植物开花生物钟

夏季的清晨,我们会看到紫茉莉的花开得正盛,可随着太阳越升越高,紫茉莉也就开始＂沉睡＂了,合拢了起来。对此现象,古人在诗句中也有体现，     

空间转录组学技术及其应用的研究进展

空间转录组简单地说就是一个完整的组织样本中不同位置的全部转录组数据信息.目前的空间转录组学技术主要包括两大类：基于原位捕获并测序和基于成像的空间转录组学技术.这些技术已被广泛应用于神经生物学、发育生物学、肿瘤生物学等领域.本文总结并比较了不同空间转录组学技术的特点,列举了空间转录组学技术在不同领域中的应用,最后讨论了其所面临的挑战和机遇.     

普洱茶不同发酵时期微生物群落宏转录组学研究

分离提取了普洱茶发酵前期和发酵中期茶叶样本中的微生物菌群全mRNA,并通过Illumina测序得到普洱茶发酵前期17376转录文本结果以及普洱茶发酵中期14456个转录文本结果。对测序结果的注释结果表明黑曲霉（Aspergillus niger）在两个阶段都占有绝对优势;对两个样本差异表达部分GO功能和KEGG PATHWAY的对比分析表明,适应渥堆发酵环境变化的微生物（如黑曲霉等）对普洱茶发酵过程起到了决定性的作用。     

单细胞转录组学细胞动态分化数据模拟算法的比较与评估

对9种单细胞转录组学(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)细胞动态分化数据模拟算法进行系统性地比较和评估,为算法的开发者和用户提供可靠的参考和帮助。利用多种评价指标对上述算法在准确性、可拓展性、适用性等3个方面进行全面评估,并对运行时间和内存消耗情况进行建模预测。结果显示：9种被评估的算法均不能在数据特征与拓扑结构这2个方面同时有完美的表现;算法Dyngen虽然能模拟与参考数据拓扑结构和细胞分化轨迹相似度较高的数据,但是它的运行时间较长且内存消耗过大;将近一半的算法还需要及时更新版本信息并维护相关功能。用户在使用scRNA-seq细胞动态分化数据模拟算法时应综合考虑不同的使用场景和特点来选择最适合的模拟算法。     

基于转录组学分析日本沼虾原肌球蛋白对小鼠巨噬细胞极化的影响

为研究日本沼虾原肌球蛋白对巨噬细胞极化的影响,运用转录组学分析原肌球蛋白诱导的巨噬细胞极化过程中基因表达的差异性。结果表明:与磷酸盐缓冲溶液组(PBS组)相比,原肌球蛋白诱导组(TM组)有69个基因表达上调,154个基因表达下调,富集到180条通路;TM组相较于脂多糖和IFN-γ联合诱导M1型巨噬细胞组(LPSIFN组)有1346个基因表达上调,1360个基因下调,富集到308条通路;TM组与IL-4诱导M2型巨噬细胞组(IL4组)相比,有455个基因上调,446个基因下调,富集到269条通路。根据KEGG结果选择5条可能涉及巨噬细胞极化的信号通路,包括NOD样受体信号通路、Jak-STAT信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路和PI3K/Akt信号通路,对这5条通路中的NOD2、TLR2、AKT3、NLRP3、Caspase-1、CD14、Lat、Myd88、NFKBIA和STAT1基因的表达进行验证,检测到TM组NOD2、TLR2、NLRP3、STAT1这4个基因表达量相较于PBS组显著升高,与这4个基因相关的NOD样受体信号通路、Jak-STAT信号通路、Toll样受体信号通路参与原肌球蛋白诱导巨噬细胞极化的过程。研究旨在为进一步分析巨噬细胞极化与食物过敏的关系提供理论依据。     

植物节律性发育的分子基础

生物钟调节了多种物生的生理过程.本文主要阐述了植物生长的日变化以及季节变化的分子基础,并分析了生物钟在植物生长发育过程中的重要作用.     

