ABCA1基因R1587K多态性在广西汉族与壮族人群中的分布

为探讨ABCA1基因R1587K单核苷酸多态性(SNP)在中国广西汉族与壮族人群中的多态性分布,采用聚合酶链-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对无血缘关系的健康汉族人100例和壮族人84例的ABCA1基因R1587K位点进行检测,分析基因型频率和等位基因频率在2组人群中的分布,并与其他种族相比较.结果表明,ABCA1基因R1587K等位基因频率在汉族分别为ηR=0.475和ηR=0.525,壮族中分别为ηR=0.411和ηK=0.589;基因型频率在汉族分别为:ηRR=0.19,ηRK=0.57,ηKK=0.24,壮族分别为:ηRR=0.25,ηRK=0.32,ηKK=0.43.2组人群的基因型频率分布无显著性差异(P＞0.05),2组人群在等位基因频率分布上也无统计学差异(P＞0.05).可见,ABCA1基因R1587K位点多态性在中国广西汉族与壮族的基因型频率分布无统计学差异,与国外不同种族人群相比具显著性差异.     

华南地区汉族人群MDR1基因单核苷酸多态性研究

 多药耐药基因1（MDR1）单核苷酸多态性（SNP）与疾病的易感性、药物治疗效果以及患者的生存复发等预后密切相关。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）方法,对华南地区无亲缘关系的汉族人群MDR1基因编码区及部分启动子区进行SNP筛查,并比较不同人种间等位基因频率的差异。结果共检测出5个多态位点：T-2410C、T-129C、C1236T、G2677T/A和C3435T,其等位基因频率-2410C为4.65%,-129C为3.11%,1236T为63.31%,2677T为44.66%,2677A为14.47%,3435T为41.18%。除T-2410C位点因报道的太少无法比较外,其余位点等位基因频率在东亚、高加索以及非洲人群中的分布存在显著差异。该研究为进一步研究华南地区汉族人群MDR1基因SNP与药物效果、药物毒副作用以及疾病易感性之间的相关性提供依据。     

中国汉族人群线粒体DNA单倍群与尿酸水平的关联研究

尿酸(UA)是人体内嘌呤核苷酸代谢的最终产物,与多种慢性疾病相关。因线粒体处于人体代谢的核心位置,线粒体DNA变异可能影响血液中尿酸水平。本研究对来自广西南宁、江苏泰州和河南郑州的3个中国汉族人群共计2 837例样本(其中男性样本1 112例、女性样本1 725例)进行分析,对样本初始的UA值矫正了性别和年龄因素。本研究根据线粒体DNA的变异将受试者分为16种基础单倍群,通过比较每个单倍群样本和其他样本的UA水平差异,探索线粒体单倍群和UA的相关性。在总体3个汉族人群中,M8单倍群的UA矫正值((310.5±87.2)μmol/L)显著低于其他单倍群((326.1±80.6)μmol/L,P=0.02),B5单倍群的UA矫正值((338.8±72.5)μmol/L)显著高于其他单倍群((324.9±81.2)μmol/L,P=0.01)。本研究结合后续分析发现,在总人群、南宁人群和泰州人群女性数据中,M8单倍群均与低UA水平显著相关;在总人群和女性数据中,B5单倍群与高UA水平显著相关。综上所述,本研究在中国汉族人群中发现了与UA水平显著相关的线粒体单倍群,为后续线粒体DNA变异在尿酸...     

EXO1基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究

胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCR-RFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797、rs1635498和rs1776148五个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点进行多态检测.结果采用SPSS16.0、PHASE、HaploView4.2软件进行数据统计分析,用Logistic模型在95%置信区间内进行相关性风险度测算.结果显示,位于EXO1基因5UTR的位点rs1635517的CC基因型携带者和C等位基因携带者患胃癌的相对风险度显著升高(p＜0.05),提示该多态位点可能与胃癌发生相关.其余4个位点虽检测到多态,但它们的基因型和等位基因频率在病例和对照中无显著差异,提示这4个位点可能与云南汉族人群的胃癌发生不相关.     

