“我喜欢鲜明观点、幽默风趣的小说”——天体物理学家肖恩·卡罗尔访谈录

肖恩·卡罗尔（Sean Carroll，下图），加州理工学院从事理论物理研究的天体物理学家，也是“Cosmic Variance”博客的创建者，他的新书《从这里到永恒》最近由多顿出版社出版。工作之余，卡罗尔的一大喜好是读书，为此，《美国科学家》杂志不久前采访了他，话题围绕对一些书的评价和其对人产生的影响，等等。以下是这次的访谈内容。     

《自然》2020年度最佳科学图片

正新冠肺炎大流行令2020年非比寻常。人们对科学领域的关注被病毒、疫情和疫苗分去一大部分,但实际上这一年有很多其他出彩的科学成果问世,同样值得瞩目。《自然》的视觉团队精心评选出了2020年度最佳科学图片,以下展示其中9幅图片。第七种冠状病毒新冠病毒引发了毁灭性的全球疫情,是2020年当仁不让的"超级反派"。SARS-CoV-2是目前已知能感染人类的第7种冠状病毒。     

为人处世杂谈

从失败中学习 在当今竞争日益激烈的社会,失败的例于可谓俯拾即是,有的是求学失败,有的是事业失败,有的是交友失败……细究起来,几乎无人没有遭受过失败的痛苦。 面对失败,大多数人都会希望尽可能从自己的脑海里将其排除掉,越快将其忘却,才能越快摆脱失败的阴影。可是,失败却像没有被斩草除根的野草一样,即使暂且忘却     

基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析

SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒已被世界卫生组织确认为SARS传染病的病原体, 它的全基因组测序工作分别由中国、加拿大、美国等国的研究小组完成. 然而它的起源仍是一个谜. 为了探寻SARS冠状病毒的来源, 基于FDOD(function of degree of disagreement)方法, 对12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒进行了全基因组比较, 构造出种系进化无根树. 结果表明, 这两类病毒(分别由12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒构成)虽然都来自冠状病毒属, 但它们位于两个不同的进化分支上. 冠状病毒属中的3个组被准确地重构. 根据得到的结果, 推测SARS冠状病毒更类似于第一组中的冠状病毒. 根据种系进化树的拓扑结构和各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系, 推测各SARS冠状病毒分离株分别位于进化树上两个大的分支, 这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息.     

新型冠状病毒的“身份证”信息

正2020年春节,迫使大家都闭门在家的新型冠状病毒究竟是一种怎样的病毒?根据科学家的研究,我们给它编制了一张"身份证"。让我们一起来看看相关信息。姓名:新型冠状病毒新型冠状病毒可以简称为"新冠病毒"。冠状病毒是个大家族。这个家族目前有15个"兄弟",其中有7个可以感染人类。在这7种可以感染人类的冠状病毒中,新冠病毒的年龄最小,它的6个"哥哥"分别是:     

对待高风险病毒,如何防患于未然

正非营利组织"生态健康联盟"(Eco Health Alliance)主席彼得·达扎克(Peter Daszak)接受了《科学家》杂志肖娜·威廉姆斯(Shawna Williams)的采访,这位深耕传染病领域的科学家对中国和其他地区的新型病毒进行了广泛、大量的研究。此次访谈,他就诸如冠状病毒等病原体如何跨跃物种传播以及如何防止下一次大规模流行病暴发的话题发表了观点。     

好气性分解纤维素细菌的分离和检定

分解纖維細菌有的是好气性的,有的是嫌气性的,有的是嗜高温的(60℃以上)。通常把高温分解纖維素的过程,不論其是好气性的或是嫌气性的,一律算作是嫌气性过程,因此所謂好气性分解纖維素細菌,就其最适的温度來講,仅限于嗜中温性的。     

拉里•布里连恩特评COVID-19战事

正我时常会觉得第一次就新型冠状病毒采访拉里·布里连恩特(Larry Brilliant)已经是很久以前的事情了。实际上,与当时75岁的布里连恩特对话才过去三个月。这位参与消灭了天花的流行病学家多年来警告人类要注意世界范围的流行病肆虐。2011年,他通过担任电影《传染病》(Contagion)的科     

