SERS光谱和分子力学研究银表面青蒿素的吸附状态

通过不同电位下,SERS光谱各谱峰相对强度的变化以及分子力学对青蒿素结构的计算和分子图形模拟对青蒿素在银表面上的吸附状态进行研究。     

取代萘磺化反应的分子力学研究

研究一系列甲氧基取代萘磺化反应，考察立体效应对反应的影响，并通过了分子力学ＤＴＭＭ程序计算及相应核磁谱数据解释反应结果。     

嘧啶(硫)醚类除草剂的非线性QSAR研究

在进行分子力学和量子化学计算的基础上,采用人工神经网络方法对40种嘧啶（硫）醚类除草剂进行了非线性QSAR研究,得出了影响它们除草活性的重要特征指标,结合量子化学研究结果,提出了该除草剂与受体相互作用的初级模型。     

纺锤菌素－DNA相互作用的分子力学分析

文章介绍了纺锤菌素－ＤＮＡ相互作用分子力学研究的最新成果，对纺锤菌素－ＤＮＡ相互作用的性质、相互作用能作了详细的叙述，并与ｘ射线晶体衍射结果作了比较．在此基础上，我们对纺锤菌素ＤＮＡ相互作用进行了分子力学分析、考察了纺锤菌素与ｄ（Ａ６）、ｄ（Ｔ６），ｄ（ＴＡＴＡＴＡ）２、ｄ（ＣＧＣＧＣＧ）２和ｄ（ＣＧＣＧＡＡＴＴＣＧＣＧ）２的相互作用，得到了一些有益的结论．     

硫杂冠醚铜（Ⅱ）配合物的理论研究

用分子力学方法对一系列标题化合物进行了研究，对它们的对象和能量的分子力学计算结果表明，在这类配合物中，五员鳌环比六员鳌环稳定，随冠醚环大小和分子内张力的变化，其配合物的结构和性质有规律的变化。     

硫代双烯型螯合物溶剂效应的定量研究

用分子力学方法研究了硫代双烯型过渡金属螯合物溶剂效应的分子模型及定量性能关系。得到了该类结构染料最大吸收波长与其在溶液中构象能的半定量关系，为快速预测该类结构染料最大吸收波长提供了一个新的方法。     

直链淀粉结构的分子动力学模拟

为了研究直链淀粉的结构，构建并优化了200个单体组成的直链淀粉模型．在DreidingⅡ力场、热力学温度为300K条件下对直链淀粉进行lns分子动力学模拟计算．分析了直链淀粉分子力学优化的结构、1 ns时的结构以及势能最低时的结构，其结果将有助于对直链淀粉结构功能的进一步研究．     

分子力对机电耦合薄膜压力敏感元件振动的影响

本文将薄膜式微谐振压力传感器谐振子简化为对边简支对边自由机电耦合微薄膜谐振系统,给出了考虑分子力作用时微薄膜压力敏感元件机电耦合系统动力学方程,推导其振型方程及频率方程,研究了分子力对系统固有频率及自由振动的影响规律.结果表明:分子力对于机电耦合微薄膜的自由振动固有频率具有重要的影响.随着系统初始间隙的减小、工作电压的增大、微薄膜厚度的减小以及薄膜长度的增大,分子力对系统固有频率的影响更加显著.在低阶模态下,分子力对固有频率的影响变大,应该予以考虑.当初始间隙减小到0.1μm时,Casimir力对固有频率的影响比van der Waals力明显,必须考虑Casimir力的影响.论文有助于薄膜式微谐振压力传感器谐振子的动力学理论分析,研究结果对于MEMS压力传感器进一步小型化具有指导意义.     

人工神经网络用于除草剂活性与结构关系预测

除草剂分子的电子结构及其原子的空间排列情况是影响除草活性的重要因素陆荣健[1～3]等从量子药理学的角度,对不同类型的、具有相同作用机制的稠杂磺酰胺除草剂进行分子力学、量子化学及构效关系研究.     