基因单核苷酸多态性与云南汉族人群胃癌的相关性研究

 胃癌是一种由基因和环境因素相互作用、在世界范围内最常见的恶性肿瘤之一.该研究用PCR-RFLP的方法,在270名健康对照个体和239名胃癌患者共509人的云南汉族人群中,对核酸外切酶1(exonuclease 1,EXO1)基因rs1635517、rs1776177、rs851797、rs1635498和rs1776148五个单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms,SNPs）位点进行多态检测.结果采用SPSS16.0、PHASE、HaploView4.2软件进行数据统计分析,用Logistic模型在95%置信区间内进行相关性风险度测算.结果显示,位于EXO1基因5’UTR的位点rs1635517的CC基因型携带者和C等位基因携带者患胃癌的相对风险度显著升高（p＜0.05）,提示该多态位点可能与胃癌发生相关.其余4个位点虽检测到多态,但它们的基因型和等位基因频率在病例和对照中无显著差异,提示这4个位点可能与云南汉族人群的胃癌发生不相关.     

广东汉族人群LDL受体基因PvuⅡ多态性位点的研究

建立了ＬＤＬ受体基因内含子１５ｐｖｕⅡ多态性位点的ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术．利用该技术从人类外周血基因组ＤＮＡ中分离到一个长为０．８１ｋｂ的片段,核酸序列测定证明分离的片段是ＬＤＬ受体基因内含子１５．对广东汉族人群内含子１５的ＰｖｕⅡ位点多态性状况进行了研究,实验显示：广东汉族人群ＬＤＬ受体基因中存在着ＰｖｕⅡ多态性位点;２１２个ＬＤＬ受体等位基因ＰｖｕⅡ酶切位点出现的频率为０．１６,说明ＰｖｕⅡ多态性位点可以作为广东人群的遗传标记．     

云南籍正常人群和肺癌人群GSTM1基因型多态性的比较研究

实验采用聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction PCR)技术对云南籍正常人和肺癌人群的GSTM1基因型多态性进行了检测，GSTM1基因纯合缺失（GSTM10／0）在正常人群中的分布频率为65．85（n=99)，而在肺癌人群中分布频率为76．8％（n=56)，结果表明GSTM1基因型多态性在云南籍正常人群和肺癌人群中的分布频率无显著性差异，本研究为进一步寻找云南人群肺癌遗传易感因子奠定了基础。     

中国北方汉族人群PPAR6基因C／T多态研究

为研究中国汉族群体PPARδ基因C294T酶切位点的遗传多态性以及该位点的具体多态形式,采用PCR-RFLP技术对329例无血缘关系的健康中国北方汉族人的染色体进行检测．用卡方检验对所得等位基因频率、基因型频率进行分析,实验结果与其他种族进行比较．结果显示C294T位点存在多态性,等位基因频率rc=25．9％,rT=74．1％;基因型频率rc/c=6．1％,rc/T=39．8％,rT／T=54．1％;经卡方检验符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;认为中国汉族群体PPARδ基因C294T酶切位点也具有遗传多态性．其基因型频率和等位基因频率在男女间没有显著性差异,与德国人群有显著性差异;与瑞典人群相比有极显著差异,而与韩国人相比没有显著性差异．     

中国北方汉族人群PPARδ基因C/T多态研究

为研究中国汉族群体PPARδ基因C294T酶切位点的遗传多态性以及该位点的具体多态形式,采用PCR-RFLP技术对329例无血缘关系的健康中国北方汉族人的染色体进行检测.用卡方检验对所得等位基因频率、基因型频率进行分析,实验结果与其他种族进行比较.结果显示C294T位点存在多态性,等位基因频率rC=25.9%,rT=74.1%;基因型频率rC/C=6.1%,rC/T=39.8%,rT/T=54.1%;经卡方检验符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;认为中国汉族群体PPARδ基因C294T酶切位点也具有遗传多态性.其基因型频率和等位基因频率在男女间没有显著性差异,与德国人群有显著性差异;与瑞典人群相比有极显著差异,而与韩国人相比没有显著性差异.     