病毒的猎手病毒学家阿尔伯特·奥斯特豪斯访谈录

阿尔伯特·奥斯特豪斯(Al-bert Osterhaus)1978年毕业于荷兰乌得勒支大学,并获得病毒学博士学位。毕业后,就职于荷兰国家公共卫生和环境研究院,在那里他作为一个病毒收藏家而名声远扬,并且负责确保用猴子和兔的肾细胞生产的疫苗不含任何病毒。他也是世界上首批证实冠状病毒是导致SAR S元凶的科学家之一。现在,他在伊拉兹马斯大学领导着一个100多人的实验室,在鹿特丹拥有两家生物技术公司,他的研发机构是全球生物协作机构的一部分。以下是他接受英国《新科学家》杂志采访的内容。     

病毒“收藏家”艾伯特·奥斯特豪斯

在4月初之前,人人都怀疑一种新发现的冠状病毒是引起严重急性呼吸道综合症(SARS)的病因。为了加以证实,研究人员必须用这种病毒去感染动物,以此观察动物是否会得病,或得病后在体内是否会产生SARS病毒。换句话说,他们必须满足柯赫氏定律。 这一动物实验最终由荷兰鹿特丹伊斯默斯大学医学中心的病毒学家艾伯特·奥斯特豪斯(Albert Osterh-aus)等人完成。他们在严格的生物安全条件下用冠状病毒感染猴子,然后解剖猴子以便仔细研究它们的     

拥抱"中国华尔街"--上海陆家嘴外籍白领生活扫描

上海陆家嘴金融区,人称“中国的华尔街”。这里外资机构密布,居住着来自美、英、法、日、德等50多个国家的外商界精英8 000多人。他们有的是跨国公司的高级职员,有的是星级酒店的老板,有的是外企驻华商务代表,每年拿着数目惊人的薪金,住着豪华高档别墅,堪称“金领淘金者”。他们在申城的工作和家庭生活情况如何呢?2002年新年前夕,记者在朋友介绍下,走进这个神秘的“洋人部     

贯徹百家爭鳴 開展學術活動

我們的学术活动是多种多样的,就活动的范围来分类,有的是題目組的,有的是研究室的,有的是全所性的,有的是全国性的。一般說来,这些活动是根据工作的成熟程度、貭量和水平的高低来分級的,同时也根据这些条件予以“升格”。例如,当某些工作报告已具备一定水平时,就提到研究室范围来討論;而根据研究室的推荐,又将某些具有較高貭量和能吸引較多同志注意力的学术报告提到全所进行学术討論。至于全国性学术报告会,则邀请全国“同行”来参加,包括上級領导机关、高等学校、产业部門及厂矿、研究     

疫病的全球化与人类文明进步

正1965年,英国医学研究委员会普通感冒中心负责人、病毒学家泰瑞尔(D. Tyrrell)的团队从一位患感冒的成年人的呼吸道中捕获了一种名为B814的可传播病毒,该论文发表在1966年1月的《柳叶刀》上,它被认为是第一篇冠状病毒的论文。60年代末期至70年代,泰瑞尔带领一群病毒学家一直在从事这项人类毒株和动物病毒的研究,1975年5月,泰瑞尔团队在《国际病毒学》上介绍了其研究的新进展,这种新病毒呈冠状外观,正式命名为冠状(corona)病毒。研究发现,在温带地区,呼吸道冠状病毒感染多发生在冬季和春季。2003年出现的SARS就属于冠状病毒,至2005年,病毒学家在全世界已经发现了5种新的人类冠状病毒。     

