小分子RNA干扰技术的原理和应用前景

和传统基因抑制工具(如反义寡核苷酸和核酶技术等)比较,RNA干扰是源自细胞的内在的基因沉默机制,抑制基因表达具有广泛、高效和特异等优点.简要阐述了RNA干扰在基因功能分析中的作用和在疾病治疗中的应用前景.     

锐顶镰孢菌Fusarium acuminatum小RNA的鉴定与分析

用高通量测序技术分析了Fusarium acuminatum细胞内小RNA的组成、长度分布、碱基偏好性、分类以及潜在的调控靶标,预测了11个新的miRNAs和6 503个潜在的siRNAs.其中,miRNAs的靶基因多定位于膜组织,具有催化或结合活性,主要与代谢相关.研究结果为农业生产中合理有效防治F.acuminatum引起的病害提供了理论基础.     

核仁小分子RNA及其基因组织形式

核仁小分子RNA(snoRNA)是非编码RNA中研究得最多,了解得最详细的成员之一。依据snoRNA保守的序列和结构元件可将其分成三类:box C/D snoRNA,box H/ACA snoRNA以及MRP RNA。它们的主要功能分别为指导rRNA或snRNA中特异位点的2′-O-核糖甲基化修饰、假尿嘧啶化修饰或作为分子伴侣参与靶标RNA高级结构的形成。目前发现的snoRNA基因组织主要有四种形式:独立基因编码的snoRNA、内含子编码的snoRNA、多顺反子snoRNA基因簇和内含子编码的snoRNA基因簇。但是,并不是每种生物都具有这四种基因组织形式。大多数脊椎动物的snoRNA产生于蛋白质基因的内含子中,植物snoRNA基因多以基因簇的形式存在,大部分酵母snoRNA由独立基因编码,锥体虫snoRNA以多顺反子形式存在,果蝇snoRNA基因都位于宿主基因的内含子中。随着对snoRNA研究工作的不断深入,snoRNA基因组织形式也呈现出前所未有的复杂性和多样性。     

国际RNA的基础和应用研究近况

RNA分子将有望在不久的将来成为制服病毒和癌症的强大工具.20世纪80年代核酶(ribozyme)的发现,使RNA的研究进入了一个崭新的时代,利用RNA分子作为防病治病的工具已成为可能.最近,siRNA的发现,使RNA的研究推向顶峰.文中对国际上RNA研究的现状进行了综述.     

非编码RNA研究进展

多年来,人们已经清楚的认识了一系列结构RNA和调节RNA。最近,由Tuschel,Bartel和Ambro实验室发表的一系列文章里,记述了这些结构RNA和调节RNA外,还包括有许多最近发现的仅由22个核苷酸组成的微小RNA(miRNA)的研究前景。由于这些RNA不编码蛋白质,所以统称为非编码RNA(ncRNA)。最近的研究表明,ncRNA比以前所想像的要丰富和重要的多,它们在转录调节,染色体复制,RNA加工、修饰,mRNA稳定性和翻译,甚至蛋白质降解和转运过程中都起作用。本文就对ncRNA的研究进展和最近发现的miRNA作一简要综述。     

RNA干涉

RNA干涉是指双链RNA引发的同源mRNA的降解过程,由于其多发生于转录水平,因此又称为转录后基因沉默。RNA干涉现象是在线虫中首次发现的,通过几年的研究发现它广泛存在于生物体中(包括单细胞生物、后生动物和哺乳动物)。本文对RNA干涉现象的发现、作用机制、相关基因等作了简单的论述。     

非编码RNA在肌肉生长发育中的调控作用研究进展

非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)在肌肉生长发育过程中发挥着重要的作用,参与调控骨骼肌干细胞的增殖、分化和肌纤维的肥大等过程.利用30篇文献综述了3类非编码RNA(长链非编码RNA、miRNA和环状RNA)在骨骼肌生长发育中的最新研究进展,旨在为肌肉疾病的治疗和农业动物生产性能的改良提供新思路.     