TGF-β1 rs1800469基因多态性与新疆汉族原发性高血压的相关性研究

为研究转化生长因子β1(TGF-β1)基因单核苷酸多态(SNP)rs1800469及血浆水平与新疆汉族原发性高血压(EH)的关系。采用整群抽取随机抽样的方式,以新疆沙湾县732名汉族人(EH组365人,对照组367人)为研究对象,进行流行病学调查和临床检查,并采集血样。用双抗体夹心法(ELISA试剂盒)测量TGF-β1血浆浓度。SNaPshot方法进行基因分型。rs1800469基因型及等位基因在EH组和对照组分布差异无显著性(P0.05)。TGF-β1血浆水平在EH组与对照组各基因型和等位基因之间无差异(P0.05)。结果表明:在新疆汉族人群中TGF-β1基因rs1800469位点存在C/T分子变异,与原发性高血压缺乏关联。同时TGF-β1基因rs1800469位点多态性与TGF-β1血浆水平不相关。     

Family-based association study of ZNF533, DOCK4 and IMMP2L gene polymorphisms linked to autism in a northeastern Chinese Han population

Objective： A study in a Caucasian population has identified two single-nucleotide polymorphisms （SNPs） in ZNF533, one in DOCK4, and two in IMMP2L, which were all significantly associated with autism. They are located in AUTS1 and AUTS5, which have been identified as autism susceptibility loci in several genome-wide screens. The present study aimed to investigate whether ZNF533, DOCK4, and IMMP2L genes are also associated with autism in a northeastern Chinese Han population. Methods： We performed a similar association study using families with three individuals （one autistic child and two unaffected parents）. A family-based transmission disequilibrium test （TDT） was used to analyze the results. Results： There were significant associations between autism and the two SNPs of ZNF533 gene （rs11885327： X^2=4.5200, P=0.0335; rs1964081 ：）（2=4.2610, P=0.0390） and the SNP of DOCK4 gene （rs2217262 X^2=5.3430, P=0.0208）. Conclusions： Our data suggest that ZNF533 and DOCK4 genes are linked to a predisposition to autism in the northeastern Chinese Han population.     

MC1R天然拮抗剂的高通量初步筛选

为了寻找高效稳定的黑色素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor, MC1R)的拮抗剂,利用作者前期工作中建立的高通量筛选方法对 1 000种中草药提取物进行了筛选,并检测了这些提取物对小鼠B16-F1细胞系黑色素生成量的影响.结果表明,补骨脂等10种粗提物具有拮抗促黑激素（MSH）激活MC1R的作用.其中,补骨脂、破茎松萝、桑根和太白树粗提物能明显降低B16-F1细胞的产黑色素能力,但其机制有所不同,补骨脂主要作用于MSH对C1R的激活过程,而其余3种提取物基本上直接作用于cAMP通路.本实验为利用上述中草药调控皮肤细胞中的黑色素生成提供了初步线索.     

DRD3基因多态性与精神分裂症的相关性研究

目的 :研究多巴胺D3受体 (DRD3)基因的多态性与精神分裂症的关系。方法 :应用PCR -RFLP技术 ,在90名无亲缘关系的正常汉族人和80名精神分裂症患者中对DRD3基因第一外显子内Ser9Gly多态性进行分析。结果 :正常汉族人群中 ,DRD3等位基因1(Ser)和2(Gly)的频率分别为0.71和0.29。在正常对照组和精神分裂症组之间 ,等位基因频率 (X2=0.02,υ=1,P>0.05)和各种基因型 (P值均大于0.05)分布无显著性差异。结论 :DRD3基因的Ser9Gly多态性与中国汉族人群精神分裂症不相关。     

Y-STR多态与民族的演化

Y染色体由于其非重组和父系遗传等特征在揭示父系谱系方面发挥着重要的作用.可利用Y-STR来研究各种人种、民族及人群起源、进化、迁徙和融合,追溯父系祖先的演化历史.对Y-STR的特性和它们在民族的起源与演化中的作用进行了综述.     