新型冠状病毒肺炎: 认知与思考

正概述新型冠状病毒肺炎是一种急性感染性肺炎,其病原体是一种先前未在人类发现的新型冠状病毒,即2019新型冠状病毒(2019 Novel Corona Virus,2019-nCoV)。2020年2月7日,中国国家卫健委决定将"新型冠状病毒感染引起的肺炎"暂命名为"新型冠状病毒肺炎"。2月11日,世界卫生组织(WHO)将其英文名称命名为CoronaVirus Disease 2019(COVID-19)。2月21日,国家卫健委决定将"新型冠状病毒肺炎"的英文名称修订为"COVID-19",与世界卫生组织命名保持一致,中文名称保持不变。     

SARS相关病毒与鼠肝炎病毒S蛋白的同源暗示一个潜在受体结合区的存在

最近, 一种新的冠状病毒被确定为近期爆发的严重急性呼吸综合征(SARS)的病原体. 虽然人们对人冠状病毒229E已经有了较多的研究, 而且其受体结合位点也被确定在S蛋白第417~547个氨基酸残基之间. 但是, 这一区域与新分离的SARS相关病毒(香港株, CUHK-W1)没有任何同源性. 有意思的是, 已知的各种冠状病毒S蛋白S1亚基的序列比对和进化分析显示, 鼠肝炎病毒(MHV)与SARS相关病毒的同源性最高. 而且, MHV的S蛋白上负责受体结合的重要位点(第62~65和第214~216位氨基酸残基)与SARS相关病毒的相应区域(第51~54和第195~197位氨基酸残基)高度同源. 这些生物信息学的分析结果可能对研究SARS相关病毒的受体结合位点和病毒侵染靶细胞的机理有所帮助, 进而为设计抗病毒药物和疫苗提供新靶点.     

野生蝙蝠体内发现SARS病毒

正如研究人员所担心的．曾引起2003年SARS大流行的病毒仍然存在：香港一个研究小组最近发现了一种与人类SARS冠状病毒同属一类的病毒，这种冠状病毒在鲁氏菊头蝠中感染率极高。     

计算机世界里的一朵奇葩

现在许多年轻人都喜欢崇拜各种明星。这些明星中，有的是流星，一闪而过；有的是恒星，千年万载在夜空中照耀着人类。今天要推荐一名值得崇拜的女科学家，她叫芭芭拉·利斯科夫（Barbara Liskov），是美国第一个获得博士学位的女性，     

冠状病毒和人类SARS病毒的分子亲缘关系研究

组分矢量方法是一种从全基因组出发, 研究物种亲缘关系的新方法. 本文使用这一方法, 通过对外类群的适当选取, 研究包括SARS病毒的冠状病毒进化关系. SARS病毒作为一个单系, 由于彼此之间的序列相似程度非常高, 难以为其选取适当的外类群. 我们利用核苷酸的突变计数来构造距离矩阵, 并将其超度规化, 在此基础上揭示SARS病毒自身的演变关系. 本文采用了更多的序列和新的方法, 反映了更为详细的冠状病毒进化关系, 使得不同方法的比较成为可能, 为冠状病毒进化关系的研究提供了新的视角.     

蛋白質的结构与功能

蛋白质是生命现象最基本的物质。生物体中蛋白质的种类是多种多样的。它们在复杂的机体中,各尽所能:有的起催化作用,促进生物体内的新陈代谢;有的是抗体,负责抵抗疾病;有的是激素,在体内起各种调节作用。构成躯体的主要部分也是蛋白质,它们完成运动、收缩、保护、结缔等功能。此外,对生物体有害的病毒和一些毒素,也是蛋自质或其络合物。     

新型冠状病毒与蝙蝠

正目前主流观点认为蝙蝠是这次新型冠状病毒的源头。我是研究蝙蝠的,这里和大家聊聊——蝙蝠已经不止一次地被推上风口浪尖了。2003年的SARS病毒,2013年的MERS(中东呼吸综合征)病毒,在非洲不时暴发的埃博拉病毒,以及2018年的猪急性腹泻综合征冠状病毒等等都被证实起源于蝙蝠。不仅如此,根据可靠的统计,科学家们在蝙蝠体内分