ClSnoRNA,水稻中的一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻中发现一种新的核仁小分子ＲＮＡ：ＣｌＳｎｏＲＮＡ。该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补。     

碳家族中的新成员

简要回顾了富勒烯的发现和研究进程，阐述了巴基球高度完美的结构特征和奇妙诱人的物理化学性质，展望了碳家族新成员及其衍生物广阔的应用前景，分析了对未来科学发展的重大意义，并通过对富勒烯发现过程的考察，总结了人类科学认识上的某些规律性和由此引发的种种思考。     

病毒编码的RNA沉默抑制子的特征及其生物技术应用

RNA沉默是一种依赖核酸序列特异性的RNA降解过程,是动物、植物抵抗病毒等外源核酸的一种保守防御机制。而针对寄主的这种防御机制,许多病毒演化出RNA沉默抑制子以克服这种防御反应。本文综述了几种动物、植物病毒抑制子的结构和作用方式,讨论了病毒抑制子之间的交叉抑制功能,病毒运动和沉默抑制子之间的关系,病毒RNA和亚病毒寄生物通过沉默抑制子而进行的自我保护原理,抑制子对于miRNA（microRNA）途径的影响以及病毒抑制子在生物技术方面的应用。     

MicroRNA特征与功能

通过分析总结现代分子生物学国际前沿microRNA(miRNA)领域的研究文献，整理出miRNA研究的基本脉络和走向。miRNA是一类长度～22nt的非编码小分子RNA，在包括线虫、果绳、家鼠、人体以及拟南芥等生物中普遍存在；它在调节基因转录与表达，调控生物体正常发育等生理过程中扮演重要角色。从比较的角度出发，揭示了miRNA与小干扰RNA在其代谢与功能方面共用某些途径，相互交叉与替代，可能同属一个更广范围的小分子RNA介导的生理调控机制。miRNA的研究可能对新一代基因药物的开发具有深远意义。     

RNA干涉及其在肿瘤研究中的应用

RNAi是双链RNA介导的转录后基因沉默的过程,是一种高效的高特异性抑制基因表达的新途径。通过双链小干涉RNA(siRNA)与一系列蛋白质结合形成siRNA诱导的沉默复合体(RISC)并活化,然后,RISC对靶基因进行识别、降解。与反义方法相比,siRNA具有更好的抑制效果。RNAi的应用将为癌症的基因治疗提供新的方法。     

酿酒酵母中一种新的反义snoRNA分子的鉴定

核仁小分子ＲＮＡ（ｓｎｏＲＮＡ）是一类在真核生物核糖体生物合成过程中起重要作用的小分子ＲＮＡ．通过计算机直接分析国际分子生物学数据库及ＲＮＡ杂交分析、ｃＤＮＡ序列测定等方法,在酿酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中发现和鉴定了１个新的ｓｎｏＲＮＡ－Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ．该ｓｎｏＲＮＡ长１０９个核苷酸,由位于酿酒酵母第１３号染色体上的１个独立基因编码．Ｚ６ｓｎｏＲＮＡ含有ｂｏｘＣ（ＵＧＡＵＧＡ）、ｂｏｘＤ（ＣＵＧＡ）等保守的结构元素,属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,即分子中有１段１１个核苷酸的片段与２５ＳｒＲＮＡ中１段保守核心序列互补,该ｓｎｏＲＮＡ片段连同其下游的ｂｏｘＤ共同指导与其互补的ｒＲＮＡ序列第２１９５位胞苷酸的２’－氧－核糖的甲基化．     

反义RNA技术及其在农业领域的应用

介绍了反义RNA的概念及作用机理,对反义RNA技术及其在农业领域的应用进行了概述．反义RNA技术是借助基因重组技术,根据碱基互补原理,用人工合成或生物体合成的特定RNA片段（或其化学修饰物）抑制或封闭基因表达的技术。在农业领域反义RNA技术主要应用于果实性状及品质的调控,对观赏植物性状的调控,植物抗病,控制油料种子中脂肪酸的合成,控制雄性不育,降低或去除食物中有害化学成分等方面其功能获得可靠的成效．     