北京地区汉族群体D1S1612 STR基因座的遗传多态性

目的首次调查中国北京地区汉族群体D1S1612基因座的等位基因频率分布.方法采用扩增片段长度多态性(Amp-FLP)分型技术对D1S1612 STR基因座进行检测.结果D1S1612检出9个等位基因,25种基因型.其STR基因座基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.01).个人识别机率(DP)为0.901～0.927.结论D1S1612 STR基因座属高杂合度、高识别能力的遗传标记,可用于法庭科学亲子鉴定和个人识别.     

High resolution linkage disequilibrium and haplotype maps for the genes in the centromeric region of chromosome 15 in Tibetans and comparisons with Han population

WITH THE SUCCESSFUL COMPLETION OF THE HUMAN GE- NOME PROJECT, ONE OF THE SCIENTIFIC MILESTONES, GENETIC VARIATIONS AND THEIR FUNCTIONAL IMPLICATIONS, HAVE BE- COME ONE OF THE FOCUSES IN GENOME RESEARCH. IT HAS BEEN KNOWN THAT GENETIC VARIATIONS, TOGETHER WITH ENVI- RONMENT, ARE RESPONSIBLE FOR THE DIFFERENCES IN COMPLEX TRAITS IN INDIVIDUALS: PHYSICAL CHARACTERISTICS, DISE…     

Functional analysis of DNA 4 coding region from a Chinese Zhangzhou isolate of banana bunchy top virus

The DNA 4 coding region of banana bunchy top virus from a Chinese Zhangzhou isolate (BBTV-ZZ) is cloned by PCR. The sequencing analysis shows that it is 351 nucleotides long and it putatively encodes a protein of 116 amino acids. On the basis of a plant binary vector pBin438, the plant expression vector pBBTV-4B harboring the BBTV-ZZ DNA 4 coding region has been constructed and then transferred to tobacco (Nicotiana tobacum cv. Xanthi nc) by a Agrobacterium-mediated procedure. Under insect-free condition, movement-defective mutant of CMV-Fny strain (CMV-Fny-△MP) is mechanically inoculated on the lower leaves of transgenic plants. Systemic symptoms with different degrees of severity are developed in the upper uninoculated leaves of transgenic plants at 12 days postinoculation (dpi), while no symptoms can be seen in the uninoculated leaves of untransformed plants at any time. Accumulation of CMV-Fny is detected on the upper uninoculated leaves of transgenic plants, but is not on that of untransformed plants by indirect double antibody sandwich enzyme-link immunosorbent assay (DAS-ELISA). The results reveal that transgenic plants have acquired the property of cell-to-cell movement and systemic spread of CMV-Fny-△MP. This suggests that the protein encoded by BBTV-ZZ DNA 4 might have function of viral movement protein.     

PAK3基因rs17327273位点多态性与秦巴山区精神发育迟滞的相关性研究

目的探究PAK3(p21-activated kinase 3)基因与精神发育迟滞(mental retardation,MR)之间可能的相关性。方法采用病例-对照研究,利用PCR-SSCP方法对PAK3基因rs17327273位点多态性与秦巴山区儿童精神发育迟滞之间进行了相关性分析。结果对rs17327273多态位点GG,GC和CC3种基因型频率进行Hardy-Weinberg平衡检验,3种基因型在总体人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=6.793,df=3,P0.05),并由总体人群计算得等位基因频率:G,0.773;C,0.217。基因型频率为:XGY,0.392;XCY,0.108;XGXG,0.306;XGXC,0.170;XCXC,0.024。分析显示,等位基因及基因型在病例组、边缘组与对照组之间的分布上均无显著性差异,等位基因在各组内性别之间亦无显著性差异(P0.05)。结论PAK3基因rs17327273位点多态性与秦巴山区精神发育迟滞之间无显著相关性。