植物代谢组学技术研究进展

 代谢组学对生物体或细胞中全部小分子代谢物进行定性、定量分析, 是继基因组学、蛋白组学之后又一门新兴的组学技术。植物代谢物在种类、含量、生理功能方面极具多样性, 因此植物代谢组学在代谢组学的研究中占据重要地位。植物代谢物是植物生理状态在代谢水平的反映, 从整体上研究植物代谢物的变化及其调控将为解析植物生长发育及其与环境因子的互作奠定基础。植物代谢组学已经被广泛的应用于代谢物积累模式及其遗传基础研究、代谢相关基因的鉴定及途径解析方面, 成为现代植物生物学研究中的热点领域之一。本文综述植物代谢组学分析技术的基本组成、发展状况及植物代谢组学应用于现代植物生物学研究的现状和趋势。     

松茸子实体转录组测序及解析

以人工种植的商品松茸子实体为对象,利用Illumina Novaseq 6000测序平台对松茸子实体进行转录组测序,并通过生物信息学手段对松茸转录组进行注释和分析.基于9个松茸样品的测序共获得76.38 Gb的数据量,组装得到的转录本和unigene个数分别为26 285和87 174.将获得的unigene与6大功能数据库进行比对,共有19 964个unigene得到注释.基于GO和KEGG数据库的注释和分析,松茸子实体unigene被注释和划分为45个和28个功能类别.在松茸子实体中,涉及unigene数量最多的生理过程包括碳水化合物代谢、运输和分解代谢、氨基酸代谢等.结果表明,松茸子实体中代谢旺盛,应采取合理措施以延缓其品质下降.松茸子实体的转录组测序将为其功能基因的挖掘以及采后品质变化机制的研究提供重要遗传数据和参考.     

低氮胁迫下栽培大豆和野大豆幼苗适应性转录组学比较研究

以栽培大豆和野大豆幼苗为实验材料，人工模拟低氮胁迫，采用转录组测序技术(RNA-seq)测试分析了胁迫处理下栽培大豆和野大豆幼苗在转录水平发生的变化，揭示了野大豆抵御低氮胁迫的分子机制.结果表明：野大豆能够通过促进根系生长维持较高的根冠比、增大根系与营养物质的接触面积吸收更多的氮抵御低氮胁迫.低氮胁迫下野大豆和栽培大豆幼苗叶片中分别有182个和733个差异表达基因，根系中分别有807个和621个差异表达基因.野大豆通过调控NRT1、NRT2和AMT蛋白家族相关基因的表达来抵御低氮胁迫.叶片中AP2/ERF-ERF、C2H2、C3H、GRAS、MYB、NAC、TIFY和WRKY转录因子，根系中C2H2、GRAS、MYB、NAC、TIFY和WRKY转录因子在野大豆抵御低氮胁迫的过程中起调控作用.野大豆抵御低氮胁迫的关键是增强叶片中的半胱氨酸、蛋氨酸代谢和谷胱甘肽代谢，增强根系中的半胱氨酸、蛋氨酸、氰基氨酸代谢，N-聚糖生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢及糖酵解.     

一类植物中特有的转录因子——AP2/EREBP转录因子家族

AP2/EREBP转录因子家族是一类在植物中特有的转录因子.该家族转录因子的共同特点是其DNA结合域为保守的AP2/EREBP结构域.根据所含保守结构域数目,该家族分为AP2和EREBP两个亚族.AP2亚族转录因子与调控植物生长发育有关,EREBP亚族转录因子应答植物非生物逆境胁迫.本文就AP2/EREBP类转录因子的结构特征、功能、与靶元件的作用模式、对基因的调控表达以及最新研究进展做全面性的综述.     

基准原子钟的发展及国家授时中心光学原子钟的研制进展

本文简要介绍了基准原子钟的发展历程;目前,光学原子钟的频率不确定度已达到了10-18量级,是现在人们公认的最可能新的时间基准.国家授时中心担负着国家综合原子时的建立和保持,是国际原子时TAI建立的主要参加单位.文中介绍了国家授时中心锶光学原子钟研制工作的最新进展.     

不同栽培基质对切花菊生长发育的影响

通过盆栽试验,研究7种不同基质对切花菊生长发育的影响,结果表明:棉籽壳 腐熟稻草的效果最佳,其次是锯木屑 腐熟稻草,蘑菇渣 腐熟稻草居三,其它4种基质均较差.     