人RNA解旋酶基因家族新成员DVH的克隆与初步功能研究

一条长3446bp 的人类新基因cDNA已从胎脑cDNA文库中被克隆,该cDNA克隆包长2583bp的开放读框,推测编码一条长860个氨基酸残基的蛋白质,预测分子质量为96．8ku,通过同源性比较及profile搜索,预测氨基酸序列显示出DExH-BOX RNA解旋酶基因家族特有的7保守基序及已知RNA解旋酶氨基酸序列的较高同源性,进一步通过蛋白质结构模型同已知RNA解旋酶结构的比较,可以认定其为一条人类RNA解旋酶基因家族新成员,通过基因编码的氨基酸序列中基序II D－E－V－H残基将其命名为DVH（DEVHbox Helicase),生物信息学手段结合DVH基因表达谱分析结果可推定DVH可能在胎儿发育过程中起作用,由于解旋基因家族同人类遗传疾病关系密切,以上结果可指导DVH基因的进一步功能研究并提示该,基因作为疾病侯选基因的可能性。     

Regulation of microRNA on plant development and viral infection

THE FIRST MIRNA WAS IDENTIFIED IN C. ELEGANS AS EARLY AS IN 1993; THE IMPORTANCE OF MIRNAS, HOWEVER, IS RECOGNIZED ONLY RECENTLY AFTER THE DISCOVERY OF MIRNAS EXISTING UNIVERSALLY IN EUKARYOTIC ORGANISMS. THE SECOND MIRNA WAS IDENTIFIED IN 2000[1]. SINCE …     

RNAi技术及其在基因组学研究中的应用

RNA干扰（RNA interference,RNAi）是一种真核生物体内的基因调控机制．在介绍RNAi的作用机制及作用特点的基础上,综述了其在基因功能研究、基因组免疫系统、人类疾病的基因治疗及水产养殖病害的防治等基因组学研究领域的最新进展与应用．     

细菌中小RNA靶标识别的研究进展

细菌的小RNA（small RNA,sRNA）是一类长度在50~500nt之间的RNA分子,目前已在细菌内发现150多种sRNA.随着越来越多的sRNA被证实,识别sRNA的靶标进而研究sRNA的功能已具有越来越重要的意义.目前,对sRNA靶标的研究主要采用生物信息学预测结合分子生物学实验的方法.本文就细菌中sRNA靶标识别方法的研究进展做一简要综述.     

从两栖类少量胚胎细胞中快速制备细胞质RNA

介绍一种用于从两栖类动物少量胚胎细胞中快速制备细胞质RNA的简便方法。首先利用NP-40溶解细胞,去掉细胞核后的细胞质溶解物用SDS及尿素变性处理蛋白质,酚提后即可从上相中用酒精沉淀出细胞质RNA。整个制备过程可在微离心管中进行,1h左右可完成。由此法制备的细胞质RNA,可用于各种目的的分析。     

siRNA对肺癌细胞株NCI-H460 bcl-2基因表达的影响

目的:研究siRNA (smallinterferenceRNA)对大细胞肺癌细胞株NCI -H4 6 0bcl- 2基因表达的影响。方法:利用Ambion公司提供的设计软件和试剂盒,设计合成以bcl - 2基因为靶标的siRNA ,通过脂质体将合成的siRNA转入NCI-H4 6 0细胞株,设置转染bcl- 2反义药物G3139和空白两对照组。用MTT法检测siRNA对细胞生长的作用;流式细胞仪检测细胞周期的改变和Bcl- 2蛋白表达;RT -PCR检测bcl- 2mRNA水平。结果:siRNA组与对照组细胞存活率均有显著性差异(P <0 0 5 ) ;siRNA组bcl- 2的mRNA明显低于对照组和反义组(P <0 0 5 ) ;siRNA组Bcl- 2蛋白阳性率明显低于对照组和反义组,siRNA组以及反义组细胞阻滞于S期。结论:体外转录合成的siRNA可抑制NCI-H4 6 0细胞bcl- 2基因的表达,抑制率可达5 0 %以上。