,最终偏差因子R1=0.0779,wR2=0.1452(对I>2(σI)的衍射点)和R1=0.1308,wR2=0.1752(对所有衍射点)。化合物中,铅通过桥连二膦酸配体形成一个<200>有机无机杂化层,层与层之间通过范德华力相连形成超分子结构。     

X-ray structure of a bacterial oligosaccharyltransferase

Asparagine-linked glycosylation is a post-translational modification of proteins containing the conserved sequence motif Asn-X-Ser/Thr. The attachment of oligosaccharides is implicated in diverse processes such as protein folding and quality control, organism development or host-pathogen interactions. The reaction is catalysed by oligosaccharyltransferase (OST), a membrane protein complex located in the endoplasmic reticulum. The central, catalytic enzyme of OST is the STT3 subunit, which has homologues in bacteria and archaea. Here we report the X-ray structure of a bacterial OST, the PglB protein of Campylobacter lari, in complex with an acceptor peptide. The structure defines the fold of STT3 proteins and provides insight into glycosylation sequon recognition and amide nitrogen activation, both of which are prerequisites for the formation of the N-glycosidic linkage. We also identified and validated catalytically important, acidic amino acid residues. Our results provide the molecular basis for understanding the mechanism of N-linked glycosylation.     

X-ray structure of a protein-conducting channel

A conserved heterotrimeric membrane protein complex, the Sec61 or SecY complex, forms a protein-conducting channel, allowing polypeptides to be transferred across or integrated into membranes. We report the crystal structure of the complex from Methanococcus jannaschii at a resolution of 3.2 A. The structure suggests that one copy of the heterotrimer serves as a functional translocation channel. The alpha-subunit has two linked halves, transmembrane segments 1-5 and 6-10, clamped together by the gamma-subunit. A cytoplasmic funnel leading into the channel is plugged by a short helix. Plug displacement can open the channel into an 'hourglass' with a ring of hydrophobic residues at its constriction. This ring may form a seal around the translocating polypeptide, hindering the permeation of other molecules. The structure also suggests mechanisms for signal-sequence recognition and for the lateral exit of transmembrane segments of nascent membrane proteins into lipid, and indicates binding sites for partners that provide the driving force for translocation.     

Crystal structure of a dUTPase.

The enzyme dUTPase catalyses the hydrolysis of dUTP and maintains a low intracellular concentration of dUTP so that uracil cannot be incorporated into DNA. dUTPase from Escherichia coli is strictly specific for its dUTP substrate, the active site discriminating between nucleotides with respect to the sugar moiety as well as the pyrimidine base. Here we report the three-dimensional structure of E. coli dUTPase determined by X-ray crystallography at a resolution of 1.9 A. The enzyme is a symmetrical trimer, and of the 152 amino acid residues in the subunit, the first 136 are visible in the crystal structure. The tertiary structure resembles a jelly-roll fold and does not show the 'classical' nucleotide-binding domain. In the quaternary structure there is a complex interaction between the subunits that may be important in catalysis. This possibility is supported by the location of conserved elements in the sequence.     

组合柔性结构的结构特征对其变形特性的影响

对柔性铰链与杆组成的组合柔性结构的结构特征进行了研究,认为柔性铰链与杆二者的厚度比、长度比是影响组合柔性结构变形特性的两个特征参数.以一组不同结构尺寸的组合柔性结构为例,分别采用有限元法与伪刚体模型法对其变形进行对比,分析了组合柔性结构的厚度比、长度比对其变形特性的影响;根据特征参数不同取值对组合柔性结构变形特性的影响结果,对组合柔性结构进行了分类.     

仿生跳跃机器人弹跳结构设计

以蚂蚱弹跳为依据，设计了一种仿蚂蚱跳跃功能结构，利用Solidworks以及ADAMS完成结构动态仿真，并按照仿真结构进行零部件的装配及模型跳跃实验。实验证明，弹跳高度可以达到预期要求。