抽水蓄能电站的开发及模式研究

本文将研究为了更好的开发抽水蓄能电站的效益，采用火电厂、核电厂、风能电厂、常规水电厂与抽水蓄能电站的联合开发的模式不失为一种好的模式。     

生物钟的研究、功能和机理——2017年度诺贝尔生理学或医学奖成果简析

 生物日节律（circadian rhythm）也叫昼夜节律,是以约昼夜24 h为周期的、在生命体中普遍存在的节律性生理生化和行为活动,是众多生物节律或生物钟的一种。美国的3位科学家杰弗理·霍尔（Jeffrey C.Hall）、迈克尔·罗斯巴什（Michael Ros-bash）和迈克尔·杨（Michael W.Young）因发现调节生物日节律行为的基因并阐明其作用原理获得了2017年的诺贝尔生理学或医学奖。这项工作揭示了一个普遍存在的基本生命现象的分子机理,对了解生命的运行原理以及生命在演化过程中与环境之间的相互作用有着重要的意义,同时也为治疗由于生物钟失常而导致的人类疾病和开发调控生物钟元件的药物奠定了基础。本文介绍生物节律的研究历史,解读生物节律的分子机理,展望生物节律研究的方向,并探讨其对人类健康和农业的意义。     

沈阳工业发展与经济增长关系的协整分析

运用协整理论对沈阳市工业发展与经济增长之间关系进行了实证检验,建立了误差修正模型,分析了沈阳市工业发展与经济增长之间的短期关系,并对两者之间的因果关系进行检验.结果表明:沈阳工业发展与经济增长之间长期存在稳定的关系,工业发展在短期内对全市经济增长具有较强的推动作用;工业发展与经济增长之间存在着显著的双向因果关系:工业发晨可推动经济增长,经济的增长又进一步推动工业发展,从而形成一种良性的循环.     

生长调节剂对边坡生态修复植物萌发生长的影响

利用不同浓度的赤霉素(GA_3)和根太阳药剂分别对披碱草和木豆种子进行处理,研究浸种对边坡生态修复植物种子萌发、幼苗生长及抗旱性的调控作用.结果表明:适宜浓度的赤霉素(GA_3)对提前披碱草种子的萌发时间、提高种子萌发率有明显作用,可显著增加茎长、缩短根长,明显使披碱草幼苗的抗旱性降低.适宜浓度的根太阳药剂提高了木豆种子的发芽势和发芽指数,对降低木豆幼苗的株高提高根系长度、增加分根数有明显作用.     

重金属pb2+对作物早期生长发育的影响

用不同浓度的pb2 溶液浸泡大豆和绿豆种子及浇灌幼苗,结果表明,不同浓度的pb2 对大豆种子的萌发和幼苗的生长发育有不同的影响,且pb2 浓度越大,种子萌发和幼苗生长的危害性越大。     

CONSTANS mediates between the circadian clock and the control of flowering in Arabidopsis

Flowering is often triggered by exposing plants to appropriate day lengths. This response requires an endogenous timer called the circadian clock to measure the duration of the day or night. This timer also controls daily rhythms in gene expression and behavioural patterns such as leaf movements. Several Arabidopsis mutations affect both circadian processes and flowering time; but how the effect of these mutations on the circadian clock is related to their influence on flowering remains unknown. Here we show that expression of CONSTANS (CO), a gene that accelerates flowering in response to long days, is modulated by the circadian clock and day length. Expression of a CO target gene, called FLOWERING LOCUS T (FT), is restricted to a similar time of day as expression of CO. Three mutations that affect circadian rhythms and flowering time alter CO and FT expression in ways that are consistent with their effects on flowering. In addition, the late flowering phenotype of such mutants is corrected by overexpressing CO. Thus, CO acts between the circadian clock and the control of flowering, suggesting mechanisms by which day length regulates flowering time.     

根田鼠身体大小生长发育规律研究

在实验室条件下,利用根田鼠1~70日龄体长、尾长、后足长、耳长以及毛长等身体生长发育的主要参数,分析其身体大小生长发育的基本规律,目的在于揭示根田鼠的次级生产过程。结果表明,根田鼠1~70日龄身体上述指标随发育时间呈多项式方式增长,决定系数(R2)均>0.9。各指标在33日龄后保持稳定,表明此阶段是根田鼠性器官发育的起始点。