1,2,3—三取代的咪唑啉盐还原反应的分子力学子化学研究

运用分子力学方法和分子轨道理论的联合计算，研究了四氢叶酸辅酶甲酸型模型化合物１，２，３－三取代的咪唑啉盐四个化合物用硼氢化钾还原的反应条件，中间体稳定性及反应结果，提出并证实了反应机制。     

静电场对碗豆幼苗膜透性影响与跨膜电导率

根据静电场作用下碗豆幼苗膜透性的试验结果,应用分子力学方法研究了离子跨膜输运能量,将植物细胞膜内部模拟为两个介电常烽不同的空间电荷区,建立离子跨膜模型,导出了界面势垒的静电荷密度与界面电导率,并从电子水平研究植物细胞畸变机理。     

利用能量原理研究单壁碳纳米管的剪切模量

利用能量方法研究了单壁碳纳米管（SWCNT）的剪切模量．采用分子力学理论得出了受扭矩作用下单壁碳纳米管的总势能;通过总势能与相应的薄壁圆筒的扭转变形能比较,推导出了单壁碳纳米管剪切模量的计算公式;碳纳米管剪切模量的计算结果与现有的研究结果相符,从而证实了本文计算公式正确有效．     

氟康唑及其衍生物构效关系的分子力学和量子化学研究

利用分子力学程序MMPM和量子化学程序CNDO／2对一系列C－8位上以氮原子与母体相连的氟康唑类分子进行计算，将计算的分子轨道指数进行多元逐步回归处理，建立了多元线性回归方程，对影响抑菌活性的主要因素做了讨论。     

丙烯氢原子[1,3]σ迁移的分子力学研究

在前人工作的基础上，用分子力学的方法进一步研究丙烯氢原子〔１，３〕σ异面迁移的反就机理，从分子的结构变化过程中整个分子的张力变化，具体分析出３个碳原子的键角减少而造成的张力增加并不是导致新键较迟形成的主要因素。     

1，2，3－三取代的咪唑啉盐还原反应的分子力学及量子化学研究

运用分子力学方法（ＭＭＰＭ）和分子轨道理论（ＣＮＤＯ／２）的联合计算，研究了四氢叶酸辅酶甲酸型模型化合物１，２，３－三取代的咪唑啉盐四个化合物用硼氢化钾还原的反应条件、中间体稳定性及反应结果，提出并证实了反应机制。     

分子体系模拟实用简介第二版

随着计算机技术的蓬勃发展,分子模拟在材料科学、物理、化学和生物学领域正扮演着越来越重要的角色。本书是第二版,广泛地介绍了原子尺度的分子模拟技术。第一部分集中于分子体系势能的计算方法,较第一版增加了量子化学（QM）、分子力学（MM）和QM／MM混合势的章节。第二部分介绍体系构象、动力学和热力学性质的研究方法,     

壳聚糖调控金属-Salen配合物的分子模拟

探索并利用金属-Salen配合物的多样性功能是化学生物学和仿生学研究的热点之一.本文使用计算机分子模拟,采用分子力学MM2和MM+方法,对金属Fe(Ⅲ)/Co(Ⅲ)-Salen配合物进行分子构型优化;而且在能量最低构型的基础上,采用半经验量子力学ZINDO/1方法进行单点能计算,在原子水平上系统考察了壳聚糖作为第五轴向配体时对配合物结构和性能的调控作用.     

分子结构计算中结果的转换

介绍了如何用Ｃ语言程序设计解决无法作程序修改的标准大程序即分子力学程序的输出数据与量子化学程序的输入数据间的转换问题。结合分子结构的实例详细讨论了整个程序设计过程，设计原理及程序的应用示例。     

莽草酸的质谱学研究

利用电子轰击质谱(EIMS)、电喷雾质谱(ESIMS)和多级质谱(MS/MS)研究莽草酸质谱学.探讨该化合物的质谱特征离子与裂解途径,提供莽草酸的质谱学基础.     

腈基类化合物对半胱氨酸蛋白酶的抑制机理

半胱氨酸蛋白酶是人体自身产生的重要酶类物质,它广泛的参与人体新陈代谢和蛋白的水解。但过量产生的半胱氨酸蛋白酶会导致骨质疏松和乳腺癌。腈基类化合物分子是一种新发现的具有抑制半胱氨酸蛋白酶作用的靶向药物分子,高效且低副作用。但是它的抑制机理一直没有得到解决。本文介绍借助量子力学/分子力学（Q M/M M）的计算研究,解得了此类化合物对于半胱氨酸蛋白酶的抑制机理,并借助分子学软件设计了一种新型药物分子,有助进一步药物研究。